chr1 839741 840250 839788 Y NA SAMD11 NA NA NA NA SAMD11 18010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 855764 856157 855856 Y NA SAMD11,NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 2103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 858256 858648 858448 Y SAMD11 NOC2L,KLHL17,PLEKHN1 NA NA NA NA SAMD11 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 956563 956812 956665 Y UBE2J2,PUSL1,GLTPD1,DVL1,CPSF3L,C1orf159,AURKAIP1,AURKAIP1,AURKAIP1,ATAD3A,ATAD3A,NOC2L,PLEKHN1,ISG15,AGRN HES4,ISG15,AGRN,RP11-465B22.3 NA NA NA NA AGRN 3060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr1 1004646 1004986 1004766 Y NA RP11-465B22.3,C1orf159 NA NA NA NA RP11-465B22.3 11532 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.85043701120423 chr1 1343359 1343768 1343546 Y NA MXRA8,AURKAIP1,CCNL2,RP4-758J18.2,MRPL20,VWA1,ATAD3C NA NA NA NA MRPL20 2666 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 1706859 1707124 1707007 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 2772 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 1708824 1709349 1708980 Y NA SLC35E2,NADK NA NA NA NA NADK 547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 1814762 1815124 1815035 Y SKI,C1orf86,MIB2 GNB1,TMEM52 NA NA NA NA GNB1 5371 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 1840449 1840835 1840668 Y SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD GNB1,TMEM52 NA NA NA NA TMEM52 7877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 2135885 2136186 2135927 Y NA C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 5973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 2177615 2177829 2177732 Y NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI C1orf86 NA NA NA NA C1orf86 35456 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 2221868 2222548 2222316 Y TNFRSF14,SKI NA NA NA NA NA C1orf86 79709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 2245775 2246116 2245876 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 75030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 2253622 2253773 2253699 Y NA NA NA NA NA NA MORN1 67373 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 2574343 2574764 2574705 Y MORN1,PANK4,ACTRT2,MMEL1 NA NA NA NA NA FAM213B 58413 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 3229711 3230157 3229865 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 245979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 3231111 3231335 3231228 Y NA NA NA NA NA NA PRDM16 247379 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 4079242 4079460 4079359 Y NA NA NA NA NA NA C1orf174 264385 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 4327537 4327841 4327648 Y NA NA NA NA NA NA AJAP1 384951 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 4697251 4697504 4697378 Y NA AJAP1 NPHP4 IMR90 Hi-C 24141950 AJAP1 15288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 4729528 4729775 4729656 Y AJAP1 AJAP1 NA NA NA NA AJAP1 16736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 4736270 4736533 4736402 Y NA AJAP1 NA NA NA NA AJAP1 23478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 6053603 6054107 6053839 Y CHD5,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2,KCNAB2 KCNAB2,NPHP4 NA NA NA NA NPHP4 3070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 6221566 6221669 6221628 Y PLEKHG5,CHD5 RPL22 NA NA NA NA RPL22 45780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 6319998 6320272 6320169 Y NA ICMT,GPR153 NA NA NA NA GPR153 963 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 6661008 6661639 6661311 Y ZBTB48,KLHL21 NOL9,TAS1R1,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3 NA NA NA NA PHF13 10106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 6894689 6894717 6894703 Y NA NA NA NA NA NA CAMTA1 51305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 7551468 7551846 7551701 Y NA NA NA NA NA NA VAMP3 277483 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 7764543 7764931 7764717 Y PER3 NA NA NA NA NA VAMP3 64398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.85043701120423 chr1 8070132 8070398 8070299 Y PER3,SLC45A1,ERRFI1 ERRFI1,RP11-431K24.1 NA NA NA NA ERRFI1 13970 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 8194345 8194402 8194374 Y NA NA ERRFI1,SLC45A1,RERE,PARK7 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-7P 70255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 8487656 8487917 8487791 Y RERE NA NA NA NA NA SLC45A1 111770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 8499087 8499228 8499177 Y NA NA NA NA NA NA SLC45A1 123201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 8953388 8953557 8953428 Y NA ENO1-IT1,ENO1 NA NA NA NA ENO1 16080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 9225492 9225752 9225745 Y NA GPR157,RP3-510D11.2,RP3-510D11.1 SLC2A7,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 RP3-510D11.2 14511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 9486434 9486788 9486620 Y NA NA H6PD,SPSB1,SLC25A33,MIR34A IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 110753 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 9488839 9489227 9489154 Y NA NA SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 108314 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 9535183 9535425 9535306 Y NA NA SPSB1,H6PD,SLC25A33,TMEM201 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A33 62116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 10700424 10700580 10700499 Y NA NA NA NA NA NA CASZ1 154127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 10927237 10927380 10927309 Y CASZ1 NA PEX14,CASZ1,APITD1-CORT,C1orf127 IMR90 Hi-C 24141950 CASZ1 72530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 11559549 11559947 11559917 Y NA PTCHD2 NA NA NA NA PTCHD2 22326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 11791882 11792060 11791938 Y NA MAD2L2,AGTRAP,C1orf167 AGTRAP IMR90 Hi-C 24141950 AGTRAP 2081 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 12236326 12236421 12236349 Y AGTRAP,TNFRSF8,TNFRSF1B TNFRSF1B NA NA NA NA TNFRSF1B 11266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 12243852 12244671 12244387 Y AGTRAP,MTHFR,CLCN6,TNFRSF8,TNFRSF1B,VPS13D TNFRSF1B,VPS13D VPS13D IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1B 18792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 12600525 12600853 12600637 Y DHRS3 NA DHRS3,VPS13D K562 ChIA-PET 22265404 VPS13D 312401 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 12609717 12610039 12609907 Y DHRS3 NA NA NA NA NA VPS13D 321593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 12616547 12616769 12616712 Y DHRS3 NA NA NA NA NA VPS13D 328423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 12674513 12674729 12674684 Y NA NA NA NA NA NA VPS13D 386389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 16087189 16087372 16087266 Y EPHA2,FBLIM1 RP11-169K16.4,FBLIM1 NA NA NA NA FBLIM1 6087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 16125579 16125747 16125670 Y FBLIM1,FBLIM1,FBLIM1,EPHA2 FBLIM1,RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.8 26977 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 16175691 16176294 16176100 Y NA RP11-169K16.8,SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 3049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 16212759 16213091 16212941 Y EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN SPEN,RP11-169K16.9 NA NA NA NA RP11-169K16.9 40117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr1 16277350 16278224 16277618 Y CASP9,PLEKHM2,SPEN,C1orf144,ZBTB17 ZBTB17 NA NA NA NA ZBTB17 22403 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 16339360 16339596 16339414 Y NA ZBTB17,C1orf64,HSPB7 NA NA NA NA HSPB7 4493 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 16502532 16502678 16502612 Y C1orf64 RP11-276H7.2,EPHA2 CLCNKA,HSPB7,C1orf64,CLCNKB,FAM131C,EPHA2,ARHGEF19,FBXO42 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EPHA2 21950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 16696032 16696399 16696223 Y NA FBXO42 NA NA NA NA FBXO42 19083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 16825333 16826291 16825792 Y NA NA SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 60166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.30227604751111 chr1 16826315 16826438 16826391 Y C1orf64,FAM131C,NBPF1 NA NECAP2,SPATA21,CROCCP3,NBPF1,CROCC IMR90 Hi-C 24141950 NECAP2 61148 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 17231253 17231704 17231392 Y PADI4,PADI2 RP11-108M9.4 CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-108M9.4 17109 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 17240188 17240783 17240515 Y NA RP11-108M9.4 CROCC K562 ChIA-PET 22265404 RP11-108M9.4 26044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 17875004 17875168 17875086 Y NA ARHGEF10L NA NA NA NA ARHGEF10L 10674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 19278388 19278892 19278719 Y UBR4,IFFO2 IFFO2 NA NA NA NA IFFO2 2288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 19333976 19334220 19334098 Y NA NA UBR4,IFFO2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 52796 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 19336477 19336714 19336579 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 55297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 19337577 19337942 19337698 Y NA NA UBR4,IFFO2,ALDH4A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IFFO2 56397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 19703880 19704261 19704067 Y NA NA NA NA NA NA PQLC2 67060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 19796024 19796128 19796080 Y NA CAPZB NA NA NA NA CAPZB 13938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 19837772 19837831 19837816 Y NA CAPZB CAPZB,C1orf151-NBL1 IMR90 Hi-C 24141950 CAPZB 27706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 20111066 20111358 20111348 Y NA TMCO4 NA NA NA NA TMCO4 13080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 20204786 20204981 20204970 Y OTUD3 OTUD3 NA NA NA NA OTUD3 2025 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr1 20407516 20407737 20407710 Y NBL1,HTR6,UBXN10 NA NA NA NA NA PLA2G5 54844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 20930711 20931037 20930891 Y CDA CDA,PINK1 PINK1 IMR90 Hi-C 24141950 CDA 17270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 20993397 20993558 20993485 Y NA PINK1,DDOST NA NA NA NA DDOST 7397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 21284001 21284025 21284019 Y NA NA NA NA NA NA RP11-487E1.2 114221 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 21348947 21349299 21348998 Y CDA,ECE1,ECE1 RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 48947 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 21428050 21428147 21428101 Y NA RP11-487E1.2 NA NA NA NA RP11-487E1.2 29804 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 21588829 21589430 21588896 Y ECE1,ALPL,EIF4G3,ECE1,ECE1 NA NA NA NA NA ECE1 80567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 21895072 21895699 21895173 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 98102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 21931612 21931850 21931825 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP 61951 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 22345590 22345859 22345703 Y ZBTB40,CDC42 LINC00339,CDC42 NA NA NA NA LINC00339 3822 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 23116669 23117052 23116861 Y NA NA NA NA NA NA EPHB2 81337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 23494015 23494642 23494449 Y NA LUZP1 NA NA NA NA LUZP1 7659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 23721090 23721462 23721458 Y ZNF436 C1orf213,ZNF436,TCEA3 HNRNPR,ZNF436 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF436 27155 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 23881180 23881765 23881497 Y NA E2F2,ID3,MDS2 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 2520 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 23882500 23882866 23882600 Y NA E2F2,ID3,MDS2 E2F2 IMR90 Hi-C 24141950 ID3 1419 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 23888678 23889201 23888997 Y ID3 E2F2,ID3,MDS2 NA NA NA NA ID3 4393 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 24691833 24692082 24691893 Y PNRC2,GRHL3 NIPAL3 NA NA NA NA NIPAL3 48202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 25823926 25824130 25824028 Y NA LDLRAP1 LDLRAP1 IMR90 Hi-C 24141950 LDLRAP1 43941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 26022319 26022793 26022555 Y SEPN1 NA NA NA NA NA SEPN1 101874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 26201699 26201757 26201716 Y SEPN1 RP1-125I3.2,MIR3917,STMN1 NA NA NA NA RP1-125I3.2 17595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 26827232 26827869 26827508 Y PDIK1L,CEP85,UBXN11,RPS6KA1,GPATCH3,ARID1A RP3-476K8.4,HMGN2 HMGN2,DHDDS,ARID1A,RPS6KA1,PIGV K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 HMGN2 30291 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 26907862 26908015 26907938 Y SH3BGRL3,UBXN11 NA NA NA NA NA HMGN2 110921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 26946837 26947249 26947076 Y CATSPER4,UBXN11,UBXN11,PIGV,GPATCH3,ARID1A NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 73275 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 26947342 26948198 26947481 Y SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1 NA RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARID1A 72326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 27191386 27191927 27191661 Y FAM46B,C1orf172,HMGN2,RPS6KA1,SFN,NUDC,GPN2 ZDHHC18,GPN2,NUDC,GPATCH3 NA NA NA NA GPN2 22861 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 27353661 27353962 27353706 Y TMEM222,MAP3K6,TRNP1 RP11-344H11.4,TRNP1,FAM46B FAM46B,C1orf172,SLC9A1,WDTC1,WASF2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM46B 16334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27383957 27384315 27384137 Y GPR3 FAM46B C1orf172,TRNP1,FAM46B,WDTC1,SLC9A1,TMEM222,SYTL1,GPR3,GPATCH3,NR0B2,FCN3,MAP3K6,CD164L2,AHDC1,IFI6,FGR,WASF2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM46B 46630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27527451 27527688 27527509 Y NA SLC9A1,WDTC1 WDTC1,SLC9A1,C1orf172 IMR90 Hi-C 24141950 WDTC1 31319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 27691785 27692261 27692091 Y TMEM222,MAP3K6 TMEM222,RP11-4K3__A.5,MAP3K6,GPR3 NA NA NA NA MAP3K6 402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27775351 27775365 27775358 Y GPR3 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27853337 27854089 27853858 Y NA WASF2 NA NA NA NA WASF2 38668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27854575 27854919 27854692 Y SYTL1,FGR,FGR,FGR,FAM76A,C1orf38 WASF2 NA NA NA NA WASF2 39906 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27869425 27869556 27869494 Y NA NA NA NA NA NA WASF2 54756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27883449 27884140 27883881 Y NA AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 44802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 27916292 27916674 27916513 Y XKR8,AHDC1 AHDC1 NA NA NA NA AHDC1 12268 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 28189568 28190269 28189912 Y SESN2,PTAFR,PTAFR,MED18,EYA3,WASF2,FGR,FGR,FGR,STX12,XKR8,C1orf38 PPP1R8,RPA2 NA NA NA NA PPP1R8 34279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 28318645 28318992 28318812 Y FAM76A NA NA NA NA NA SMPDL3B 59141 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 28573636 28574084 28573917 Y NA AL353354.1,DNAJC8,ATPIF1,SESN2 NA NA NA NA SESN2 9954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 29451057 29451462 29451431 Y TMEM200B,TMEM200B NA NA NA NA NA SRSF4 55037 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr1 29563709 29564430 29563877 Y PTPRU MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 2681 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 29564766 29564995 29564881 Y NA MECR,PTPRU NA NA NA NA PTPRU 3738 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 31320336 31320627 31320524 Y NA RP1-65J11.1 SDC3 K562 ChIA-PET 22265404 RP1-65J11.1 25261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 31627566 31627958 31627874 Y SDC3,HCRTR1,NKAIN1 NA SNRNP40,PUM1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 90728 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 31628220 31628457 31628359 Y NA NA PUM1,NKAIN1,SERINC2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PUM1 91382 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 31956203 31956482 31956384 Y PEF1 NA SERINC2,SNRNP40,HCRTR1,NKAIN1,FABP3,LOC149086,LOC284551,TINAGL1 IMR90 Hi-C 24141950 SERINC2 75791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 32420307 32420572 32420414 Y TMEM234,PEF1,PTP4A2,PTP4A2 PTP4A2 KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTP4A2 11850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 32701561 32701886 32701724 Y NA CCDC28B,IQCC,EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B NA NA NA NA MTMR9LP 3335 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 32732571 32732683 32732626 Y LCK EIF3I,TMEM234,MTMR9LP,FAM167B,HDAC1 NA NA NA NA FAM167B 21737 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 33077721 33078012 33077949 Y FNDC5 ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 36492 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 33089029 33089046 33089038 Y NA ZBTB8OS,RBBP4 NA NA NA NA ZBTB8OS 25458 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 33220963 33221073 33221021 Y NA KIAA1522 NA NA NA NA KIAA1522 15477 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 33405191 33405597 33405376 Y RNF19B TMEM54,RNF19B NA NA NA NA RNF19B 22689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 33515825 33516245 33515960 Y RNF19B AK2,ADC AK2,S100PBP,RNF19B,TMEM54,FNDC5,HPCA,ADC IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AK2 28352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 33564918 33565286 33565197 Y NA AK2,ADC NA NA NA NA ADC 20213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 33685276 33685676 33685470 Y NA TRIM62,ZNF362 TRIM62,ZNF362,PHC2,ZSCAN20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF362 34470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 35891843 35891965 35891904 Y NA NA NA NA NA NA NCDN 129109 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 36103028 36103196 36103152 Y NA PSMB2 TFAP2E IMR90 Hi-C 24141950 PSMB2 2249 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 36283726 36283900 36283813 Y NA NA NA NA NA NA CLSPN 50158 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 36641160 36641451 36641218 Y NA TRAPPC3,MAP7D1,THRAP3 NA NA NA NA MAP7D1 21980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 36840093 36840535 36840445 Y EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,LSM10,CSF3R STK40,LSM10 NA NA NA NA STK40 8962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 36866636 36866899 36866720 Y LSM10 STK40,LSM10,OSCP1 NA NA NA NA LSM10 5143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr1 36877889 36878288 36878089 Y NA STK40,LSM10,OSCP1,MRPS15 NA NA NA NA LSM10 16396 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 37937293 37937526 37937471 Y YRDC,MTF1,C1orf122,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA LINC01137 486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 37942874 37943354 37943027 Y YRDC,SNIP1,MTF1,ZC3H12A LINC01137,ZC3H12A,MEAF6 NA NA NA NA ZC3H12A 4721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 38009784 38010404 38010149 Y SNIP1,MTF1,ZC3H12A MEAF6,SNIP1,RP3-423B22.5,DNALI1,GNL2 MEAF6 IMR90 Hi-C 24141950 SNIP1 7499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 38134422 38134555 38134489 Y NA C1orf109,CDCA8 NA NA NA NA C1orf109 21359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 38495782 38495936 38495884 Y NA SF3A3,FHL3,UTP11L,POU3F1 NA NA NA NA POU3F1 14514 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 39509536 39509726 39509631 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 19546 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 39516193 39516422 39516273 Y NA NDUFS5,MACF1 NA NA NA NA NDUFS5 26203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 39874208 39874673 39874342 Y KIAA0754 KIAA0754 NA NA NA NA KIAA0754 57 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 40628781 40629153 40628997 Y NA RLF NA NA NA NA RLF 3736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 40954031 40954187 40954167 Y ZNF684,DEM1 RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA RP11-656D10.3 18146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 41005233 41005440 41005262 Y RLF RP11-656D10.3,ZNF684 NA NA NA NA ZNF684 10000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 41501440 41501773 41501639 Y NA NA NA NA NA NA CITED4 175422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 42127851 42128791 42128091 Y NA NA NA NA NA NA FOXO6 302257 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr1 42180382 42180624 42180465 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 318972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 42204580 42205516 42204895 Y NA NA NA NA NA NA HIVEP3 294080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 42774668 42774801 42774679 Y CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3 FOXJ3 NA NA NA NA FOXJ3 24747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 43389220 43390772 43390027 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 31758 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 43407355 43407700 43407616 Y YBX1,ERMAP,SZT2 SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1 14830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 43427522 43427762 43427666 Y NA SLC2A1,SLC2A1-AS1 NA NA NA NA SLC2A1-AS1 4802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 43533809 43534205 43534063 Y NA NA FLJ32224,SLC2A1,LOC100129924,C1orf50,CCDC23,ERMAP IMR90 Hi-C 24141950 WDR65 101615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 43884019 43884040 43884030 Y ST3GAL3,MPL,SZT2 MED8,SZT2,HYI NA NA NA NA SZT2 30466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 43997843 43998152 43997977 Y PTPRF PTPRF NA NA NA NA PTPRF 8985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 44452990 44453115 44453039 Y NA RP11-7O11.3,IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9,RP5-1198O20.4 NA NA NA NA CCDC24 1916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 45057924 45058133 45058042 Y C1orf228,RNF220 NA NA NA NA NA TMEM53 80094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 45283789 45284126 45283958 Y NA RPS8,SNORD55,RPS15AP11,PLK3,TCTEX1D4,BTBD19,RNU5E-6P,PTCH2 NA NA NA NA RNU5E-6P 120 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 46111666 46112048 46111975 Y NA RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1 NA NA NA NA RP11-767N6.2 3450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 46528388 46528566 46528496 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R3 111594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 46793807 46793895 46793851 Y NA LRRC41,UQCRH,NSUN4 NSUN4 IMR90 Hi-C 24141950 NSUN4 9954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 47677583 47677805 47677734 Y PDZK1IP1,TAL1 TAL1 NA NA NA NA TAL1 18087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 51083951 51084011 51083988 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 339924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 51102056 51102361 51102067 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 321574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 51312022 51312165 51312091 Y NA NA NA NA NA NA FAF1 111770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 51809780 51810107 51809799 Y NA TTC39A NA NA NA NA TTC39A 992 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 52088228 52088763 52088412 Y NA OSBPL9 NA NA NA NA OSBPL9 47377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 52173889 52173954 52173921 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL9 133038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 52628189 52628583 52628480 Y NA ZFYVE9,RP4-800M22.2 NA NA NA NA RP4-800M22.2 1491 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 54441729 54442008 54441915 Y NA HSPB11,LRRC42 NA NA NA NA LRRC42 31979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 54700132 54700688 54700499 Y NA CYB5RL NA NA NA NA CYB5RL 36423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 54715450 54715803 54715579 Y NA NA NA NA NA NA CYB5RL 51741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 54804829 54805209 54805022 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 71943 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 54953784 54954325 54954090 Y SSBP3,SSBP3 NA TCEANC2,SSBP3,CYB5RL,MRPL37,CDCP2,YIPF1,DIO1,TMEM59,HSPB11,HEATR8-TTC4 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SSBP3 76632 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 55009665 55009918 55009852 Y NA NA NA NA NA NA SSBP3 132513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 55650535 55650650 55650593 Y NA USP24 NA NA NA NA USP24 28136 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 55678785 55679185 55678893 Y NA NA NA NA NA NA USP24 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 56797894 56798374 56798151 Y NA NA PPAP2B IMR90 Hi-C 24141950 PPAP2B 310600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 57042744 57043185 57043024 Y C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 65789 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 57043287 57044160 57043621 Y PRKAA2,PPAP2B NA NA NA NA NA PPAP2B 64814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 57887813 57887926 57887901 Y NA NA NA NA NA NA PRKAA2 778818 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 58969564 58969575 58969570 Y NA DAB1,OMA1 NA NA NA NA DAB1 40831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 59280773 59281281 59281052 Y FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 32988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 59281873 59282217 59282125 Y MYSM1,FGGY,JUN JUN NA NA NA NA JUN 34088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 59369049 59370138 59369602 Y FGGY NA NA NA NA NA RP4-794H19.4 113921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 59522982 59523218 59523118 Y NA RP4-794H19.4 FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-794H19.4 38923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 61649786 61650305 61649984 Y NFIA,NFIA,NFIA NA NA NA NA NA NFIA 320855 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 62751605 62751997 62751995 Y NA KANK4 NA NA NA NA KANK4 31088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 63022251 63022602 63022448 Y NA NA NA NA NA NA USP1 122283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 64417224 64417447 64417336 Y ROR1 NA NA NA NA NA CFL1P3 109868 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 64558632 64559006 64558819 Y NA NA NA NA NA NA CFL1P3 251276 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 66740731 66741065 66740898 Y NA NA NA NA NA NA TCTEX1D1 475077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 67029939 67030347 67030122 Y PDE4B NA NA NA NA NA TCTEX1D1 185795 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 67460593 67460710 67460683 Y NA NA NA NA NA NA SLC35D1 57072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 67883059 67883215 67883204 Y NA SERBP1 NA NA NA NA SERBP1 10883 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 68257383 68257657 68257565 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 39493 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr1 68285768 68286070 68285946 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 11080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 68321515 68321736 68321554 Y NA GNG12 NA NA NA NA GNG12 24365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 68572958 68573227 68573176 Y NA NA NA NA NA NA WLS 123576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 68647153 68647165 68647159 Y NA WLS NA NA NA NA WLS 49638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 70635460 70635702 70635581 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA LRRC40 33601 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 70709017 70709466 70709138 Y NA LRRC40,SRSF11,RP4-677H15.4 NA NA NA NA RP4-677H15.4 24311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 70807938 70808237 70808103 Y NA ANKRD13C,HHLA3 NA NA NA NA ANKRD13C 10180 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 72749220 72749791 72749447 Y NEGR1 NEGR1 NA NA NA NA NEGR1 2803 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 77165935 77166101 77166017 Y NA TPI1P1 ST6GALNAC3 IMR90 Hi-C 24141950 TPI1P1 2461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 77595980 77596376 77595997 Y NA RP4-706A16.3 NA NA NA NA RP4-706A16.3 3212 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 77842116 77842473 77842156 Y NA NA NA NA NA NA AK5 96380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78196845 78197195 78197020 Y NA ZZZ3,USP33,RP4-706L14.2,FAM73A NA NA NA NA USP33 26342 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78350506 78350835 78350671 Y FAM73A NEXN NA NA NA NA NEXN 1363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78423142 78423521 78423473 Y NA FUBP1,DNAJB4 NA NA NA NA FUBP1 19273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78557346 78557710 78557476 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB4 114487 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78907891 78908155 78908023 Y NA NA MGC27382,PTGFR IMR90 Hi-C 24141950 PTGFR 140323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 78957462 78957762 78957688 Y PTGFR NA NA NA NA NA IFI44L 125845 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 79215772 79216132 79215819 Y NA NA NA NA NA NA IFI44 102291 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 84120524 84120814 84120773 Y PRKACB NA NA NA NA NA RP11-475O6.1 203892 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 84710038 84710507 84710127 Y NA NA NA NA NA NA PRKACB 168293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 84966686 84966774 84966730 Y NA RPF1,GNG5 NA NA NA NA GNG5 3474 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 85049005 85049203 85049109 Y NA CTBS RPF1,GNG5 IMR90 Hi-C 24141950 CTBS 10842 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr1 85991291 85991622 85991523 Y DDAH1,CYR61 NA NA NA NA NA DDAH1 50311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 85992810 85993270 85993105 Y NA DDAH1 NA NA NA NA DDAH1 48663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 86035824 86036171 86035900 Y NA DDAH1,CYR61 NA NA NA NA DDAH1 5762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 86077578 86077925 86077749 Y DDAH1,CYR61 DDAH1,CYR61 DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYR61 33134 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 87190718 87190974 87190846 Y NA SH3GLB1 NA NA NA NA SH3GLB1 22459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 87800631 87801610 87800748 Y NA LMO4 NA NA NA NA LMO4 8480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 89303069 89303193 89303134 Y GBP4,GBP2,GTF2B NA NA NA NA NA GTF2B 52434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90077145 90077551 90077320 Y ZNF326,LRRC8C LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 19080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90100291 90100368 90100330 Y NA LRRC8C NA NA NA NA LRRC8C 3660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90309838 90310280 90310072 Y LRRC8C,ZNF326 LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 25265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90319744 90319959 90319950 Y NA LRRC8D NA NA NA NA LRRC8D 35171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90372321 90372729 90372378 Y LRRC8B,LRRC8C,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 85151 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 90376424 90376756 90376561 Y LRRC8D,LRRC8D,ZNF326 NA NA NA NA NA GEMIN8P4 81124 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 91322848 91323191 91323185 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 7641 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 91361231 91361653 91361295 Y NA RP4-665J23.1 NA NA NA NA RP4-665J23.1 46024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 92183243 92183457 92183382 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 186435 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 92202579 92202753 92202666 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR3 167139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 93324554 93324784 93324669 Y NA RPL5 NA NA NA NA RPL5 28972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 93634565 93634982 93634927 Y MTF2 CCDC18,TMED5 NA NA NA NA CCDC18 8494 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94038553 94038921 94038737 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 126865 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 94084336 94084510 94084423 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 172648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94093325 94093611 94093590 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1L 181637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 94145547 94146118 94145739 Y NA NA NA NA NA NA MIR760 164270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 94158127 94158185 94158167 Y GCLM,DNTTIP2 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 152203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94158601 94159338 94158654 Y GCLM,DNTTIP2,BCAR3 NA BCAR3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 151050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 94201362 94201612 94201551 Y NA NA BCAR3,MIR760,DR1,DNTTIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MIR760 108776 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94244939 94245309 94245199 Y ARHGAP29,FNBP1L,BCAR3 NA BCAR3,MIR760,FNBP1L IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR760 65079 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94535371 94535770 94535449 Y ARHGAP29 NA NA NA NA NA GCLM 162405 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94712395 94712617 94712502 Y ARHGAP29 ARHGAP29 ABCA4,ARHGAP29,ABCD3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP29 26007 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 94795618 94795987 94795955 Y NA NA ARHGAP29,ABCA4,ABCD3 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGAP29 56994 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 95007995 95008302 95008221 Y NA F3 NA NA NA NA F3 2639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 96537517 96537524 96537521 Y NA NA NA NA NA NA EEF1A1P11 372962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 97596064 97596178 97596116 Y PTBP2 NA NA NA NA NA PTBP2 410843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 98011760 98012364 98012119 Y NA SEC63P1 NA NA NA NA SEC63P1 2503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 98518546 98518920 98518639 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 133941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 98642709 98642844 98642773 Y NA NA NA NA NA NA DPYD 258104 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 100678369 100678762 100678562 Y NA DBT NA NA NA NA DBT 34628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 101486133 101486158 101486151 Y NA RP11-421L21.3,DPH5 NA NA NA NA RP11-421L21.3 3276 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 108634261 108634637 108634400 Y NA NA VAV3 IMR90 Hi-C 24141950 SLC25A24 106834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 108741685 108742156 108741931 Y FAM102B SLC25A24 NA NA NA NA SLC25A24 214 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 109467804 109468470 109468110 Y GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1 AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 35636 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 109499781 109500180 109500079 Y NA AKNAD1,CLCC1 NA NA NA NA AKNAD1 3926 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 109572587 109572654 109572620 Y NA WDR47,TAF13 NA NA NA NA WDR47 10196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 110141142 110141149 110141146 Y NA AMPD2 NA NA NA NA AMPD2 15577 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 110271520 110271826 110271755 Y GSTM3 GSTM1,GSTM3 NA NA NA NA GSTM3 10558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 110406868 110407271 110407021 Y GNAI3,CSF1 CSF1 CSF1,GSTM2,GSTM4,GNAI3,AHCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 CSF1 43593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 110454846 110455290 110455005 Y GSTM2,CSF1 CSF1 NA NA NA NA CSF1 3982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 110879130 110879445 110879277 Y CSF1 RBM15,LAMTOR5-AS1 NA NA NA NA RBM15 2 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 111182665 111183078 111182779 Y LRIF1,CD53 KCNA3 KCNA3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNA3 32577 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 111230020 111230418 111230220 Y LRIF1,CD53 KCNA3 NA NA NA NA KCNA3 14365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 111981832 111982198 111982008 Y NA ATP5F1,WDR77 NA NA NA NA ATP5F1 7288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 112143517 112143622 112143594 Y CEPT1,CHI3L2 NA NA NA NA NA RAP1A 60677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 112163826 112164071 112163877 Y C1orf183,C1orf183,C1orf162,RAP1A NA NA NA NA NA RAP1A 80986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 112438367 112438956 112438733 Y NA NA NA NA NA NA FAM212B 141921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 114575988 114576152 114576061 Y NA NA SYT6 IMR90 Hi-C 24141950 OLFML3 55925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 115052481 115052766 115052572 Y BCAS2,TRIM33 TRIM33 NA NA NA NA TRIM33 700 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 115605190 115605611 115605404 Y BCAS2,SIKE1 TSPAN2,RP4-666F24.3 NA NA NA NA TSPAN2 24510 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 115722074 115722498 115722181 Y NGF NA NGF IMR90 Hi-C 24141950 RP4-666F24.3 81781 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 116088478 116088732 116088606 Y NA NA NGF,VANGL1,SYCP1 IMR90 Hi-C 24141950 VANGL1 93842 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 116920378 116921129 116920740 Y SLC22A15,ATP1A1,ATP1A1,CD58,ATP1A1 ATP1A1,ATP1A1OS NA NA NA NA ATP1A1 7088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 120188395 120188927 120188667 Y NA PHGDH NA NA NA NA ZNF697 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 120380695 120381105 120381020 Y NA NA NA NA NA NA PHGDH 180274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 142538903 142539547 142539454 Y NA NA NA NA NA NA RP11-417J8.3 77222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 144941125 144941602 144941408 Y NA RNU2-38P NA NA NA NA RNU2-38P 1070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 145065013 145065489 145065359 Y NA PDE4DIP,SEC22B NOTCH2NL,PDE4DIP,SEC22B,LOC653513,NBPF9,LOC728875,PFN1P2,NBPF10 IMR90 Hi-C 24141950 PDE4DIP 8697 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 145396760 145397198 145397044 Y NA RP11-458D21.1,RNVU1-6,TXNIP LIX1L,HFE2,ANKRD35,TXNIP,RBM8A,ANKRD34A,PIAS3,POLR3GL,GNRHR2,PEX11B,RNF115 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNVU1-6 16003 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 145455122 145455741 145455465 Y PDE4DIP,PDE4DIP,SEC22B,NOTCH2NL,NBPF10,CD160,TXNIP TXNIP,POLR3GL,ANKRD34A,LIX1L,RBM8A NA NA NA NA POLR3GL 12647 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 145519496 145519624 145519499 Y NBPF10,TXNIP LIX1L,RBM8A,RP11-315I20.1,GNRHR2,PEX11B,ITGA10 NA NA NA NA ITGA10 3267 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 145701524 145701615 145701570 Y NA NA NA NA NA NA RNF115 92488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 146956714 146956895 146956804 Y GPR89B NA NA NA NA NA BCL9 54287 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 147806841 147807184 147807140 Y NA RNU1-122P NA NA NA NA RNU1-122P 1955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr1 149138053 149138113 149138087 Y NA NA NA NA NA NA RP11-14N7.2 211731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 149816287 149817606 149817166 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H2AA4,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2BC 2733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 149820361 149820952 149820609 Y NA HIST2H2BF,HIST2H3D,HIST2H4A,HIST2H3C,HIST2H2AA3,HIST2H2BC,HIST2H3A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB NA NA NA NA HIST2H2AA4 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 150185878 150186128 150186012 Y HIST2H2AC,VPS45,RPRD2,ANP32E ANP32E,RNU2-17P NA NA NA NA ANP32E 20376 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 150585815 150586394 150586132 Y CDC42SE1,PLEKHO1,ANP32E,PRPF3,FAM63A,FAM63A,FAM63A,CTSS,MCL1 MCL1,ENSA NA NA NA NA ENSA 13694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 151344220 151344519 151344431 Y NA PI4KB,RP11-126K1.6,RFX5,SELENBP1,PSMB4 NA NA NA NA SELENBP1 1011 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 151422102 151422465 151422287 Y NA POGZ NA NA NA NA POGZ 7476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 151918166 151918684 151918434 Y NA THEM4,S100A10 S100A10,CELF3,THEM4,RORC,S100A11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 THEM4 37882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 151960875 151961433 151961102 Y S100A11,S100A10 S100A10 NA NA NA NA S100A10 3433 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 153824989 153825297 153825210 Y NA NA NA NA NA NA GATAD2B 68154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 153845025 153845089 153845058 Y NA GATAD2B NA NA NA NA GATAD2B 48362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 153936554 153936861 153936642 Y UBAP2L,HAX1,S100A16,SNAPIN,ILF2,JTB,CREB3L4 GATAD2B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9 NA NA NA NA CREB3L4 1149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 154154606 154155027 154154830 Y SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3 TPM3,UBAP2L,C1orf43 NA NA NA NA TPM3 10097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 154699087 154699216 154699140 Y NA NA NA NA NA NA ADAR 100612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 154728745 154728994 154728977 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 111762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 154782504 154782818 154782668 Y NA NA NA NA NA NA KCNN3 57938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 154957258 154957622 154957425 Y NA PMVK,PBXIP1,PYGO2,SHC1,FLAD1,ZBTB7B NA NA NA NA FLAD1 3444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 155164183 155164959 155164537 Y NA TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA NA NA NA NA MIR92B 1215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 155904830 155905033 155904931 Y NA RIT1,KIAA0907 NA NA NA NA KIAA0907 2639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156073854 156074351 156074085 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA MEX3A,LMNA LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LMNA 23490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 156095033 156095181 156095051 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA MEX3A,LMNA NA NA NA NA LMNA 44669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156103413 156103690 156103594 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,LMNA NA NA NA NA NA LMNA 53049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156118146 156118395 156118328 Y MEF2D,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,RIT1,ARHGEF2,ARHGEF2 SLC25A44 NA NA NA NA SLC25A44 43485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156426931 156427503 156427197 Y ARHGEF2,ARHGEF2,LMNA,SLC25A44,PMF1,C1orf182,SH2D2A,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 41117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156472693 156472952 156472780 Y LMNA,C1orf182,RRNAD1,MEF2D MEF2D NA NA NA NA MEF2D 4073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 156676478 156676824 156676750 Y C1orf85,PEAR1,CRABP2,CRABP2 RP11-284F21.7,NES,CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC NA NA NA NA CRABP2 2870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 157111103 157111381 157111197 Y RRNAD1,ETV3,ETV3 ETV3 NA NA NA NA ETV3 4837 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 157964633 157965029 157964831 Y OR10T2 KIRREL NA NA NA NA KIRREL 3570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 157980631 157980890 157980708 Y KIRREL KIRREL NA NA NA NA KIRREL 19568 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 158119500 158119689 158119553 Y NA ELL2P1,CD1D LOC646268,KIRREL,AIM2 IMR90 Hi-C 24141950 ELL2P1 25856 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 158146699 158147069 158146946 Y NA ELL2P1,CD1D NA NA NA NA CD1D 668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 158147244 158147839 158147743 Y NA ELL2P1 NA NA NA NA CD1D 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 159851477 159851987 159851825 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 NA NA NA NA CCDC19 15966 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 159859603 159860031 159859945 Y SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2 C1orf204,CCDC19,TAGLN2 C1orf204,SLAMF8 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC19 7922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr1 159880076 159880706 159880437 Y FCRL6,DCAF8,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA CCDC19 12123 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 159886226 159886307 159886250 Y NA CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 7215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 159892447 159892988 159892803 Y NCSTN,TAGLN2 CCDC19,TAGLN2,IGSF9 NA NA NA NA TAGLN2 534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 160982920 160983992 160983766 Y CD84,CD48,SLAMF7,CD244,NR1I3,FCGR2A,FCER1G,DEDD,DEDD,USF1,ARHGAP30 F11R,USF1 NA NA NA NA F11R 5146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 161359666 161360218 161359899 Y HSPA6,ATF6,ARHGAP30,FCER1G,FCGR2A C1orf192 NR1I3,APOA2,TOMM40L,SDHC,NDUFS2,ADAMTS4,UFC1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 24002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 161369073 161369991 161369486 Y NA C1orf192 ADAMTS4,NDUFS2,APOA2,TOMM40L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C1orf192 33409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 161502624 161502920 161502837 Y ADAMTS4,PCP4L1,C1orf192,OLFML2B NA NA NA NA NA C1orf192 166960 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 162539981 162540420 162539994 Y C1orf226,UHMK1,HSD17B7,UAP1 UAP1 NA NA NA NA UAP1 10658 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 163005587 163006022 163005933 Y UAP1,DDR2,RGS4,RGS4,RGS4,RGS4 RGS4 C1orf110 IMR90 Hi-C 24141950 RGS4 30543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 164717528 164717907 164717706 Y NA NA NA NA NA NA PBX1 194707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 165797615 165798367 165798308 Y UCK2 UCK2,TMCO1 NA NA NA NA TMCO1 2623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 166828089 166828463 166828188 Y POU2F1,POGK POGK,TADA1 NA NA NA NA TADA1 15101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 167135568 167135867 167135776 Y NA RP11-277B15.1 CD247,POU2F1,GPA33 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-277B15.1 5494 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 167322904 167323093 167323001 Y NA NA NA NA NA NA POU2F1 134838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 167424728 167425462 167425239 Y POU2F1,RCSD1,CD247 NA NA NA NA NA CREG1 95542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 168338134 168338331 168338175 Y NA NA NA NA NA NA TBX19 89856 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 168368318 168368620 168368438 Y TBX19 NA NA NA NA NA TBX19 120040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 168787153 168787165 168787159 Y NA NA NA NA NA NA DPT 90651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 171473011 171473311 171473138 Y NA PRRC2C NA NA NA NA PRRC2C 20360 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 172291507 172291926 172291559 Y NA NA NA NA NA NA PIGC 119304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 173447359 173447668 173447399 Y PRDX6 PRDX6 NA NA NA NA PRDX6 2954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 173909740 173909938 173909924 Y RC3H1,ZBTB37 NA NA NA NA NA GAS5 73720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 173958715 173958784 173958750 Y NA RC3H1,RP11-160H22.3 NA NA NA NA RC3H1 30651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 175094142 175094504 175094323 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0040 65631 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 175160901 175161109 175161018 Y KIAA0040,KIAA0040 KIAA0040 NA NA NA NA KIAA0040 766 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 179098871 179099008 179098957 Y NA NA NA NA NA NA TOR3A 50359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 181042855 181043067 181042961 Y NA MR1,IER5 NA NA NA NA IER5 12571 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 181074349 181074924 181074645 Y XPR1,IER5 IER5 NA NA NA NA IER5 18711 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr1 182854499 182854851 182854644 Y NA DHX9 NA NA NA NA DHX9 47995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 183248987 183249454 183249212 Y NCF2,NCF2,ARPC5,LAMC1 NA NA NA NA NA SMG7 189897 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 183811794 183811833 183811814 Y NCF2,NCF2 NA NA NA NA NA TSEN15 206978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 184033703 184034036 184033838 Y NA TSEN15 NA NA NA NA TSEN15 14892 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 184700299 184700688 184700567 Y NA EDEM3 NA NA NA NA EDEM3 21359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 184836042 184836526 184836376 Y EDEM3,TRMT1L,TRMT1L,SWT1,SWT1,IVNS1ABP,FAM129A NA NA NA NA NA FAM129A 105156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 186943840 186944382 186944105 Y PTGS2,PLA2G4A NA NA NA NA NA PLA2G4A 147755 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 197739507 197739631 197739601 Y NA DENND1B NA NA NA NA DENND1B 3195 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 198237796 198237952 198237874 Y NA NA NA NA NA NA NEK7 113703 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 200857233 200857815 200857711 Y KIF21B NA NA NA NA NA KIF21B 133013 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr1 201246115 201246382 201246194 Y PKP1 PKP1 PKP1,TMEM9,LAD1,TNNI1,IGFN1,TNNT2 IMR90 Hi-C 24141950 PKP1 4198 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 201472589 201472996 201472808 Y LMOD1,CSRP1,CSRP1,CSRP1 PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA RP11-134G8.7 1373 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 201508517 201509575 201509484 Y NA RP11-134G8.7,CSRP1 NA NA NA NA CSRP1 31933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 202003479 202003610 202003599 Y NA NA NA NA NA NA RNPEP 53979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203481982 203482534 203482093 Y BTG2,ATP2B4 PRELP NA NA NA NA PRELP 39026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203491011 203491485 203491466 Y PPFIA4,SNRPE PRELP NA NA NA NA PRELP 48055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203619380 203619832 203619595 Y BTG2,LAX1 ATP2B4 NA NA NA NA ATP2B4 25691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203789427 203789442 203789436 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 26645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203794311 203794511 203794411 Y NA ZC3H11A,SNRPE NA NA NA NA ZC3H11A 31529 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 203965652 203965916 203965843 Y NA NA ETNK2,SNRPE,LINC00303,SOX13 IMR90 Hi-C 24141950 SOX13 74327 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 204098794 204099127 204098964 Y NA ETNK2,REN NA NA NA NA ETNK2 20180 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 204238647 204239007 204238820 Y GOLT1A,PLEKHA6 NA NA NA NA NA KISS1 75033 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 204289566 204289863 204289752 Y SOX13,PPP1R15B NA NA NA NA NA PLEKHA6 54930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 204317952 204318184 204318134 Y ETNK2,PIK3C2B PLEKHA6 NA NA NA NA PLEKHA6 26609 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 205512470 205512827 205512691 Y NA CDK18,RNU2-19P NA NA NA NA RNU2-19P 21017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 206677196 206677895 206677559 Y NA IKBKE,RASSF5,RP11-534L20.4 NA NA NA NA RASSF5 984 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 206910483 206910789 206910591 Y RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2 NA NA NA NA NA MAPKAPK2 54194 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 207064076 207064429 207064213 Y NA IL24 NA NA NA NA IL24 4359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 207069223 207069337 207069332 Y NA IL24 NA NA NA NA IL24 435 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 207509006 207509478 207509176 Y CR1,CD46,CD55 CD55 NA NA NA NA CD55 16153 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 208135157 208135309 208135233 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 52410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 208136912 208137268 208137107 Y NA NA CD34,LOC148696,MIR29B2,MIR29C,PLXNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD34 54165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 208443226 208443424 208443350 Y NA PLXNA2 PLXNA2,CD34 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA2 27561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 209942657 209943400 209942924 Y LAMB3,G0S2,TRAF3IP3 RP1-28O10.1,C1orf74 NA NA NA NA C1orf74 12504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 211035320 211035533 211035504 Y NA NA NA NA NA NA RP11-543B16.1 309286 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 211688648 211688771 211688711 Y NA NA NEK2,RCOR3,TRAF5,LINC00467,RD3,SLC30A1,INTS7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC30A1 61313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 211786767 211786829 211786805 Y NA SLC30A1 SLC30A1,NEK2 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SLC30A1 36683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 211837893 211837920 211837910 Y NA NEK2 NA NA NA NA NEK2 9040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 211912030 211912428 211912229 Y NA NA NA NA NA NA NEK2 65070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 211976591 211977124 211977068 Y NA LPGAT1 NA NA NA NA LPGAT1 24990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 212102475 212102639 212102508 Y NA NA NA NA NA NA LPGAT1 100361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 212261904 212262125 212262011 Y PPP2R5A RPL21P28 NA NA NA NA RPL21P28 38533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 212659054 212659720 212659497 Y ATF3,ATF3,ATF3 NA ATF3,FAM71A,ANGEL2,NSL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NENF 54825 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 212731490 212732709 212732386 Y NA ATF3 ATF3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ATF3 3967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr1 212780782 212781279 212780943 Y NA ATF3 NA NA NA NA ATF3 44106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 212866755 212867095 212867036 Y BATF3 BATF3 NA NA NA NA BATF3 4232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 214601098 214601566 214601506 Y PTPN14 NA NA NA NA NA PTPN14 122226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 214614555 214614760 214614639 Y NA NA NA NA NA NA PTPN14 109032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 215198285 215198630 215198297 Y KCNK2,KCNK2 KCNK2 NA NA NA NA KCNK2 21167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 216774004 216774285 216774188 Y ESRRG,ESRRG NA NA NA NA NA GPATCH2 1028139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 218553747 218554148 218553928 Y NA RP11-224O19.2,TGFB2 NA NA NA NA TGFB2 36170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 219547203 219547495 219547349 Y NA NA LOC728463,TGFB2 IMR90 Hi-C 24141950 LYPLAL1 202017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 220427006 220427444 220427299 Y NA MORF4L1P1,RAB3GAP2 NA NA NA NA MORF4L1P1 2094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 221916049 221916599 221916319 Y DUSP10,DUSP10 DUSP10 NA NA NA NA DUSP10 2531 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 222502119 222502129 222502124 Y NA NA DUSP10 IMR90 Hi-C 24141950 HHIPL2 217316 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 223326849 223326980 223326946 Y NA NA TLR5,SUSD4,CAPN8 IMR90 Hi-C 24141950 DISP1 340443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 223901276 223901546 223901311 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 13981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 223914239 223914747 223914523 Y TP53BP2,FBXO28,CAPN2 CAPN2 NA NA NA NA CAPN2 26944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 223964690 223965055 223964731 Y TP53BP2,FBXO28 NA NA NA NA NA TP53BP2 66619 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 224180261 224180516 224180350 Y NA NA NA NA NA NA FBXO28 119273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.94675893859047 chr1 224598124 224598418 224598271 Y WDR26 CNIH3,WDR26 NA NA NA NA CNIH3 21944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 224924541 224924939 224924681 Y NA NA NA NA NA NA DNAH14 157025 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 225895377 225895885 225895482 Y ENAH RP11-145A3.1 ENAH,TMEM63A,SRP9,EPHX1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-145A3.1 9071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 226007337 226007385 226007361 Y NA SRP9,EPHX1 NA NA NA NA EPHX1 11543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 226443007 226443187 226443097 Y NA NA NA NA NA NA LIN9 52383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 226890865 226891416 226891300 Y ITPKB ITPKB NA NA NA NA ITPKB 33608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr1 227976197 227976490 227976208 Y NA NA NA NA NA NA JMJD4 55085 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 228782602 228782886 228782775 Y NA NA NA NA NA NA RHOU 85938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 228783266 228783899 228783495 Y C1orf35,TRIM11,HIST3H2A,RHOU NA NA NA NA NA RHOU 84925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.74080481846561 chr1 228962635 228963190 228962905 Y RHOU NA NA NA NA NA RHOU 93811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 229409656 229409997 229409713 Y RAB4A RP5-1061H20.4,RAB4A NA NA NA NA RAB4A 4834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 229473732 229474385 229474330 Y NA NA NA NA NA NA RAB4A 68910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 229601636 229601883 229601761 Y NA ACTA1,NUP133,RP4-613A2.1 NA NA NA NA ACTA1 33791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 229825145 229825279 229825212 Y NA NA TAF5L,URB2,GALNT2,PGBD5 IMR90 Hi-C 24141950 URB2 65164 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 230089577 230089803 230089690 Y NA NA NA NA NA NA GALNT2 101733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 230561990 230562633 230562303 Y NA NA NA NA NA NA COG2 213602 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 231868761 231869568 231868969 Y NA NA NA NA NA NA DISC1 108200 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 232671774 232671885 232671830 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-74P 294048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 232765644 232766127 232765957 Y NA NA TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2 IMR90 Hi-C 24141950 RNU1-74P 199806 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 25.7635652935767 chr1 233249275 233249581 233249334 Y NA NA NA NA NA NA NTPCR 164924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234163168 234163347 234163228 Y SLC35F3 NA NA NA NA NA SLC35F3 124489 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234275805 234276023 234275906 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827C21.1 214864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 234658291 234658851 234658374 Y NA TARBP1,RP5-855F14.1 NA NA NA NA RP5-855F14.1 6674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 234669721 234669929 234669823 Y NA RP5-855F14.1 LOC100506795 K562 ChIA-PET 22265404 RP5-855F14.1 4196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234728712 234729023 234728867 Y NA IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 14248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234738546 234738834 234738624 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4437 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 234748100 234748931 234748566 Y IRF2BP2 IRF2BP2 NA NA NA NA IRF2BP2 4829 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 234852227 234852379 234852265 Y NA NA LOC100506810,TARBP1,LOC100506795,IRF2BP2,LINC00184,TOMM20 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2BP2 108956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234857710 234858181 234857899 Y NA NA NA NA NA NA IRF2BP2 114439 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 234914073 234914641 234914410 Y IRF2BP2 NA IRF2BP2,LOC100506795,LINC00184,LOC100506810,TOMM20,RBM34 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 IRF2BP2 170802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 235097868 235098070 235097979 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,TARBP1,LOC100506795 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 16481 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 235120162 235120433 235120341 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B RP11-443B7.3 IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-443B7.3 5611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 235186710 235186949 235186846 Y ARID4B NA LOC100506795,LOC100506810,LINC00184,IRF2BP2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-443B7.3 72159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 235242252 235242564 235242410 Y IRF2BP2,ARID4B,ARID4B SNORA14B,TOMM20 IRF2BP2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SNORA14B 46688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 235484403 235484795 235484782 Y NA GGPS1,ARID4B,TBCE NA NA NA NA GGPS1 3870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 236039869 236040195 236039976 Y LYST LYST LYST,GNG4 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 4745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 236115118 236115321 236115175 Y LYST NA LYST,B3GALNT2,NID1 IMR90 Hi-C 24141950 LYST 70178 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 236179538 236179652 236179595 Y NA NID1 NA NA NA NA NID1 46810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 236430059 236430250 236430155 Y NA ERO1LB NA NA NA NA ERO1LB 13069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 236866415 236866949 236866639 Y NA ACTN2 NA NA NA NA ACTN2 18661 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 237634251 237634535 237634324 Y NA NA NA NA NA NA RPL35P1 491614 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr1 240306412 240306787 240306695 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 24668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 240306890 240307603 240307416 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 23852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr1 240308207 240308537 240308375 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22918 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 240308546 240308862 240308776 Y NA ADH5P3 NA NA NA NA ADH5P3 22593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 242108255 242108348 242108324 Y NA NA EXO1 IMR90 Hi-C 24141950 EXO1 98986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr1 244210956 244211944 244211575 Y NA NA NA NA NA NA AKT3 198575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr1 244462616 244463099 244462949 Y AKT3,AKT3,ADSS NA AKT3,SDCCAG8,LOC339529,C1orf100,ADSS IMR90 Hi-C 24141950 ADSS 150337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 244613820 244614139 244614120 Y NA ADSS,C1orf101 NA NA NA NA ADSS 384 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 246061196 246061440 246061372 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 607174 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr1 246317158 246317459 246317368 Y NA NA NA NA NA NA SMYD3 351155 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 246436053 246436378 246436216 Y SMYD3,SMYD3 NA NA NA NA NA SMYD3 232236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 246763574 246763751 246763579 Y NA TFB2M,CNST NA NA NA NA CNST 35828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 247035132 247035504 247035470 Y CNST,ZNF669,AHCTF1 NA NA NA NA NA AHCTF1 57776 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 247093396 247093478 247093437 Y NA AHCTF1 NA NA NA NA AHCTF1 116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr1 248894360 248894532 248894495 Y NA NA NA NA NA NA MIR3124 224044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr1 249157308 249157673 249157562 Y OR14I1,ZNF672,ZNF692,ZNF692 MIR3124,SH3BP5L,ZNF672,ZNF692,PGBD2 NA NA NA NA ZNF692 5965 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 729218 729515 729367 Y NA DIP2C NA NA NA NA DIP2C 4168 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 3137708 3138098 3138049 Y NA PFKP NA NA NA NA PFKP 31183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 3306877 3306999 3306944 Y NA NA LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 93874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 3441336 3441600 3441518 Y NA NA LOC338588,LOC100216001,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 228333 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.85043701120423 chr10 3497590 3497951 3497729 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 PITRM1 284587 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 3509617 3509911 3509759 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 296614 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 3510310 3510716 3510597 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PITRM1 297307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 3845250 3845852 3845788 Y KLF6 KLF6 LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 19777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 3893365 3894190 3893886 Y KLF6 NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 67892 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 3896143 3896475 3896326 Y NA NA LOC100216001,LOC338588,KLF6 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF6 70670 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 4283808 4284356 4284092 Y NA NA KLF6,LOC100216001,LOC338588 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr10 4289203 4289519 4289251 Y NA LINC00702 KLF6,LOC338588,LOC100216001 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 5099 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 4358748 4358982 4358870 Y NA NA KLF6 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00702 74644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 4713647 4713873 4713697 Y NA LINC00704 NA NA NA NA LINC00704 4473 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 5333644 5334212 5333929 Y NA NA AKR1E2,tAKR IMR90 Hi-C 24141950 RP13-463N16.6 301869 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 5783071 5783414 5783247 Y NA NA GDI2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM208B 58270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6078858 6079339 6079180 Y PFKFB3,PFKFB3,RBM17,RBM17,IL2RA RBM17 NA NA NA NA RBM17 49611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6206285 6206560 6206485 Y NA PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 21404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6212827 6212938 6212883 Y FBXO18 PFKFB3 NA NA NA NA PFKFB3 27946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6245814 6246792 6246043 Y PFKFB3,PFKFB3 NA NA NA NA NA PFKFB3 60933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr10 6443408 6443712 6443449 Y PFKFB3,PFKFB3 NA IL2RA,PFKFB3,LOC399715,FBXO18,RBM17,IL15RA,PRKCQ IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PFKFB3 258527 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6449763 6450038 6449901 Y PRKCQ NA NA NA NA NA PFKFB3 264882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 6836289 6836715 6836468 Y NA NA NA NA NA NA PFKFB3 651408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 10631619 10631869 10631724 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 1019884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 10872581 10872970 10872768 Y NA NA SFTA1P,CELF2 IMR90 Hi-C 24141950 USP6NL 778783 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 11017838 11018101 11017971 Y NA NA NA NA NA NA USP6NL 633652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 11969895 11970071 11969983 Y NA PROSER2-AS1 NA NA NA NA PROSER2-AS1 35196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 12490797 12491318 12490959 Y SEC61A2,CAMK1D NA NA NA NA NA CAMK1D 101316 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 13692317 13692641 13692563 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 65390 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 13908290 13908478 13908416 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 281363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr10 13915234 13915426 13915347 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 288307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 14015733 14016130 14015958 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 388806 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 14031797 14031930 14031864 Y FRMD4A NA NA NA NA NA PRPF18 404870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 14053069 14053428 14053261 Y NA NA NA NA NA NA PRPF18 426142 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 14066158 14066580 14066511 Y NA NA NA NA NA NA FRMD4A 435561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 14605482 14605831 14605731 Y HSPA14,DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 103341 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 14624029 14624329 14624184 Y DCLRE1C NA NA NA NA NA FRMD4A 121888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 15191044 15191371 15191092 Y MEIG1,NMT2,C10orf111 NMT2 NA NA NA NA NMT2 17321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 17044035 17044524 17044318 Y VIM,TRDMT1,ST8SIA6 NA NA NA NA NA RSU1 186508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 17068694 17069080 17068926 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 172973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 17105178 17105416 17105257 Y NA NA NA NA NA NA TRDMT1 136637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 17248953 17248971 17248962 Y TRDMT1,VIM TRDMT1,VIM,RP11-124N14.3 TRDMT1,CUBN,VIM K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TRDMT1 6900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 17384125 17384326 17384225 Y VIM NA NA NA NA NA RP11-124N14.3 109293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 17707752 17708081 17707913 Y VIM,ST8SIA6,STAM STAM NA NA NA NA STAM 23628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 21386477 21386751 21386615 Y NA NA NA NA NA NA NEBL 74365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 21581688 21582509 21582285 Y NA NA C10orf114,C10orf140,MLLT10,PIP4K2A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-275N1.1 77370 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 21816029 21816444 21816223 Y NA MLLT10 NA NA NA NA MLLT10 4650 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 21991974 21992366 21992143 Y NA NA NA NA NA NA MLLT10 170880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 22629825 22629981 22629966 Y DNAJC1 COMMD3,BMI1 NA NA NA NA BMI1 21685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 23801336 23801634 23801483 Y OTUD1 NA NA NA NA NA OTUD1 75138 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 24498955 24499204 24499146 Y KIAA1217 NA NA NA NA NA ARHGAP21 511393 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 24993053 24993414 24993236 Y GPR158,ARHGAP21 ARHGAP21 NA NA NA NA ARHGAP21 17183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 25786270 25786305 25786288 Y NA NA NA NA NA NA THNSL1 482683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 26191189 26191209 26191199 Y NA NA NA NA NA NA APBB1IP 533923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 27531769 27532240 27532024 Y ABI1,ANKRD26,YME1L1,MASTL,ACBD5 ACBD5 NA NA NA NA ACBD5 2710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 29196228 29196432 29196257 Y BAMBI NA BAMBI,LYZL1 IMR90 Hi-C 24141950 BAMBI 231957 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 29924706 29925406 29925356 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 98304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 29970673 29971027 29970896 Y SVIL NA NA NA NA NA SVIL 52683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 30471622 30471929 30471877 Y KIAA1462 NA KIAA1462,SVIL IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1462 69199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 31073492 31073855 31073655 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1-AS1,ZEB1,ZNF438 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 245011 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 31422679 31422989 31422772 Y ZNF438,ZNF438 NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 103813 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr10 31423488 31423889 31423800 Y NA NA ARHGAP12,ZEB1,ZNF438,ZEB1-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF438 104622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 31892273 31892723 31892643 Y NA NA ZEB1 IMR90 Hi-C 24141950 ZEB1-AS1 284897 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 32048872 32049424 32049213 Y ZEB1,KIF5B NA ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP12 166318 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr10 32316515 32316560 32316538 Y NA KIF5B NA NA NA NA KIF5B 26799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 32438322 32438553 32438446 Y NA NA KIF5B,ARHGAP12,EPC1 IMR90 Hi-C 24141950 KIF5B 94963 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 32621222 32621521 32621374 Y ARHGAP12,CCDC7,C10orf68,EPC1 EPC1 NA NA NA NA EPC1 44205 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 33250851 33251304 33251058 Y NA RP11-462L8.1,ITGB1 NA NA NA NA RP11-462L8.1 5078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 33415871 33415993 33415948 Y NA NA ITGB1 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB1 123151 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 33547800 33548221 33548104 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 74969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 33560971 33561296 33561097 Y NA NA NA NA NA NA NRP1 61894 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 34569605 34569879 34569742 Y NA NA NA NA NA NA RP11-8L18.3 381150 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 35059349 35059608 35059479 Y NA PARD3 NA NA NA NA PARD3 42645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 43633157 43633403 43633253 Y RASGEF1A CSGALNACT2 NA NA NA NA CSGALNACT2 1223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr10 43950893 43951349 43951098 Y NA HNRNPF,RP11-517P14.2 NA NA NA NA RP11-517P14.2 36707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 44185624 44185942 44185694 Y NA ZNF32 NA NA NA NA ZNF32 43320 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 45453721 45453921 45453864 Y ALOX5 RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA RASSF4 866 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 45470476 45470795 45470517 Y NA RASSF4,C10orf10,ZNF22,C10orf25 NA NA NA NA C10orf10 1463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 47008240 47008359 47008300 Y GPRIN2 SYT15 NA NA NA NA SYT15 38840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 47129494 47129670 47129546 Y SYT15,PPYR1 NA NA NA NA NA SYT15 160094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 50595145 50595278 50595227 Y C10orf128 NA NA NA NA NA PGBD3 149808 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 54471417 54471775 54471523 Y NA RP11-556E13.1 NA NA NA NA RP11-556E13.1 41394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 54484465 54484478 54484473 Y NA RP11-556E13.1 NA NA NA NA RP11-556E13.1 28691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 56854357 56854710 56854534 Y NA NA NA NA NA NA MTRNR2L5 502040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 60949726 60949909 60949819 Y NA NA NA NA NA NA BICC1 678826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 63663540 63663817 63663641 Y ARID5B ARID5B NA NA NA NA ARID5B 4481 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 65125268 65125651 65125502 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 59406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 65128612 65128923 65128710 Y NA NA NA NA NA NA PRELID1P3 56134 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 65226977 65227255 65227116 Y NA PRELID1P3,JMJD1C NA NA NA NA JMJD1C 3255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 65389747 65390882 65390384 Y NA NA NA NA NA NA REEP3 110624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr10 65649061 65649074 65649064 Y NA RP11-170M17.2 NA NA NA NA RP11-170M17.2 11931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 65930110 65930546 65930307 Y NA NA NA NA NA NA RP11-170M17.2 269105 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 69609160 69609390 69609211 Y NA DNAJC12,SIRT1 SIRT1 K562 ChIA-PET 22265404 DNAJC12 13236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 69822197 69822546 69822385 Y NA HERC4,MYPN NA NA NA NA HERC4 10559 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 70088080 70088572 70088236 Y SIRT1,PBLD,HNRNPH3 HNRNPH3,PBLD NA NA NA NA HNRNPH3 359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 70735854 70735920 70735884 Y CCAR1,SUPV3L1,DDX50,DDX21 DDX21,KIAA1279 KIAA1279 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA1279 10567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 70821151 70821852 70821361 Y DDX21,VPS26A,SRGN SRGN KIAA1279,DDX21,SRGN,VPS26A,SUPV3L1 IMR90 Hi-C 24141950 SRGN 24010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 71626507 71626840 71626632 Y COL13A1 NA NA NA NA NA COL13A1 66863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 71928097 71928630 71928606 Y NA AIFM2,TYSND1 TYSND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SAR1A 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 72435631 72435850 72435741 Y ADAMTS14 ADAMTS14 NA NA NA NA ADAMTS14 5072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 73528339 73528873 73528813 Y CDH23,SPOCK2,C10orf54,C10orf105 C10orf54 NA NA NA NA C10orf54 2382 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 73595852 73596345 73596141 Y C10orf54,PSAP PSAP CDH23 IMR90 Hi-C 24141950 PSAP 12781 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 74014911 74015029 74015003 Y NA ANAPC16,ASCC1,DDIT4 NA NA NA NA DDIT4 16649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 74289425 74289733 74289722 Y NA NA NA NA NA NA MICU1 94166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 75240023 75240096 75240089 Y NA RP11-137L10.6,PPP3CB NA NA NA NA RP11-137L10.6 13187 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 75768391 75768772 75768419 Y NA VCL NA NA NA NA VCL 12519 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 76633406 76633470 76633438 Y NA NA NA NA NA NA KAT6B 50066 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 77164585 77164731 77164659 Y ZNF503 ZNF503 NA NA NA NA ZNF503 4921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 79098837 79098943 79098890 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 297410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 79324798 79325050 79324993 Y NA NA NA NA NA NA KCNMA1 71303 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 79346819 79347304 79347005 Y KCNMA1 KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 49049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 79389440 79389814 79389806 Y NA KCNMA1 NA NA NA NA KCNMA1 6539 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 79685177 79685609 79685373 Y NA DLG5 NA NA NA NA DLG5 799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr10 80166856 80166996 80166943 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987 IMR90 Hi-C 24141950 RPS24 375338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 80516479 80516892 80516667 Y ZMIZ1 NA LOC283050,RPS24,ZMIZ1,POLR3A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZMIZ1 309900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 80626499 80626705 80626607 Y NA NA LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A IMR90 Hi-C 24141950 ZMIZ1 200087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 80684242 80684460 80684352 Y NA NA NA NA NA NA ZMIZ1 142332 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 80732492 80734123 80733460 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 92669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 80737664 80737999 80737882 Y ZMIZ1,PPIF NA NA NA NA NA ZMIZ1 88793 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 80841621 80841843 80841705 Y NA ZMIZ1 NA NA NA NA ZMIZ1 14829 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 81085771 81086240 81085963 Y ZMIZ1,PPIF PPIF NA NA NA NA PPIF 18985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 82260440 82261008 82260524 Y TSPAN14 TSPAN14,RP11-137H2.4 NA NA NA NA RP11-137H2.4 32690 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 85324845 85324972 85324948 Y NA NA NA NA NA NA HMGN2P8 514213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 88471302 88471860 88471725 Y LDB3,LDB3,LDB3 BMPR1A NA NA NA NA BMPR1A 42547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 88713984 88714363 88714198 Y SNCG SNCG,MMRN2,AGAP11 NA NA NA NA SNCG 2012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 89827526 89827767 89827673 Y KLLN,PTEN NA PTEN,RNLS,KLLN IMR90 Hi-C 24141950 RP11-380G5.3 124267 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 89876323 89876522 89876471 Y KLLN,PTEN NA PTEN,KLLN,RNLS,ATAD1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-380G5.3 173064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 90689067 90689322 90689158 Y NA NA NA NA NA NA STAMBPL1 51576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 90844295 90844413 90844369 Y NA NA FAS,LIPA,CH25H IMR90 Hi-C 24141950 ACTA2 95148 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 90846894 90847268 90847248 Y LIPA,CH25H NA CH25H,LIPA IMR90 Hi-C 24141950 ACTA2 97747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 92783161 92783490 92783369 Y NA NA PCGF5,ANKRD1 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD1 104128 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 92921990 92922253 92922075 Y HECTD2 NA ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 55655 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 92923893 92924265 92924064 Y NA NA RPP30,NUDT9P1,PCGF5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PCGF5 53643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 93367671 93367850 93367762 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 22961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 93373465 93373915 93373562 Y PPP1R3C PPP1R3C NA NA NA NA PPP1R3C 16896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 94351391 94351691 94351485 Y CPEB3 IDE,KIF11 NA NA NA NA KIF11 348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 94459466 94459797 94459609 Y HHEX HHEX NA NA NA NA HHEX 13521 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 94516915 94517155 94517045 Y HHEX,EXOC6 NA EXOC6,KIF11,HHEX IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HHEX 70970 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 94831659 94831948 94831694 Y CYP26A1,CYP26A1 CYP26A1 NA NA NA NA CYP26A1 427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 95145053 95145431 95145242 Y NA NA NA NA NA NA MYOF 94643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 95196959 95197603 95197264 Y NA MYOF NA NA NA NA MYOF 42471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 95205346 95205630 95205524 Y NA MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 34444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 95225325 95225770 95225711 Y MYOF MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 14304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 95228207 95228553 95228471 Y MYOF,CEP55,CEP55 MYOF,CEP55 NA NA NA NA MYOF 11521 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 97809134 97809259 97809196 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 7983 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 97809290 97809583 97809571 Y NA CCNJ,ENTPD1-AS1 NA NA NA NA CCNJ 8139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 102284617 102284981 102284927 Y NA HIF1AN,SEC31B,NDUFB8 NA NA NA NA HIF1AN 1848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 104364219 104364413 104364273 Y NA TRIM8 NA NA NA NA TRIM8 37840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 104401686 104402330 104401988 Y NA NA NA NA NA NA TRIM8 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr10 104545681 104545915 104545784 Y NT5C2,NFKB2,NFKB2,NFKB2,C10orf32 NA NA NA NA NA C10orf32 66065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 104903006 104903392 104903228 Y C10orf32,NT5C2 NT5C2 NA NA NA NA NT5C2 47664 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 105532054 105532211 105532109 Y NA NA NA NA NA NA SH3PXD2A 81090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 105681714 105681858 105681786 Y NA OBFC1,SLK NA NA NA NA OBFC1 5751 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 111725333 111725444 111725334 Y NA XPNPEP1,ADD3 NA NA NA NA ADD3 28682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 112158460 112158738 112158533 Y DUSP5 NA SMC3,DUSP5 IMR90 Hi-C 24141950 SMNDC1 95751 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 114139786 114140040 114139910 Y VTI1A,ACSL5,ACSL5 ACSL5 NA NA NA NA ACSL5 8010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 114715800 114716132 114715855 Y NA TCF7L2 NA NA NA NA TCF7L2 7791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 115033380 115033572 115033427 Y TCF7L2 NA TECTB,GUCY2GP,VTI1A IMR90 Hi-C 24141950 TCF7L2 325371 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 119028396 119028853 119028412 Y SLC18A2 NA NA NA NA NA PDZD8 104125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 120072477 120072945 120072874 Y NA FAM204A NA NA NA NA FAM204A 26895 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 121161203 121161864 121161442 Y EIF3A NA NA NA NA NA RGS10 138356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 121829686 121829950 121829715 Y NA NA NA NA NA NA NACAP2 74465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 123626359 123626403 123626376 Y NA NA NA NA NA NA ATE1-AS1 59424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 123900798 123900950 123900924 Y TACC2 NA NA NA NA NA TACC2 154109 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 124067478 124067825 124067684 Y NA NA NA NA NA NA PLEKHA1 64387 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 124196519 124196712 124196524 Y TACC2,PLEKHA1,PLEKHA1,PLEKHA1 HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 22329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 124246598 124247224 124247089 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 27557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 124254349 124254758 124254614 Y NA HTRA1 NA NA NA NA HTRA1 35308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr10 125935063 125935400 125935231 Y NA NA NA NA NA NA CHST15 83857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 126029584 126030073 126029818 Y CHST15 NA HMX3 IMR90 Hi-C 24141950 OAT 75472 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 126212520 126212862 126212532 Y NA RPS10P18 NA NA NA NA RPS10P18 35373 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 126315526 126315929 126315823 Y FAM53B NA NA NA NA NA FAM53B 114909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 127574091 127574564 127574346 Y NA RNU2-42P,DHX32,FANK1 NA NA NA NA RNU2-42P 2683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 128351863 128352142 128352116 Y NA NA FANK1 IMR90 Hi-C 24141950 DOCK1 239836 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 128592998 128593177 128593088 Y NA DOCK1 NA NA NA NA DOCK1 1020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 128947297 128947480 128947351 Y NA NA NA NA NA NA DOCK1 355319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 132099901 132100191 132100002 Y NA NA NA NA NA NA GLRX3 167238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 133794080 133794414 133794353 Y NA BNIP3 PPP2R2D IMR90 Hi-C 24141950 BNIP3 645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr10 133879247 133879524 133879406 Y NA NA BNIP3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BNIP3 85812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr10 134043390 134043516 134043464 Y JAKMIP3 DPYSL4 NA NA NA NA DPYSL4 44986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 134122010 134122092 134122081 Y NA STK32C,LRRC27 DPYSL4 IMR90 Hi-C 24141950 STK32C 21259 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 134330832 134331178 134331005 Y NA INPP5A INPP5A,ADAM8,C10orf91 IMR90 Hi-C 24141950 INPP5A 18146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 134360968 134361428 134361255 Y INPP5A INPP5A NA NA NA NA INPP5A 11644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr10 135119353 135119734 135119518 Y ADAM8,TUBGCP2 ZNF511,TUBGCP2,PRAP1 NA NA NA NA ZNF511 245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 316965 317318 317187 Y SIRT3,SIGIRR,SIGIRR,LRRC56,ANO9,ATHL1,IFITM1 NLRP6,RP11-326C3.2,ATHL1,IFITM2,IFITM1,IFITM3 NA NA NA NA IFITM1 5459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 355877 356724 356385 Y NA IFITM1,IFITM3,B4GALNT4,PKP3 IFITM1,IFITM2,RIC8A,BET1L,ATHL1,PKP3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 B4GALNT4 11072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr11 368352 368730 368427 Y NA IFITM3,B4GALNT4,PKP3,SIGIRR NA NA NA NA B4GALNT4 556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 469770 469895 469845 Y B4GALNT4,CEND1 PTDSS2,RNH1 NA NA NA NA PTDSS2 23502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 589256 589485 589371 Y SIGIRR RASSF7,C11orf35,MIR210HG,PHRF1,IRF7 NA NA NA NA PHRF1 14770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 629192 629570 629436 Y IRF7,IRF7,SCT,DRD4 IRF7 NA NA NA NA IRF7 15193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 741538 741804 741722 Y IRF7,IRF7 TMEM80,DEAF1,TALDO1,PDDC1,AP006621.5,CEND1 NA NA NA NA TALDO1 3525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 840856 841090 840896 Y NA SLC25A22,RPLP2,PIDD,PNPLA2,CD151,AP006621.8,POLR2L,TSPAN4 NA NA NA NA TSPAN4 48 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 926738 926879 926801 Y BRSK2,CEND1,AP2A2 CHID1,AP2A2 NA NA NA NA AP2A2 3844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 1357863 1358286 1357997 Y TOLLIP,BRSK2 TOLLIP TOLLIP,LOC255512 K562 ChIA-PET 22265404 TOLLIP 28979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 1404202 1404317 1404259 Y IFITM10,DUSP8 BRSK2 TOLLIP,LOC255512,MUC5B,BRSK2,MOB2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BRSK2 4812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 1543133 1543339 1543203 Y NA DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 47811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 1595832 1596187 1595959 Y NA DUSP8 NA NA NA NA DUSP8 4682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 1726957 1727350 1727237 Y IFITM10 IFITM10 NA NA NA NA IFITM10 42471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 1989837 1990190 1989954 Y IGF2,TSSC4,TH,IGF2,IGF2 MRPL23,H19 NA NA NA NA MRPL23 23329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 2717684 2718130 2717946 Y TSSC4,TRPM5,KCNQ1 KCNQ1OT1 NA NA NA NA KCNQ1OT1 1094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 2913617 2913951 2913751 Y NA CDKN1C,SLC22A18,SLC22A18AS,PHLDA2 NA NA NA NA SLC22A18 5000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 3090855 3091125 3090991 Y NA RNU1-91P,CARS NA NA NA NA CARS 14012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 3742975 3743362 3743342 Y NA NA NA NA NA NA PGAP2 73592 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 3918054 3918451 3918253 Y NA STIM1,MIR4687 NA NA NA NA MIR4687 42762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 4232015 4232345 4232181 Y OR52M1,OR52K2,OR52K1,OR51D1,C11orf40,OR52I1 NA OR52M1,TRIM68,OR52I1 IMR90 Hi-C 24141950 RRM1 118078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 5567409 5567542 5567475 Y OR52J3,OR52E2,OR52A1,OR51V1,OR51B2,OR51B6,OR51M1,OR51Q1,OR52E4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR56B1,OR52N4,OR52E8,OR56A5,OR56A4,OR52N5,OR52N1,OR52D1,OR52H1 HBE1,TRIM6,TRIM6-TRIM34 NA NA NA NA HBE1 42562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 6723829 6724231 6724032 Y NA DCHS1,MRPL17,GVINP1 NA NA NA NA MRPL17 21197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 6958348 6958743 6958546 Y NA ZNF215 NA NA NA NA ZNF215 12713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 7426320 7426390 7426356 Y SYT9 NA NA NA NA NA OLFML1 78229 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 8041450 8041887 8041518 Y OR10A3,RIC3,TUB,TUB TUB,RP11-236J17.6 TUB IMR90 Hi-C 24141950 TUB 2659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 8273804 8274153 8274013 Y NA NA NA NA NA NA RIC3 85202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 8727919 8728019 8727969 Y ASCL3 RPL27A NA NA NA NA RPL27A 25961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 9017468 9017784 9017768 Y NA TMEM9B-AS1,TMEM9B,NRIP3 NA NA NA NA NRIP3 5812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 9385760 9386326 9386092 Y ZNF143,SWAP70,TMEM9B,NRIP3,DENND5A,TMEM41B,IPO7 IPO7 ZNF143,IPO7,TMEM41B,DENND5A,KRT8P41,SCUBE2,LOC644656 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IPO7 17843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr11 9587499 9588027 9587720 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1 ZNF143,LOC644656 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 WEE1 5201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 9590279 9590748 9590469 Y WEE1,WEE1 WEE1 LOC644656,ZNF143 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 WEE1 2480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 9623030 9623285 9623166 Y ZNF143,WEE1,WEE1 WEE1 NA NA NA NA WEE1 29802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 9635436 9636077 9635827 Y DENND5A,ZNF143,WEE1,SWAP70 WEE1,SWAP70 WEE1,LOC644656,ZNF143,SBF2,ADM,SWAP70,LOC283104,LOC440028 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WEE1 42208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 9907928 9908258 9908093 Y NA NA SWAP70,LOC440028,LOC283104 IMR90 Hi-C 24141950 SWAP70 224304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 10135641 10135992 10135817 Y NA NA LOC283104,LOC440028 IMR90 Hi-C 24141950 SBF2 177762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 10347188 10347587 10347388 Y ADM SBF2,ADM,AMPD3 NA NA NA NA AMPD3 19328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 10541440 10541628 10541530 Y AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,AMPD3,ZBED5 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA MTRNR2L8 12717 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 10549004 10549441 10549205 Y AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141 MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1 NA NA NA NA RNF141 11336 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 10955665 10956051 10955935 Y NA CTD-2003C8.2 EIF4G2,MICALCL,CTR9,GALNTL4,LOC729013,ZBED5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2003C8.2 36796 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12013824 12014110 12014066 Y DKK3,DKK3,DKK3 DKK3 NA NA NA NA DKK3 15206 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12065635 12065803 12065720 Y NA DKK3,RP13-631K18.5,MICAL2 DKK3,MICAL2,USP47,CTR9,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 DKK3 36319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12101706 12102070 12101803 Y DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2 RP13-631K18.5,MICAL2 MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 RP13-631K18.5 4368 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12181262 12181458 12181363 Y MICALCL,MICAL2 NA MICALCL IMR90 Hi-C 24141950 MICAL2 67719 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12184848 12185162 12185016 Y NA NA NA NA NA NA MICAL2 71305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 12204138 12204505 12204342 Y MICAL2,MICALCL NA NA NA NA NA MICAL2 90595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 12309352 12309734 12309588 Y TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL NA NA NA NA NA PARVA 86998 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 12697923 12698543 12698251 Y PARVA,TEAD1 TEAD1 NA NA NA NA TEAD1 3954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr11 12824175 12824668 12824395 Y TEAD1 NA NA NA NA NA TEAD1 130206 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr11 12884715 12885004 12884787 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 190746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 12973520 12973623 12973568 Y NA NA NA NA NA NA TEAD1 279551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 13238046 13238305 13238120 Y NA NA ARNTL,BTBD10,LOC100506305 IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 57894 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 13283262 13283494 13283392 Y NA ARNTL ARNTL IMR90 Hi-C 24141950 ARNTL 12705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 13299973 13300299 13300022 Y FAR1,ARNTL ARNTL NA NA NA NA ARNTL 3774 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 13327996 13328024 13328011 Y NA ARNTL NA NA NA NA ARNTL 31797 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 14356156 14356413 14356247 Y NA RRAS2 NA NA NA NA RRAS2 27639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 14443887 14444060 14443964 Y RRAS2 NA RRAS2,COPB1,SPON1 IMR90 Hi-C 24141950 RRAS2 59835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 14874249 14874576 14874405 Y CYP2R1 CYP2R1 NA NA NA NA CYP2R1 37222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 16945489 16945781 16945647 Y NA RP11-466H18.1 NA NA NA NA RP11-466H18.1 48779 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 17374298 17375700 17374969 Y RPS13,B7H6 NA NA NA NA NA ABCC8 120749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 18404883 18405218 18405078 Y LDHA LDHA,AC084117.3,LDHC NA NA NA NA LDHA 8717 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr11 18405328 18405801 18405464 Y HPS5,TSG101,SPTY2D1 LDHA,AC084117.3,LDHC NA NA NA NA LDHA 8134 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 19649981 19650160 19650072 Y NAV2 NA NA NA NA NA NAV2 279710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 19957110 19957424 19957380 Y NAV2 NA NA NA NA NA HTATIP2 425807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 26863519 26863562 26863540 Y NA NA NA NA NA NA CCDC34 519853 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 27682701 27682852 27682777 Y NA NA NA NA NA NA BDNF 58753 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 27715832 27716154 27716086 Y NA BDNF NA NA NA NA BDNF 25451 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 28128920 28129110 28128941 Y METTL15 METTL15,KIF18A NA NA NA NA KIF18A 1065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 28764751 28764902 28764829 Y NA RP11-115J23.1 BDNF-AS1,BDNF,KIF18A,METTL15 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 42589 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 28853592 28853798 28853653 Y NA NA BDNF-AS1,BDNF IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 131430 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 28864582 28864807 28864697 Y NA NA BDNF,BDNF-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-115J23.1 142420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 29974880 29975070 29974975 Y NA NA NA NA NA NA RP11-115J23.1 1252718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 31946597 31946955 31946776 Y NA NA ELP4,IMMP1L IMR90 Hi-C 24141950 PAX6 109088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 32728667 32728946 32728768 Y NA NA NA NA NA NA PRRG4 120543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 32913428 32913828 32913453 Y NA QSER1 NA NA NA NA QSER1 704 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 33181656 33182005 33181958 Y NA NA NA NA NA NA CSTF3 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 33313001 33313236 33313097 Y NA HIPK3 NA NA NA NA HIPK3 36783 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 33713598 33714029 33713919 Y CD59 CD59 NA NA NA NA CD59 41962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 34183211 34183613 34183509 Y NA NA NA NA NA NA NAT10 58062 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35052236 35052689 35052493 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 35053022 35053283 35053109 Y CD44 NA SLC1A2,CD44,PDHX IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 104296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35103874 35105511 35104330 Y CD44 NA CD44,PDHX,APIP,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 52068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35132711 35132959 35132793 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 PDHX,CD44,SLC1A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP4-607I7.1 24620 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35186946 35187176 35187019 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 28529 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35188303 35189153 35188420 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 29886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35204984 35205337 35205050 Y CD44 RP4-607I7.1,CD44 NA NA NA NA CD44 46567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 35395403 35395808 35395629 Y SLC1A2 NA NA NA NA NA CD44 236986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 39065264 39065315 39065290 Y NA NA NA NA NA NA RP11-313M3.1 115688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 39183372 39183493 39183434 Y NA RP11-313M3.1 NA NA NA NA RP11-313M3.1 2369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 13.8136562850667 chr11 43760547 43760939 43760743 Y NA NA NA NA NA NA ALKBH3 139422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 43955473 43955506 43955502 Y NA C11orf96 NA NA NA NA C11orf96 10581 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 44547557 44547712 44547661 Y NA CD82 EXT2,CHST1,ACCS,CD82,TSPAN18 IMR90 Hi-C 24141950 CD82 36265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 44749241 44749630 44749607 Y TSPAN18 TSPAN18 PRDM11,TSPAN18,CD82,TP53I11 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 3226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 44758780 44759166 44758916 Y NA TSPAN18 TSPAN18,PRDM11,CD82,TP53I11,SYT13 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN18 12765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 44882780 44883083 44882907 Y NA NA NA NA NA NA TP53I11 87757 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 44963197 44963482 44963283 Y NA TP53I11 NA NA NA NA TP53I11 7358 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 45201958 45202605 45202216 Y NA NA NA NA NA NA SYT13 103265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr11 45396230 45396452 45396394 Y CRY2,CRY2 RP11-430H10.1 EXT2,PRDM11,CHST1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-430H10.1 21308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 45680274 45680465 45680372 Y NA CHST1 NA NA NA NA CHST1 4707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 45864713 45865116 45864826 Y NA SLC35C1,CRY2,MAPK8IP1 NA NA NA NA CRY2 1553 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46015298 46015560 46015479 Y NA NA GYLTL1B,PEX16 K562 ChIA-PET 22265404 GYLTL1B 74126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46058881 46059222 46059206 Y NA NA NA NA NA NA PHF21A 81763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46258702 46259233 46258865 Y DGKZ CREB3L1 PHF21A,DGKZ,CREB3L1,MDK IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 37979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 46264726 46265198 46265009 Y NA CREB3L1 DGKZ,PHF21A,CREB3L1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 32014 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 46270167 46270467 46270346 Y CREB3L1 CREB3L1 CREB3L1,PHF21A,DGKZ IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CREB3L1 26745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46410888 46411787 46411136 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 10582 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46444740 46444848 46444831 Y NA MDK NA NA NA NA MDK 44434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 46538668 46539048 46538858 Y NA NA NA NA NA NA AMBRA1 74627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 46619183 46619437 46619308 Y NA AMBRA1,ATG13,HARBI1 AMBRA1 K562 ChIA-PET 22265404 AMBRA1 5508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 47573563 47574025 47573747 Y NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1 NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4 NA NA NA NA NDUFS3 10863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 47787265 47787534 47787400 Y SPI1,CELF1,CELF1,CELF1,PTPRJ,FNBP4 FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 47789923 47790126 47789984 Y NA FNBP4 NA NA NA NA FNBP4 2928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 47844695 47845036 47844861 Y NA NUP160 NA NA NA NA NUP160 23071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 47867685 47867881 47867783 Y OR4X1 NUP160 NA NA NA NA NUP160 226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 48004294 48004631 48004323 Y CELF1,CELF1,CELF1,CELF1,FNBP4,PTPRJ PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 4181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 48040170 48040457 48040234 Y NA PTPRJ NA NA NA NA PTPRJ 40057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 57200214 57200547 57200409 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3 SLC43A3,RTN4RL2 SSRP1,TNKS1BP1,P2RX3,PRG3,PRG2,SLC43A3,TIMM10,SLC43A1,UBE2L6,SMTNL1,ZDHHC5 IMR90 Hi-C 24141950 SLC43A3 7161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 57333685 57333973 57333758 Y SLC43A3,SLC43A3,SLC43A3,ZDHHC5,UBE2L6 TIMM10,SERPING1 NA NA NA NA UBE2L6 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 57542885 57543297 57542929 Y NA C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 24170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 57546018 57546724 57546105 Y MED19,C11orf31 C11orf31,CTNND1 NA NA NA NA CTNND1 27303 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr11 58340867 58341571 58341167 Y OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF NA NA NA NA LPXN 2122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 59323878 59323962 59323920 Y NA NA NA NA NA NA OSBP 57655 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 59331910 59331948 59331929 Y OR5AN1,OR4D6,OR4D11 OSBP NA NA NA NA OSBP 49669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 59537612 59537828 59537719 Y PATL1,STX3 MRPL16 NA NA NA NA MRPL16 38517 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 60683096 60683305 60683236 Y CYBASC3,CYBASC3,CD5,SLC15A3,CD6 PRPF19,TMEM109,TMEM132A,SLC15A3 NA NA NA NA TMEM109 3750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 61394263 61394463 61394368 Y NA SYT7,RPLP0P2 NA NA NA NA RPLP0P2 13755 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 61523945 61524112 61524089 Y INCENP,DAK,C11orf9 FEN1,FADS2 NA NA NA NA FEN1 33997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 61602064 61602538 61602257 Y INCENP,CYBASC3,CPSF7,CPSF7,FEN1 FEN1,FADS2,FADS1 NA NA NA NA FADS1 7274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 61738760 61739751 61739487 Y NA FTH1 NA NA NA NA FTH1 5628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 61781118 61781313 61781282 Y DAGLA,FTH1 FTH1 FADS1,BEST1,FTH1,FADS3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FTH1 47986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr11 62211626 62212261 62212170 Y FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 99210 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr11 62248272 62248499 62248283 Y NA NA NA NA NA NA RP11-864I4.4 62972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 62267084 62267180 62267134 Y WDR74,STX5,SLC3A2,NXF1,AHNAK RP11-864I4.4 NA NA NA NA RP11-864I4.4 44291 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 62272728 62273223 62272788 Y ROM1 RP11-864I4.4,AHNAK NA NA NA NA RP11-864I4.4 38248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 62306762 62307027 62306934 Y WDR74,STX5,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654 NA NA NA NA RP11-864I4.4 4444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 62312037 62312397 62312245 Y WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1 NA NA NA NA RP11-864I4.4 566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 62319122 62319673 62319430 Y WDR74,UBXN1,STX5,NXF1,AHNAK,EML3 RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 AHNAK IMR90 Hi-C 24141950 AHNAK 2034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 62320979 62321244 62321106 Y NA RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1,MTA2 NA NA NA NA AHNAK 463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 62441871 62442205 62442039 Y NXF1 GANAB,INTS5,METTL12,C11orf83,C11orf48,UBXN1,BSCL2 NA NA NA NA UBXN1 2362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 63298876 63299223 63298998 Y OTUB1,MARK2,RARRES3 HRASLS5,LGALS12,RARRES3 NA NA NA NA RARRES3 3058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 63334518 63335083 63334716 Y RARRES3,OTUB1 RARRES3,PLA2G16 NA NA NA NA RARRES3 32237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 63685258 63686079 63685609 Y NA RCOR2,NAA40 NA NA NA NA RCOR2 2942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 63705603 63705837 63705685 Y NA RCOR2,NAA40,COX8A,AP000721.4,OTUB1 NA NA NA NA NAA40 1172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 63949132 63949273 63949224 Y NA MACROD1,STIP1,FERMT3,NUDT22,TRPT1,DNAJC4 NA NA NA NA STIP1 1471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 64140304 64140795 64140552 Y RCOR2,NAA40,GPR137,KCNK4,NRXN2,NRXN2,CDC42BPG RPS6KA4 NA NA NA NA RPS6KA4 15684 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 65076655 65076852 65076688 Y EHD1,BATF2,FAU,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2 POLA2,CDC42EP2,DPF2,TIGD3 NA NA NA NA CDC42EP2 3437 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65244638 65245303 65245021 Y BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MALAT1 17930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr11 65248969 65249218 65249208 Y SNX32 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 14015 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 65254949 65255610 65255242 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,FRMD8,NEAT1,MIR612 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 7623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65261229 65261625 65261527 Y CDC42EP2 AP000769.1,MALAT1,SCYL1 MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1 IMR90 Hi-C 24141950 MALAT1 1608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 65264635 65265953 65265057 Y NA AP000769.1,MALAT1,SCYL1 NA NA NA NA MALAT1 1402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 5.92013840788571 chr11 65323331 65323567 65323509 Y FOSL1 SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65328084 65328375 65328271 Y NA SCYL1,LTBP3,SSSCA1,FAM89B,EHBP1L1 NA NA NA NA LTBP3 3683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65419981 65420225 65420142 Y CDC42EP2,TIGD3,SLC25A45,FRMD8,EHBP1L1,KCNK7,MAP3K11,PCNXL3,PACS1,EIF1AD,DKFZp761E198,CTSW,SIPA1,SIPA1,RELA,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 8340 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr11 65420425 65420654 65420491 Y TIGD3,SLC25A45,MAP3K11,SNX32,PACS1,GAL3ST3,CTSW,SIPA1,SIPA1,KAT5 MAP3K11,PCNXL3,MIR4690,SIPA1,RELA NA NA NA NA RELA 7911 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr11 65666492 65667203 65666864 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B MUS81,CFL1,EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1 NA NA NA NA FOSL1 448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr11 65678943 65679154 65679019 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,CFL1,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,KLC2,FOSL1,SART1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65679250 65679576 65679373 Y RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1 EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 5012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 65683105 65683625 65683322 Y NA EFEMP2,CTSW,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA C11orf68 963 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.39859797489735 chr11 65695608 65695878 65695746 Y EHBP1L1,MAP3K11,RELA,DKFZp761E198 FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1 NA NA NA NA DRAP1 10880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 65782974 65783337 65783107 Y FOSL1 BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2 NA NA NA NA CST6 5662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 66080826 66081241 66080906 Y CD248 RAB1B,CNIH2,YIF1A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8 NA NA NA NA CD248 1274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 66659730 66659912 66659812 Y CLCF1,RBM4 LRFN4 NA NA NA NA LRFN4 37612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 66717584 66717809 66717709 Y CLCF1,ADRBK1 PC NA NA NA NA PC 6038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 67138852 67139479 67139267 Y NA POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 67139742 67140272 67140082 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA NA NA NA NA AP003419.11 687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr11 67146992 67147327 67147282 Y NA POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2 NA NA NA NA AP003419.11 7937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 67955066 67955423 67955397 Y TCIRG1,SUV420H1 SUV420H1 NA NA NA NA SUV420H1 23872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 68121765 68121884 68121804 Y ALDH3B1,C11orf24 LRP5 NA NA NA NA LRP5 43688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 68608164 68608616 68608368 Y NA CPT1A NA NA NA NA CPT1A 1262 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 69197125 69197542 69197234 Y ORAOV1,MYEOV NA MYEOV,CCND1 IMR90 Hi-C 24141950 AP000439.2 59969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 69235389 69235576 69235517 Y NA AP000439.2 MYEOV,ORAOV1,CCND1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 21935 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 69258094 69258432 69258217 Y CCND1 AP000439.2 CCND1,TPCN2,MYEOV,ORAOV1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP000439.2 583 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 70245269 70246141 70245676 Y ANO1,FADD,PPFIA1,CTTN CTTN,AP000487.5 NA NA NA NA AP000487.5 2675 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 71650610 71650763 71650692 Y NA RP11-849H4.2,RNF121 NUMA1,IL18BP IMR90 Hi-C 24141950 RNF121 12863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 71704625 71704847 71704670 Y NA IL18BP NA NA NA NA IL18BP 2740 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 72452508 72452870 72452656 Y STARD10,ATG16L2,ARAP1 ARAP1,STARD10 NA NA NA NA ARAP1 49774 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 72868553 72869130 72868609 Y NA FCHSD2 STARD10,FCHSD2,ATG16L2,ARAP1,MIR4692,P2RY2,P2RY6,ARHGEF17 IMR90 Hi-C 24141950 FCHSD2 17247 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 72953792 72954055 72953924 Y NA P2RY2 NA NA NA NA P2RY2 26449 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 72991769 72991956 72991802 Y RELT,RELT,P2RY6,P2RY6 ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 25378 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 73034605 73034942 73034774 Y NA ARHGEF17 NA NA NA NA ARHGEF17 17271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 73088357 73088912 73088439 Y NA RELT NA NA NA NA RELT 3048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 73729347 73729733 73729506 Y NA UCP2 NA NA NA NA UCP2 36995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 74465903 74466299 74466070 Y POLD3,RNF169 RP11-864N7.2,RNF169 XRRA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF169 7990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr11 74565092 74565468 74565281 Y NA NA NA NA NA NA XRRA1 92777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 74609449 74609745 74609637 Y LOC441617,XRRA1 XRRA1,SPCS2 NA NA NA NA XRRA1 48500 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 75061558 75062072 75061823 Y NA ARRB1,RPS3 NA NA NA NA ARRB1 685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 75919893 75920246 75919996 Y WNT11 WNT11 NA NA NA NA WNT11 113 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr11 75920696 75920900 75920748 Y NA WNT11 NA NA NA NA WNT11 916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 75946013 75946323 75946187 Y NA WNT11 C11orf30,MAP6,UVRAG,PRKRIR,WNT11,GUCY2E,DGAT2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT11 26233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 76340225 76340306 76340286 Y NA LRRC32 NA NA NA NA LRRC32 39485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 76534548 76534939 76534880 Y GDPD4 TSKU,RP11-21L23.3,ACER3 ACER3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACER3 34972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 77751153 77751354 77751183 Y NA INTS4,KCTD14,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2 NA NA NA NA KCTD14 3883 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 77837663 77837947 77837805 Y NA NDUFC2-KCTD14,NDUFC2,ALG8,KCTD21-AS1 NA NA NA NA ALG8 10759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 82781050 82781223 82781203 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 85 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 82805889 82806270 82806080 Y NA RAB30 NA NA NA NA RAB30 24924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 82961020 82961401 82961211 Y NA RP11-727A23.1,CCDC90B NA NA NA NA CCDC90B 34049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 83278002 83278167 83278160 Y NA NA NA NA NA NA AP003026.1 111746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 85047149 85047448 85047300 Y NA NA NA NA NA NA TMEM126B 290181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 85757330 85757451 85757391 Y NA PICALM NA NA NA NA PICALM 21473 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 86222200 86222363 86222315 Y NA NA NA NA NA NA C11orf73 210947 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 86454778 86455149 86454967 Y PRSS23 PRSS23 PRSS23,ME3,CCDC81 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PRSS23 44952 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 86792626 86792948 86792684 Y NA TMEM135 NA NA NA NA TMEM135 45740 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 86841159 86841223 86841164 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 94273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 87149211 87149297 87149219 Y NA NA NA NA NA NA TMEM135 402325 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 88071526 88071793 88071707 Y NA CTSC NA NA NA NA CTSC 2571 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 89937153 89937335 89937244 Y NA CHORDC1 NA NA NA NA CHORDC1 17197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 92194935 92195280 92195108 Y NA NA NA NA NA NA SLC36A4 733850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 93343191 93343552 93343372 Y NA KIAA1731 NA NA NA NA KIAA1731 49253 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 93863761 93864262 93864073 Y MED17,FUT4,PANX1 PANX1 NA NA NA NA PANX1 3667 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 94440479 94440817 94440610 Y KDM4DL AMOTL1,RP11-867G2.8 PIWIL4 IMR90 Hi-C 24141950 AMOTL1 2882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 94882788 94883137 94883023 Y NA NA NA NA NA NA ENDOD1 61814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 95557234 95557451 95557366 Y NA CEP57,FAM76B NA NA NA NA FAM76B 35661 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 95610217 95610530 95610374 Y NA MTMR2 NA NA NA NA MTMR2 45949 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 95746570 95746792 95746680 Y FAM76B NA NA NA NA NA MTMR2 90091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 95888064 95888524 95888506 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 185820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 95976157 95976737 95976478 Y FAM76B,MAML2,JRKL,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 97607 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 95982466 95982894 95982863 Y NA NA NA NA NA NA MAML2 91450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 96006843 96007267 96007082 Y FAM76B,MAML2,CCDC82 NA NA NA NA NA MAML2 67077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 96040167 96040456 96040282 Y MAML2 MAML2 NA NA NA NA MAML2 33888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr11 96071900 96072294 96072196 Y MAML2,JRKL,CCDC82 MAML2,CCDC82,JRKL NA NA NA NA MAML2 2050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 100043788 100043797 100043793 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP42 512587 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 102042993 102043398 102043047 Y C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1 NA NA NA NA NA YAP1 63801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 102216514 102216961 102216815 Y TMEM123,BIRC3,BIRC2 BIRC3,BIRC2 NA NA NA NA BIRC2 572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 102297400 102297813 102297636 Y BIRC3,BIRC2,MMP20,TMEM123 TMEM123 BIRC2 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM123 41302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 108487361 108487672 108487557 Y EXPH5 EXPH5,DDX10 NPAT,EXPH5,ATM IMR90 Hi-C 24141950 EXPH5 24896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 109958650 109959379 109958908 Y NA ZC3H12C ZC3H12C IMR90 Hi-C 24141950 ZC3H12C 2708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 109966397 109966711 109966537 Y NA ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 4310 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 110002516 110002895 110002708 Y RDX ZC3H12C NA NA NA NA ZC3H12C 40429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 110067293 110067585 110067439 Y NA NA ZC3H12C,RDX,FDX1 IMR90 Hi-C 24141950 RDX 97862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 110367857 110368312 110368149 Y ZC3H12C,RDX,FDX1 NA FDX1,POU2AF1,LOC100132078,C11orf53,BTG4,ARHGAP20 IMR90 Hi-C 24141950 FDX1 69250 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 111692318 111692670 111692505 Y NA NA PPP2R1B IMR90 Hi-C 24141950 C11orf1 54989 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 111929773 111930099 111929899 Y DIXDC1 DLAT,C11orf57,PIH1D2,TIMM8B,SDHD NA NA NA NA C11orf57 12711 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 112188870 112189262 112188962 Y IL18 RP11-356J5.12 NA NA NA NA RP11-356J5.12 49398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 112941331 112941794 112941502 Y NA NA NA NA NA NA NCAM1 111334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 113375857 113376013 113375967 Y CLDN25 DRD2 TTC12,DRD2 IMR90 Hi-C 24141950 DRD2 31444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 113552333 113552865 113552581 Y NA NA NA NA NA NA ZW10 89668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 113945404 113945849 113945581 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 180660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 114033536 114034161 114033636 Y ZBTB16,ZBTB16 NA NA NA NA NA NNMT 92348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 114162155 114162496 114162247 Y NA NNMT NA NA NA NA NNMT 35646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 114312879 114313299 114312892 Y NA RBM7,C11orf71,REXO2 NA NA NA NA REXO2 4771 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 115372753 115373113 115372889 Y CADM1 CADM1 NA NA NA NA CADM1 562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 116723326 116723638 116723620 Y SIK3 NA NA NA NA NA ZNF259 66560 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 116802235 116802679 116802498 Y SIK3,PCSK7 NA NA NA NA NA ZNF259 145469 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 117805497 117805937 117805753 Y NA IL10RA FXYD6-FXYD2 IMR90 Hi-C 24141950 IL10RA 49126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 118782911 118783378 118783221 Y SLC37A4,RNF26,HYOU1,HYOU1,HMBS,DPAGT1,CCDC153,BCL9L,UPK2,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 3494 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 118784118 118784508 118784405 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA MIR4492 4701 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 118791529 118792348 118792152 Y PHLDB1,BCL9L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 1969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 118793665 118793922 118793750 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 395 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 118799839 118800231 118800031 Y C2CD2L MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 118800245 118800827 118800413 Y MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CXCR5,CXCR5,CCDC84 MIR4492,BCL9L NA NA NA NA BCL9L 5928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 119241226 119241377 119241346 Y NA RNF26,C1QTNF5,USP2,USP2-AS1 NA NA NA NA USP2 9059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 119454963 119455433 119455083 Y NA NA TRIM29,USP2,LOC100499227 IMR90 Hi-C 24141950 PVRL1 142361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr11 120053242 120053546 120053328 Y NA OAF POU2F3,LOC649133 IMR90 Hi-C 24141950 OAF 25929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 120363124 120363469 120363220 Y NA NA NA NA NA NA ARHGEF12 157337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 120512132 120512391 120512245 Y NA NA GRIK4 IMR90 Hi-C 24141950 ARHGEF12 306345 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 121107211 121107513 121107369 Y SC5DL,SC5DL NA SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 213399 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr11 121307019 121307215 121307117 Y SORL1 SORL1 SORL1 IMR90 Hi-C 24141950 SORL1 13697 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 122049218 122049681 122049522 Y NA MIRLET7A2,MIR100 NA NA NA NA MIR100 28202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 122072667 122072944 122072770 Y NA NA NA NA NA NA MIR100 51651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 122552605 122552791 122552717 Y NA UBASH3B NA NA NA NA UBASH3B 28222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 122956299 122956503 122956402 Y NA SNORD14C,HSPA8 NA NA NA NA HSPA8 24361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 123077641 123077822 123077735 Y NA CLMP CLMP IMR90 Hi-C 24141950 CLMP 13652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 123394284 123394590 123394437 Y NA NA NA NA NA NA AP000783.1 95226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 124587586 124587756 124587671 Y ROBO4,NRGN,ESAM SPA17,SIAE,NRGN,RP11-677M14.2,RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA NRGN 19986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 124668888 124669222 124669022 Y NA RP11-677M14.3,ESAM NA NA NA NA ESAM 38702 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 125037243 125037532 125037366 Y NA PKNOX2 NA NA NA NA PKNOX2 4660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 125665065 125665247 125665168 Y NA PATE2 NA NA NA NA PATE2 18351 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 125985923 125986168 125986013 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 CDON 54693 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 126010526 126010866 126010726 Y NA NA HYLS1 IMR90 Hi-C 24141950 FAM118B 68443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 126084365 126084425 126084397 Y NA FAM118B,RPUSD4 NA NA NA NA RPUSD4 4778 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 126290424 126290762 126290592 Y NA NA NA NA NA NA ST3GAL4 66889 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128294765 128294892 128294836 Y NA NA ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 160561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128335578 128335794 128335665 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 119659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128339730 128340284 128340256 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 115169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr11 128341794 128342415 128342241 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 113038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128346619 128346923 128346838 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 108530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128348079 128348401 128348240 Y NA NA NA NA NA NA ETS1 107052 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128352415 128352744 128352497 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 102709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128363188 128363283 128363236 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 92170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128376891 128377234 128377096 Y ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 78219 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128377315 128377487 128377422 Y FLI1,FLI1,ETS1 NA NA NA NA NA ETS1 77966 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128489785 128490148 128489925 Y NA ETS1 ETS1,FLI1 IMR90 Hi-C 24141950 ETS1 34332 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 128927593 128927968 128927781 Y NA NA NA NA NA NA FLI1 373163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 129731747 129732130 129731880 Y ST14,NFRKB,TMEM45B TMEM45B,NFRKB NA NA NA NA NFRKB 31355 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 129871629 129871941 129871631 Y NA PRDM10,TCEB2P2 NA NA NA NA PRDM10 899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 130392180 130392594 130392285 Y NA NA SNX19,ADAMTS15 IMR90 Hi-C 24141950 ADAMTS15 75311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr11 130767627 130768066 130767878 Y NA SNX19 NA NA NA NA SNX19 16338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 132411283 132411428 132411357 Y NA NA NA NA NA NA IGSF9B 1413452 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 133991300 133991384 133991342 Y NA NA NA NA NA NA JAM3 54480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr11 134124453 134124658 134124640 Y NCAPD3,THYN1,GLB1L3,GLB1L2 VPS26B,NCAPD3,THYN1,ACAD8 NA NA NA NA ACAD8 3064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 794631 794815 794739 Y CCDC77,KDM5A NINJ2 NINJ2,WNK1,B4GALNT3 IMR90 Hi-C 24141950 NINJ2 23686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 860254 860664 860544 Y RAD52,NINJ2,WNK1 WNK1 NA NA NA NA WNK1 495 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 1208361 1208617 1208550 Y NA NA NA NA NA NA ERC1 110686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 1407863 1408257 1407945 Y NA NA NA NA NA NA WNT5B 228800 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 2144277 2144357 2144308 Y LRTM2 DCP1B CACNA1C,MIR3649,CACNA2D4,ADIPOR2,DCP1B,LOC100652846,WNT5B IMR90 Hi-C 24141950 DCP1B 32576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 2161154 2161552 2161208 Y LRTM2 DCP1B NA NA NA NA DCP1B 49453 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 2175107 2175395 2175116 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 63406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 2374154 2374447 2374269 Y NA NA NA NA NA NA DCP1B 262453 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr12 3948349 3948613 3948479 Y NA PARP11 NA NA NA NA PARP11 31995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 4378284 4379414 4378568 Y PARP11,C12orf4,CCND2,C12orf5 CCND2,C12orf5 PARP11 IMR90 Hi-C 24141950 CCND2 1524 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 5722968 5723064 5723018 Y NA NA NA NA NA NA ANO2 330334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 6187612 6187773 6187703 Y NA NA NA NA NA NA CD9 119108 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 6291358 6291755 6291562 Y VWF,CD9 CD9 VWF,PLEKHG6,CD9 IMR90 Hi-C 24141950 CD9 15126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 6335136 6335793 6335267 Y SCNN1A CD9 NA NA NA NA CD9 28255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 6387822 6388153 6388049 Y NA NA VWF,PLEKHG6,CD9,TNFRSF1A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNFRSF1A 61127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 6403662 6404056 6403860 Y PLEKHG6,PLEKHG6,PLEKHG6 TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 45224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 6404239 6404667 6404531 Y NA TNFRSF1A VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2 IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF1A 44613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr12 6444583 6445131 6444861 Y CD4,CD4,TNFRSF1A TNFRSF1A,LTBR NA NA NA NA TNFRSF1A 4149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 6663248 6663743 6663420 Y GPR162,ENO2,C12orf53,VAMP1,IFFO1 SCARNA10,GAPDH,IFFO1,NOP2 NA NA NA NA IFFO1 9 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 6684613 6684668 6684641 Y NA GAPDH,IFFO1,NOP2,CHD4 NA NA NA NA NOP2 8756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 7000184 7000641 7000294 Y PEX5,VAMP1,ACRBP,CD4,CD4,PTPN6 CDCA3,USP5,TPI1,RPL13P5,LRRC23,SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57 NA NA NA NA SPSB2 3662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr12 7034730 7034838 7034794 Y ACSM4,PTMS,PHB2,PHB2,EMG1,USP5,USP5,SPSB2,SPSB2,ATN1 SPSB2,ENO2,ATN1,C12orf57,RNU7-1,EMG1,SCARNA12,PHB2 NA NA NA NA ATN1 3104 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 7592182 7592797 7592685 Y PEX5,NANOG RP11-157G21.2,CD163L1 NA NA NA NA RP11-157G21.2 1596 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr12 8123169 8123746 8123395 Y CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3 SLC2A3 SLC2A3,FOXJ2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC2A3 36298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.85043701120423 chr12 8179132 8179551 8179335 Y NA FOXJ2,C3AR1 PEX5,SLC2A14,SLC2A3,FOXJ2,C3AR1,NECAP1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXJ2 3748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 10337097 10337455 10337232 Y NA GABARAPL1 NA NA NA NA GABARAPL1 25602 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 10869298 10869573 10869459 Y NA STYK1 NA NA NA NA STYK1 44381 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11043114 11043456 11043318 Y TAS2R7,TAS2R8,TAS2R31,TAS2R20,TAS2R14,TAS2R13 NA NA NA NA NA STYK1 218197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11582484 11582789 11582637 Y TAS2R50,TAS2R43,TAS2R42 NA NA NA NA NA ETV6 217999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11731456 11731873 11731547 Y TAS2R43,TAS2R42 NA NA NA NA NA ETV6 68915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11851043 11851172 11851118 Y NA NA NA NA NA NA ETV6 50255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11962012 11962232 11962094 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 161224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 11976145 11976420 11976223 Y ETV6,BCL2L14 NA NA NA NA NA ETV6 175357 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 12883612 12883681 12883638 Y APOLD1 GPR19,CDKN1B NA NA NA NA CDKN1B 17620 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 12960939 12961466 12961074 Y NA DDX47 NA NA NA NA DDX47 2784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 13025126 13025347 13025203 Y NA RPL13AP20,GPRC5A,MIR614 NA NA NA NA RPL13AP20 1086 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr12 13253893 13254547 13254171 Y CDKN1B,EMP1 NA NA NA NA NA KIAA1467 58675 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr12 13277970 13278212 13278173 Y EMP1 NA EMP1,GSG1 IMR90 Hi-C 24141950 EMP1 69438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 14413561 14413925 14413703 Y NA RP11-134N1.2 ATF7IP IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-134N1.2 46037 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 15409824 15410065 15409954 Y NA NA NA NA NA NA ARHGDIB 297162 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 15853599 15853765 15853693 Y NA NA NA NA NA NA EPS8 179498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 15910995 15911177 15911085 Y NA NA PTPRO IMR90 Hi-C 24141950 EPS8 122086 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 16553699 16554214 16553898 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 55623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 16554253 16554721 16554664 Y NA NA NA NA NA NA MGST1 56177 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 19048962 19049238 19049131 Y NA NA PIK3C2G IMR90 Hi-C 24141950 PLEKHA5 231410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 19566135 19566181 19566158 Y NA AEBP2 NA NA NA NA AEBP2 11156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 22779557 22779668 22779574 Y NA ETNK1 NA NA NA NA ETNK1 3548 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 24673435 24673806 24673663 Y SOX5 RP11-444D3.1 NA NA NA NA RP11-444D3.1 39718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 25099512 25100288 25099550 Y BCAT1 BCAT1 NA NA NA NA BCAT1 105 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 25539082 25539407 25539207 Y NA NA BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KRAS 137212 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr12 26267263 26267811 26267415 Y NA SSPN,BHLHE41,RP11-283G6.3 NA NA NA NA SSPN 5113 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 26427494 26428032 26427844 Y NA NA SSPN,BHLHE41,ITPR2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-283G6.3 149944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 26522536 26522924 26522687 Y ITPR2 NA NA NA NA NA RP11-283G6.3 244986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 26805266 26805775 26805502 Y NA NA NA NA NA NA ITPR2 178356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 27613510 27613909 27613776 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 60455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 27678444 27678624 27678473 Y PPFIBP1 PPFIBP1 NA NA NA NA PPFIBP1 4080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 27748114 27748496 27748421 Y NA NA NA NA NA NA PPFIBP1 73750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 28501330 28501622 28501413 Y NA RNU4-54P NA NA NA NA RNU4-54P 30934 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 29317763 29317994 29317897 Y NA FAR2 NA NA NA NA FAR2 17727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 29487594 29487680 29487637 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 44442 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 29489399 29489493 29489486 Y NA ERGIC2 NA NA NA NA ERGIC2 42629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 30945631 30945953 30945771 Y NA CAPRIN2,LINC00941 NA NA NA NA LINC00941 24 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 34500403 34500725 34500579 Y NA NA NA NA NA NA RP13-7D7.1 99987 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 39104065 39104215 39104143 Y CPNE8 NA NA NA NA NA CPNE8 195017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 41137156 41137542 41137225 Y CNTN1 NA NA NA NA NA SLC2A13 639265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 45207855 45208059 45207957 Y NA NA NA NA NA NA NELL2 105572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 45628991 45629732 45629167 Y ANO6,ANO6 ANO6,PLEKHA8P1 NA NA NA NA PLEKHA8P1 21167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46786554 46786766 46786571 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 NA NA NA NA RP11-96H19.1 11092 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46809510 46809878 46809694 Y NA SLC38A2,RP11-96H19.1 SLC38A4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 34048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 46832663 46832984 46832824 Y NA NA SLC38A2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 RP11-96H19.1 57201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46844808 46845174 46844835 Y NA NA NA NA NA NA RP11-96H19.1 69346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46866769 46866797 46866784 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 91307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46867492 46867759 46867536 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 92030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46917975 46918280 46918143 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 142513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr12 46918651 46918824 46918737 Y NA NA SLC38A2,SLC38A4,SLC38A1,AMIGO2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 143189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46943558 46944140 46943794 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 168096 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 46951455 46951753 46951519 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 175993 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 46956686 46956942 46956800 Y SLC38A2 NA SLC38A2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-96H19.1 181224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 47053760 47053887 47053821 Y NA NA SLC38A2,SLC38A1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-96H19.1 278298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 47474423 47475249 47474825 Y NA AMIGO2 NA NA NA NA AMIGO2 2689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 47701468 47701752 47701723 Y NA NA AMIGO2,MIR4698,LOC100233209,FAM113B IMR90 Hi-C 24141950 AMIGO2 229734 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 48076459 48076736 48076534 Y NA RPAP3,RP1-197B17.3 NA NA NA NA RPAP3 21108 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 48395275 48395444 48395393 Y COL2A1 TMEM106C TMEM106C MCF7 ChIA-PET 22265404 TMEM106C 39923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 49276307 49276420 49276362 Y OR8S1,RND1 DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,CACNB3,DDX23,ARF3,WNT10B,FKBP11,DDN,WNT1,PRKAG1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RND1 18626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 49277442 49277626 49277534 Y NA DDX23,RND1,CCDC65,FKBP11 RND1,DDX23,CACNB3,DDN,PRKAG1,ARF3,FKBP11 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CCDC65 18267 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 49628278 49628526 49628405 Y LMBR1L,TUBA1A TUBA1C,TUBA1A DHH,TUBA1A,RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,PRPH,MLL2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 47171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 49641026 49641246 49641136 Y NA NA RHEBL1,TUBA1C,TUBA1A,LMBR1L,DHH,MLL2,TUBA1B,SPATS2,MCRS1,FAM186B,PRPH IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 59919 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 49646906 49646981 49646941 Y NA NA RHEBL1,TUBA1C,TUBA1B,DHH,LMBR1L IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TUBA1A 65799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 49739029 49739393 49739097 Y PRPF40B,C1QL4,DNAJC22 TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 49739970 49740063 49739997 Y NA TROAP,C1QL4,DNAJC22,SPATS2 NA NA NA NA DNAJC22 1270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr12 50056796 50057319 50056974 Y TMBIM6,NCKAP5L,FMNL3 TMBIM6,FMNL3 NA NA NA NA TMBIM6 42189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 50555629 50555991 50555816 Y ACCN2,DIP2B CERS5 NA NA NA NA CERS5 3297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 51536826 51537135 51537116 Y CSRNP2 TFCP2 NA NA NA NA TFCP2 27791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 52241760 52242326 52241842 Y SLC4A8,FIGNL2 NA SCN8A,BIN2,GALNT6,SLC4A8,FIGNL2 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 56366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 52262826 52263308 52263216 Y NA ACVRL1 SCN8A,ACVR1B,SLC4A8 IMR90 Hi-C 24141950 ACVRL1 35384 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 52580785 52580889 52580797 Y NA KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 2895 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 52588132 52588259 52588205 Y FIGNL2,GRASP,NR4A1 KRT80,KRT7 NA NA NA NA KRT80 4348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 52674655 52675081 52674843 Y C12orf44,KRT80,KRT7 KRT81 NA NA NA NA KRT81 8237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53253974 53254173 53254090 Y RARG,KRT6A,KRT5 NA KRT83,KRT82,KRT6A,KRT79,KRT78,KRT6B,KRT2,LOC283404,LOC283403,KRT81,KRT84,KRT85,KRT75,KRT6C,KRT71,KRT72,KRT73,KRT1,KRT77,KRT4 IMR90 Hi-C 24141950 KRT18 86482 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 53267781 53268340 53268093 Y PFDN5 NA KRT18,KRT8,LOC283403,EIF4B,KRT80,LOC283404 MCF7 ChIA-PET 22265404 KRT18 72315 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr12 53273269 53273433 53273418 Y NA NA NA NA NA NA KRT18 67222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53318665 53319069 53319016 Y NA KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 21586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53339346 53339557 53339459 Y EIF4B,KRT8,KRT18,KRT18 KRT18,KRT8 NA NA NA NA KRT18 1098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53515585 53515944 53515597 Y NA SPRYD3,IGFBP6,RP11-1136G11.6 NA NA NA NA IGFBP6 26365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53615195 53615822 53615501 Y CSAD,SP1,PRR13,PFDN5 ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1 NA NA NA NA RARG 8942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 53726510 53726905 53726727 Y NA PFDN5,C12orf10,RP11-680A11.5,AAAS,SP1 NA NA NA NA AAAS 9862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 53969356 53969561 53969448 Y NA ATF7 NA NA NA NA ATF7 48638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54411861 54412590 54411908 Y COPZ1,ATP5G2,HOXC10,HOXC9,HOXC8,HOXC4,HOXC6,HOXC5,HOXC4 HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC8 11029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54415475 54415883 54415632 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 8754 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54416528 54417002 54416575 Y NA HOXC10,HOXC6,HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 7635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54433983 54434162 54434078 Y NA HOXC9,HOXC-AS1,HOXC8,HOXC5,HOXC4 NA NA NA NA HOXC5 9346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 54444172 54444407 54444311 Y ATF7,ATP5G2,HOXC12,HOXC11 HOXC8,HOXC5,HOXC4 FLJ12825 IMR90 Hi-C 24141950 HOXC4 1254 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54589708 54589846 54589777 Y CALCOCO1,NCKAP1L,GPR84 SMUG1 SMUG1,HOXC4,HOXC9 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SMUG1 8930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 54810296 54811355 54811225 Y GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5 NA ZNF385A IMR90 Hi-C 24141950 ITGA5 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 55808460 55808880 55808766 Y NA NA NA NA NA NA METTL7B 264450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 56914338 56914532 56914358 Y NA GLS2,RP11-153M3.1,RBMS2 NA NA NA NA RBMS2 625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 57026164 57026397 57026368 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 2203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 57028610 57029302 57028864 Y NA BAZ2A,ATP5B NA NA NA NA BAZ2A 10 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.96006920394286 chr12 57494239 57494362 57494284 Y MBD6,STAT6 TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA NAB2 13562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 57520981 57521279 57521090 Y NA TMEM194A,NAB2,LRP1,STAT6 NA NA NA NA LRP1 705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 57635972 57636429 57636328 Y SLC26A10,R3HDM2,DTX3,B4GALNT1,ARHGEF25,NDUFA4L2 NXPH4,SHMT2 NA NA NA NA SHMT2 14862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 57855378 57855667 57855523 Y NA R3HDM2,INHBE,GLI1,MARS,ARHGAP9 NA NA NA NA GLI1 3460 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 58094555 58094631 58094593 Y NA OS9,AGAP2-AS1,TSPAN31 NA NA NA NA OS9 8817 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 58923778 58923975 58923913 Y LRIG3,LRIG3 NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 388328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 59300729 59300915 59300862 Y LRIG3,LRIG3 LRIG3 NA NA NA NA LRIG3 11388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 59488814 59489192 59489003 Y NA NA LRIG3 IMR90 Hi-C 24141950 LRIG3 176511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 63051832 63051994 63051914 Y MON2,PPM1H NA NA NA NA NA C12orf61 56618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 63124974 63125146 63125033 Y C12orf61 NA NA NA NA NA C12orf61 129760 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 65005842 65006280 65005896 Y GNS,C12orf66,TBK1,RASSF3 RASSF3 NA NA NA NA RASSF3 3549 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 66136008 66136292 66136116 Y HMGA2 NA NA NA NA NA HMGA2 79619 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 66286698 66286979 66286899 Y IRAK3 NA NA NA NA NA RPSAP52 67944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 66628292 66629290 66628922 Y TMBIM4,IRAK3,HELB IRAK3,RBMS1P1 NA NA NA NA RBMS1P1 1278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr12 69036661 69037118 69036873 Y NA RAP1B,RP11-254B13.3,RPL7P42,NUP107 NA NA NA NA RP11-254B13.3 1888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr12 69634325 69634686 69634559 Y SLC35E3,MDM2,YEATS4,RAB3IP,RAB3IP,FRS2,CCT2,CCT2,CPSF6 CPSF6 NA NA NA NA CPSF6 3008 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 69797421 69797731 69797518 Y NA YEATS4 NA NA NA NA YEATS4 45938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 70081797 70082155 70082063 Y NA RAB3IP NA NA NA NA RAB3IP 48306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 70329390 70329536 70329438 Y NA NA PTPRB,KCNMB4 IMR90 Hi-C 24141950 RAB3IP 198929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 70634012 70634396 70634290 Y RAB3IP,KCNMB4,CNOT2,CNOT2,CNOT2 CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA CNOT2 378 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 70650618 70650832 70650694 Y NA CNOT2,RP11-611E13.2 NA NA NA NA RP11-611E13.2 15478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 75878955 75879237 75879096 Y NA GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 6495 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 75885817 75885886 75885852 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA GLIPR1 13357 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 75902459 75902855 75902619 Y KRR1 GLIPR1,KRR1 NA NA NA NA KRR1 561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 76219425 76219952 76219684 Y PHLDA1 NA PHLDA1,NAP1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-114H23.1 155843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 77060081 77060100 77060091 Y NA NA E2F7,ZDHHC17 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC17 95268 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 77166025 77166335 77166180 Y NA ZDHHC17 NA NA NA NA ZDHHC17 10657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 77251083 77251471 77251277 Y NA CSRP2 NA NA NA NA CSRP2 19369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 77456593 77456922 77456786 Y E2F7 E2F7 NA NA NA NA E2F7 438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr12 79279208 79279511 79279476 Y NA NA NA NA NA NA PAWR 803366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 89747699 89748479 89748073 Y NA DUSP6 NA NA NA NA DUSP6 2651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 92458847 92459245 92459094 Y BTG1 NA NA NA NA NA C12orf79 75445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 92501411 92501848 92501769 Y NA C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 32842 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 92517420 92517830 92517671 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 92517978 92518398 92518142 Y BTG1 C12orf79,RP11-796E2.4,BTG1 NA NA NA NA C12orf79 16292 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 93949724 93949882 93949803 Y NA SOCS2,SOCS2-AS1 NA NA NA NA SOCS2 11708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 94170549 94170892 94170731 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 101398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 94172136 94172517 94172167 Y NA NA NA NA NA NA CRADD 102985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 94817703 94818348 94818256 Y NA RBMS2P1,CCDC41 NA NA NA NA RBMS2P1 958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 96589359 96589977 96589479 Y LTA4H,ELK3 ELK3 NA NA NA NA ELK3 3199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 96613519 96613922 96613765 Y NA ELK3 NA NA NA NA ELK3 27359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 96642925 96643253 96643074 Y CDK17 NA NA NA NA NA ELK3 56765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 96650909 96650966 96650937 Y NA NA NA NA NA NA ELK3 64749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 99043983 99044295 99044139 Y NA IKBIP,APAF1 NA NA NA NA APAF1 7064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 100518805 100519127 100519119 Y NA UHRF1BP1L NA NA NA NA UHRF1BP1L 15499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 101692271 101692665 101692300 Y NA UTP20 NA NA NA NA UTP20 20384 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 102191481 102191520 102191506 Y NA GNPTAB NA NA NA NA GNPTAB 31196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 102285250 102285626 102285359 Y DRAM1 DRAM1 NA NA NA NA DRAM1 16121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 104301376 104301628 104301530 Y NA HSP90B1 NA NA NA NA HSP90B1 20257 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 104330398 104330552 104330475 Y NA HSP90B1,C12orf73,TDG NA NA NA NA HSP90B1 8513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 104658660 104659046 104658853 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA RPL18AP3 1604 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 104693849 104694220 104693862 Y NA RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3 NA NA NA NA EID3 1297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 105020354 105020448 105020373 Y NA NA NA NA NA NA CHST11 173281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 106328094 106328476 106328238 Y CKAP4 NA NUAK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NUAK1 203335 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 107377522 107377900 107377585 Y RFX4,RIC8B,MTERFD3 C12orf23,MTERFD3 NA NA NA NA MTERFD3 1044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 108297283 108297694 108297638 Y NA NA NA NA NA NA PRDM4 144234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 108761286 108761499 108761386 Y SSH1,CORO1C,SELPLG,SELPLG CMKLR1 CMKLR1 IMR90 Hi-C 24141950 CMKLR1 30168 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr12 109088465 109088864 109088838 Y SSH1,CORO1C CORO1C NA NA NA NA CORO1C 34508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 109167575 109167781 109167683 Y NA CORO1C NA NA NA NA CORO1C 44203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 109227089 109227462 109227320 Y NA SSH1 NA NA NA NA SSH1 21904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 109232143 109232504 109232328 Y FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 16862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr12 109248007 109248657 109248411 Y SELPLG,CORO1C,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 109249389 109249909 109249762 Y CORO1C,SSH1,SSH1 SSH1 NA NA NA NA SSH1 23 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 110517321 110517546 110517448 Y ARPC3 C12orf76,IFT81 C12orf76 K562 ChIA-PET 22265404 C12orf76 7830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 110750652 110751139 110750939 Y NA ATP2A2 NA NA NA NA ATP2A2 34091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 111028698 111029042 111028796 Y ARPC3,PPTC7,HVCN1 PPTC7,TCTN1 PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPTC7 9573 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 111752741 111753113 111753000 Y NA NA NA NA NA NA FAM109A 51812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 111842634 111842962 111842759 Y NA FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 111847615 111848064 111847953 Y ALDH2,FAM109A,SH2B3 FAM109A,SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 5863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 111875686 111876044 111875771 Y BRAP,SH2B3 SH2B3 NA NA NA NA SH2B3 33934 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 111904763 111905142 111904953 Y ALDH2,ATXN2 NA NA NA NA NA SH2B3 63011 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 112018937 112019235 112019073 Y NA ATXN2 NA NA NA NA ATXN2 16245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 113660919 113661318 113661188 Y TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 4020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 113667617 113667862 113667654 Y DTX1,IQCD,TPCN1 DDX54,TPCN1,IQCD NA NA NA NA IQCD 10718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 113925032 113925100 113925066 Y NA NA RBM19,DTX1 IMR90 Hi-C 24141950 SDS 62926 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 114029271 114029455 114029396 Y LHX5 NA RBM19 IMR90 Hi-C 24141950 SDS 167165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 114449273 114449426 114449313 Y NA RBM19 RBM19,TBX5 IMR90 Hi-C 24141950 RBM19 47097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 115889491 115890073 115889778 Y NA NA TBX3 IMR90 Hi-C 24141950 TBX3 769522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 116362516 116362609 116362584 Y MED13L NA NA NA NA NA MED13L 350534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 116498439 116498839 116498749 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA NA NA NA NA MED13L 214304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 116701070 116701373 116701314 Y MAP1LC3B2,MED13L MED13L NA NA NA NA MED13L 11770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 116821073 116821333 116821156 Y NA NA MED13L,LINC00173,MIR4472-2,MAP1LC3B2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MED13L 107930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 116872040 116872309 116872217 Y NA NA NA NA NA NA LINC00173 96918 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 116893494 116893818 116893640 Y MED13L,MAP1LC3B2 NA MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00173 75409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 116975193 116975459 116975296 Y MED13L,MAP1LC3B2 LINC00173 NA NA NA NA LINC00173 5966 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 120153680 120153798 120153737 Y NA NA NA NA NA NA PRKAB1 50122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 120445148 120445418 120445237 Y CCDC64 NA NA NA NA NA RAB35 107888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 120926786 120926862 120926830 Y SIRT4 TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1,RNF10,COQ5 NA NA NA NA DYNLL1 21133 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 121322345 121322363 121322358 Y NA SPPL3,RPL12P33 NA NA NA NA SPPL3 17811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 121566211 121566268 121566242 Y P2RX4,CAMKK2,P2RX7 P2RX7 P2RX4,P2RX7 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 P2RX7 2354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 121950322 121950543 121950327 Y SETD1B,RHOF NA NA NA NA NA RP13-941N14.1 66154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 122006998 122007221 122007110 Y P2RX4,SETD1B,RHOF RP13-941N14.1,KDM2B NA NA NA NA RP13-941N14.1 9476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 122020162 122020238 122020212 Y RNF34,SETD1B,ORAI1,KDM2B,KDM2B RP13-941N14.1,KDM2B,ORAI1 NA NA NA NA KDM2B 3242 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 122124782 122125118 122124936 Y P2RX4,CAMKK2,WDR66,WDR66,HPD,MORN3 MORN3,TMEM120B MORN3,LOC338799,SETD1B K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 MORN3 16245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 122908043 122908483 122908329 Y ZCCHC8,DENR,CLIP1 CLIP1 NA NA NA NA CLIP1 2864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 124108091 124108301 124108196 Y NA TMED2,DDX55,EIF2B1,GTF2H3,TCTN2 NA NA NA NA EIF2B1 8012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 124907545 124908050 124907792 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 142085 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr12 124916261 124916578 124916546 Y NA NA NA NA NA NA NCOR2 133557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125027797 125027993 125027883 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 22142 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 125028947 125029179 125029054 Y NA NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 20956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125050856 125051375 125051213 Y UBC,NCOR2 NCOR2 NA NA NA NA NCOR2 721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 125066562 125066782 125066660 Y FAM101A NCOR2 NCOR2,SCARB1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NCOR2 16427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125169582 125169721 125169665 Y UBC,NCOR2 NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 119447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125197556 125198099 125197767 Y NCOR2,UBC NA NCOR2,ZNF664-FAM101A IMR90 Hi-C 24141950 NCOR2 147421 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125230587 125231048 125230629 Y NCOR2,UBC NA NCOR2 IMR90 Hi-C 24141950 SCARB1 134166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125412421 125412524 125412468 Y NA SCARB1,UBC NA NA NA NA UBC 12507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 125424077 125424667 125424516 Y NA UBC,DHX37 UBC IMR90 Hi-C 24141950 UBC 24163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 127645786 127646010 127646007 Y NA AC079949.1 NA NA NA NA AC079949.1 2662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr12 130056562 130056756 130056659 Y NA NA NA NA NA NA SLC15A4 750034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 131855919 131857124 131856355 Y NA NA NA NA NA NA SFSWAP 336502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 132014283 132014643 132014520 Y NA NA GPR133 IMR90 Hi-C 24141950 SFSWAP 178983 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.08301166203386 chr12 132232542 132232780 132232661 Y DDX51 SFSWAP NA NA NA NA SFSWAP 38916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr12 132293483 132293821 132293495 Y NA MMP17 NA NA NA NA MMP17 17117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 132647278 132647407 132647355 Y SFSWAP,ULK1,FBRSL1 DDX51,NOC4L,RP13-977J11.2 NA NA NA NA NOC4L 20285 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr12 132899646 132899852 132899767 Y GALNT9 RP13-895J2.2,GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 4083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 132904307 132904701 132904477 Y NA GALNT9 NA NA NA NA GALNT9 372 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr12 132970087 132970237 132970177 Y CHFR,ANKLE2,FBRSL1 NA GALNT9,LOC100130238,P2RX2,POLE,DDX51,NOC4L,LOC100507055,FBRSL1,EP400NL IMR90 Hi-C 24141950 GALNT9 66152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr12 133029955 133030417 133030330 Y NA MUC8,FBRSL1 LOC100507055,FBRSL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MUC8 18309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 20693405 20693544 20693484 Y CRYL1 GJA3 NA NA NA NA GJA3 39644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 20694627 20695029 20694906 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 38159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 20701926 20702100 20701958 Y PSPC1,ZMYM5 GJA3 NA NA NA NA GJA3 31088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 21400254 21400509 21400379 Y NA NA NA NA NA NA N6AMT2 54157 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 21607254 21607660 21607524 Y NA LATS2 NA NA NA NA LATS2 26026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 22583629 22583981 22583861 Y EFHA1 NA NA NA NA NA RPS7P10 382475 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 23500406 23500844 23500578 Y NA NA NA NA NA NA RFESDP1 78166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 23973487 23973793 23973652 Y NA SACS NA NA NA NA SACS 32048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 24528296 24528692 24528455 Y PCOTH SPATA13 SPATA13,TNFRSF19 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 23252 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 24567849 24568139 24567952 Y NA SPATA13 SPATA13 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA13 15905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 24722927 24723324 24723037 Y NA NA SPATA13 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SPATA13 170983 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 26760531 26760858 26760712 Y WASF3 RNF6 WASF3,RNF6 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RNF6 33933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 27572004 27572077 27572041 Y NA NA RASL11A,USP12,MTIF3,RPL21 IMR90 Hi-C 24141950 USP12 171956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 29067304 29067673 29067579 Y NA FLT1 NA NA NA NA FLT1 39 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 29148829 29149214 29148994 Y POMP EIF4A1P7 FLT1 IMR90 Hi-C 24141950 EIF4A1P7 21756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr13 30808184 30808483 30808334 Y NA NA NA NA NA NA PRDX2P1 59801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 31422053 31422459 31422280 Y C13orf33 NA USPL1,ALOX5AP,TEX26-AS1,C13orf33,TEX26 IMR90 Hi-C 24141950 USPL1 232223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 31444557 31445090 31444788 Y C13orf26 NA NA NA NA NA USPL1 254727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 32725009 32725223 32725116 Y NA NA NA NA NA NA BRCA2 162388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 33728009 33728149 33728045 Y STARD13 NA NA NA NA NA STARD13 194618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 33781660 33782051 33781892 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 140716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 34116442 34117241 34116673 Y NA NA NA NA NA NA STARD13 193675 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 34216569 34217156 34216982 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 173030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 34253090 34253722 34253494 Y NA NA NA NA NA NA RFC3 136464 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr13 35322323 35322497 35322408 Y NBEA NA NA NA NA NA NBEA 191927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 36918283 36918673 36918579 Y NA CCDC169,CCDC169-SOHLH2,SOHLH2,SPG20 NA NA NA NA SPG20 23644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 36992146 36992544 36992307 Y SPG20,SPG20 SPG20,CCNA1 NA NA NA NA CCNA1 11423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 40962857 40963140 40963012 Y FOXO1 NA NA NA NA NA FOXO1 275594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 41811647 41811915 41811781 Y NA KBTBD7,MTRF1 NA NA NA NA MTRF1 23827 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 42035432 42035829 42035442 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 152091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 42137571 42138044 42137923 Y NA NA NA NA NA NA NAA16 254230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 42370920 42370928 42370925 Y NA NA NA NA NA NA AKAP11 473361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 42967379 42967658 42967522 Y TNFSF11,DGKH NA NA NA NA NA AKAP11 123090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 43099384 43099709 43099478 Y DGKH,AKAP11,TNFSF11,TNFSF11 TNFSF11 ENOX1 IMR90 Hi-C 24141950 TNFSF11 35163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 44542732 44543742 44543446 Y SERP2 DGKZP1 SERP2 IMR90 Hi-C 24141950 DGKZP1 2172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 44833229 44833563 44833337 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,LINC00284,TSC22D1,NUFIP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 112238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 44848357 44848873 44848719 Y C13orf31,CCDC122,C13orf31 NA SERP2,NUFIP1,TSC22D1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERP2 96928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 45492137 45492940 45492235 Y TSC22D1 NA NA NA NA NA NUFIP1 68678 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 47128078 47128394 47128310 Y LCP1,C13orf18,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 2775 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 47128564 47128952 47128887 Y LCP1,LRCH1 LRCH1 NA NA NA NA LRCH1 3261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 47242568 47242887 47242653 Y NA NA NA NA NA NA LRCH1 117265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 48526121 48526135 48526130 Y MED4,SUCLA2 SUCLA2-AS1 NA NA NA NA SUCLA2-AS1 47390 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 48639735 48640044 48639890 Y NA NUDT15,SUCLA2,MED4 NA NA NA NA MED4 27223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 49569007 49569270 49569139 Y NA FNDC3A NA NA NA NA FNDC3A 20959 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 49888133 49888426 49888280 Y NA NA NA NA NA NA CDADC1 68086 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 50094191 50094472 50094332 Y CAB39L,SETDB2,PHF11,PHF11 PHF11 NA NA NA NA PHF11 26445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 50209681 50209984 50209832 Y SETDB2,ARL11 NA NA NA NA NA RCBTB1 51962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 50857956 50857973 50857965 Y NA NA DLEU2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL34P26 75926 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 51103280 51103738 51103647 Y NA NA DLEU1,DLEU2,EBPL,TRIM13,MIR3613 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL34P26 169381 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 52218923 52219366 52219003 Y WDFY2,DHRS12,DHRS12 NA NA NA NA NA WDFY2 62279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 52303239 52303556 52303323 Y WDFY2 NA NA NA NA NA DHRS12 72737 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 55958757 55958898 55958823 Y NA NA NA NA NA NA PCDH8 2537982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 60338539 60338813 60338676 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 397308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 60580804 60581154 60581101 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 154967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 60679231 60679569 60679243 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH3 56552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 60716670 60717071 60716778 Y NA DIAPH3 NA NA NA NA DIAPH3 19050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 63021628 63021960 63021792 Y NA NA NA NA NA NA PCDH20 1021408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 64508473 64508866 64508848 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 139278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr13 64536046 64536314 64536270 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 111830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 64537945 64538229 64538154 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 109915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 64589476 64589676 64589576 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 58468 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr13 64596462 64596642 64596562 Y NA NA NA NA NA NA LINC00355 51502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 64623751 64624068 64623941 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 24076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr13 64652316 64652644 64652373 Y NA LINC00355 NA NA NA NA LINC00355 4172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 11.2921158520783 chr13 67461334 67461726 67461614 Y PCDH9 NA NA NA NA NA LINC00355 2813190 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 72996613 72996915 72996766 Y NA NA NA NA NA NA MZT1 302910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 73118273 73118475 73118375 Y PIBF1 NA NA NA NA NA MZT1 181350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 74550144 74550303 74550225 Y NA NA NA NA NA NA KLF12 156091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 74708897 74709334 74709161 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 2503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 74709487 74710034 74709735 Y KLF12 KLF12 NA NA NA NA KLF12 3093 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 77166796 77167041 77166918 Y NA NA NA NA NA NA KCTD12 291499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 77897670 77898015 77897832 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 1170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 77898193 77898346 77898226 Y NA MYCBP2 NA NA NA NA MYCBP2 839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 80510902 80511186 80511006 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 401900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 80614628 80615478 80614937 Y NA NA SPRY2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRY2 297608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 80810111 80810307 80810235 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 102779 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 81436860 81437248 81437054 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 523774 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 84480650 84480755 84480723 Y NA NA NA NA NA NA SPRY2 3567564 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr13 87776313 87776722 87776395 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 4221352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 88345046 88345403 88345227 Y NA NA NA NA NA NA MIR17HG 3652671 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 93880621 93881133 93881009 Y NA GPC6 NA NA NA NA GPC6 3526 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 93947360 93947697 93947394 Y NA NA NA NA NA NA GPC6 70265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 95919951 95920261 95920073 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 31426 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 95931058 95931197 95931128 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 20490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 95932787 95933077 95933010 Y NA ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 18610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 95951518 95951672 95951596 Y ABCC4 ABCC4 NA NA NA NA ABCC4 15 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 96262046 96262201 96262124 Y DZIP1 DZIP1 NA NA NA NA DZIP1 32756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 96424038 96424083 96424061 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 96645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 96427402 96427645 96427445 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 100009 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 96498991 96499334 96499248 Y NA NA NA NA NA NA DNAJC3 171598 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97143722 97143959 97143730 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 439986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 97263096 97263285 97263191 Y NA NA NA NA NA NA UGGT2 559360 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97424682 97424992 97424817 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 446696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97550852 97551225 97550967 Y NA NA NA NA NA NA MBNL2 320463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97877294 97877762 97877400 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 5606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr13 97879082 97879401 97879140 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 7394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97908706 97909024 97908751 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 37018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 97913986 97914316 97914087 Y NA MBNL2 NA NA NA NA MBNL2 42298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 97991476 97991911 97991864 Y MBNL2 NA NA NA NA NA RAP2A 92565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 98082020 98082299 98082214 Y MBNL2,RAP2A RAP2A RAP2A IMR90 Hi-C 24141950 RAP2A 2177 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99128143 99128552 99128498 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99128638 99129073 99128919 Y STK24 NA NA NA NA NA STK24 99121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr13 99135278 99135706 99135580 Y NA NA NA NA NA NA STK24 92488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 99161455 99162128 99161863 Y NA NA NA NA NA NA STK24 66066 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99874246 99874352 99874282 Y NA UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3 NA NA NA NA H2AFZP3 8234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99880215 99880463 99880360 Y GPR183 UBAC2-AS1,UBAC2,H2AFZP3 NA NA NA NA H2AFZP3 14203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99950103 99950501 99950500 Y GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 84091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99957911 99958107 99958020 Y DOCK9,CLYBL,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 91899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 99974545 99974749 99974637 Y GPR183 NA NA NA NA NA H2AFZP3 108533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 100026921 100028247 100027781 Y UBAC2,UBAC2,GPR18,GPR183 NA NA NA NA NA TM9SF2 123424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 100620497 100620786 100620718 Y ZIC5,ZIC2 ZIC5 NA NA NA NA ZIC5 1377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 100738422 100738621 100738542 Y NA PCCA NA NA NA NA PCCA 648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 100928465 100928851 100928516 Y NA NA NA NA NA NA RPL15P18 127119 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 103249969 103250343 103250155 Y ERCC5,TPP2 TPP2 NA NA NA NA TPP2 2616 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 104663923 104664083 104664030 Y NA NA NA NA NA NA ERCC5 1168729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr13 105792553 105792815 105792695 Y DAOA NA NA NA NA NA ARGLU1 1425697 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 108103235 108103615 108103559 Y NA NA NA NA NA NA LIG4 765101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 109568044 109568430 109568179 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 666456 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 109576446 109576812 109576641 Y NA NA NA NA NA NA TNFSF13B 674858 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 111044675 111045176 111044974 Y COL4A1,COL4A2 NA NA NA NA NA COL4A1 87179 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 111172874 111173635 111173314 Y ING1,ING1,ANKRD10,RAB20 RAB20 NA NA NA NA RAB20 38445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 111278486 111278706 111278495 Y NA CARKD NA NA NA NA CARKD 12605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 111526935 111527249 111527195 Y RAB20 LINC00346,ANKRD10 NA NA NA NA LINC00346 6773 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 111589420 111590157 111589779 Y NA ANKRD10 ARHGEF7,LINC00346 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 24004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr13 111594578 111594832 111594693 Y RAB20,ANKRD10 ANKRD10 ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 29162 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 111659256 111659421 111659366 Y NA NA ANKRD10,ARHGEF7 IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD10 93840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr13 113677034 113677374 113677296 Y NA NA NA NA NA NA MCF2L-AS1 55896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr13 113928164 113928348 113928293 Y CUL4A LAMP1 NA NA NA NA LAMP1 21208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114147699 114148153 114147800 Y F7,F10,PROZ,GRTP1 DCUN1D2,TMCO3 NA NA NA NA TMCO3 4389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114876029 114876284 114876205 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 19802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114884280 114884926 114884814 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 11160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114892702 114892820 114892783 Y NA RASA3 NA NA NA NA RASA3 3266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114894223 114894969 114894576 Y RASA3 RASA3 NA NA NA NA RASA3 1117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr13 114927536 114927629 114927597 Y RASA3 RASA3 RASA3,CDC16,FLJ44054,ATP4B,CHAMP1 IMR90 Hi-C 24141950 RASA3 31450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 20803011 20803143 20803077 Y NA TTC5,CCNB1IP1,PARP2,RPPH1 NA NA NA NA CCNB1IP1 3540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 21150605 21151121 21150987 Y TEP1,TMEM55B,PNP,ZNF219,ARHGEF40 RNASE4,ANG NA NA NA NA ANG 269 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 21439863 21440073 21439999 Y NA METTL17,RP11-84C10.4 NA NA NA NA METTL17 15856 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr14 21684818 21685080 21685024 Y OR10G2,OR4E2,OR10G3,RNASE8,OR5AU1 NA NA NA NA NA HNRNPC 50573 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 22896809 22896968 22896893 Y NA TRDJ4,TRDJ2 NA NA NA NA TRDJ4 25273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 23083172 23083436 23083304 Y NA DAD1,ABHD4 NA NA NA NA ABHD4 18026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 23293879 23294567 23294288 Y RBM23,C14orf119,SLC7A7,SLC7A7 MRPL52,MMP14,LRP10 REM2 MCF7 ChIA-PET 22265404 MRPL52 2521 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 23307440 23308274 23307581 Y SLC7A8,PSMB5,PSMB5,LRP10,MRPL52,MMP14 MRPL52,MMP14,LRP10 NA NA NA NA MMP14 3674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 23466494 23466910 23466688 Y CDH24,C14orf93 MIR4707,HAUS4,AJUBA,C14orf93,PSMB5 NA NA NA NA C14orf93 10465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 23611395 23611621 23611510 Y SLC7A8 C14orf119,ACIN1 NA NA NA NA ACIN1 48572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 24163763 24164098 24163827 Y NA NA NA NA NA NA DHRS2 66439 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 24454112 24454320 24454216 Y DHRS4L2,DHRS4L2 DHRS4,DHRS4L2 NA NA NA NA DHRS4L2 16964 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 27263370 27263754 27263562 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3006G17.2 1048738 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 27631441 27631502 27631472 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3006G17.2 680990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 30663968 30664325 30664158 Y PRKD1 PRKD1 PRKD1,FOXG1,C14orf23 IMR90 Hi-C 24141950 PRKD1 4864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 30757003 30757069 30757036 Y NA CTD-2251F13.1 NA NA NA NA CTD-2251F13.1 7180 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 32597823 32598061 32597946 Y NUBPL NA NA NA NA NA ARHGAP5-AS1 53824 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 32672212 32672871 32672506 Y ARHGAP5 NA NUBPL,ARHGAP5-AS1,ARHGAP5 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP5-AS1 128213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 32953597 32954289 32954012 Y ARHGAP5,AKAP6,NPAS3 RP11-320M16.1 NA NA NA NA RP11-320M16.1 1591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 33093045 33093198 33093106 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 141039 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 33106586 33106949 33106623 Y NA NA NA NA NA NA RP11-320M16.1 154580 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 33366513 33366604 33366563 Y NA NPAS3 AKAP6 IMR90 Hi-C 24141950 NPAS3 35535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 33592979 33593087 33593032 Y NPAS3 NA NA NA NA NA NPAS3 190840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 33950978 33951281 33951079 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 548839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 33993605 33993755 33993680 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 591466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34033986 34034251 34034169 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 631847 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34095367 34095561 34095464 Y NA NA NA NA NA NA NPAS3 693228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34176402 34176558 34176443 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 753004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 34407262 34407567 34407424 Y NA NA NA NA NA NA SPTSSA 521995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34529400 34529785 34529476 Y EGLN3 NA EGLN3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 399777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34802064 34802306 34802186 Y C14orf147 NA SPTSSA MCF7 ChIA-PET 22265404 SPTSSA 127256 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 34966252 34966485 34966304 Y NA SPTSSA,EGLN3,EAPP NA NA NA NA EGLN3 36272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 35090811 35090907 35090859 Y NA SNX6 NA NA NA NA SNX6 6482 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 35562791 35563105 35562948 Y NA PPP2R3C,KIAA0391 NA NA NA NA PPP2R3C 26618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 35800965 35801124 35801022 Y BAZ1A,SRP54,FAM177A1,PPP2R3C,PSMA6,RALGAPA1,NFKBIA NA NA NA NA NA PSMA6 55126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 35854902 35855043 35854959 Y NA NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 16912 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 35855857 35856187 35856101 Y NA NFKBIA NA NA NA NA NFKBIA 15768 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 36235126 36235268 36235197 Y NA RALGAPA1 NA NA NA NA RALGAPA1 41242 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 36277376 36277519 36277444 Y NFKBIA,RALGAPA1 RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L NA NA NA NA RALGAPA1 866 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 37465189 37465490 37465428 Y NKX2-8,SLC25A21,MIPOL1 NA NA NA NA NA SLC25A21 174581 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 37587049 37587449 37587434 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A21 52622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 39954969 39955272 39955039 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 55265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 39958924 39958943 39958934 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 59220 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 41099089 41099243 41099183 Y NA NA NA NA NA NA FBXO33 1199385 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 7.34535691348783 chr14 42075138 42075996 42075609 Y LRFN5 NA NA NA NA NA FBXO33 2175434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 49375724 49376075 49375898 Y NA NA NA NA NA NA RN7SL1 675222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 50329576 50329987 50329651 Y NA NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 11655 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr14 50334846 50335244 50334992 Y RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6 NEMF,ARF6 SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NEMF 16925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr14 50439731 50439867 50439806 Y NA NA NA NA NA NA RP11-58E21.3 66080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 50467375 50468846 50468075 Y RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 37101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 50527611 50528257 50527921 Y RPL36AL,ARF6,C14orf182 RP11-58E21.3 NA NA NA NA RP11-58E21.3 21664 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 50681069 50681448 50681362 Y NA SOS2 NA NA NA NA SOS2 14828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 50799629 50799645 50799635 Y NA ATP5S,L2HGDH NA NA NA NA L2HGDH 22363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52110768 52111053 52110947 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 156950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52119936 52120349 52120008 Y FRMD6 NA NA NA NA NA FRMD6 166118 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52145900 52146294 52146052 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 144619 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52163680 52163849 52163765 Y FRMD6 NA NA NA NA NA GNG2 127064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52349798 52350236 52349885 Y PTGDR,GNG2 NA NA NA NA NA GNG2 58885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 52365324 52366071 52365347 Y NA NA NA NA NA NA GNG2 74411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52372298 52373220 52372436 Y PTGER2,GNG2 NA NA NA NA NA C14orf166 80973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52584121 52584359 52584179 Y NA NA NID2,C14orf166 IMR90 Hi-C 24141950 NID2 50409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 52622606 52622722 52622664 Y NA NA C14orf166,NID2,PTGDR IMR90 Hi-C 24141950 NID2 88894 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 53257268 53257587 53257438 Y NA GNPNAT1 NA NA NA NA GNPNAT1 882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 53399403 53399746 53399574 Y NA FERMT2 NA NA NA NA FERMT2 17407 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 53575786 53575939 53575850 Y DDHD1 DDHD1 NA NA NA NA DDHD1 42061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr14 54443717 54444101 54443910 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 20238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 54469950 54470091 54470024 Y NA BMP4 NA NA NA NA BMP4 46471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 54833964 54834357 54834051 Y NA CDKN3 NA NA NA NA CDKN3 27210 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 55104908 55105113 55104939 Y NA NA NA NA NA NA SAMD4A 73093 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55152891 55153126 55153104 Y SAMD4A NA NA NA NA NA SAMD4A 121076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55439267 55439511 55439438 Y NA NA NA NA NA NA WDHD1 52312 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55569033 55569319 55569207 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 19509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55569733 55570176 55570087 Y LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L LGALS3 LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LGALS3 18652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr14 55574465 55575376 55574639 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 13452 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55589903 55590059 55589993 Y GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3 LGALS3 LGALS3,DLGAP5,WDHD1,MAPK1IP1L IMR90 Hi-C 24141950 LGALS3 1075 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 55765939 55766288 55766115 Y GCH1 FBXO34,RP11-665C16.6 NA NA NA NA RP11-665C16.6 29146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 55841053 55841315 55841186 Y MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,ATG14 ATG14 NA NA NA NA ATG14 35261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 56047594 56047945 56047904 Y NA KTN1,KTN1-AS1 NA NA NA NA KTN1-AS1 2766 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 57343255 57343511 57343375 Y OTX2,OTX2 NA NA NA NA NA EXOC5 390215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 58726838 58727438 58727133 Y NA PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA PSMA3 17289 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 58748134 58748542 58748422 Y ARID4A PSMA3,RP11-349A22.5,C14orf37,ARID4A NA NA NA NA RP11-349A22.5 14310 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 59656513 59656908 59656842 Y DAAM1 DAAM1 NA NA NA NA DAAM1 3149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 59949393 59949731 59949550 Y C14orf149 JKAMP NA NA NA NA JKAMP 232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 61570265 61570959 61570637 Y SLC38A6 NA NA NA NA NA TRMT5 124189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 61612107 61612325 61612234 Y SIX1 NA SLC38A6,SIX1,SIX4,MNAT1,TRMT5 IMR90 Hi-C 24141950 TRMT5 166031 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 61937176 61937384 61937282 Y NA NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 97874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 61938268 61939375 61939158 Y HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 95883 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 61948602 61948733 61948613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 86525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 61960014 61960497 61960231 Y PRKCH,HIF1A NA NA NA NA NA RP11-47I22.3 74761 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 62068950 62069250 62069099 Y HIF1A RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 33692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 62069550 62069793 62069672 Y NA RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 34292 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 62082808 62083073 62082921 Y SYT16 RP11-47I22.3 NA NA NA NA RP11-47I22.3 47550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 62636657 62636665 62636660 Y SYT16 NA RHOJ,KCNH5,GPHB5 IMR90 Hi-C 24141950 COX4I1P1 339570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 63159002 63159168 63159087 Y NA NA NA NA NA NA RHOJ 509664 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 63170752 63171096 63170924 Y NA NA NA NA NA NA RHOJ 497736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 63894419 63894585 63894502 Y PPP2R5E,KCNH5,GPHB5 NA NA NA NA NA PPP2R5E 113507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 64320785 64320937 64320842 Y PPP2R5E,WDR89,WDR89,SYNE2,SYNE2 SYNE2 NA NA NA NA SYNE2 3102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 64968114 64968655 64968380 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 64975156 64975343 64975202 Y NA AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB25 5225 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 64976158 64976191 64976175 Y ZBTB25,ZBTB1 AKAP5,ZBTB1,ZBTB25,HSPA2,PPP1R36 NA NA NA NA ZBTB25 6227 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 65175295 65175757 65175503 Y SYNE2,ZBTB1,MAX,CHURC1,PLEKHG3 PLEKHG3 NA NA NA NA PLEKHG3 6475 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 65293635 65294075 65293719 Y NA NA NA NA NA NA SPTB 50526 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 65637410 65637773 65637587 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAX 69997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 65746592 65747003 65746788 Y NA NA LOC645431,FUT8,MIR4708 IMR90 Hi-C 24141950 FUT8 128307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 66126309 66126626 66126333 Y NA NA NA NA NA NA FUT8 250999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 67763359 67763655 67763501 Y NA NA NA NA NA NA MPP5 57533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 68431145 68431760 68431180 Y NA NA NA NA NA NA RAD51B 146649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 68973571 68973743 68973640 Y NA NA NA NA NA NA PPIAP6 86658 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 69274132 69274272 69274201 Y NA ZFP36L1 RAD51B,ZFP36L1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L1 12942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 69281323 69281785 69281441 Y DCAF5 ZFP36L1 RAD51B,ZFYVE26 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L1 20133 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 69417007 69417266 69417043 Y NA ACTN1 NA NA NA NA ACTN1 26891 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 69618210 69618757 69618360 Y NA DCAF5,EXD2 NA NA NA NA DCAF5 343 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr14 70251545 70251918 70251732 Y NA NA NA NA NA NA SRSF5 59928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 71797093 71797681 71797289 Y PCNX SIPA1L1,RP1-261D10.2 SIPA1L1,LOC145474 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 10562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 71838643 71839069 71838909 Y PCNX,SIPA1L1 NA SIPA1L1 IMR90 Hi-C 24141950 RP1-261D10.2 52112 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 71996595 71997083 71996703 Y NA NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 210064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 72021992 72022911 72022768 Y SIPA1L1 NA NA NA NA NA RP1-261D10.2 235461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 73083921 73084271 73084094 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4,RBM25 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 274538 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 73110081 73110359 73110171 Y NA NA RGS6,DPF3,DCAF4 IMR90 Hi-C 24141950 DPF3 248450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 73131912 73132517 73132075 Y NA NA NA NA NA NA DPF3 226292 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 73934074 73934542 73934230 Y ZFYVE1,ZFYVE1,RBM25,PSEN1,ZNF410,C14orf43,NUMB NUMB,C14orf169 NA NA NA NA NUMB 5726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 74140666 74140779 74140723 Y FAM161B RP3-414A15.10,DNAL1,PNMA1 NA NA NA NA DNAL1 31088 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 74220862 74221204 74221002 Y NUMB,ZNF410,C14orf43,C14orf43 PNMA1,RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 30859 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 74252099 74252503 74252342 Y NA RP5-1021I20.1 NA NA NA NA RP5-1021I20.1 36 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 74981330 74981609 74981543 Y NPC2 MIR4709,ISCA2,NPC2 NA NA NA NA NPC2 22450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 75038441 75039020 75038725 Y NPC2,DLST LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 38286 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 75059529 75060083 75059743 Y NPC2 LTBP2,CTD-2207P18.2 NA NA NA NA LTBP2 17223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 75086409 75086922 75086553 Y PGF LTBP2,CTD-2207P18.2 LTBP2,KIAA0317,FCF1,YLPM1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CTD-2207P18.2 5059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 75521336 75521721 75521672 Y MLH3,ACYP1 MLH3,ACYP1 NA NA NA NA MLH3 5101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 75777354 75777713 75777592 Y NA FOS,RP11-293M10.5 NA NA NA NA RP11-293M10.5 18247 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 76395057 76395394 76395222 Y ESRRB,TGFB3 IFT43 NA NA NA NA IFT43 28578 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 76734272 76734379 76734290 Y ESRRB NA NA NA NA NA TGFB3 286938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 76843326 76843356 76843341 Y NA NA NA NA NA NA RP11-187O7.1 256648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77386302 77386621 77386483 Y IRF2BPL RP11-488C13.1,RP11-7F17.1 IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-488C13.1 35209 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77466876 77467234 77466958 Y ZDHHC22,NGB,VASH1,KIAA1737,IRF2BPL RP11-7F17.1,IRF2BPL NA NA NA NA IRF2BPL 25800 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr14 77495718 77495873 77495815 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 NA NA NA NA IRF2BPL 2684 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77499482 77500543 77500476 Y VASH1,C14orf166B,IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 6448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr14 77500544 77500911 77500765 Y NA IRF2BPL,RP11-7F17.3 KIAA1737,POMT2,GSTZ1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IRF2BPL 7510 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77505083 77505447 77505354 Y TMEM63C,TMED8,KIAA1737 IRF2BPL,RP11-7F17.3 IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 12049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 77508586 77508871 77508699 Y IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 15552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77509664 77510215 77509840 Y IRF2BPL IRF2BPL,RP11-7F17.3 IRF2BPL IMR90 Hi-C 24141950 IRF2BPL 16630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77591216 77591790 77591612 Y TMED8,NGB TMEM63C,ZDHHC22 NA NA NA NA TMEM63C 10305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 77640033 77640278 77640160 Y NA ZDHHC22 C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC22 32956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 79406333 79406507 79406344 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1141907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 79432037 79432160 79432099 Y NA NA NA NA NA NA ADCK1 1167611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 81019191 81019257 81019224 Y DIO2,CEP128 NA NA NA NA NA DIO2 167091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 81248217 81248588 81248549 Y NA NA NA NA NA NA CEP128 175273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 81685513 81686063 81685724 Y GTF2A1,GTF2A1 SNORA79,DYNLL1P1 NA NA NA NA GTF2A1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr14 88775558 88775609 88775584 Y NA NA NA NA NA NA SPATA7 73659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 88786403 88786557 88786480 Y NA NA NA NA NA NA SPATA7 62711 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 90167936 90168219 90168049 Y TDP1,FOXN3,FOXN3 NA FOXN3,LOC400236,PRO1768,EFCAB11 IMR90 Hi-C 24141950 FOXN3 84443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 91102939 91103218 91103079 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 177605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91134460 91134696 91134603 Y NA NA NA NA NA NA TTC7B 146127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91423143 91423331 91423289 Y RPS6KA5,CCDC88C NA NA NA NA NA C14orf159 101346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91454457 91454803 91454684 Y NA NA NA NA NA NA C14orf159 69874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91575388 91575575 91575505 Y SMEK1,GPR68,CCDC88C,RPS6KA5,C14orf159 NA C14orf102,RPS6KA5,C14orf159,CCDC88C IMR90 Hi-C 24141950 RPS6KA5 50408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91683304 91683542 91683359 Y NA GPR68 NA NA NA NA GPR68 34727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91696123 91696361 91696283 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 GPR68 NA NA NA NA GPR68 21908 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91716270 91716863 91716728 Y RPS6KA5,SMEK1,CCDC88C,GPR68,GPR68 GPR68 NA NA NA NA GPR68 1406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91729802 91729926 91729864 Y GPR68,GPR68 GPR68 GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 GPR68 11533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 91730791 91731194 91731191 Y NA GPR68 GPR68 K562 ChIA-PET 22265404 GPR68 12522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr14 91814664 91814951 91814783 Y RPS6KA5,C14orf159,SMEK1,CCDC88C NA NA NA NA NA CCDC88C 67237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 93192576 93192808 93192662 Y MOAP1,C14orf142,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 20239 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 93193771 93194035 93193928 Y MOAP1,C14orf109,C14orf109,SLC24A4,SLC24A4,RIN3 LGMN NA NA NA NA LGMN 19012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 93587401 93587589 93587495 Y KIAA1409 ITPK1 ITPK1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ITPK1 6736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 95068378 95068532 95068464 Y NA SERPINA5,SERPINA3 NA NA NA NA SERPINA3 8182 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 95680303 95680655 95680479 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 57956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 95691488 95691499 95691495 Y NA NA NA NA NA NA DICER1 69141 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 95731733 95732288 95732036 Y DICER1,CLMN NA NA NA NA NA CLMN 51955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 96562177 96562641 96562498 Y NA NA NA NA NA NA C14orf132 58516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 97646734 97646983 97646791 Y NA NA C14orf177 IMR90 Hi-C 24141950 VRK1 385093 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 98676573 98676976 98676755 Y NA NA CMTM7 MCF7 ChIA-PET 19890323 SETD3 1268240 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 99439262 99439638 99439565 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 505578 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 99827366 99827674 99827539 Y NA NA NA NA NA NA SETD3 117542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr14 99934490 99934508 99934499 Y EML1 SETD3,CCNK NA NA NA NA SETD3 10708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 100071651 100072022 100071781 Y NA CCDC85C,RP11-543C4.1,HHIPL1 NA NA NA NA RP11-543C4.1 2758 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 100415478 100415881 100415722 Y NA NA NA NA NA NA EML1 213448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 100659173 100659604 100659490 Y NA YY1,RP11-638I2.4 DEGS2,YY1,EVL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YY1 43031 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 101029795 101030067 101029931 Y NA BEGAIN NA NA NA NA BEGAIN 21683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 101147038 101147458 101147200 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 42584 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 101151381 101151698 101151540 Y RTL1,DLK1 DLK1 NA NA NA NA DLK1 38344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 101159258 101159870 101159708 Y NA DLK1 NA NA NA NA DLK1 30172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 101237616 101237781 101237733 Y NA DLK1 WDR25,LINC00523,DLK1 IMR90 Hi-C 24141950 DLK1 47574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 101288434 101288543 101288490 Y NA NA NA NA NA NA DLK1 98392 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 102227271 102227509 102227387 Y WDR20,PPP2R5C,PPP2R5C PPP2R5C NA NA NA NA PPP2R5C 1136 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 102288392 102288845 102288491 Y NA NA NA NA NA NA PPP2R5C 62257 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 102414226 102414964 102414565 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 13901 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 4.16602332406772 chr14 102429527 102429743 102429691 Y NA DYNC1H1 NA NA NA NA DYNC1H1 662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr14 102530459 102530762 102530662 Y NA NA NA NA NA NA WDR20 73078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 102554875 102555215 102555129 Y HSP90AA1 WDR20,HSP90AA1 NA NA NA NA WDR20 48625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 102991046 102991386 102991124 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 16910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 102991831 102991939 102991900 Y NA ANKRD9 ANKRD9,RCOR1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANKRD9 17695 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 103673427 103673966 103673589 Y CDC42BPB NA LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-736N17.8 114367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 103781496 103782004 103781810 Y EXOC3L4,TNFAIP2 EIF5 RCOR1,EIF5,MARK3,CDC42BPB,LOC100131366,TNFAIP2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 EIF5 15877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 103929089 103929460 103929098 Y NA NA NA NA NA NA CKB 57988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 104690511 104690903 104690604 Y TMEM179,PPP1R13B,KIF26A RP11-260M19.2 NA NA NA NA RP11-260M19.2 2590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 105144100 105144955 105144117 Y GPR132,AKT1 INF2,ADSSL1 NA NA NA NA INF2 8988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 105201949 105202125 105202062 Y ADSSL1 INF2,ADSSL1,SIVA1 NA NA NA NA ADSSL1 13426 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 105290315 105290696 105290451 Y GPR132 AKT1 NA NA NA NA AKT1 30227 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 105491233 105491512 105491453 Y NA AHNAK2,C14orf79,CDCA4 NA NA NA NA CDCA4 5748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 105536057 105536658 105536303 Y CRIP1,GPR132 NA NA NA NA NA CDCA4 50572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr14 105760670 105760918 105760811 Y C14orf80,C14orf80,C14orf80,GPR132,BRF1 BTBD6,PACS2,BRF1 NA NA NA NA PACS2 3982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr14 105947921 105948133 105948082 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 6059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr14 105948139 105949025 105948432 Y NA CRIP2,C14orf80,TMEM121 NA NA NA NA C14orf80 5167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.52154043298836 chr14 106857348 106857526 106857389 Y NA NA NA NA NA NA LINC00221 78919 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.19264385477249 chr15 21905791 21906130 21906013 Y NA NA NA NA NA NA TUBGCP5 925265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 25018281 25018456 25018384 Y SNURF,SNRPN,SNRPN,SNRPN SNRPN NA NA NA NA SNRPN 48338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 25555752 25555966 25555813 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 126162 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 25564293 25564526 25564383 Y SNRPN,SNURF,SNRPN,UBE3A,UBE3A NA NA NA NA NA UBE3A 117602 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 25614491 25614606 25614563 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 67522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 26327449 26327665 26327505 Y NA NA ATP10A,LOC100128714 IMR90 Hi-C 24141950 UBE3A 645321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 26332554 26332834 26332747 Y NA NA NA NA NA NA UBE3A 650426 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 27014024 27014086 27014055 Y GABRB3,GABRB3,GABRA5,GABRA5 NA NA NA NA NA AC145436.1 569585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 30022522 30022814 30022806 Y FAM189A1 NA NA NA NA NA RP11-680F8.1 57328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 31733081 31733438 31733352 Y MTMR10,KLF13 NA KLF13,OTUD7A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLF13 116023 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 32020218 32020316 32020267 Y NA NA OTUD7A IMR90 Hi-C 24141950 OTUD7A 140676 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 32962221 32962756 32962661 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 45419 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 32964268 32964677 32964326 Y NA GREM1 NA NA NA NA GREM1 43498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 34277588 34277641 34277608 Y C15orf55 NA NA NA NA NA AVEN 51736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 35384953 35385239 35385081 Y NA RP11-323I15.2 ATPBD4 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-323I15.2 2271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 36720333 36720777 36720654 Y NA NA ATPBD4,LOC100507466 IMR90 Hi-C 24141950 C15orf41 149035 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 37403099 37403474 37403147 Y MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2 MEIS2 LOC100507466,C15orf41,MEIS2 IMR90 Hi-C 24141950 MEIS2 11595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 38751078 38751316 38751209 Y NA FAM98B NA NA NA NA FAM98B 6750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 39361992 39362177 39362006 Y NA NA FSIP1,C15orf53 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 509103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 39522676 39523134 39522804 Y NA NA C15orf54 IMR90 Hi-C 24141950 THBS1 348146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 40373777 40374114 40374053 Y FSIP1,BAHD1,BMF,BMF,BMF SRP14,BMF NA NA NA NA BMF 24979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 40391032 40391342 40391133 Y PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 7751 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 40397040 40397227 40397203 Y BUB1B,BMF,BMF,BMF BMF NA NA NA NA BMF 1866 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 40601054 40601299 40601247 Y BMF,BMF,C15orf57,BAHD1,PLCB2 ANKRD63,PLCB2,C15orf52,DISP2 PAK6 K562 ChIA-PET 22265404 PLCB2 2918 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 40728458 40728872 40728667 Y NA IVD,BAHD1,CHST14 NA NA NA NA BAHD1 1048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 41139695 41139794 41139738 Y NA ZFYVE19,DNAJC17,SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA SPINT1 5479 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 41158071 41158384 41158228 Y RHOV SPINT1,RHOV,VPS18 NA NA NA NA RHOV 6103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 41219895 41220240 41219942 Y NA VPS18,DLL4,CHAC1 NA NA NA NA DLL4 357 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 41953918 41954236 41954127 Y EHD4,MGA NA MAPKBP1 IMR90 Hi-C 24141950 TYRO3 106045 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 42083275 42083582 42083459 Y NA MAPKBP1,JMJD7,PLA2G4B,JMJD7-PLA2G4B NA NA NA NA MAPKBP1 18643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 43415014 43415563 43415337 Y NA UBR1,TMEM62 NA NA NA NA TMEM62 1537 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 44838663 44839045 44838853 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 11408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 44869897 44870156 44869963 Y NA EIF3J-AS1,EIF3J NA NA NA NA EIF3J 42642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 45076532 45076874 45076594 Y B2M NA NA NA NA NA TRIM69 57346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 45748469 45749175 45748989 Y SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN RP11-519G16.3 NA NA NA NA RP11-519G16.3 9844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 50400309 50400464 50400394 Y ATP8B4 NA NA NA NA NA HDC 155759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 50620432 50620711 50620437 Y NA GABPB1-AS1,GABPB1 NA NA NA NA GABPB1-AS1 24814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 51369445 51369616 51369500 Y TRPM7,SPPL2A TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 25857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 51369900 51370046 51369953 Y NA TNFAIP8L3 NA NA NA NA TNFAIP8L3 25427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 51850561 51850924 51850712 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2 NA NA NA NA NA DMXL2 62106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 52024012 52024470 52024199 Y TMOD3,MAPK6,DMXL2,LYSMD2 TMOD2,LYSMD2 NA NA NA NA TMOD2 17288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 52135746 52136104 52135949 Y DMXL2,MAPK6,TMOD3 TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 15921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 52153526 52153874 52153708 Y NA TMOD3 NA NA NA NA TMOD3 33701 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 52330351 52330361 52330356 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2184D3.1 55131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 56513902 56514185 56514176 Y NA RFX7,TEX9 NA NA NA NA RFX7 19298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 58898092 58898418 58898348 Y NA NA NA NA NA NA ADAM10 141759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 59019191 59019406 59019394 Y NA ADAM10,FAM63B NA NA NA NA ADAM10 20771 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 59642348 59642705 59642508 Y BNIP2,RNF111 FAM81A,MYO1E NA NA NA NA FAM81A 20187 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 59687013 59687166 59687070 Y NA FAM81A,MYO1E MYO1E,LDHAL6B,FAM81A IMR90 Hi-C 24141950 MYO1E 23914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 60700608 60701055 60700809 Y NA ANXA2,RP11-745A24.2 NA NA NA NA RP11-745A24.2 5946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 60883059 60884017 60883872 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 113682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 61051185 61051571 61051320 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 281808 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 61113423 61113507 61113465 Y NA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 344046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 61520020 61520614 61520340 Y RORA NA NA NA NA NA RP11-219B17.1 750643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 63427902 63428515 63428147 Y USP3,RAB8B,LACTB LACTB,RPS27L NA NA NA NA LACTB 15903 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 63795379 63795825 63795543 Y NA USP3 NA NA NA NA USP3 586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 64057692 64057995 64057851 Y NA NA NA NA NA NA HERC1 66146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64060591 64060833 64060743 Y USP3,HERC1,DAPK2 NA NA NA NA NA HERC1 63308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64540216 64540468 64540344 Y HERC1,ZNF609 NA NA NA NA NA PPIB 86812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64722485 64722825 64722650 Y NA KIAA0101,TRIP4,ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 28116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64753700 64753985 64753784 Y PLEKHO2 ZNF609 NA NA NA NA ZNF609 2759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64919514 64919887 64919625 Y NA RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 36336 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64932987 64933351 64933169 Y PLEKHO2 RP11-330L19.1 NA NA NA NA RP11-330L19.1 49809 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64991554 64991938 64991797 Y NA OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 1542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 64997362 64997587 64997475 Y MTFMT OAZ2 NA NA NA NA OAZ2 3882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 65127928 65128208 65128016 Y NA PIF1,PLEKHO2 PIF1 K562 ChIA-PET 22265404 PLEKHO2 3880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 65189466 65189943 65189728 Y OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21 ANKDD1A SPG21 IMR90 Hi-C 24141950 ANKDD1A 12158 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 65244919 65245418 65244949 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 35230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr15 65245420 65245827 65245459 Y ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,PARP16 ANKDD1A,SPG21 NA NA NA NA SPG21 34821 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr15 65596266 65596532 65596409 Y NA RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5310 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 65596702 65597188 65596889 Y DENND4A RNU5A-1,PARP16 PARP16,CILP,CLPX,IGDCC3,PDCD7,MTFMT,DPP8,RASL12,OSTBETA,IGDCC4,SPG21,PTPLAD1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PARP16 5746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 66125063 66125305 66125185 Y NA DENND4A SLC24A1,DENND4A,RAB11A,C15orf44,MEGF11 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DENND4A 42432 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 66993287 66993569 66993487 Y MAP2K1,SMAD6 SMAD6 NA NA NA NA SMAD6 721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67095524 67095803 67095671 Y NA NA NA NA NA NA SMAD6 102958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr15 67134448 67134928 67134631 Y NA NA SMAD6,SNAPC5 IMR90 Hi-C 24141950 SMAD6 141882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67359902 67360303 67360058 Y NA RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 5801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr15 67383217 67384219 67383746 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 29116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr15 67385827 67386130 67385989 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 31726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 67393197 67393867 67393527 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 39096 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 67399103 67399775 67399548 Y SMAD3 RP11-798K3.2,SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 45002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 67401891 67402640 67402087 Y SMAD3 SMAD3 NA NA NA NA SMAD3 47790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 67423316 67423661 67423503 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 69215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67426476 67426864 67426547 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 72375 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 67440032 67440420 67440131 Y NA NA NA NA NA NA SMAD3 85931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 67442347 67443164 67443030 Y SMAD3 NA NA NA NA NA SMAD3 88246 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67488498 67488886 67488594 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 56252 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 67490281 67490446 67490307 Y SMAD3 NA NA NA NA NA IQCH 54692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67516633 67516865 67516859 Y NA IQCH,AAGAB NA NA NA NA IQCH 28273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 67926783 67927143 67926830 Y NA NA NA NA NA NA MAP2K5 93736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 68132387 68132778 68132514 Y PIAS1 NA NA NA NA NA PIAS1 211739 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr15 68366463 68366575 68366519 Y NA PIAS1 NA NA NA NA PIAS1 21946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 68564194 68564543 68564236 Y NA CLN6,FEM1B FEM1B,CLN6,ANP32A,CORO2B,ITGA11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FEM1B 3598 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 68579972 68580192 68580087 Y ITGA11 CLN6,FEM1B NA NA NA NA FEM1B 11831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 69453904 69454158 69454121 Y GLCE GLCE NA NA NA NA GLCE 2981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 69724089 69724530 69724231 Y NA KIF23,RP11-253M7.1,RPLP1 NA NA NA NA RPLP1 18593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 70027564 70027712 70027628 Y NA NA TLE3,C15orf50 IMR90 Hi-C 24141950 RPLP1 284441 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 70391851 70392235 70392005 Y TLE3 TLE3 NA NA NA NA TLE3 3336 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 70576810 70576951 70576880 Y TLE3 NA LOC145837 IMR90 Hi-C 24141950 TLE3 188295 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 70767457 70767783 70767604 Y TLE3 NA C15orf50,KIF23,LOC145837,TLE3 IMR90 Hi-C 24141950 UACA 286149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 70924070 70924122 70924096 Y NA NA C15orf50,UACA IMR90 Hi-C 24141950 UACA 129810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 71149072 71149436 71149201 Y LARP6 LRRC49,LARP6,THAP10 NA NA NA NA LARP6 4574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 71385768 71386181 71385996 Y NA THSD4 NA NA NA NA THSD4 1110 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 71840441 71840454 71840446 Y NA NA NA NA NA NA THSD4 453150 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 72448533 72448632 72448574 Y TMEM202,CELF6,CELF6,SENP8,SENP8 SENP8,MYO9A NA NA NA NA MYO9A 39615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 72518614 72519346 72519221 Y ARIH1,PKM2 NA NA NA NA NA MYO9A 109696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 72617371 72617435 72617389 Y MYO9A,SENP8,PARP6,CELF6,CELF6,CELF6 HEXA NA NA NA NA HEXA 49382 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 72824073 72824405 72824125 Y NA NA NA NA NA NA ARIH1 59406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 73061587 73061861 73061724 Y PARP6,CELF6,CELF6,ARIH1,ADPGK ADPGK NA NA NA NA ADPGK 14326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 73435699 73435965 73435801 Y NEO1,HCN4 NA NA NA NA NA NEO1 93648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74249257 74249448 74249278 Y NA LOXL1,STOML1,PML NA NA NA NA LOXL1 32927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74412993 74413248 74413104 Y STRA6,CCDC33,C15orf59,TBC1D21 NA NA NA NA NA ISLR 50764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74464511 74464760 74464636 Y CD276,LOXL1,PML,UBL7,UBL7,ISLR,ISLR ISLR,RP11-60L3.1,STRA6 NA NA NA NA ISLR 499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74536866 74536980 74536923 Y NA RP11-60L3.1,STRA6 NA NA NA NA STRA6 34258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74666695 74666987 74666837 Y CLK3,ARID3B NA NA NA NA NA SEMA7A 57821 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 74909072 74909376 74909224 Y NA CLK3 NA NA NA NA CLK3 20231 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 75018665 75019349 75018947 Y SCAMP2,C15orf39,CYP1A1 EDC3,CYP1A1 NA NA NA NA CYP1A1 2714 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr15 75495544 75495835 75495599 Y SIN3A,SIN3A,MAN2C1,CSK,SCAMP2,C15orf39 C15orf39 NA NA NA NA C15orf39 9560 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 75746315 75746749 75746512 Y PPCDC,C15orf39,IMP3,NEIL1,MAN2C1,SIN3A,SIN3A,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 132 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr15 75747348 75747533 75747407 Y RPP25,SIN3A SIN3A NA NA NA NA SIN3A 1165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 76050803 76051078 76050853 Y NA CSPG4,ODF3L1,DNM1P35 NA NA NA NA DNM1P35 21839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 76639120 76639380 76639270 Y NA ETFA,ISL2 NA NA NA NA ISL2 12055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 77351977 77352357 77352309 Y NA TSPAN3 PSTPIP1 IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN3 21969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 77711297 77711794 77711478 Y NA PEAK1,HMG20A NA NA NA NA HMG20A 543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 78598854 78599004 78598959 Y NA DNAJA4,WDR61 WDR61,IDH3A,DNAJA4,IREB2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR61 8718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 79381600 79382164 79381699 Y NA NA NA NA NA NA CTSH 141684 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 80211506 80211893 80211588 Y NA MTHFS,C15ORF37,ST20,ST20-MTHFS,BCL2A1 NA NA NA NA C15ORF37 1614 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 80453068 80453275 80453180 Y BCL2A1,ZFAND6 FAH NA NA NA NA FAH 10236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 80773280 80773702 80773515 Y KIAA1199 NA NA NA NA NA ARNT2 78588 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 81069569 81069760 81069666 Y MESDC1,KIAA1199 NA NA NA NA NA KIAA1199 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 81277111 81277444 81277389 Y STARD5,MESDC1 MESDC2,MESDC1 NA NA NA NA MESDC2 2775 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 82156047 82156216 82156161 Y NA NA NA NA NA NA MEX3B 180266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 83857531 83857848 83857643 Y AP3B2,HDGFRP3 HDGFRP3 NA NA NA NA HDGFRP3 16922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 85455479 85455863 85455740 Y SLC28A1 NA NA NA NA NA PDE8A 65808 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 85628969 85629268 85629119 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 107298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 85645018 85645768 85645040 Y NA NA NA NA NA NA PDE8A 123347 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 85874454 85874742 85874552 Y NA AKAP13 AKAP13 IMR90 Hi-C 24141950 AKAP13 47060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 85987048 85987479 85987219 Y AKAP13,AKAP13 NA NA NA NA NA AKAP13 65246 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 86165783 86166027 86165915 Y NA NA NA NA NA NA KLHL25 170234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 86211201 86211615 86211423 Y AKAP13,KLHL25 NA NA NA NA NA KLHL25 124646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 87733598 87733881 87733709 Y NA NA NA NA NA NA LINC00052 384279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 88021101 88021401 88021180 Y NA NA NTRK3,AGBL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00052 96759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 89156201 89156887 89156382 Y NA AEN,ISG20 NA NA NA NA AEN 5640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 89856537 89857272 89856853 Y NA POLG NA NA NA NA POLG 18820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90017364 90017928 90017702 Y MESP1,C15orf42 NA NA NA NA NA POLG 141272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 90241907 90242276 90242092 Y NA KIF7,PEX11A,WDR93 NA NA NA NA WDR93 9879 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90419728 90419914 90419806 Y ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2 AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38 NA NA NA NA AP3S2 15660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90571687 90571922 90571811 Y ANPEP,AP3S2,ZNF710,SEMA4B,IQGAP1 ZNF710 NA NA NA NA ZNF710 29063 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90722818 90722829 90722824 Y ZNF774 SEMA4B SEMA4B MCF7 ChIA-PET 22265404 SEMA4B 20982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90754464 90755447 90755260 Y SEMA4B,SEMA4B,CIB1 CIB1 NA NA NA NA CIB1 19832 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90938187 90938493 90938325 Y NA ZNF774,IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 8737 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 90944087 90944636 90944284 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,C15orf58,CRTC3,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 14637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr15 90945502 90945781 90945680 Y FES,FES,FES,ZNF710,CIB1,IQGAP1 IQGAP1 NA NA NA NA IQGAP1 16052 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 91153046 91153352 91153276 Y NA NA NA NA NA NA CRTC3 81889 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 91208661 91208996 91208948 Y NA RP11-387D10.2,BLM NA NA NA NA RP11-387D10.2 49376 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr15 91331328 91331736 91331526 Y NA NA NA NA NA NA BLM 72770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 91417545 91417844 91417693 Y NA FURIN,FES,MAN2A2 NA NA NA NA FES 7081 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 93363497 93364154 93363735 Y ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2 ASB9P1,FAM174B ASB9P1,CHD2,LOC100507217 IMR90 Hi-C 24141950 FAM174B 12383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr15 93374780 93375598 93375185 Y NA ASB9P1,FAM174B,CHD2 CHD2,LOC100507217,ASB9P1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FAM174B 23666 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr15 93425040 93425223 93425112 Y C15orf32 CHD2 NA NA NA NA CHD2 514 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 93458042 93458417 93458141 Y NA CHD2 NA NA NA NA CHD2 33516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 93520042 93520437 93520098 Y CHD2 NA NA NA NA NA CHD2 95516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 93542371 93542660 93542397 Y NA NA NA NA NA NA CHD2 117845 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 94670993 94671018 94671006 Y NA NA NA NA NA NA CTD-3049M7.1 58944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 95128045 95128087 95128066 Y NA NA NA NA NA NA MCTP2 355278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 96807705 96807805 96807755 Y NA NA LOC400456 IMR90 Hi-C 24141950 NR2F2 59362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 96898438 96898666 96898552 Y NA NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 2972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 96900187 96900329 96900243 Y NR2F2,NR2F2 NR2F2,NR2F2-AS1,MIR1469,RP11-522B15.3 NA NA NA NA RP11-522B15.3 4721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 99193577 99194531 99194069 Y IGF1R IGF1R NA NA NA NA IGF1R 3377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr15 99270923 99271213 99270975 Y IGF1R NA NA NA NA NA IGF1R 80723 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr15 99397047 99397167 99397105 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 206847 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 99403545 99404056 99403701 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 213345 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 99409834 99409977 99409865 Y NA NA NA NA NA NA IGF1R 219634 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 99525654 99525915 99525785 Y NA NA NA NA NA NA SYNM 110505 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 99995215 99995527 99995307 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 19843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 100025808 100025958 100025883 Y MEF2A,MEF2A MEF2A MEF2A,LRRC28,LYSMD4 IMR90 Hi-C 24141950 MEF2A 10438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 100216338 100216615 100216373 Y MEF2A,MEF2A NA NA NA NA NA LYSMD4 55151 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 100651295 100651582 100651483 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS17 228628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 101234924 101235169 101235060 Y ALDH1A3 NA ALDH1A3,LRRK1,ASB7 IMR90 Hi-C 24141950 LINS 93489 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 101261855 101262549 101262221 Y NA NA ALDH1A3,LRRK1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINS 120420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr15 101499118 101499600 101499493 Y LRRK1 LRRK1 NA NA NA NA LRRK1 41698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 101546574 101546638 101546606 Y NA NA NA NA NA NA LRRK1 89154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 101564329 101564758 101564573 Y PCSK6 NA NA NA NA NA LRRK1 106909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 101631799 101632179 101632024 Y CHSY1 NA NA NA NA NA CHSY1 157958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr15 101834172 101834455 101834316 Y TM2D3,TARSL2,SNRPA1 CHSY1,VIMP,SNRPA1 NA NA NA NA SNRPA1 685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr15 102213485 102213850 102213667 Y NA TM2D3,TARSL2 NA NA NA NA TM2D3 22891 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 121563 121849 121614 Y TMEM8A,PIGQ,PIGQ,NME4,MRPL28,ITFG3,DECR2,RHBDF1,MPG,MPG SNRNP25,POLR3K,RHBDF1,MPG NA NA NA NA RHBDF1 2505 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 578748 579156 578911 Y LUC7L PIGQ,NHLRC4 NA NA NA NA PIGQ 35839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 615969 616302 616108 Y RGS11,NHLRC4 PIGQ,NHLRC4,RAB40C NA NA NA NA NHLRC4 973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 651803 652154 651979 Y NA PIGQ,NHLRC4,RAB40C,C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90 NA NA NA NA RAB40C 14446 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 729341 729555 729445 Y NA C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,STUB1,JMJD8,WDR24,FBXL16,METRN,FAM173A,HAGHL NA NA NA NA STUB1 1117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr16 1150049 1150415 1150232 Y NA NA NA NA NA NA CACNA1H 50826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 1166792 1167154 1166886 Y NA CACNA1H CACNA1H,RPUSD1,CHTF18,GNG13,PRR25,LMF1,SOX8 IMR90 Hi-C 24141950 CACNA1H 34087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 1232339 1232689 1232437 Y NA CACNA1H NA NA NA NA CACNA1H 31098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 1381826 1382192 1381930 Y UNKL,SPSB3,MAPK8IP3,EME2,BAIAP3,BAIAP3 UBE2I,BAIAP3,GNPTG NA NA NA NA BAIAP3 224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 1585996 1586318 1586108 Y NA TELO2,TMEM204 NA NA NA NA TMEM204 9307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 1979729 1980160 1979842 Y TSC2,MLST8,DNASE1L2,C16orf79,ABCA3,CCDC154,NME3,NUBP2,TBL3,RNF151 NDUFB10,SNORA64,RPS2,SNHG9,TBL3 NUBP2,FAHD1,IGFALS,C16orf73,HS3ST6,MAPK8IP3,SPSB3,EME2,NME3,MRPS34,HAGH,LINC00254 IMR90 Hi-C 24141950 NDUFB10 27349 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 2478608 2478672 2478640 Y RPS2,RNF151,TBL3,GFER,NTHL1,TSC2,TRAF7,MLST8,MLST8,DNASE1L2,ECI1,TCEB2,FLYWCH2 CCNF,C16orf59,NTN3,TBC1D24 NA NA NA NA CCNF 1213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr16 2561562 2561710 2561655 Y PKD1,RAB26,CASKIN1,PDPK1 NTN3,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1 NA NA NA NA ATP6V0C 161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 2885761 2886144 2885824 Y NA ZG16B,FLYWCH2 NA NA NA NA ZG16B 7591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 2917931 2918273 2918246 Y NA ZG16B,FLYWCH2,FLYWCH1 PRSS22,LOC100128788,PRSS27,SRRM2,PRSS33,PRSS41,TCEB2,PAQR4,PKMYT1,FLYWCH1,FLYWCH2,KREMEN2,ZG16B,PRSS30P,PRSS21 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 FLYWCH2 12914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 3053798 3054225 3053960 Y NA KREMEN2,PAQR4,PKMYT1,TNFRSF12A,THOC6,HCFC1R1,MMP25 NA NA NA NA TNFRSF12A 12221 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 3156518 3156937 3156694 Y PAQR4,CLUAP1,ZNF205 IL32,ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF205 3624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr16 3200393 3200919 3200597 Y NA ZNF205,ZNF213 NA NA NA NA ZNF213 22615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr16 3285972 3286117 3286070 Y PRSS22,ZSCAN10,ZNF200,ZNF200,ZNF200,ZNF75A,ZNF263 ZNF200,MEFV,ZNF263 NA NA NA NA ZNF200 1751 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 3414643 3415237 3414919 Y NA MTRNR2L4,ZNF174 NA NA NA NA MTRNR2L4 5046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr16 3889135 3889287 3889211 Y NA CREBBP NA NA NA NA CREBBP 39440 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 4010667 4011135 4010934 Y CORO7 NA NA NA NA NA CREBBP 81940 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 4233647 4234082 4234013 Y NA NA NA NA NA NA ADCY9 69461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr16 4321625 4322178 4321908 Y ZNF500,PAM16,MGRN1,HMOX2,FAM100A,C16orf5,C16orf5,ANKS3,TFAP4 TFAP4 NA NA NA NA TFAP4 549 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr16 4357393 4358110 4357824 Y CORO7 TFAP4,PAM16 ADCY9,CREBBP,TFAP4,LOC100507501,VASN,CORO7-PAM16 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP4 36317 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 4666118 4666710 4666381 Y NA MGRN1 NA NA NA NA MGRN1 1624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 4818680 4818913 4818758 Y C16orf5,C16orf5,SEC14L5,ROGDI C16orf71,ANKS3,ZNF500,ROGDI NA NA NA NA ZNF500 3055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 8015278 8015380 8015329 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 698160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 8159340 8159643 8159579 Y NA NA NA NA NA NA METTL22 553897 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 8852303 8852368 8852337 Y NA PMM2,TMEM186 PMM2,TMEM186 IMR90 Hi-C 24141950 PMM2 28312 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 9055639 9056008 9055791 Y C16orf72,USP7 USP7 NA NA NA NA USP7 363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 9162231 9162510 9162397 Y NA C16orf72 USP7,C16orf72 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 C16orf72 20995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 9277609 9277994 9277792 Y NA NA ATF7IP2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf72 94104 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 11032093 11032474 11032340 Y NA DEXI,CLEC16A NA NA NA NA DEXI 1843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 11086769 11086952 11086818 Y NA NA NA NA NA NA CLEC16A 50424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr16 11295999 11296122 11296015 Y SNN,LITAF,LITAF,NUBP1,CIITA,SOCS1 RMI2 NA NA NA NA RMI2 45354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 11591931 11591962 11591945 Y NA NA SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF IMR90 Hi-C 24141950 LITAF 136275 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 11734091 11734770 11734262 Y SOCS1,ZC3H7A,TXNDC11,RUNDC2A,LITAF,LITAF,SNN LITAF,SNN TXNDC11,SNN,CLEC16A,LITAF IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LITAF 5854 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 11890330 11890418 11890367 Y LITAF,LITAF,SNN,RUNDC2A,TXNDC11,ZC3H7A ZC3H7A NA NA NA NA ZC3H7A 1207 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 11968147 11968344 11968329 Y ZC3H7A RSL1D1,GSPT1 RSL1D1 IMR90 Hi-C 24141950 RSL1D1 24705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 12008398 12008797 12008598 Y NA GSPT1 NA NA NA NA GSPT1 459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr16 13873618 13873819 13873731 Y NA NA NA NA NA NA ERCC4 138195 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr16 14050567 14050869 14050623 Y MKL2 ERCC4 NA NA NA NA ERCC4 38553 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 15766632 15767024 15766843 Y KIAA0430,NDE1,NDE1 KIAA0430,NDE1 NA NA NA NA NDE1 31508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 16242630 16242651 16242642 Y NA NA NA NA NA NA NOMO3 81701 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 17458127 17458575 17458373 Y NA NA NA NA NA NA XYLT1 104163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 18811720 18812078 18811899 Y SMG1,COQ7,COQ7 RPS15A,ARL6IP1 NA NA NA NA ARL6IP1 720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 19106464 19106699 19106563 Y NA COQ7,ITPRIPL2 NA NA NA NA ITPRIPL2 16555 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 19707699 19708034 19707815 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 17744 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 19710173 19710469 19710241 Y NA IQCK NA NA NA NA IQCK 15309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr16 19769577 19769967 19769778 Y CCP110,GPRC5B,IQCK IQCK NA NA NA NA IQCK 43799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 21656930 21657029 21656972 Y CRYM,METTL9,IGSF6 NA NA NA NA NA METTL9 50391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 22046502 22046742 22046619 Y NA C16orf52 NA NA NA NA C16orf52 29543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 22202596 22202946 22202679 Y POLR3E,CDR2 EEF2K UQCRC2,POLR3E,PDZD9,C16orf52,VWA3A,EEF2K K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 12657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 22207042 22207397 22207176 Y NA EEF2K POLR3E,EEF2K,C16orf52 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EEF2K 8206 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 22349127 22349159 22349143 Y POLR3E POLR3E NA NA NA NA POLR3E 42397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 22421466 22421891 22421890 Y NA SMG1P1,CDR2,RRN3P3 NA NA NA NA SMG1P1 24438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 23431856 23432257 23432204 Y USP31,COG7 COG7 SCNN1B IMR90 Hi-C 24141950 COG7 30244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 23531974 23532033 23532005 Y NA GGA2,UBFD1,EARS2 NA NA NA NA GGA2 658 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 24538501 24538703 24538598 Y RBBP6 RBBP6 NA NA NA NA RBBP6 8311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 24865270 24865636 24865496 Y SLC5A11 NA ARHGAP17 IMR90 Hi-C 24141950 TNRC6A 126254 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 25060889 25061147 25061001 Y NA ARHGAP17 NA NA NA NA ARHGAP17 35902 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 25564339 25564353 25564346 Y NA NA NA NA NA NA ZKSCAN2 297087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 26609483 26609820 26609735 Y NA NA HS3ST4 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 668295 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 26625836 26626028 26625891 Y NA NA HS3ST4 IMR90 Hi-C 24141950 NSMCE1 652087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 27338285 27338559 27338369 Y KIAA0556,IL4R IL4R NA NA NA NA IL4R 15296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 27533512 27533805 27533694 Y JMJD5,JMJD5,IL21R,KIAA0556,GTF3C1 GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 25429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 27546889 27546978 27546937 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA GTF3C1 12256 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 27577101 27577365 27577280 Y NA GTF3C1,KIAA0556 NA NA NA NA KIAA0556 17647 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 28160349 28160575 28160437 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 NA NA NA NA NA XPO6 60666 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 28186234 28186473 28186328 Y SULT1A1,SULT1A1,APOBR,XPO6 XPO6 NA NA NA NA XPO6 34768 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 29168403 29168702 29168538 Y SPNS1 NA RRN3P2 IMR90 Hi-C 24141950 RRN3P2 84240 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 29709853 29709969 29709906 Y QPRT SPN,QPRT,C16orf54 NA NA NA NA QPRT 37253 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 29712327 29712432 29712378 Y HIRIP3,QPRT SPN,QPRT,C16orf54 NA NA NA NA QPRT 39727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 29796508 29796713 29796645 Y KCTD13,C16orf92,ALDOA C16orf54,KIF22,MAZ,PRRT2,MVP NA NA NA NA KIF22 3327 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 30579441 30579843 30579693 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,SEPT1,ITGAL,STX4,ZNF689 ZNF768,AC002310.12,ZNF747,ZNF764,AC002310.7,ZNF688,ZNF785 NA NA NA NA AC002310.7 1728 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 30645556 30645885 30645776 Y CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14 ZNF689,PRR14,FBRS PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF689 12223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr16 30885980 30886229 30886174 Y ZNF689,PHKG2,RNF40,C16orf93,ZNF668 MIR4519,BCL7C,CTF1,FBXL19,FBXL19-AS1 NA NA NA NA MIR4519 1336 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 31129616 31130225 31129940 Y ARMC5,STX4,PYCARD,ITGAX,ITGAM,ZNF668,ZNF668,ZNF646,MYST1,FUS ZNF646,PRSS53,VKORC1,BCKDK,KAT8,PRSS8 NA NA NA NA KAT8 4541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 31264985 31265278 31265093 Y STX4,ZNF668,ZNF646,MYST1,ITGAX,PYCARD,ITGAM NA NA NA NA NA PYCARD 52214 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 31888166 31888535 31888469 Y ARMC5,ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 5087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 31905713 31906088 31906002 Y ZNF267 ZNF267 NA NA NA NA ZNF267 22634 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 33509690 33509798 33509723 Y NA NA NA NA NA NA ZNF267 1626611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 46823783 46824029 46823881 Y NA C16orf87 NA NA NA NA C16orf87 39294 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr16 48400459 48400723 48400564 Y LONP2,N4BP1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 79590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 48417730 48418013 48418003 Y N4BP1,SIAH1,SIAH1 NA NA NA NA NA SIAH1 62300 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 49316261 49316466 49316357 Y CBLN1,C16orf78 NA NA NA NA NA N4BP1 664202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 49910498 49910724 49910573 Y NA NA ZNF423 IMR90 Hi-C 24141950 HEATR3 187128 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 50236881 50237262 50237048 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 40786 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 50313130 50313496 50313255 Y NA ADCY7 NA NA NA NA ADCY7 35082 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 51186041 51186738 51186313 Y NA NA NA NA NA NA CYLD 412080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr16 51572702 51572897 51572800 Y NA NA SALL1 IMR90 Hi-C 24141950 HNRNPA1P48 104770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 51670868 51671078 51670973 Y NA HNRNPA1P48 NA NA NA NA HNRNPA1P48 6589 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 53125869 53126178 53125948 Y NA CHD9 NA NA NA NA CHD9 38924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 53165497 53165808 53165602 Y NA NA NA NA NA NA CHD9 78552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 53465709 53465843 53465769 Y NA RBL2 NA NA NA NA RBL2 46 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 53802432 53802770 53802659 Y NA NA NA NA NA NA FTO 66557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 56641054 56641530 56641359 Y MT2A,MT1E MT3,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 943 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 56644047 56644457 56644379 Y NLRC5,HERPUD1 MT3,MT2A,MT1E,MT1A,MT1F NA NA NA NA MT2A 3936 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 57670999 57671200 57671100 Y GPR56,PLLP,CX3CL1,CCL17,GPR56 GPR56,GPR97 NA NA NA NA GPR56 28435 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 57680678 57681373 57680764 Y NA GPR56,GPR97,CCDC135 NA NA NA NA GPR97 18726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 57717053 57717380 57717096 Y FAM192A,ZNF319,GPR97 GPR97,CCDC135 NA NA NA NA CCDC135 9325 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 57825127 57825454 57825291 Y NA NA NA NA NA NA KATNB1 57485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 66587187 66587393 66587288 Y NA TK2,CKLF,CKLF-CMTM1,CMTM1,CMTM3 NA NA NA NA CKLF-CMTM1 2697 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 66784501 66784840 66784671 Y NA DYNC1LI2 NA NA NA NA DYNC1LI2 800 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 66906996 66907469 66907329 Y SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2 NAE1,PDP2 NA NA NA NA NAE1 1837 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr16 66960903 66961306 66961106 Y PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD RRAD,FAM96B,CES2,CES3 NA NA NA NA RRAD 3356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 67149596 67149757 67149715 Y LRRC29,LRRC29,FAM65A,ATP6V0D1,C16orf70 C16orf70,B3GNT9,FBXL8,TRADD,HSF4 NA NA NA NA C16orf70 7735 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 67565199 67565482 67565398 Y C16orf70,LRRC29,LRRC29,FHOD1,PSMB10,DPEP2,DDX28,ATP6V0D1,FAM65A FAM65A,CTCF NA NA NA NA FAM65A 14878 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 67597304 67597932 67597899 Y THAP11,RLTPR,ACD FAM65A,CTCF NA NA NA NA CTCF 2994 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 67687517 67687714 67687560 Y HSF4,KIAA0895L,SLC9A5,TSNAXIP1,PARD6A RLTPR,ACD,PARD6A,C16orf86 NA NA NA NA ACD 4999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 68234152 68234458 68234209 Y NA PLA2G15 NA NA NA NA PLA2G15 42749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 68271348 68271876 68271591 Y TSNAXIP1,SLC12A4,ESRP2 PLA2G15,SLC7A6 NA NA NA NA PLA2G15 5331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr16 68544131 68544336 68544235 Y NA ZFP90,RNU4-36P SMPD3,CDH1,PRMT7,CDH3 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP90 17657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 69351854 69351929 69351891 Y NA VPS4A,PDF,NIP7,COG8 NA NA NA NA VPS4A 8595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 69432325 69432475 69432421 Y TERF2 TERF2,CYB5B NFAT5,MIR1538,VPS4A,COG8,TERF2,NOB1,CYB5B,NQO1,WWP2 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TERF2 7999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 69563572 69563696 69563627 Y NA NFAT5 NFAT5,CYB5B,TERF2,MIR1538 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFAT5 33301 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 69751128 69751528 69751345 Y PDF,TERF2,NQO1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA NQO1 7326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 69790577 69791500 69790768 Y PDF,NIP7,NOB1 NQO1,NOB1,WWP2 NA NA NA NA WWP2 2709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.30227604751111 chr16 70467076 70467247 70467197 Y NA ST3GAL2,FUK NA NA NA NA ST3GAL2 3893 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 70470997 70471281 70471214 Y NA FUK NA NA NA NA ST3GAL2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 70725776 70726100 70725941 Y MTSS1L MTSS1L MTSS1L MCF7 ChIA-PET 22265404 MTSS1L 7807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 71070712 71070940 71070844 Y NA NA NA NA NA NA HYDIN 191685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 71753676 71753893 71753785 Y HPR,PHLPP2 PHLPP2 NA NA NA NA PHLPP2 2711 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 72459158 72459630 72459377 Y NA NA NA NA NA NA TXNL4B 332828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr16 72882732 72883050 72882991 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX3 208547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 73023566 73023933 73023728 Y ZFHX3 NA NA NA NA NA ZFHX3 67664 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 73053285 73053647 73053466 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 37950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 73088640 73089206 73088991 Y NA ZFHX3 NA NA NA NA ZFHX3 2391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 73104505 73104770 73104567 Y ZFHX3,ZFHX3 ZFHX3 ZFHX3,HTA IMR90 Hi-C 24141950 ZFHX3 12908 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 73206454 73206866 73206668 Y NA NA ZFHX3,HPR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFHX3 114857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr16 74353064 74353398 74353241 Y FA2H PSMD7,RP11-252A24.2 NA NA NA NA PSMD7 24391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 74539925 74540002 74539964 Y NA NA NA NA NA NA GLG1 99010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 74702224 74702291 74702259 Y NA RFWD3,MLKL NA NA NA NA RFWD3 3445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 75278988 75279894 75279594 Y CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1 BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 20057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 75286788 75287025 75286897 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 12926 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 75288221 75288577 75288338 Y NA BCAR1 NA NA NA NA BCAR1 11374 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 75598847 75599270 75599139 Y TMEM170A TMEM231,GABARAPL2 NA NA NA NA GABARAPL2 598 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 75628076 75628219 75628207 Y NA TMEM231,GABARAPL2,ADAT1 NA NA NA NA ADAT1 26979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 76269107 76269317 76269211 Y NA RPL18P13 NA NA NA NA RPL18P13 1586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 78832287 78832508 78832373 Y NA NA NA NA NA NA WWOX 700977 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 78908280 78908607 78908407 Y NA NA NA NA NA NA MAF 724004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 79635433 79635866 79635594 Y MAF MAF NA NA NA NA MAF 2822 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 79692252 79692530 79692298 Y NA NA WWOX IMR90 Hi-C 24141950 MAF 59641 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 80060890 80061347 80061153 Y NA NA NA NA NA NA MAF 428279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 80648932 80649251 80648956 Y NA NA NA NA NA NA DYNLRB2 76301 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 80694679 80694985 80694832 Y CDYL2 NA NA NA NA NA DYNLRB2 122048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 80838768 80839127 80839024 Y CENPN,C16orf61,ATMIN,CDYL2 CDYL2 NA NA NA NA CDYL2 2542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81514966 81515415 81515191 Y NA CMIP NA NA NA NA CMIP 38191 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81634791 81634955 81634874 Y GAN NA NA NA NA NA PLCG2 135747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81649296 81649780 81649593 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 120922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81659842 81660553 81660320 Y NA NA NA NA NA NA PLCG2 110149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81785976 81786155 81786044 Y PLCG2,CMIP,CMIP PLCG2 ATMIN,PKD1L2,GAN,BCMO1,MIR4720 IMR90 Hi-C 24141950 PLCG2 15274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81865379 81865629 81865509 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 94677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 81900511 81900900 81900809 Y CMIP,CMIP,PLCG2 NA NA NA NA NA PLCG2 129809 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 82661526 82661961 82661896 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 3118 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 82662605 82662975 82662756 Y CDH13 CDH13 NA NA NA NA CDH13 4197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 82685978 82686417 82686161 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 27570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 82687139 82687406 82687299 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 28731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 82687467 82688028 82687715 Y NA CDH13 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 CDH13 29059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 82689057 82689347 82689181 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 30649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 82693893 82694152 82693974 Y NA CDH13 NA NA NA NA CDH13 35485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 83715826 83716249 83715944 Y HSBP1 NA NA NA NA NA HSBP1 123199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 83777004 83777385 83777194 Y HSDL1 NA NA NA NA NA HSBP1 62063 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 83780658 83780994 83780826 Y OSGIN1 NA NA NA NA NA HSBP1 58454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr16 83835897 83836084 83835978 Y NA HSBP1 HSBP1 IMR90 Hi-C 24141950 HSBP1 3364 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr16 84523883 84523965 84523925 Y NA NA NA NA NA NA COTL1 125718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 84641438 84641605 84641502 Y ZDHHC7,KIAA0513,CRISPLD2,COTL1 COTL1,KLHL36 NA NA NA NA COTL1 8078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 84866015 84866457 84866298 Y NA CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 14425 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 84869763 84870234 84870125 Y CRISPLD2 CRISPLD2 NA NA NA NA CRISPLD2 18173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 85185210 85185759 85185517 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 125835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 85202555 85203049 85202710 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0513 143180 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 14.1425528632825 chr16 85268297 85268637 85268360 Y NA NA LOC400548,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 208922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85355565 85356105 85355766 Y NA NA FAM92B,LOC727710,GINS2,KIAA0182,KIAA0513,LINC00311 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0513 296190 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85473143 85473232 85473181 Y NA NA KIAA0182,LOC400548,FAM92B,LINC00311,LOC727710,GINS2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 248447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85499556 85499891 85499629 Y NA NA KIAA0182,LOC727710,C16orf74,LINC00311,LOC400548,FAM92B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 221788 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85586938 85587370 85587020 Y NA NA LINC00311,LOC400548,KIAA0182,FAM92B,LOC727710,C16orf74,KIAA0513,GINS2,COX4NB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GINS2 134309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 85604470 85605423 85604746 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 116256 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85606114 85606473 85606294 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 115206 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85608106 85608214 85608158 Y NA NA LINC00311,FAM92B IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 113465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85617282 85617663 85617577 Y NA NA LOC727710,LOC400548,LINC00311,KIAA0182,C16orf74 IMR90 Hi-C 24141950 GINS2 104016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 85751381 85751721 85751674 Y NA GINS2,C16orf74 NA NA NA NA GINS2 29702 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85780154 85780247 85780189 Y NA C16orf74,COX4I1 GINS2 IMR90 Hi-C 24141950 C16orf74 2488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 85783855 85783992 85783913 Y NA C16orf74,COX4I1 NA NA NA NA C16orf74 1120 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 86192413 86192513 86192490 Y NA NA LOC400550,MTHFSD,FOXF1,LOC146513,LOC732275,COX4I1,COX4NB IMR90 Hi-C 24141950 IRF8 262004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 86421149 86421325 86421222 Y FOXF1,FOXC2 NA LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXF1 120808 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr16 86541340 86541581 86541457 Y FOXF1 FOXF1,MTHFSD NA NA NA NA FOXF1 552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 86587305 86587716 86587504 Y NA FOXF1,MTHFSD,FOXC2,FOXL1 NA NA NA NA MTHFSD 464 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 86964858 86965748 86965178 Y NA NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 356884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 86985410 86985767 86985608 Y FOXC2,FOXL1 NA FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95 IMR90 Hi-C 24141950 FOXL1 377436 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 87490621 87490719 87490682 Y NA NA NA NA NA NA FBXO31 66873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 87780321 87780693 87780507 Y NA KLHDC4 NA NA NA NA KLHDC4 16905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 87810498 87810587 87810524 Y NA KLHDC4 ZCCHC14,JPH3,KLHDC4,CA5A,SLC7A5,BANP,ZFPM1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KLHDC4 12900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 87870717 87871153 87871035 Y NA SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 29941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 87886258 87886670 87886593 Y MAP1LC3B,ZCCHC14,BANP,BANP,BANP SLC7A5 NA NA NA NA SLC7A5 14424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 87952545 87952677 87952600 Y BANP,BANP BANP NA NA NA NA BANP 28173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 88338212 88338634 88338285 Y ZNF469 NA BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 179091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 88450186 88450490 88450462 Y NA NA CA5A,SLC7A5,BANP IMR90 Hi-C 24141950 ZFPM1 67235 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 88771579 88772211 88771675 Y ACSF3,ZFPM1,ZC3H18,CYBA,GALNS,CBFA2T3,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166 MVD,SNAI3,RNF166,CTU2 NA NA NA NA CTU2 708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 88835950 88836275 88836191 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT RNF166,CTU2 K562 ChIA-PET 22265404 PIEZO1 13344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 88857121 88857244 88857196 Y NA PIEZO1,CDT1,APRT NA NA NA NA PIEZO1 7502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 88919657 88920044 88919827 Y SNAI3,RNF166,RNF166,CBFA2T3 APRT,TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA TRAPPC2L 584 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 88921143 88921285 88921195 Y ZC3H18,CYBA,SNAI3,RNF166,RNF166,RNF166,CBFA2T3 APRT,TRAPPC2L,GALNS NA NA NA NA GALNS 93 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89066514 89066746 89066599 Y CBFA2T3 NA ACSF3 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2555A7.2 50627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89241276 89241597 89241419 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA CDH15 5101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.6178623603746 chr16 89268043 89268411 89268231 Y NA CDH15,ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 13707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.96006920394286 chr16 89313669 89314138 89313993 Y ZNF276,ZNF778 ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 31551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr16 89323118 89323579 89323381 Y NA ZNF778 NA NA NA NA ZNF778 41000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr16 89388621 89389157 89388908 Y ZNF276,C16orf7 NA NA NA NA NA ZNF778 106503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89392350 89392997 89392648 Y NA NA NA NA NA NA ZNF778 110232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89451016 89451317 89451295 Y CBFA2T3,ACSF3,ZNF778,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPG7,SPATA2L,ANKRD11 NA NA NA NA NA ANKRD11 103652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 89555521 89555997 89555713 Y ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,C16orf7,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 89571786 89572109 89572034 Y ACSF3,ZNF276,ZNF276,TCF25,SPATA2L,CHMP1A,ANKRD11 ANKRD11,SPG7 NA NA NA NA SPG7 16461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89579992 89580270 89580045 Y ACSF3,ZNF778,DBNDD1,ZNF276,SPG7 ANKRD11,SPG7,RPL13,SNORD68 NA NA NA NA SPG7 24667 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr16 89879863 89880236 89880053 Y NA FANCA,SPIRE2 NA NA NA NA FANCA 829 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr16 89904172 89904600 89904272 Y MC1R,SPIRE2 FANCA,SPIRE2,TCF25 NA NA NA NA SPIRE2 21585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr16 89992380 89992810 89992683 Y NA MC1R,AC092143.1,TUBB3,DEF8,CENPBD1,AFG3L1P NA NA NA NA TUBB3 6580 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 574639 574965 574941 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 15852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 576455 576740 576580 Y NA RPS4XP17,VPS53 NA NA NA NA RPS4XP17 17668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 654300 654699 654470 Y NA VPS53,FAM57A,DBIL5P,GEMIN4,RNMTL1,GLOD4 NA NA NA NA DBIL5P 400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 872261 872610 872409 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 8400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 873777 873849 873813 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 7161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 881410 881576 881449 Y NA NXN,TIMM22 NA NA NA NA NXN 400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 932596 932954 932809 Y NA TIMM22 NXN IMR90 Hi-C 24141950 TIMM22 34239 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1107024 1107388 1107281 Y NA ABR ABR,INPP5K,PITPNA,SLC43A2,YWHAE,LOC100306951,BHLHA9,MYO1C,CRK IMR90 Hi-C 24141950 ABR 22927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1157102 1157245 1157179 Y NA ABR ABR,YWHAE,PITPNA,INPP5K,LOC100306951,SCARF1,RILP,TUSC5,BHLHA9,CRK,SLC43A2 IMR90 Hi-C 24141950 ABR 26787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1390195 1390341 1390268 Y MYO1C,MYO1C,MYO1C CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 3765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 1391218 1391783 1391434 Y NA CRK,MYO1C,INPP5K,PITPNA-AS1 NA NA NA NA MYO1C 2323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr17 1521068 1521369 1521308 Y CRK,WDR81,HIC1,PITPNA,SLC43A2,SCARF1 SLC43A2,RILP NA NA NA NA SLC43A2 8811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1585953 1586309 1586247 Y NA RILP,TLCD2,WDR81,MIR22HG NA NA NA NA PRPF8 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1953067 1954207 1953327 Y TSR1,SMG6,SMG6,SGSM2,SGSM2,PITPNA,SLC43A2,RTN4RL1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 1241 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr17 1974774 1975359 1974921 Y SCARF1,HIC1,HIC1 RTN4RL1,DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 19326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr17 1979194 1979509 1979218 Y NA DPH1,OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 23746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 1992717 1993096 1992933 Y SLC43A2,SCARF1,WDR81 OVCA2,HIC1 NA NA NA NA HIC1 37269 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 1994416 1994643 1994603 Y HIC1,HIC1 HIC1 NA NA NA NA HIC1 38968 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2026015 2026378 2026080 Y SERPINF2,SERPINF2 NA NA NA NA NA HIC1 70567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2077546 2077639 2077593 Y NA NA NA NA NA NA HIC1 122098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2082960 2083277 2083133 Y NA NA NA NA NA NA SRR 121400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2095819 2096093 2095903 Y WDR81 NA NA NA NA NA SRR 108584 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2166387 2166805 2166676 Y METTL16,SMG6,SMG6 SRR,SMG6 NA NA NA NA SRR 37872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2300026 2300553 2300288 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 1859 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 2302108 2302510 2302261 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT NA NA NA NA NA MNT 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2302778 2303366 2303033 Y SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT MNT NA NA NA NA MNT 366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 2305266 2305571 2305415 Y RAP1GAP2,PAFAH1B1,MNT MNT NA NA NA NA MNT 2854 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2409124 2409453 2409310 Y NA METTL16 NA NA NA NA METTL16 3732 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2627139 2627523 2627311 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50827 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 2627618 2628097 2628087 Y NA NA NA NA NA NA RAP1GAP2 50253 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 2952123 2952503 2952284 Y ASPA,ASPA,PAFAH1B1 NA NA NA NA NA RAP1GAP2 273773 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4125491 4125809 4125534 Y NA ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4205148 4205753 4205440 Y P2RX1,ATP2A3,ZZEF1,ZMYND15,ZMYND15,SMTNL2,SMTNL2,ARRB2,UBE2G1 ANKFY1 NA NA NA NA ANKFY1 39874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4412786 4412979 4412855 Y NA MYBBP1A NA NA NA NA MYBBP1A 43947 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4811647 4812042 4811731 Y NA GP1BA,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1 NA NA NA NA GP1BA 21550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4839784 4839936 4839857 Y C17orf107 GP1BA,RNF167,SLC25A11,ENO3,PFN1,SPAG7,CAMTA2 NA NA NA NA RNF167 1367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 4934963 4935218 4935186 Y NA CAMTA2,INCA1,KIF1C,ZFP3 NA NA NA NA KIF1C 35720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 5000892 5001205 5000989 Y NA ZFP3,AC012146.7,ZNF232 NA NA NA NA AC012146.7 11558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 5412379 5412497 5412422 Y USP6 DHX33,MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 24248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 5430157 5430402 5430333 Y NLRP1 MIS12,DERL2 NA NA NA NA DERL2 42026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 5505945 5506132 5506040 Y NA NLRP1 WSCD1,AIPL1,FAM64A IMR90 Hi-C 24141950 NLRP1 14612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 5736283 5736492 5736391 Y NA NA NA NA NA NA NLRP1 215539 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 6655808 6656203 6655969 Y RNASEK,GABARAP,XAF1 SLC13A5,XAF1 XAF1,MIR4520A,ALOX15P1,MIR4520B,MED31,C17orf100,FBXO39,TEKT1 IMR90 Hi-C 24141950 XAF1 563 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 6790647 6790875 6790776 Y SLC16A11,DLG4,DLG4 ALOX12P2 NA NA NA NA ALOX12P2 35467 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 6962166 6962433 6962299 Y BCL6B AC027763.2,RNASEK,C17orf49,SLC16A13,SLC16A11 NA NA NA NA SLC16A11 16924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 7015601 7015870 7015677 Y TNFSF12,POLR2A,CD68,CD68,SLC13A5,XAF1,RNASEK,GABARAP,EIF5A,ASGR1,ASGR2,ASGR2 NA NA NA NA NA SLC16A11 70359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 7115018 7115437 7115195 Y NA ACADVL,DLG4,DVL2,PHF23,GABARAP,CTDNEP1 NA NA NA NA ACADVL 3007 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 7389589 7389989 7389739 Y C17orf49,GPS2,ACAP1,WRAP53,KDM6B,CHD3,AMAC1L3,ZBTB4,POLR2A ZBTB4,POLR2A NA NA NA NA POLR2A 3904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 7737438 7738736 7737971 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 2486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 7738822 7740614 7739046 Y ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr17 7745337 7745870 7745591 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4115 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 7745915 7746944 7746139 Y NA KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 4693 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 7746991 7747556 7747325 Y POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1 NA NA NA NA KDM6B 5769 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 7790181 7790340 7790322 Y POLR2A,WRAP53,PER1,CTC1,KDM6B,CHD3,CHD3 KDM6B,CYB5D1,CHD3,LSMD1,AC025335.1,CNTROB,TRAPPC1 NA NA NA NA LSMD1 3625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 8029634 8030116 8029995 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107 NA NA NA NA HES7 4224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr17 8056609 8057167 8057155 Y NA HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 8057335 8058055 8057702 Y KDM6B,NDEL1,CTC1,PER1,VAMP2,C17orf59 HES7,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59 NA NA NA NA PER1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 8090038 8090540 8090163 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324 NA NA NA NA C17orf59 1024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 8103328 8103700 8103595 Y NA PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59,AURKB,LINC00324,PFAS,CTC1 NA NA NA NA AURKB 8218 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr17 8761203 8761507 8761409 Y PIK3R6 NA NA NA NA NA PIK3R5 105522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 9953965 9954309 9954075 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 205770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 9967021 9967410 9967262 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 192669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 10039316 10039664 10039496 Y GAS7,GAS7 NA NA NA NA NA RPS27AP1 120415 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 10658369 10658680 10658526 Y SHISA6,TMEM220,PIRT TMEM220,RP11-963H4.2 ZNF18,SHISA6,PIRT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-963H4.2 10509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 13241219 13241377 13241298 Y NA NA HS3ST3B1 IMR90 Hi-C 24141950 HS3ST3A1 261867 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 14105008 14105251 14105153 Y COX10,HS3ST3B1 NA NA NA NA NA HS3ST3B1 97149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 14206072 14206436 14206180 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 3672 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 14206970 14207459 14207274 Y HS3ST3B1 HS3ST3B1 NA NA NA NA HS3ST3B1 4570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 15141283 15141756 15141580 Y NA PMP22 NA NA NA NA PMP22 24887 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 15849102 15849709 15849209 Y ZSWIM7,TTC19,ADORA2B ADORA2B NA NA NA NA ADORA2B 2871 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 15925215 15925448 15925362 Y ZNF286A,NCOR1 TTC19,ZSWIM7 NA NA NA NA ZSWIM7 24184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 16438910 16439232 16439111 Y NA FAM211A,ZNF287 NA NA NA NA ZNF287 31288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 17397062 17397447 17397255 Y NA MED9,RASD1 NA NA NA NA RASD1 262 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 17596410 17596829 17596636 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 13623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 17597479 17598220 17598134 Y ALKBH5,FLCN,COPS3 RAI1 NA NA NA NA RAI1 14692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 17615930 17616232 17616056 Y NA RAI1 NA NA NA NA RAI1 33143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 17655489 17655938 17655636 Y DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9 NA NA NA NA NA RAI1 72702 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 17743258 17743857 17743527 Y SMCR8 SREBF1 NA NA NA NA SREBF1 4933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 17817256 17817562 17817444 Y SREBF1 NA NA NA NA NA TOM1L2 56174 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 17861466 17861608 17861562 Y SMCR8 TOM1L2,LRRC48 NA NA NA NA TOM1L2 12128 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 18032331 18032623 18032472 Y TOM1L2,MYO15A DRG2 NA NA NA NA DRG2 43131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 18106383 18106643 18106603 Y NA ALKBH5,LLGL1 NA NA NA NA LLGL1 20258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 18200436 18200727 18200570 Y SMCR8,TOP3A FLII,TOP3A,SMCR8 NA NA NA NA TOP3A 15594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 19141562 19141875 19141665 Y RNF112,EPN2 NA NA NA NA NA SNORD3A 52233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 19656390 19656618 19656531 Y MAPK7,MAPK7 NA NA NA NA NA ALDH3A2 106941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 19883392 19883621 19883525 Y NA AKAP10,SPECC1 NA NA NA NA AKAP10 3736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 20688064 20688832 20688343 Y NA OLA1P2,SCDP1 NA NA NA NA SCDP1 2106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 21179100 21179414 21179208 Y CCDC144NL,KCNJ12,C17orf103,MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 MAP2K3,KCNJ12,C17orf51,USP22,DHRS7B,C17orf103 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAP2K3 6570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 21189600 21190105 21189864 Y MAP2K3,MAP2K3 C17orf103,MAP2K3 NA NA NA NA MAP2K3 3616 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 21314266 21314623 21314560 Y NA KCNJ12 NA NA NA NA KCNJ12 36757 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 21515861 21516199 21516031 Y NA C17orf51 CCDC144NL K562 ChIA-PET 22265404 C17orf51 40139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 4.27565551680635 chr17 22069559 22069863 22069667 Y NA NA NA NA NA NA C17orf51 593837 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 25409900 25410125 25410078 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 208977 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 25415234 25415538 25415430 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203564 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 25415760 25416041 25415903 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 203061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 25416172 25416581 25416426 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 202521 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 38.7001640367344 chr17 25479961 25480088 25479965 Y NA NA NA NA NA NA WSB1 139014 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 25659975 25660361 25659997 Y NA WSB1 NA NA NA NA WSB1 40873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 25680632 25681097 25680982 Y NA NA KSR1,WSB1,MIR4522 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WSB1 61530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr17 27072804 27073286 27072989 Y TRAF4 PROCA1,RAB34,RPL23A,NEK8,TLCD1,TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 3802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27104790 27105049 27104918 Y SEBOX TRAF4 NA NA NA NA TRAF4 35788 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27129097 27129445 27129306 Y NA NA NA NA NA NA ERAL1 50511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27273335 27273648 27273499 Y PHF12 DHRS13,PIPOX,PHF12 NA NA NA NA PIPOX 1883 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27475765 27476166 27476073 Y NEK8,PHF12 MYO18A NA NA NA NA MYO18A 29264 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 27506307 27506816 27506504 Y TLCD1,TLCD1,TRAF4,GIT1,MYO18A MYO18A NA NA NA NA MYO18A 877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 27530741 27530989 27530946 Y NA MYO18A MYO18A,TAOK1,NUFIP2 IMR90 Hi-C 24141950 MYO18A 25311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27619094 27619880 27619581 Y TAOK1 NA NA NA NA NA NUFIP2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 27791459 27791862 27791696 Y NA NA NA NA NA NA MIR4523 75779 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 29176780 29177123 29176952 Y NA CRLF3,CTD-2349P21.1,ATAD5 NA NA NA NA ATAD5 19792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 29423002 29423667 29423241 Y NA NF1 NA NA NA NA NF1 3057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 29596751 29597032 29596911 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 42098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 29609076 29609437 29609257 Y NA EVI2B,EVI2A NA NA NA NA EVI2B 29693 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 29876692 29877391 29877039 Y NA NA NA NA NA NA RAB11FIP4 160050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 30588630 30588823 30588726 Y NA RHBDL3 NA NA NA NA RHBDL3 2372 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 30724674 30725107 30724769 Y RHOT1 C17orf75,ZNF207,PSMD11 NA NA NA NA PSMD11 44172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 30846365 30846870 30846526 Y NA CDK5R1 NA NA NA NA CDK5R1 34728 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 32568123 32568572 32568229 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL7 CCL8,CCL7,CCL2,CCL13,CCL11 IMR90 Hi-C 24141950 CCL2 11732 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 32579001 32579427 32579231 Y NA CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 32579434 32580053 32579676 Y CCL8,CCL7 CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 32581116 32581488 32581294 Y NA CCL2,CCL7 NA NA NA NA CCL2 812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 33300552 33300861 33300820 Y NA ZNF830,LIG3,CCT6B NA NA NA NA LIG3 4652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 33867743 33868178 33867841 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,CCL5,CCL23 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34887 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 33868194 33868343 33868266 Y RFFL,SLFN5,SLFN11,SLFN12L,CCL5 AP2B1,PEX12 NA NA NA NA AP2B1 34722 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 34838937 34839070 34839023 Y NA ZNHIT3,PIGW NA NA NA NA ZNHIT3 1403 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 34871446 34871455 34871448 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 17392 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 34875469 34875747 34875679 Y NA ZNHIT3,PIGW,MYO19,GGNBP2 NA NA NA NA PIGW 13100 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 35078576 35079010 35078700 Y NA NA LHX1,AATF,ACACA,MRM1,DHRS11 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MRM1 122575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 35292129 35292558 35292512 Y ACACA,LHX1,AATF RP11-445F12.1,AATF NA NA NA NA RP11-445F12.1 169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 35682301 35682446 35682421 Y NA NA NA NA NA NA ACACA 82463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 36412216 36412471 36412263 Y NA RP11-1407O15.2,MRPL45 NA NA NA NA RP11-1407O15.2 7387 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 36585417 36585600 36585486 Y ARHGAP23 ARHGAP23 NA NA NA NA ARHGAP23 2755 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 36813395 36813674 36813472 Y ARHGAP23,C17orf96,SRCIN1 C17orf96,MLLT6 NA NA NA NA C17orf96 15513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 37065070 37065230 37065172 Y NA LASP1 NA NA NA NA LASP1 40958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 37366071 37366159 37366135 Y STAC2 CACNB1,RPL19,STAC2 NA NA NA NA RPL19 11535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 37862068 37862252 37862166 Y GSDMB,GRB7,GRB7,GRB7,GRB7,PGAP3,ERBB2,ERBB2 ERBB2,PGAP3,MIEN1 NA NA NA NA PGAP3 11018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 38496652 38496786 38496719 Y MSL1,CASC3,WIPF2,RARA,RARA RARA NA NA NA NA RARA 33208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 38601076 38601487 38601191 Y GJD3,IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 3374 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 38603509 38603888 38603710 Y IGFBP4 TOP2A,IGFBP4 NA NA NA NA IGFBP4 5807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 38707495 38707811 38707586 Y KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4 NA NA NA NA NA TNS4 51646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 39949116 39949497 39949168 Y KRT14,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 7933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 39949517 39949745 39949566 Y KRT36,KRT15,KRT19,KRT9,KRT14,KRT16,KRT17,JUP JUP,LEPREL4,FKBP10 NA NA NA NA JUP 8334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 40539110 40539537 40539349 Y NA STAT3,PTRF NA NA NA NA STAT3 524 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 40670495 40670831 40670653 Y WNK4,RAB5C,PTRF AC067852.1,NAGLU,COASY,MLX NA NA NA NA AC067852.1 905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 40805539 40806065 40805782 Y NA TUBG1,FAM134C,TUBG2,PLEKHH3,CNTNAP1 NA NA NA NA TUBG2 3258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 41173099 41173334 41173293 Y NAGLU,VAT1 RUNDC1,RPL27,IFI35,VAT1,RND2 NA NA NA NA VAT1 1806 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 41778909 41778996 41778931 Y NA NA MPP2,LOC100130581,MPP3,MEOX1,DUSP3,DHX8,ARL4D,MIR2117,ETV4,C17orf105,SOST,CD300LG IMR90 Hi-C 24141950 SOST 55160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 42173326 42173627 42173470 Y NA LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53 NA NA NA NA HDAC5 25443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 42276572 42276897 42276785 Y TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3 TMUB2,ATXN7L3,UBTF NA NA NA NA ATXN7L3 1091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.39859797489735 chr17 42634020 42634172 42634095 Y TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2 FZD2 NA NA NA NA FZD2 1095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 42797981 42798248 42798116 Y CCDC43 CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1,ADAM11 NA NA NA NA RP11-1072C15.1 2016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 42861642 42861917 42861696 Y NA ADAM11,GJC1 NA NA NA NA ADAM11 27243 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 43018379 43018606 43018493 Y NA CCDC103,EFTUD2,FAM187A,KIF18B,C1QL1 NA NA NA NA KIF18B 4476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 43095998 43096402 43096133 Y NA NMT1,DCAKD NA NA NA NA NMT1 30576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 43170304 43170536 43170449 Y ADAM11,HIGD1B,GFAP NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3 NA NA NA NA DCAKD 33831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 43304336 43305039 43304628 Y PLEKHM1,ARHGAP27,FMNL1 FMNL1 NA NA NA NA FMNL1 7525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 43449108 43449433 43449167 Y NA NA NA NA NA NA MAP3K14 56694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 44113965 44114105 44114069 Y KIAA1267,KIAA1267 NA NA NA NA NA MAPT 144217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 44234299 44234706 44234578 Y NA NA NA NA NA NA MAPT 264551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 44344171 44344471 44344293 Y NA NA KANSL1-AS1,KANSL1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 MAPT 374423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr17 44848812 44849347 44849259 Y NA NA NA NA NA NA RPS7P11 51279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr17 45282976 45283116 45283053 Y NA CDC27,ITGB3 MYL4 K562 ChIA-PET 22265404 CDC27 18188 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 45356357 45357027 45356891 Y NA ITGB3 NA NA NA NA ITGB3 27094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 45609469 45609601 45609554 Y NA NPEPPS NA NA NA NA NPEPPS 11161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 45717975 45718065 45718017 Y NA KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 6777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 45771013 45771467 45771041 Y NPEPPS,OSBPL7,CDK5RAP3,TBX21,TBKBP1 KPNB1 NA NA NA NA KPNB1 46171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr17 45980057 45980402 45980230 Y NA SP6,SP2,AC003665.1,PNPO NA NA NA NA SP2 8541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 46079914 46080281 46080131 Y NPEPPS,TBKBP1,TBX21,SP2 CDK5RAP3,COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 33111 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 46102426 46102830 46102617 Y NA COPZ2,NFE2L1 NA NA NA NA COPZ2 10562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 46289129 46289412 46289274 Y NA NA NA NA NA NA AC090627.1 80297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 46642274 46642589 46642562 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8 NA NA NA NA HOXB4 12884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 46662223 46662405 46662377 Y NA HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 6750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 46662684 46663231 46662943 Y HOXB2,HOXB3,HOXB4,HOXB9,HOXB8,HOXB7,HOXB6,HOXB5 HOXB-AS1,HOXB2,HOXB4,HOXB6,HOXB8,HOXB9,HOXB7 NA NA NA NA HOXB4 7211 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr17 47049793 47049986 47049890 Y IGF2BP1,SNF8 SNF8,RNU1-42P,IGF2BP1 IGF2BP1 MCF7 ChIA-PET 22265404 IGF2BP1 22788 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 47270202 47270509 47270359 Y CALCOCO2,ZNF652,ZNF652,GNGT2,GNGT2,GNGT2,ABI3 GNGT2,PHOSPHO1 NA NA NA NA GNGT2 15427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 47337469 47337918 47337568 Y CALCOCO2,UBE2Z PHOSPHO1 NA NA NA NA PHOSPHO1 31341 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 47467973 47468124 47468044 Y ABI3,PHOSPHO1,ZNF652,ZNF652,SPOP,MYST2,FAM117A ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 22122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 47468290 47468719 47468487 Y ZNF652,ZNF652 ZNF652,PHB,AC004797.1 NA NA NA NA PHB 21527 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 47928830 47928921 47928887 Y FAM117A NA NA NA NA NA RP11-613C6.4 58125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 48228924 48229616 48229504 Y SPATA20,SAMD14 SAMD14,PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA PPP1R9B 2933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 48255388 48256117 48255676 Y NA PPP1R9B,COL1A1 NA NA NA NA COL1A1 20876 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 48338432 48338651 48338443 Y EPN3 TMEM92 LOC284080,ITGA3,PDK2,SAMD14,PPP1R9B,COL1A1,HILS1,SGCA,TMEM92 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM92 8116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 48367346 48367814 48367643 Y PPP1R9B TMEM92 NA NA NA NA TMEM92 20579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 48716257 48716537 48716480 Y NA ABCC3 NA NA NA NA ABCC3 6119 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 50561518 50561825 50561670 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1225629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 50795913 50796132 50795928 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1460024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 50838489 50838508 50838499 Y NA NA NA NA NA NA UTP18 1502600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 52328438 52328710 52328574 Y NA NA NA NA NA NA TOM1L1 646038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 53497202 53497618 53497598 Y NA NA NA NA NA NA MMD 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 53497797 53498268 53498065 Y NA MMD NA NA NA NA MMD 444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 53661870 53662078 53661978 Y NA NA TMEM100 IMR90 Hi-C 24141950 TMEM100 145404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 54987224 54987877 54987630 Y SCPEP1,TRIM25 TRIM25,COIL NA NA NA NA TRIM25 1522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55432914 55433044 55432979 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 101702 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55501996 55502706 55502262 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 170784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55517850 55518075 55517943 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 186638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 55518270 55518753 55518516 Y MSI2,MSI2 NA NA NA NA NA MSI2 187058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55540558 55540950 55540705 Y NA NA NA NA NA NA MSI2 209346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55734748 55734863 55734779 Y DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 190554 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 55740175 55740776 55740501 Y MSI2,MSI2,DYNLL2 NA NA NA NA NA MRPS23 184641 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 55970352 55970806 55970481 Y SUPT4H1,VEZF1 MRPS23 NA NA NA NA MRPS23 44935 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56013342 56013699 56013370 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 16985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56014018 56014160 56014055 Y NA CUEDC1,VEZF1 VEZF1,CUEDC1,SRSF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 16524 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56023350 56023692 56023525 Y NA CUEDC1,VEZF1 CUEDC1,VEZF1 IMR90 Hi-C 24141950 CUEDC1 6992 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56426877 56426962 56426920 Y MTMR4,SUPT4H1 SUPT4H1 NA NA NA NA SUPT4H1 1492 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56428194 56428499 56428372 Y VEZF1,MTMR4,SUPT4H1 NA NA NA NA NA SUPT4H1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56587640 56587744 56587729 Y PPM1E,DYNLL2,MKS1,SEPT4,MTMR4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 5522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 56600012 56600151 56600118 Y DYNLL2,OR4D2,SEPT4,SEPT4 MTMR4,SEPT4 NA NA NA NA MTMR4 6746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 57231530 57231848 57231723 Y NA AC099850.1,TRIM37,SKA2,PRR11 NA NA NA NA PRR11 670 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 57409690 57409997 57409875 Y YPEL2 YPEL2 NA NA NA NA YPEL2 2640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 57831888 57832338 57832062 Y VMP1,RNFT1 VMP1,PTRH2 NA NA NA NA PTRH2 48901 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 57853705 57854627 57854148 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 62000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 57863159 57864676 57863979 Y NA NA NA NA NA NA MIR21 51951 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 57905350 57905555 57905420 Y NA MIR21 NA NA NA NA MIR21 11072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 58212242 58212405 58212344 Y NA NA C17orf64,HEATR6,LOC645638,USP32,APPBP2,LOC653653 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEATR6 57950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 58804933 58805128 58805031 Y NA NA NA NA NA NA BCAS3 52119 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 59939507 59939855 59939761 Y BRIP1 BRIP1 NA NA NA NA BRIP1 625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 60085676 60086036 60086030 Y NACA2,MED13 NA NA NA NA NA MED13 54607 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 60555037 60555507 60555099 Y NA RP11-464D20.2 MRC2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-464D20.2 36621 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 60729712 60730300 60729931 Y NA MRC2 NA NA NA NA MRC2 26950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 60897286 60897580 60897414 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 194524 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61043121 61043648 61043243 Y NA NA NA NA NA NA MRC2 340359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61357224 61357494 61357377 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W,MARCH10 IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 164245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61370802 61371122 61370929 Y MAP3K3,LIMD2 NA MIR548W IMR90 Hi-C 24141950 CYB561 150617 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61629052 61629111 61629082 Y NA KCNH6,DCAF7,TACO1 NA NA NA NA DCAF7 3230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61779039 61779508 61779383 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 2507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 61796482 61796787 61796636 Y NA LIMD2,STRADA NA NA NA NA LIMD2 19950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 62409252 62409599 62409468 Y ICAM2,ERN1,PECAM1,DDX5 NA NA NA NA NA TEX2 70591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 62526246 62526643 62526459 Y NA POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5 NA NA NA NA DDX5 23929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 62703261 62703596 62703473 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 47075 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 62705157 62705447 62705234 Y SMURF2 SMURF2 SMURF2 IMR90 Hi-C 24141950 SMURF2 48971 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 63019276 63019534 63019390 Y RGS9,GNA13 AMZ2P1,GNA13 AMZ2P1 IMR90 Hi-C 24141950 GNA13 31423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 63038886 63039290 63039133 Y GNA13 GNA13 NA NA NA NA GNA13 11667 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 63119249 63119621 63119552 Y GNA13 RGS9 RGS9,GNA13,AMZ2P1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS9 11928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr17 63569009 63569274 63569155 Y NA AXIN2 NA NA NA NA AXIN2 13244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 63639930 63640399 63640359 Y NA NA NA NA NA NA AXIN2 84165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 63937645 63937764 63937728 Y CEP112 NA NA NA NA NA CEP112 248438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 63996608 63996849 63996729 Y NA NA NA NA NA NA CEP112 189353 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 64194072 64194322 64194164 Y NA CEP112 NA NA NA NA CEP112 7870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 64380133 64380302 64380218 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 83379 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 64455929 64456369 64456061 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 159175 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 64463185 64463416 64463350 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 166431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 64503657 64504241 64503882 Y NA NA NA NA NA NA PRKCA 206903 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 64947420 64948018 64947947 Y NA CACNG4 CACNG5,CACNG4,CACNG1,HELZ,PRKCA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CACNG4 11008 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 65847253 65847408 65847335 Y NA BPTF NA NA NA NA BPTF 27613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 66016045 66016315 66016119 Y NA C17orf58,KPNA2 BPTF,C17orf58,KPNA2 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KPNA2 13320 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 66374219 66374806 66374507 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 66374808 66375131 66375016 Y SLC16A6 NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 76523 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 66376984 66377775 66377396 Y NA NA WIPI1 IMR90 Hi-C 24141950 WIPI1 73879 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 66509186 66509763 66509535 Y SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A PRKAR1A NA NA NA NA PRKAR1A 3265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 69437254 69437446 69437407 Y NA NA SOX9,LOC100499467,SLC39A11 IMR90 Hi-C 24141950 LOC124685 177673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 69596730 69596951 69596781 Y NA LOC124685 NA NA NA NA LOC124685 18168 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 70417215 70417683 70417549 Y SOX9 NA NA NA NA NA RPL32P33 203687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 70461830 70461987 70461862 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 159383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 70511484 70511781 70511663 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 109589 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 70512872 70513243 70513164 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 108127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 70587266 70587776 70587444 Y NA RPL32P33 NA NA NA NA RPL32P33 33594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 70712408 70712674 70712489 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P33 91038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 71336325 71336719 71336454 Y NA CDC42EP4 CDC42EP4 MCF7 ChIA-PET 22265404 CDC42EP4 30011 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 71338137 71338558 71338458 Y NA CDC42EP4 NA NA NA NA CDC42EP4 31823 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 72564769 72564992 72564860 Y NA NA NA NA NA NA RAB37 99725 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 72746451 72746964 72746655 Y NA SLC9A3R1,NAT9,TMEM104 NA NA NA NA SLC9A3R1 3660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 72978355 72978661 72978434 Y KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 CDR2L 3066 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 72984795 72985307 72985001 Y RAB37,CDR2L CDR2L,ICT1,KCTD2 NA NA NA NA CDR2L 3068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 73007918 73008254 73008160 Y RAB37,GRIN2C,FADS6,C17orf28,CDR2L,SUMO2,KCTD2,ARMC7 CDR2L,ICT1,KCTD2,ATP5H NA NA NA NA ICT1 1153 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 73133469 73133809 73133510 Y NA ARMC7,NT5C,HN1,SUMO2 NA NA NA NA NT5C 7579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 73696530 73696897 73696707 Y SAP30BP,ITGB4,ITGB4 SAP30BP,RECQL5,ITGB4 NA NA NA NA ITGB4 18511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 73868951 73869202 73869040 Y TRIM47 WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38 NA NA NA NA TRIM47 3454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 74368264 74368743 74368490 Y SPHK1,SPHK1 SPHK1,PRPSAP1 NA NA NA NA SPHK1 1922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 74525744 74526079 74526045 Y ST6GALNAC2,MGAT5B,CYGB RHBDF2,SNORD1B NA NA NA NA SNORD1B 29112 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 74526422 74526750 74526585 Y CYGB RHBDF2,SNORD1B NA NA NA NA SNORD1B 28441 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 74593962 74594390 74594127 Y FAM100B,SPHK1,SPHK1,RHBDF2,JMJD6 SNORD1B,ST6GALNAC2 ST6GALNAC2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 ST6GALNAC2 12924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 74705254 74705618 74705431 Y MXRA7 MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA MXRA7 156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 74764385 74764732 74764559 Y NA JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2 NA NA NA NA SRSF2 32929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 74837613 74837891 74837804 Y NA MGAT5B MFSD11,MGAT5B,SEC14L1,SRSF2,SEPT9 IMR90 Hi-C 24141950 MGAT5B 24647 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 75120383 75120864 75120582 Y JMJD6,SEC14L1,SEC14L1,SEPT9,SEPT9,SEC14L1,SEC14L1 LINC00338,SEC14L1 NA NA NA NA LINC00338,SEC14L1 39585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr17 75281811 75282557 75281917 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 7160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 75282703 75283463 75282995 Y SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 8052 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75319028 75319523 75319372 Y SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 44377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 75319670 75320031 75319742 Y MGAT5B,SEPT9,SEPT9 SEPT9 NA NA NA NA SEPT9 45019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 75384636 75384998 75384811 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 109985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75385660 75386043 75385777 Y SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 111009 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75387909 75388384 75388205 Y SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 113258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 75402047 75402301 75402134 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 127396 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75405377 75405733 75405639 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 130726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75417194 75417582 75417357 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 142543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 75421302 75421687 75421325 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 146651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 75422359 75422648 75422577 Y SEPT9,SEPT9,SEPT9,SEPT9 NA NA NA NA NA SEPT9 147708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 75429541 75429800 75429625 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 154890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr17 75451587 75451956 75451821 Y NA NA NA NA NA NA SEPT9 176936 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 75954393 75954796 75954614 Y NA TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 43453 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 10.1957939246921 chr17 75955923 75956319 75956134 Y TMC8,TMC6,TMC6,TNRC6C TNRC6C TNRC6C,LOC100507351 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNRC6C 41930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76195016 76195360 76195224 Y TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SYNGR2,TK1,AFMID,BIRC5 BIRC5 IMR90 Hi-C 24141950 BIRC5 12907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76337607 76338208 76338068 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 76338337 76338836 76338651 Y USP36,CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 15322 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 76347582 76348110 76347694 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 6048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 76348964 76349371 76349046 Y USP36,CYTH1,TMC6,TMC8,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 4787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76356993 76357093 76357047 Y SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 NA NA NA NA SOCS3 2835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76361692 76362147 76361865 Y NA SOCS3,PGS1 PGS1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOCS3 7534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76371853 76372298 76372087 Y CYTH1,SOCS3,PGS1 SOCS3,PGS1 SOCS3 K562 ChIA-PET 22265404 PGS1 423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 76801462 76801678 76801575 Y DNAH17,USP36,CYTH1 CYTH1,USP36 NA NA NA NA CYTH1 25083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76858403 76858717 76858585 Y PGS1,CYTH1,ENGASE,USP36 USP36 NA NA NA NA USP36 22880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 76875667 76876103 76875916 Y CYTH1,ENGASE,CANT1 USP36,TIMP2 NA NA NA NA USP36 40144 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 77034665 77035262 77034914 Y CYTH1,USP36,ENGASE CANT1,C1QTNF1,ENGASE NA NA NA NA C1QTNF1 17769 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 77778056 77778248 77778123 Y CBX2,CBX8 CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 4574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 77787297 77787609 77787349 Y NA CBX2,CBX8,CBX4 NA NA NA NA CBX8 13815 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr17 77916401 77916581 77916489 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 91066 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr17 77916649 77916884 77916753 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D16 90763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 77959820 77960211 77960016 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 47436 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 77961931 77962339 77962251 Y NA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 45308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 77970749 77971301 77971166 Y CBX4,SGSH,RNF213,GAA,EIF4A3 TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA TBC1D16 36346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 78008584 78008924 78008651 Y TBC1D16,GAA TBC1D16,CCDC40 NA NA NA NA CCDC40 149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 78238527 78238862 78238699 Y GAA,EIF4A3,SGSH,RNF213 SLC26A11,SGSH,RNF213 NA NA NA NA RNF213 5862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 78304141 78304261 78304201 Y NPTX1 NA NA NA NA NA RNF213 71476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 78428203 78429274 78428566 Y NA ENDOV,NPTX1 NA NA NA NA NPTX1 20369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr17 78652497 78652856 78652573 Y SGSH,RNF213 NA NA NA NA NA RPTOR 135878 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 78754047 78754707 78754061 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 208691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr17 78763390 78763671 78763525 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 199727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 78806684 78807307 78807121 Y C17orf56 NA NA NA NA NA CHMP6 156091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 78830209 78830686 78830492 Y NA NA NA NA NA NA CHMP6 132712 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79017666 79018027 79017910 Y AZI1,BAIAP2 BAIAP2 NA NA NA NA BAIAP2 10718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 79201540 79201781 79201661 Y HGS AZI1,C17orf89 NA NA NA NA AZI1 6741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79316253 79317268 79317090 Y NA SLC38A10 BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,C17orf56,C17orf89,LINC00482,MIR3186,C17orf70,FSCN2,NPLOC4 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 48906 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79319325 79319648 79319507 Y FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 51978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr17 79319812 79320225 79320116 Y FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1 NA BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC38A10 52465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79360408 79361324 79361141 Y ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10 NA NA NA NA NA SLC38A10 93061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79370754 79371569 79371407 Y NA NA NA NA NA NA SLC38A10 103407 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79397073 79397461 79397298 Y MAFG,MAFG,NPLOC4,HGS NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 80628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79399639 79399699 79399664 Y GCGR,BAHCC1 NA NA NA NA NA RP13-766D20.1 78390 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79448388 79448678 79448571 Y NPB,AATK,AZI1,BAHCC1 RP13-766D20.1,ACTG1 NA NA NA NA RP13-766D20.1 29411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr17 79942701 79942868 79942785 Y SLC16A3,NARF,CCDC57,C17orf62,C17orf62 PYCR1,ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3 NA NA NA NA ASPSCR1 10018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 79979263 79979824 79979465 Y NA ASPSCR1,LRRC45,STRA13,RAC3,DCXR,GPS1,RFNG,DUS1L NA NA NA NA LRRC45 85 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80052713 80052821 80052782 Y MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN GPS1,RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 1387 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr17 80056613 80056910 80056718 Y C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN RFNG,DUS1L,FASN NA NA NA NA FASN 2405 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr17 80188750 80189250 80189000 Y NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3 CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 4477 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80199457 80199968 80199484 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA SLC16A3 15184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80214734 80215057 80214944 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 14550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80216124 80216440 80216314 Y NA CCDC57,SLC16A3,CSNK1D NA NA NA NA CSNK1D 13167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80255798 80256475 80256187 Y SIRT7,MAFG,MAFG,CCDC57,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,NARF,NARF,HEXDC,C17orf62,C17orf62,CSNK1D,SECTM1,CD7 CSNK1D,SECTM1 NA NA NA NA CSNK1D 26191 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80290802 80291044 80290895 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80292742 80293207 80293087 Y MAFG,MAFG,SLC16A3,SLC16A3,CSNK1D,SECTM1 SECTM1,TEX19 NA NA NA NA SECTM1 2792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80454894 80455238 80455175 Y LRRC45,CCDC57,FN3KRP,NARF C17orf62,NARF,FOXK2 NA NA NA NA FOXK2 20351 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80592968 80593241 80593234 Y NA NA NA NA NA NA RAB40B 61363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80805995 80806457 80806155 Y NA NA NA NA NA NA TBCD 98055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr17 80821463 80821609 80821520 Y NA NA NA NA NA NA TBCD 113523 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr17 80834043 80834346 80834307 Y ZNF750 NA NA NA NA NA TBCD 126103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 159482 159743 159659 Y CETN1 USP14 NA NA NA NA USP14 3099 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 222573 222827 222703 Y NA THOC1 NA NA NA NA THOC1 43223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 394915 395311 395219 Y NA NA NA NA NA NA COLEC12 103411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 395862 395959 395924 Y NA NA NA NA NA NA COLEC12 102763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 667633 668016 667981 Y THOC1,CLUL1,YES1,TYMS,C18orf56,ENOSF1,ENOSF1 TYMS,C18orf56,ENOSF1 NA NA NA NA C18orf56 11293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr18 2350863 2351242 2350869 Y NA NA METTL4 IMR90 Hi-C 24141950 METTL4 218266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 2605641 2605936 2605854 Y NA METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1 NA NA NA NA NDC80 36131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 2979905 2979994 2979950 Y SMCHD1 LPIN2 NA NA NA NA LPIN2 31319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 3624338 3624601 3624482 Y TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1 NA NA NA NA NA TGIF1 214732 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 3639477 3639730 3639610 Y NA NA NA NA NA NA TGIF1 229871 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 5514119 5514431 5514166 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 114268 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 5542461 5543034 5542604 Y EPB41L3 NA NA NA NA NA EPB41L3 85665 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 5895274 5895803 5895585 Y TMEM200C NA L3MBTL4 IMR90 Hi-C 24141950 EPB41L3 266575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 7273554 7273981 7273852 Y NA SNORA48 PTPRM IMR90 Hi-C 24141950 SNORA48 25170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 8704447 8704767 8704559 Y NA NA CCDC165,NDUFV2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB12 97004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 9742767 9742849 9742828 Y VAPA,RAB31 RAB31 TXNDC2 IMR90 Hi-C 24141950 RAB31 36605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 9743544 9744009 9743684 Y VAPA,RAB31 RAB31 NA NA NA NA RAB31 37382 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 9914998 9915501 9915128 Y PPP4R1,RAB31,VAPA VAPA NA NA NA NA VAPA 2999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr18 10543130 10543398 10543236 Y NAPG NAPG NA NA NA NA NAPG 19228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 10726542 10726663 10726595 Y NAPG NA NA NA NA NA NAPG 202640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 10766591 10766813 10766750 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 242689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr18 11005597 11005922 11005792 Y NA NA NA NA NA NA NAPG 481695 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 11431991 11432229 11432112 Y NA NA NA NA NA NA GNAL 254726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 11849903 11850727 11850169 Y MPPE1,CHMP1B CHMP1B NA NA NA NA CHMP1B 508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr18 12076743 12076871 12076848 Y NA NA GNAL IMR90 Hi-C 24141950 IMPA2 97719 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 12288068 12288497 12288213 Y NA TUBB6 TUBB6 IMR90 Hi-C 24141950 TUBB6 17171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 12641281 12641332 12641311 Y SPIRE1,SPIRE1,PSMG2 AP005482.1,SPIRE1,PSMG2 NA NA NA NA AP005482.1 14710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 12864190 12864369 12864245 Y NA NA NA NA NA NA PTPN2 63273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 12880036 12880906 12880743 Y NA PTPN2 NA NA NA NA PTPN2 46736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 13374941 13375140 13375024 Y C18orf1,C18orf1 NA NA NA NA NA RNMT 349519 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 14111961 14112330 14112146 Y NA ZNF519 NA NA NA NA ZNF519 18159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 19090172 19090203 19090178 Y NA NA NA NA NA NA ESCO1 88642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 19397108 19397142 19397125 Y NA NA NA NA NA NA MIB1 114190 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 19904686 19904949 19904805 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 GATA6 157282 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr18 20139802 20140256 20140003 Y GATA6 NA CTAGE1,GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 235968 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 20274994 20275099 20275066 Y NA NA GATA6 IMR90 Hi-C 24141950 RBBP8 101125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr18 21091625 21091887 21091629 Y C18orf8 C18orf8 NA NA NA NA C18orf8 10152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 21228672 21228807 21228737 Y LAMA3,ANKRD29 ANKRD29 NA NA NA NA ANKRD29 12042 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 21417655 21417852 21417722 Y NPC1,LAMA3 NA NA NA NA NA TTC39C 152885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 21562247 21562750 21562607 Y NA TTC39C TTC39C IMR90 Hi-C 24141950 TTC39C 7987 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 22929287 22929693 22929350 Y NA ZNF521 NA NA NA NA ZNF521 461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 25695112 25695346 25695270 Y CDH2 NA NA NA NA NA CDH2 60064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 26744101 26744374 26744185 Y NA NA NA NA NA NA CDH2 988691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 30862088 30862282 30862185 Y NA NA NA NA NA NA RNF138 1192270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 32289089 32289403 32289194 Y NA NA NA NA NA NA DTNA 217835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 32610382 32610507 32610471 Y ZNF24,MAPRE2 NA NA NA NA NA MAPRE2 55490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 33389735 33389972 33389879 Y ZNF24,ZNF396,INO80C NA NA NA NA NA C18orf21 160074 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 33876540 33877026 33876703 Y NA FHOD3 NA NA NA NA FHOD3 863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 42857952 42858246 42858076 Y NA NA NA NA NA NA SLC14A1 443846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 43210324 43210708 43210352 Y NA NA NA NA NA NA SLC14A1 91384 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 43297098 43297112 43297106 Y SLC14A2 SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 4980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 43307603 43307620 43307613 Y NA SLC14A1 NA NA NA NA SLC14A1 5511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 43381768 43381900 43381886 Y NA NA EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC14A1 79676 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 43582956 43583166 43583086 Y PSTPIP2,EPG5 EPG5 NA NA NA NA EPG5 37716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 43608916 43609273 43609243 Y PSTPIP2,EPG5 PSTPIP2 NA NA NA NA PSTPIP2 40965 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 44675442 44676177 44675810 Y NA HDHD2,IER3IP1 NA NA NA NA HDHD2 551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 45687716 45687836 45687757 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 45688048 45688324 45688110 Y NA NA NA NA NA NA SMAD2 232533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr18 46066779 46067121 46067052 Y CTIF CTIF NA NA NA NA CTIF 3362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46253142 46253362 46253168 Y NA NA NA NA NA NA CTIF 189725 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46269539 46269878 46269723 Y NA NA NA NA NA NA SMAD7 205203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46428346 46428737 46428479 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 46344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46456597 46456819 46456703 Y SMAD7,SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 18262 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46460097 46460351 46460248 Y NA SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 14730 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46478230 46479206 46479122 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 NA NA NA NA SMAD7 3149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr18 46482158 46482454 46482304 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 SMAD7 K562 ChIA-PET 22265404 SMAD7 7077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 46502180 46502412 46502333 Y SMAD7 SMAD7 SMAD7,CTIF MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 SMAD7 27099 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr18 46523478 46523814 46523611 Y SMAD7,SMAD7 SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 48397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 46524155 46524830 46524741 Y NA SMAD7 CTIF,SMAD7,DYM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMAD7 49074 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 47252630 47252839 47252704 Y LIPG NA ACAA2,SCARNA17,MYO5B,LIPG IMR90 Hi-C 24141950 ACAA2 85491 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 47794579 47794725 47794639 Y NA CCDC11,MBD1,CXXC1 NA NA NA NA CCDC11 3687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 48680027 48680136 48680067 Y MEX3C NA NA NA NA NA MEX3C 62538 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 48720847 48721238 48721193 Y NA MEX3C NA NA NA NA MEX3C 21436 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 51699489 51699550 51699520 Y NA MBD2 NA NA NA NA MBD2 49608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 51883843 51884006 51883925 Y NA NA NA NA NA NA POLI 90069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 52613483 52613779 52613741 Y NA CCDC68 NA NA NA NA CCDC68 10960 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 53107364 53107398 53107375 Y NA NA NA NA NA NA TCF4 222620 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 53332836 53333181 53332979 Y NA TCF4 NA NA NA NA TCF4 2818 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 55474402 55474444 55474420 Y NA ATP8B1 ATP8B1 MCF7 ChIA-PET 22265404 ATP8B1 6069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 55893671 55893850 55893725 Y MALT1 NA NA NA NA NA NEDD4L 184072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 56117134 56117320 56117186 Y NA NA NA NA NA NA SNORD28 148543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 56339458 56339877 56339543 Y MALT1 ALPK2,MALT1 NA NA NA NA MALT1 2840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 59997447 59997624 59997536 Y NA TNFRSF11A NA NA NA NA TNFRSF11A 6927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 60173605 60173906 60173662 Y KIAA1468,ZCCHC2 ZCCHC2 ZCCHC2 MCF7 ChIA-PET 22265404 ZCCHC2 14334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 60189219 60189514 60189362 Y TNFRSF11A,ZCCHC2 ZCCHC2 NA NA NA NA ZCCHC2 979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 60263992 60264160 60264076 Y NA NA NA NA NA NA ZCCHC2 75752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 61033511 61033750 61033687 Y NA BCL2,KDSR NA NA NA NA KDSR 768 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 67625128 67625312 67625237 Y CD226 NA NA NA NA NA RTTN 245869 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 67957012 67957306 67957264 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 2875 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 68002975 68003345 68003133 Y NA SOCS6 NA NA NA NA SOCS6 48838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 70535937 70536272 70536159 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 1276828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 70814652 70814839 70814746 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 998261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 71563069 71563215 71563130 Y NA NA NA NA NA NA FBXO15 249885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 71950185 71950349 71950304 Y NA CYB5A NA NA NA NA CYB5A 6902 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 72782580 72783607 72783115 Y ZNF407,ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA NA ZADH2 135696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 72919537 72919929 72919697 Y ZADH2 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA ZADH2 234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 72919988 72920296 72920123 Y ZADH2,TSHZ1 ZADH2,TSHZ1 NA NA NA NA TSHZ1 414 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 74277239 74277430 74277301 Y NA NA NA NA NA NA RP11-17M16.1 71762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 74766602 74767022 74766743 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 76617 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 74789913 74790245 74790119 Y MBP NA NA NA NA NA MBP 53394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 74808374 74808713 74808562 Y NA MBP NA NA NA NA MBP 34926 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 74818309 74818676 74818510 Y MBP MBP NA NA NA NA MBP 24963 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 74921028 74921148 74921053 Y MBP NA MBP IMR90 Hi-C 24141950 MBP 77389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 75115540 75115770 75115653 Y NA NA NA NA NA NA MBP 271901 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr18 75697384 75697771 75697683 Y NA NA NA NA NA NA MBP 853745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr18 77153646 77154504 77153944 Y ATP9B,NFATC1,NFATC1 NA NA NA NA NA NFATC1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr18 77218531 77218849 77218576 Y NFATC1,CTDP1 NA NA NA NA NA NFATC1 64675 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 77245359 77245518 77245445 Y NA NA NA NA NA NA NFATC1 91503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr18 77551694 77552094 77551810 Y PQLC1,CTDP1 NA KCNG2,PQLC1,CTDP1,RBFA,TXNL4A IMR90 Hi-C 24141950 CTDP1 113893 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 290136 290651 290316 Y RNF126,GZMM,C19orf21,PPAP2C,PPAP2C PPAP2C NA NA NA NA PPAP2C 743 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 342831 343179 342882 Y MIER2 MIER2 NA NA NA NA MIER2 33 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 488227 488667 488380 Y NA SHC2,MADCAM1,TPGS1,CDC34 ODF3L2,SHC2,TPGS1,MADCAM1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 MADCAM1 1051 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 573434 573573 573481 Y ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG CDC34,GZMM,BSG,HCN2 NA NA NA NA BSG 4137 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 661410 661735 661571 Y HMHA1,GZMM,C19orf6,ABCA7,RNF126 POLRMT,RNF126,FSTL3,PALM NA NA NA NA RNF126 133 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 778993 779222 779048 Y GPX4,BSG,CNN2 PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 15853 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 782330 783005 782707 Y NA PTBP1,MIR4745,MIR3187 NA NA NA NA PTBP1 12070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr19 823657 823956 823874 Y BSG,PRSS57,PTBP1,LPPR3,PRTN3,ELANE,AZU1 PTBP1,MIR4745,MIR3187,CFD NA NA NA NA MIR3187 12073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 867005 867400 867203 Y GPX4,GPX4,C19orf24,ATP5D,ODF3L2,C19orf20,BSG,POLRMT,CNN2,CFD CFD,MED16,R3HDM4 NA NA NA NA CFD 9552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 888565 888780 888647 Y SBNO2,HMHA1,CIRBP,GZMM,RNF126,C19orf6,ABCA7 CFD,MED16,R3HDM4,ARID3A NA NA NA NA MED16 2438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1133172 1133384 1133209 Y C19orf22,ARID3A,ABCA7,MIDN,HMHA1,SBNO2,SBNO2 POLR2E,GPX4,SBNO2 NA NA NA NA GPX4 31236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1140329 1140530 1140433 Y NA POLR2E,GPX4,SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 31752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1169743 1170349 1170015 Y NA SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 1933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr19 1171933 1172315 1172045 Y NA STK11 NA NA NA NA SBNO2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1172839 1173266 1172915 Y CFD,ATP5D,GPX4,GPX4 SBNO2,STK11 NA NA NA NA SBNO2 557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 1183874 1184237 1184064 Y SBNO2 SBNO2,STK11 ATP5D,MIDN,SBNO2,STK11,GPX4 MCF7 ChIA-PET 22265404 STK11 3169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1189532 1189666 1189566 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26 NA NA NA NA STK11 2126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1214932 1215433 1215243 Y NA SBNO2,STK11,C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP NA NA NA NA C19orf26 20593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1240232 1240534 1240365 Y MUM1,APC2,C19orf26 C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA ATP5D 483 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1260732 1261171 1260912 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA CIRBP 3348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 1266359 1266798 1266589 Y NA C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1,EFNA2 NA NA NA NA C19orf24 6228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr19 1408607 1408695 1408655 Y CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15 NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3039 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 1408835 1409120 1409078 Y NA NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15 NA NA NA NA DAZAP1 3267 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 1445282 1445452 1445336 Y C19orf26,EFNA2,MUM1,APC2 GAMT,DAZAP1,RPS15,C19orf25,PCSK4,REEP6 NA NA NA NA RPS15 8924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2061356 2061737 2061654 Y SF3A2,OAZ1,GADD45B,DOT1L,C19orf35,REXO1,CSNK1G2,MKNK2,MOBKL2A BTBD2,MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MKNK2 12113 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2095281 2095723 2095416 Y NA MKNK2,IZUMO4,MOB3A NA NA NA NA MOB3A 609 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 2165096 2165788 2165320 Y REXO1,CSNK1G2,OAZ1,GADD45B,C19orf35,DOT1L DOT1L,AP3D1 NA NA NA NA AP3D1 2632 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2489253 2489454 2489354 Y BTBD2,MOBKL2A,PLEKHJ1,SF3A2,SGTA,TIMM13 LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 15133 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2494705 2495117 2494880 Y DOT1L,GADD45B LMNB2,GADD45B NA NA NA NA GADD45B 20585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 2540691 2541097 2540881 Y TIMM13 NA NA NA NA NA GADD45B 66571 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2578988 2579272 2579256 Y TMPRSS9 NA NA NA NA NA GADD45B 104868 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 2711591 2711804 2711730 Y GADD45B,GNA15 GNG7,DIRAS1,SLC39A3 NA NA NA NA DIRAS1 7612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 3035530 3035851 3035686 Y NCLN,DOHH,DOHH,SLC39A3,SGTA,THOP1,TLE6,TLE2,TLE2 TLE2,AES NA NA NA NA TLE2 9782 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 3458286 3458426 3458380 Y NA C19orf77,DOHH,FZR1 NA NA NA NA C19orf77 20114 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 3655813 3656105 3655965 Y NA PIP5K1C NA NA NA NA PIP5K1C 42372 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 4067781 4068111 4067963 Y SEMA6B,ATCAY,ZBTB7A ZBTB7A NA NA NA NA ZBTB7A 2838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 4084320 4084813 4084566 Y NA ZBTB7A,MAP2K2 NA NA NA NA ZBTB7A 19377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 4108837 4109162 4109070 Y TMIGD2,CCDC94,C19orf29,APBA3,MRPL54,MATK,ZBTB7A ZBTB7A,MAP2K2,CREB3L3 NA NA NA NA MAP2K2 12964 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 4456385 4456784 4456737 Y UBXN6,UBXN6 UBXN6,HDGFRP2 NA NA NA NA UBXN6 566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 4812881 4813376 4813265 Y SEMA6B,TICAM1 FEM1A,TICAM1 NA NA NA NA TICAM1 16340 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 4976440 4976890 4976638 Y TICAM1,KDM4B KDM4B NA NA NA NA KDM4B 9315 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 5139337 5139604 5139434 Y NA NA NA NA NA NA RPL32P34 136141 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 5338459 5338816 5338637 Y PTPRS NA NA NA NA NA PTPRS 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 5624052 5624252 5624226 Y VMAC,RFX2,DUS3L,SAFB2,SAFB SAFB,SAFB2,RPL36 NA NA NA NA SAFB2 1995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 5940860 5941142 5941001 Y NA FUT5,NDUFA11,VMAC,CAPS,RANBP3 NA NA NA NA CAPS 31142 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 5989815 5989915 5989890 Y SLC25A23,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L,HSD11B1L RANBP3 NA NA NA NA RANBP3 13662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 6056849 6057757 6057360 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 80696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 6066698 6067208 6066827 Y SLC25A41,TMEM146,PRR22,DUS3L,RFX2,ACSBG2 NA NA NA NA NA RANBP3 90545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 6067299 6067617 6067410 Y DENND1C,SAFB2,SAFB,RFX2 NA NA NA NA NA RANBP3 91146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 6108978 6109271 6109224 Y NA NA NA NA NA NA RFX2 88312 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 6271729 6272422 6272353 Y NDUFA11,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 5537 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.52154043298836 chr19 6273754 6274259 6273940 Y VAV1,GPR108,DENND1C,RFX2,MLLT1 MLLT1 NA NA NA NA MLLT1 3700 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 6489533 6489689 6489612 Y CD70,SLC25A23,DENND1C,TUBB4,TNFSF9 SLC25A23,TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TUBB4A 11170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 6539979 6540238 6540076 Y NA TUBB4A,TNFSF9 NA NA NA NA TNFSF9 10969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 6587274 6587651 6587637 Y DENND1C,TNFSF9,ZNF557,CD70 CD70 NA NA NA NA CD70 14463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 6802447 6802718 6802569 Y DENND1C,TNFSF9,TNFSF14,EMR1,GPR108,VAV1 SH2D3A NA NA NA NA SH2D3A 36848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7197339 7197547 7197388 Y NA NA NA NA NA NA INSR 94498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7266028 7266415 7266222 Y NA INSR NA NA NA NA INSR 25630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7483723 7483869 7483787 Y NA ARHGEF18 NA NA NA NA ARHGEF18 25724 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7547905 7548376 7548024 Y STXBP2,CD209,PEX11G,MCOLN1 C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA C19orf45 7486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7559450 7559827 7559455 Y NA C19orf45,PEX11G,ZNF358,MCOLN1,PNPLA6 NA NA NA NA PEX11G 508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7720323 7720877 7720670 Y PEX11G,MCOLN1,PNPLA6,RETN,C19orf59,XAB2,LOC100131801,STXBP2 XAB2,STXBP2,TRAPPC5 NA NA NA NA STXBP2 20556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 7907381 7907869 7907475 Y PNPLA6,PNPLA6,KIAA1543,FBN3,LASS4,EVI5L,FLJ22184,CTXN1 EVI5L,LRRC8E NA NA NA NA EVI5L 14262 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 8488784 8489136 8488939 Y PRAM1,MYO1F RAB11B,MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA MARCH2 12630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 8518703 8518940 8518821 Y NA MARCH2,HNRNPM NA NA NA NA HNRNPM 11052 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 8674150 8674979 8674636 Y ADAMTS10 MYO1F,ADAMTS10 NA NA NA NA ADAMTS10 530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 9420483 9420931 9420837 Y NA ZNF559 NA NA NA NA ZNF559 11517 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 9517572 9518021 9517955 Y NA ZNF266 NA NA NA NA ZNF266 26233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 9747838 9748099 9747855 Y ZNF559,ZNF559,ZNF846 ZNF561,ZNF562,RPS4XP22 NA NA NA NA ZNF561 17763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 9903168 9903577 9903239 Y NA FBXL12,UBL5,PIN1 NA NA NA NA FBXL12 32915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 10056236 10056512 10056406 Y ZNF846,COL5A3,OLFM2 NA NA NA NA NA COL5A3 62635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 10346765 10347120 10347031 Y TYK2,S1PR5,S1PR5,DNM2,ATG4D,ZNF846,FBXL12,C19orf66,PPAN,ICAM3 S1PR2,DNMT1,MRPL4,ICAM1,ICAM4 NA NA NA NA DNMT1 6803 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 10515339 10515636 10515481 Y PDE4A,PDE4A TYK2,MIR1181 NA NA NA NA MIR1181 3125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr19 10713789 10714290 10714179 Y ICAM1,ICAM3,TYK2,PDE4A,DNM2,C19orf38,S1PR5,S1PR5,ATG4D,CDKN2D,CDKN2D,SLC44A2 KRI1,CDKN2D,SLC44A2,ILF3 NA NA NA NA SLC44A2 2656 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 11202212 11202837 11202668 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 4174 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 11205696 11206011 11205901 Y ACP5,ACP5,DNM2,C19orf38,CCDC159,LDLR LDLR NA NA NA NA LDLR 7658 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 11484314 11484469 11484411 Y ZNF439,ZNF653,ZNF627,ZNF491,ZNF441,ELAVL3,CCDC151,SMARCA4,SMARCA4 CCDC159,RAB3D,TMEM205,SWSAP1,EPOR,RGL3 NA NA NA NA SWSAP1 953 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 12888910 12889352 12889266 Y NA C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A NA NA NA NA JUNB 10958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.74080481846561 chr19 12899457 12901460 12900777 Y NA PRDX2,RNASEH2A,MAST1,RTBDN NA NA NA NA JUNB 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13023589 13024232 13023881 Y ZNF709,TNPO2,TNPO2,MAST1,DAND5 HOOK2,DNASE2,GCDH,SYCE2,FARSA,CALR,RAD23A,GADD45GIP1 NA NA NA NA SYCE2 3858 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13137197 13137461 13137217 Y NA NFIX NA NA NA NA NFIX 32775 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13143095 13143350 13143204 Y WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2 NFIX NA NA NA NA NFIX 38673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13164647 13164970 13164763 Y NA LYL1 NA NA NA NA LYL1 47005 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 13262107 13262928 13262695 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 2878 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 13266326 13267156 13266576 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,DNASE2,LYL1,STX10 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 7097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 13273540 13274187 13273840 Y MAN2B1,C19orf43,JUNB,LYL1 TRMT1,NACC1,STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 14311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 13278382 13278991 13278445 Y BEST2,JUNB,LYL1,STX10 STX10,IER2 NA NA NA NA IER2 19153 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 13917794 13918010 13917903 Y RFX1,ZSWIM4,NANOS3 MRI1,C19orf53,ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 13520 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13944151 13944331 13944193 Y CCDC130,RFX1,DCAF15,ZSWIM4 ZSWIM4 NA NA NA NA ZSWIM4 39877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13954357 13954714 13954441 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 50083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13957204 13959386 13957586 Y NA NA NA NA NA NA ZSWIM4 52930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 13972364 13973309 13972780 Y CCDC130,RFX1,PRKACA,IL27RA,DCAF15,ZSWIM4 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 41705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr19 13975574 13976059 13975671 Y CACNA1A,LPHN1,CC2D1A,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 38955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13976745 13977653 13977105 Y CACNA1A,RFX1,LPHN1,ZSWIM4,C19orf57 CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 37361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 13995440 13995781 13995611 Y NA CC2D1A,C19orf57 NA NA NA NA CC2D1A 19233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 14404408 14404769 14404597 Y NA NA NA NA NA NA CD97 84544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 14661096 14661426 14661346 Y NA TECR,DNAJB1,NDUFB7 NA NA NA NA NDUFB7 19448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 14732511 14733275 14733016 Y SYDE1 NA NA NA NA NA NDUFB7 51637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 15161016 15161340 15161178 Y CASP14 CCDC105 NA NA NA NA CCDC105 41460 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 15283162 15283418 15283290 Y NA ILVBL,NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 26374 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 15321082 15321623 15321224 Y RASAL3 NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 11290 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 15334094 15334476 15334286 Y SLC1A6,WIZ NOTCH3 NA NA NA NA NOTCH3 24302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 15947617 15948119 15947980 Y AKAP8,AKAP8L,RASAL3,OR10H3,OR10H4,RAB8A,KLF2,AP1M1 UCA1 NA NA NA NA UCA1 9846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 15974006 15974442 15974280 Y NA UCA1,CYP4F2 NA NA NA NA CYP4F2 32488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 16188924 16190024 16189835 Y TPM4 TPM4,RAB8A NA NA NA NA TPM4 13093 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 16560891 16561165 16561157 Y NA EPS15L1,CALR3,C19orf44 NA NA NA NA EPS15L1 19731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17200566 17201240 17200825 Y MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B HAUS8,MYO9B NA NA NA NA MYO9B 15975 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17236053 17237400 17237360 Y MED26,HAUS8,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 51462 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17246297 17246722 17246423 Y SLC27A1,PGLS,OCEL1,MYO9B NA NA NA NA NA MYO9B 61706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17667126 17667426 17667289 Y MAP1S,ARRDC2,MYO9B,SLC27A1,PGLS,GLT25D1 PGLS NA NA NA NA PGLS 46688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17890338 17890582 17890537 Y FAM129C,MAST3,JAK3,FCHO1 B3GNT3 NA NA NA NA B3GNT3 13055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 17961350 17961505 17961471 Y FAM129C,FCHO1,FCHO1,IL12RB1,IFI30,ARRDC2,JAK3 JAK3,RPL18A PLVAP,FAM125A,TMEM221,BST2,NXNL1,UNC13A,GLT25D1,FAM129C,MAP1S,FCHO1,INSL3,B3GNT3,JAK3,SLC5A5,KCNN1,RPL18A,CCDC124,ARRDC2 IMR90 Hi-C 24141950 JAK3 4470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18133045 18133309 18133130 Y FAM129C,MAP1S,FCHO1,FCHO1,LRRC25,IFI30,ELL,ARRDC2,ARRDC2 ARRDC2 NA NA NA NA ARRDC2 23104 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr19 18162301 18162691 18162523 Y NA MAST3,IL12RB1 NA NA NA NA MAST3 43912 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18230044 18230277 18230172 Y FCHO1,JAK3 MAST3,IL12RB1,PIK3R2 NA NA NA NA IL12RB1 22290 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18402387 18403564 18402535 Y JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,MAST3,IFI30,SSBP4,LRRC25,KLHL26,ELL,CRTC1,C19orf60,JUND,PGPEP1 KIAA1683,JUND,LSM4,PGPEP1 NA NA NA NA JUND 11955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 18527231 18527472 18527362 Y LSM4,SSBP4,ISYNA1,ISYNA1 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18527701 18528040 18527800 Y KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,IFI30,JUND,PGPEP1,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 27 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr19 18528263 18528792 18528577 Y UPF1,ARRDC2,ARRDC2,IFI30,PGPEP1,UBA52,C19orf60,LRRC25,SSBP4 GDF15,SSBP4,ISYNA1 NA NA NA NA SSBP4 589 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18600936 18601077 18601043 Y NA ELL NA NA NA NA ELL 29860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18625662 18626077 18625893 Y UPF1,IL12RB1,IFI30,JUND,LRRC25,KLHL26,UBA52,FKBP8,ELL ELL,FKBP8,KXD1 NA NA NA NA ELL 4860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 18631384 18632027 18631497 Y ELL ELL,FKBP8,KXD1,UBA52 NA NA NA NA ELL 447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 18793678 18793914 18793817 Y PDE4C KLHL26,CRTC1 NA NA NA NA CRTC1 1191 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 19143307 19143510 19143378 Y DDX49,SUGP1,NR2C2AP,SUGP2,ARMC6 ARMC6,SUGP2,SLC25A42 NA NA NA NA SUGP2 475 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 19248583 19248716 19248628 Y NA TMEM161A NA NA NA NA TMEM161A 1261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 19432213 19432594 19432445 Y SUGP2,NCAN,ZNF14,PBX4,SUGP1,MAU2 MAU2,SUGP1 NA NA NA NA SUGP1 2560 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 19600012 19600395 19600260 Y RFXANK,MAU2,GATAD2A,PBX4,GMIP NDUFA13,TSSK6,YJEFN3,CILP2 NA NA NA NA NDUFA13 24150 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 23309445 23309479 23309469 Y NA NA NA NA NA NA ZNF730 53433 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 23732304 23732710 23732386 Y NA NA NA NA NA NA ZNF675 135312 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr19 28218670 28219232 28218933 Y NA NA NA NA NA NA UQCRFS1 1483216 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 30157267 30157499 30157417 Y PLEKHF1,C19orf12,C19orf12 PLEKHF1,C19orf12 NA NA NA NA PLEKHF1 3304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 30336581 30336824 30336781 Y C19orf2,C19orf2 CCNE1 NA NA NA NA CCNE1 35776 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 30940722 30941004 30940861 Y NA NA NA NA NA NA URI1 528171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 33668108 33668528 33668227 Y SLC7A10,LRP3 LRP3,SLC7A10 NA NA NA NA LRP3 1599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 33996867 33997517 33996997 Y LRP3 PEPD NA NA NA NA PEPD 13183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 34310855 34311133 34311012 Y NA KCTD15 NA NA NA NA KCTD15 26017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 34396925 34397389 34397012 Y NA NA KCTD15 MCF7 ChIA-PET 22265404 KCTD15 112087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr19 34625713 34625998 34625854 Y PDCD2L LSM14A CEBPA,LOC80054,KCTD15,CHST8,UBA2,KIAA0355,LRP3,SLC7A10,WDR88,LSM14A,PEPD IMR90 Hi-C 24141950 LSM14A 35411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 34746041 34746169 34746166 Y KIAA0355 KIAA0355,RPL29P33 NA NA NA NA KIAA0355 2599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 34850085 34850642 34850351 Y ZNF599,ZNF302,ZNF181 GPI,PDCD2L NA NA NA NA GPI 1700 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 35100505 35100815 35100739 Y ZNF302 SCGB1B2P NA NA NA NA SCGB1B2P 33899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 35643836 35643967 35643905 Y FFAR3,USF2,MAG,HPN,LGI4 FXYD1,FXYD5 NA NA NA NA FXYD5 203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 35763871 35764402 35764192 Y FXYD1,FXYD1,HAMP LSR,USF2 NA NA NA NA USF2 5990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 35809679 35810380 35810036 Y GRAMD1A,FXYD5,FXYD5,FXYD5,USF2,FFAR2,U2AF1L4,IGFLR1,FFAR3 NA NA NA NA NA USF2 51798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 36757480 36757645 36757542 Y NA ZNF565 ZNF146 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF565 22321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 36882143 36882391 36882267 Y NA ZFP14,ZFP82 NA NA NA NA ZFP14 14042 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 37156610 37156902 37156838 Y ZNF565,ZNF565,ZFP14,ZNF566,ZNF566,ZNF260,ZNF529,ZNF790,ZNF420,ZNF345,ZNF345,ZNF529,ZNF382,ZNF567,ZNF461 ZNF461,AC074138.3,ZNF567 NA NA NA NA ZNF461 855 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 37246589 37246720 37246657 Y NA ZNF850 NA NA NA NA ZNF850 15007 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 37322216 37322466 37322299 Y ZFP14,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF829,ZNF829,ZNF585B,ZNF568,ZNF420,ZNF383,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345 ZNF345,ZNF790 NA NA NA NA ZNF345 16797 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 37408041 37408149 37408081 Y ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568 ZNF829,ZNF568 NA NA NA NA ZNF568 2810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 37795242 37795359 37795301 Y ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF829,ZNF568,ZNF420,ZNF585B,ZNF793,ZNF781,ZNF607,ZNF607,ZNF573,ZNF570,ZNF569,ZNF540,ZNF527,HKR1 HKR1 NA NA NA NA HKR1 6380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr19 37830170 37830469 37830239 Y NA HKR1,ZNF527 ZNF527 IMR90 Hi-C 24141950 HKR1 28431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 39171828 39172087 39171896 Y FAM98C,RASGRP4,RINL,NFKBIB,HNRNPL,MAP4K1 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 35539 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 39179503 39179787 39179628 Y RASGRP4,NFKBIB,HNRNPL ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 43214 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 39184148 39184440 39184342 Y C19orf33,PSMD8,PAK4,MRPS12,MRPS12,FBXO27,ACTN4 ACTN4 NA NA NA NA ACTN4 47859 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 39849240 39849632 39849436 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530 MED29,PAF1 IMR90 Hi-C 24141950 SAMD4B 18204 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 39863077 39863463 39863179 Y NA GMFG,SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2 NA NA NA NA PAF1 16372 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 39919610 39919819 39919723 Y NA PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2,RPS16,SUPT5H,TIMM50 NA NA NA NA RPS16 4769 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 40315090 40315548 40315357 Y NA DYRK1B,FBL NA NA NA NA DYRK1B 7293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 40923099 40923282 40923196 Y SHKBP1,EGLN2,EGLN2,C19orf54 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA PRX 5826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 40939716 40940068 40940022 Y SERTAD1 PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB,SPTBN4 NA NA NA NA SERTAD3 8544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 41831643 41832527 41831971 Y CEACAM4,CEACAM3,CEACAM21,CYP2A13,HNRNPUL1,HNRNPUL1,CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2 CCDC97,TMEM91,TGFB1,B9D2,BCKDHA NA NA NA NA CCDC97 17549 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 41915515 41915996 41915671 Y ARHGEF1,HNRNPUL1,TGFB1 B9D2,BCKDHA,EXOSC5,ATP5SL NA NA NA NA EXOSC5 14131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42027706 42027846 42027786 Y NA NA CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 83084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42037922 42038313 42037990 Y CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1 NA LOC100505495 IMR90 Hi-C 24141950 ATP5SL 93300 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 42289644 42289819 42289732 Y NA NA NA NA NA NA RPS19 72169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42444277 42444712 42444407 Y POU2F2,CD79A,ARHGEF1,ARHGEF1 RABAC1 NA NA NA NA RABAC1 16830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42633561 42634224 42633619 Y ARHGEF1,POU2F2,DEDD2 NA NA NA NA NA ZNF574 62932 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42772295 42772768 42772477 Y NA ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 1606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 42772804 42773312 42773020 Y CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 POU2F2,LOC100505622,MIR4323 IMR90 Hi-C 24141950 CIC 2115 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 42775992 42776735 42776352 Y NA GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145 NA NA NA NA CIC 5303 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 42784527 42784991 42784716 Y ATP1A3,GRIK5,ZNF574,ZNF526,GSK3A,TMEM145,PRR19,PAFAH1B3,PAFAH1B3,PAFAH1B3,MEGF8 GSK3A,ERF,CIC,PRR19,PAFAH1B3,TMEM145,MEGF8 NA NA NA NA CIC 13838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr19 43835548 43835842 43835742 Y NA CD177 TEX101 IMR90 Hi-C 24141950 CD177 19969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 44287065 44287299 44287223 Y NA SMG9,KCNN4,ZNF283 NA NA NA NA KCNN4 3656 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 44711538 44711905 44711597 Y NA ZNF226,ZNF227,ZNF233 NA NA NA NA ZNF227 1838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 45129392 45129792 45129578 Y PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR PVR NA NA NA NA PVR 15306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 45221919 45222313 45222185 Y NA BCL3 NA NA NA NA BCL3 26649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr19 45248499 45249479 45248793 Y NA NA NA NA NA NA BCL3 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 45350775 45351289 45350997 Y BCL3,PVRL2,RELB BCAM,PVRL2,TOMM40 NA NA NA NA PVRL2 3343 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.52154043298836 chr19 45755637 45756189 45755812 Y RELB,CLASRP,VASP NA NA NA NA NA BLOC1S3 75634 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 45946690 45947113 45946759 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,PPP1R13L,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N ERCC1,VASP,FOSB,RTN2,LOC100287177,EML2 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 FOSB 22140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr19 45953764 45954783 45954182 Y NA CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB,VASP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 14470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr19 45954905 45955186 45955133 Y GIPR,RELB,CLASRP,TRAPPC6A,BLOC1S3,PPM1N,FOSB CD3EAP,FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2 FOSB IMR90 Hi-C 24141950 FOSB 14067 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 45959420 45959846 45959631 Y GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP FOSB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOSB 9407 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 45968349 45968608 45968538 Y GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA FOSB 645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 46011701 46012269 46011904 Y FBXO46,CLASRP,ZNF296,VASP FOSB,ERCC1,PPM1N,RTN2,VASP NA NA NA NA VASP 3864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 46437050 46437156 46437068 Y NA IRF2BP1,MYPOP,NOVA2 NANOS2 IMR90 Hi-C 24141950 MYPOP 33188 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 46683956 46684315 46684191 Y NA NA NA NA NA NA HIF3A 113988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 46930027 46930174 46930086 Y NA CCDC8,PNMAL1 CCDC8,LOC100506012 IMR90 Hi-C 24141950 CCDC8 15186 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 47062362 47062544 47062453 Y NA GAPDHP38,CALM3 NA NA NA NA GAPDHP38 2464 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 47142195 47142976 47142503 Y NA CALM3,PTGIR,DACT3 NA NA NA NA PTGIR 15820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr19 47363167 47364689 47363471 Y PNMAL1,PNMAL2,LOC100506012,CALM3,DACT3,ARHGAP35 AP2S1 SLC1A5,MIR3190,BBC3,ARHGAP35,AP2S1,ZC3H4,CCDC9,FKRP,STRN4,NPAS1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 AP2S1 10918 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 47599577 47599849 47599731 Y NA TMEM160,SAE1,ZC3H4 NA NA NA NA SAE1 14682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 47742856 47743228 47743000 Y NA BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA BBC3 8833 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 47746329 47746738 47746506 Y SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA CCDC9 10499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 47776748 47776969 47776841 Y GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1 BBC3,CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA PRR24 606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 47792934 47793257 47793053 Y NA CCDC9,PRR24,C5AR1 NA NA NA NA C5AR1 1654 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 48076356 48076760 48076653 Y SLC8A2,ZNF541 NA GLTSCR1,KPTN,MEIS3,SLC8A2,NAPA,LOC100505681,ZNF541 IMR90 Hi-C 24141950 NAPA 59859 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 48103581 48103982 48103689 Y GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1 NA GLTSCR1,NAPA MCF7 ChIA-PET 22265404 NAPA 87084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 48151789 48152128 48151872 Y NA NA NA NA NA NA EHD2 62472 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 48625125 48625566 48625247 Y NA PLA2G4C,LIG1,ZNF114 NA NA NA NA PLA2G4C 13051 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr19 48903013 48903207 48903134 Y PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1 TMEM143,KDELR1,GRWD1 NA NA NA NA KDELR1 10203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 48996099 48996379 48996219 Y NA GRWD1,CYTH2 NA NA NA NA CYTH2 25810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 49092091 49092636 49092297 Y BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11 SPHK2,RPL18,DBP NA NA NA NA SPHK2 27912 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 49486890 49487028 49486959 Y NA BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA GYS1 7539 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 49495555 49495708 49495609 Y SPHK2,SPHK2,BCAT2,NUCB1,TRPM4 BAX,FTL,GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 49521043 49521282 49521101 Y NA GYS1,RUVBL2 NA NA NA NA RUVBL2 26338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 49577003 49577438 49577313 Y SULT2B1,MAMSTR,KCNA7 SNRNP70,LIN7B,C19orf73,PPFIA3 NA NA NA NA SNRNP70 9238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 49698080 49698342 49698211 Y NA TRPM4 NA NA NA NA TRPM4 39082 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 49836983 49837445 49837293 Y SNRNP70,IRF3,FLT3LG,FLT3LG,BCL2L12,ALDH16A1,CD37 CTC-301O7.4,DKKL1,TEAD2 NA NA NA NA CTC-301O7.4 4420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 50417620 50417965 50417778 Y NA PNKP,TBC1D17,AKT1S1,ATF5,IL4I1,NUP62 NA NA NA NA ATF5 11994 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 50872495 50872846 50872654 Y NA NR1H2,KCNC3,POLD1 NA NA NA NA POLD1 12615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 51059944 51060288 51060130 Y NA JOSD2,LRRC4B NA NA NA NA LRRC4B 9014 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 51221435 51221859 51221691 Y KCNC3,ASPDH,LRRC4B,SYT3,SYT3,SHANK1 SHANK1,CLEC11A NA NA NA NA SHANK1 728 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 51774338 51774710 51774481 Y NA CD33,IGLON5 NA NA NA NA IGLON5 38392 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 51796169 51796569 51796297 Y NA IGLON5,VSIG10L CD33,IGLON5 IMR90 Hi-C 24141950 IGLON5 16533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 52052884 52053120 52052983 Y NA SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175 ZNF175,SIGLEC10,SIGLEC8,SIGLEC6,SIGLEC5 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF175 19431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 52068853 52069119 52068985 Y SIGLEC7,CD33,SIGLEC8,SIGLEC12,SIGLEC12,SIGLEC6,ZNF175 SIGLEC6,ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 3432 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 52075080 52075242 52075159 Y ZNF615,ZNF614,ZNF613,SIGLEC7,SIGLEC6,ZNF649,ZNF175 SIGLEC6,ZNF175 NA NA NA NA ZNF175 2529 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 52192085 52192767 52192400 Y ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577 MIRLET7E NA NA NA NA MIRLET7E 1272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr19 52310413 52310785 52310550 Y ZNF350,SIGLEC10,SIGLEC12,SIGLEC14,FPR1,FPR2,FPR3 FPR3,FPR1 NA NA NA NA FPR1 5050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 52350870 52351321 52351078 Y ZNF610,CLDND2,LOC147646,SIGLEC14 FPR1,ZNF577 NA NA NA NA ZNF577 40882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 53145294 53145545 53145446 Y NA ZNF83 NA NA NA NA ZNF83 46204 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 53150651 53150972 53150733 Y NA ZNF83 ZNF137P IMR90 Hi-C 24141950 ZNF83 40777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 53426305 53426488 53426354 Y ZNF765,ZNF468,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 17366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 53444729 53445104 53444918 Y ZNF765,ZNF761,ZNF665,ZNF347,ZNF347,ZNF160,ZNF808,ZNF701,ZNF701,ZNF83,ZNF816 ZNF320,ZNF816-ZNF321P,ZNF321P,ZNF816 NA NA NA NA ZNF816-ZNF321P 875 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 53592651 53593387 53593361 Y NA ZNF160,ZNF415 NA NA NA NA ZNF160 11302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 53727403 53727861 53727738 Y NA ZNF665,ZNF677 NA NA NA NA ZNF677 28290 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr19 54291187 54291209 54291198 Y BIRC8,ZNF845,ZNF765,ZNF761,ZNF813 AC008753.3 NA NA NA NA AC008753.3 14334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 54352555 54352808 54352773 Y VSTM1,OSCAR,LILRB3,LILRB2,LILRA6,LILRA5,LILRA3,LILRA3,ZNF331,ZNF331,NLRP12,MYADM MYADM,AC008753.6,PRKCG CACNG8,CACNG6,VSTM1,NDUFA3,OSCAR,TFPT,PRPF31,TMC4,MBOAT7,LILRB5,LILRA6,LILRA4,LILRB1,PRKCG,CACNG7 HELA,K562,H1ESC,IMR90 5C,Hi-C 22955621,24141950 MYADM 14669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 54465243 54465494 54465291 Y TFPT,PRPF31,NDUFA3,MYADM,CACNG7,CACNG8 CACNG8 NA NA NA NA CACNG8 949 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.85043701120423 chr19 54713468 54714085 54713942 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,TARM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 10858 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 54714720 54715094 54714879 Y NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6 MBOAT7,TSEN34,RPS9 NA NA NA NA RPS9 12110 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 55600172 55600429 55600236 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA RDH13 19513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 55619280 55619321 55619308 Y NA RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 7606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 55627475 55627790 55627718 Y LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C RDH13,PPP1R12C NA NA NA NA PPP1R12C 548 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 55699968 55700281 55700219 Y NA SYT5 NA NA NA NA SYT5 10159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 55850120 55850505 55850225 Y KIR3DL2,NCR1,PPP1R12C,PPP6R1,ZNF865,ZNF784,ZNF628,EPN1,SUV420H2,LOC388564 SUV420H2,COX6B2,IL11,RPL28 NA NA NA NA SUV420H2 899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 55880979 55881171 55881094 Y ZNF579,NAT14,COX6B2,IL11 SUV420H2,COX6B2,IL11,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 1148 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr19 55885541 55885905 55885786 Y NA SUV420H2,COX6B2,IL11,RPL28,UBE2S NA NA NA NA IL11 5710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 56116208 56117068 56116734 Y NA ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2 NA NA NA NA FIZ1 4872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr19 56789143 56789486 56789342 Y NA NA NA NA NA NA ZNF542 87982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 56833034 56833496 56833435 Y ZSCAN5A ZNF542,ZSCAN5A NA NA NA NA ZNF542 43972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 57582950 57583170 57583060 Y NA NA NA NA NA NA ZNF264 117698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 58162762 58163096 58162801 Y NA ZNF134,ZNF211,ZNF551 NA NA NA NA ZNF211 23001 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 58237757 58238155 58237774 Y NA ZNF551,ZNF671,ZNF776,ZNF586 ZNF154 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF671 765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 58321012 58321020 58321017 Y VN1R1,ZNF211,ZNF587,ZNF417,ZNF776,ZNF586,ZNF552 ZNF586,ZNF552,ZNF587 NA NA NA NA ZNF552 3261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr19 58557282 58557656 58557471 Y NA CTD-2368P22.1,ZNF606,ZSCAN1,ZNF135 NA NA NA NA ZNF135 10951 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr19 58912594 58912944 58912773 Y ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324 A1BG,ZNF497,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B NA NA NA NA ZNF584 1723 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr19 59087419 59087864 59087514 Y NA ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M,CENPBD1P1,MZF1 NA NA NA NA MZF1 4477 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 394418 394640 394594 Y SH3YL1 NA NA NA NA NA ACP1 132278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 1722150 1722351 1722236 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 24273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 1725652 1725860 1725698 Y NA PXDN NA NA NA NA PXDN 20764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 1810384 1810763 1810574 Y NA NA NA NA NA NA PXDN 63760 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 2617084 2617480 2617333 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 762173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 3226385 3226781 3226690 Y NA NA NA NA NA NA TSSC1 152872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 3583560 3583858 3583796 Y NA AC108488.4,RNASEH1-AS1,RNASEH1,RPS7 NA NA NA NA AC108488.4 1097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 6997134 6997480 6997307 Y RSAD2,CMPK2 RSAD2,CMPK2 NA NA NA NA RSAD2 6457 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 7571177 7571382 7571249 Y NA NA NA NA NA NA RNF144A 515654 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 8816590 8817048 8816915 Y NA AC011747.7 NA NA NA NA ID2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 8872785 8872976 8872902 Y NA NA NA NA NA NA AC011747.7 52792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9142736 9142998 9142867 Y NA MBOAT2 NA NA NA NA MBOAT2 794 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9427801 9428115 9428020 Y YWHAQ,ITGB1BP1,ASAP2 NA NA NA NA NA ASAP2 82907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9641378 9641587 9641543 Y NA IAH1 NA NA NA NA IAH1 29591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9688603 9688902 9688848 Y ADAM17 ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 5019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9705660 9705808 9705714 Y NA ADAM17 NA NA NA NA ADAM17 11739 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 9879413 9880120 9879773 Y ADAM17 NA ADAM17,YWHAQ,IAH1,KLF11,ITGB1BP1 IMR90 Hi-C 24141950 TAF1B 101363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 10260365 10260994 10260486 Y ODC1,TAF1B,RRM2,RRM2 CYS1 NA NA NA NA RRM2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 10274411 10274722 10274506 Y TAF1B,RRM2,RRM2,C2orf48 RRM2 NA NA NA NA RRM2 13956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 10418251 10419155 10418675 Y NA HPCAL1 RRM2,GRHL1,NOL10,HPCAL1 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HPCAL1 21860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 10441145 10441558 10441458 Y KLF11 HPCAL1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 HPCAL1 130 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 10489892 10489997 10489924 Y HPCAL1 HPCAL1 NA NA NA NA HPCAL1 48877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 10550434 10550795 10550555 Y HPCAL1,HPCAL1 ODC1,RP11-320M2.1 ODC1 IMR90 Hi-C 24141950 ODC1 35835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 11270081 11270242 11270156 Y KCNF1,C2orf50 PQLC3 NA NA NA NA PQLC3 23082 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 11514785 11514933 11514926 Y NA ROCK2 ROCK2,E2F6,PQLC3,PDIA6,C2orf50 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 28329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 11531800 11532088 11531893 Y NTSR2,KCNF1,C2orf50 ROCK2 ROCK2,PDIA6,PQLC3,KCNF1,FLJ33534,C2orf50,GREB1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ROCK2 45344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 11884050 11884543 11884432 Y NA NA NA NA NA NA LPIN1 68329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 12856062 12856442 12856137 Y NA TRIB2 NA NA NA NA TRIB2 1047 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr2 16122453 16123200 16122898 Y NBAS,MYCN MYCN NA NA NA NA MYCN 43767 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 16365312 16365661 16365578 Y NA NA NA NA NA NA MYCN 286626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 17824489 17824666 17824658 Y NA NA NA NA NA NA GEN1 108459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 19464609 19464927 19464768 Y NA NA NT5C1B-RDH14 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00954 601694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 19562818 19563058 19562929 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 503563 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 19811541 19811934 19811810 Y NA NA NA NA NA NA LINC00954 254687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 20345416 20345679 20345548 Y NA NA PUM2,WDR35,MATN3,SDC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SDC1 77515 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 20534195 20534238 20534216 Y NA PUM2 NA NA NA NA PUM2 15757 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 20624612 20624982 20624777 Y HS1BP3 RHOB HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOB 19853 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 20795362 20795521 20795453 Y HS1BP3 NA HS1BP3,RHOB,PUM2 IMR90 Hi-C 24141950 HS1BP3 53328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 21691615 21691861 21691725 Y NA NA NA NA NA NA C2orf43 670733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 23783139 23783161 23783150 Y NA NA NA NA NA NA KLHL29 177051 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 25701614 25701880 25701747 Y NA NA NA NA NA NA DNMT3A 138155 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 26184450 26184595 26184522 Y NA KIF3C NA NA NA NA KIF3C 19023 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 26220678 26220902 26220866 Y RAB10 KIF3C,RAB10 ASXL2,RAB10,FAM59B,KIF3C IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KIF3C 17060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 26521727 26522029 26521734 Y NA EPT1,GPR113 NA NA NA NA EPT1 7386 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 26946934 26947339 26946998 Y C2orf28,C2orf28,HADHA,HADHB,C2orf18 AC015977.5,KCNK3,CENPA NA NA NA NA KCNK3 33315 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 27304052 27304486 27304234 Y CENPA,CENPA,DPYSL5,SLC5A6,PPM1G,GTF3C2,CAD,CGREF1 AGBL5,OST4,EMILIN1,KHK,CGREF1,ABHD1 NA NA NA NA KHK 3129 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 27543962 27544264 27544065 Y NA SLC30A3,MPV17,AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17 NA NA NA NA MPV17 2283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 27614467 27614499 27614483 Y EIF2B4,EIF2B4 AC074117.10,GTF3C2,EIF2B4,SNX17,ZNF513,FTH1P3,PPM1G,NRBP1 NA NA NA NA FTH1P3 233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 27958320 27958698 27958604 Y NA AC074091.13,MRPL33 BRE,PLB1,RBKS,MRPL33,FOSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC074091.13 21721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 28120564 28120959 28120784 Y FOSL2,RBKS BRE,RBKS NA NA NA NA RBKS 8599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 28492228 28492339 28492284 Y NA NA NA NA NA NA FOSL2 120976 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 28621403 28621758 28621597 Y PPP1CB,PPP1CB,FOSL2 FOSL2,AC104695.3 NA NA NA NA AC104695.3 5864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 29009696 29009902 29009742 Y FOSL2,PPP1CB,PPP1CB PPP1CB NA NA NA NA PPP1CB 37190 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 33596058 33596304 33596181 Y RASGRP3 NA NA NA NA NA RASGRP3 63087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 36584242 36585529 36584872 Y FEZ2,CRIM1 CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 3173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 36599325 36599532 36599405 Y NA CRIM1 NA NA NA NA CRIM1 18256 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 36654413 36654491 36654452 Y NA NA NA NA NA NA CRIM1 73344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 36795570 36795942 36795825 Y FEZ2 NA NA NA NA NA FEZ2 75288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 37592833 37593153 37593092 Y NA PRKD3,QPCT NA NA NA NA QPCT 23116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 37603882 37604154 37604086 Y QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 34165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 37605671 37605839 37605750 Y CCDC75,QPCT QPCT NA NA NA NA QPCT 35954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 37789550 37789826 37789587 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 173785 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 37797953 37798358 37798079 Y EIF2AK2,CDC42EP3 NA CDC42EP3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 165253 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 37880894 37881162 37881056 Y EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3 NA NA NA NA NA CDC42EP3 82449 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 38008241 38008581 38008345 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 44630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 38009711 38009894 38009885 Y NA CDC42EP3 CDC42EP3,PRKD3,QPCT IMR90 Hi-C 24141950 CDC42EP3 46100 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 38373682 38374230 38374188 Y CDC42EP3,CYP1B1 NA NA NA NA NA ATL2 228197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 38538303 38538646 38538475 Y NA NA NA NA NA NA ATL2 63781 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 38552581 38552739 38552658 Y NA ATL2 NA NA NA NA ATL2 49688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 39079289 39079498 39079407 Y SRSF7,ARHGEF33 DHX57,MORN2 NA NA NA NA DHX57 21577 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 39443973 39444333 39444109 Y SOS1 NA NA NA NA NA SOS1 94487 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 39719153 39719730 39719398 Y MAP4K3 NA NA NA NA NA MAP4K3 56700 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 40509736 40509978 40509875 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 326215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 40647677 40648234 40647999 Y NA NA NA NA NA NA SLC8A1 187959 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 40950073 40950087 40950080 Y NA NA LOC100128590,SLC8A1 IMR90 Hi-C 24141950 SLC8A1 113880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 42149327 42149700 42149496 Y PKDCC AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 9163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 42161610 42162017 42161892 Y NA AC104654.2 NA NA NA NA AC104654.2 2747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 42328958 42329862 42329543 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 55798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 42329971 42330163 42329978 Y NA NA EML4 IMR90 Hi-C 24141950 PKDCC 56811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 42535809 42536204 42535901 Y NA NA COX7A2L IMR90 Hi-C 24141950 COX7A2L 114024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43037224 43037999 43037611 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MTA3 317515 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 43144669 43144850 43144755 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 306898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43151826 43152270 43152066 Y NA NA ZFP36L2,LOC100129726,THADA IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZFP36L2 299478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43327979 43328013 43327996 Y NA NA THADA,ZFP36L2,LOC100129726 IMR90 Hi-C 24141950 ZFP36L2 123735 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43405877 43406433 43406206 Y OXER1 ZFP36L2 ZFP36L2,THADA,LOC100129726 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZFP36L2 45315 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43437815 43438151 43437904 Y OXER1,ZFP36L2 ZFP36L2 NA NA NA NA ZFP36L2 13597 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 43692800 43693176 43692988 Y NA NA NA NA NA NA THADA 128009 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 46294979 46295300 46295093 Y NA NA NA NA NA NA EPAS1 223506 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 46557036 46557117 46557077 Y NA EPAS1 NA NA NA NA EPAS1 38230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 46586439 46586863 46586504 Y EPAS1 NA NA NA NA NA EPAS1 67633 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 46993562 46993962 46993767 Y NA LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 47874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 47076896 47077421 47077187 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 35060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 47077976 47078245 47078111 Y SOCS5,SOCS5,MCFD2,MCFD2 LINC01119 NA NA NA NA LINC01119 36140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 47195176 47195614 47195246 Y RHOQ,TTC7A,MCFD2 MCFD2 NA NA NA NA MCFD2 28182 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr2 47270774 47271231 47270943 Y NA NA NA NA NA NA MCFD2 103780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 47296749 47297008 47296937 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 104732 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 47306951 47307378 47307182 Y NA NA NA NA NA NA CALM2 94362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 47499706 47499760 47499719 Y C2orf61 NA TTC7A,CALM2,SOCS5,MCFD2,C2orf61 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC073283.4 70453 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 52304154 52304543 52304242 Y NA NA NA NA NA NA CHAC2 1688386 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 54196339 54196842 54196524 Y ASB3,ASB3,PSME4 ACYP2,PSME4 NA NA NA NA PSME4 362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 54786900 54787386 54787056 Y NA NA NA NA NA NA SPTBN1 105478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 54787503 54787764 54787623 Y RTN4,SPTBN1 NA NA NA NA NA SPTBN1 106081 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr2 54861793 54862155 54861956 Y NA NA NA NA NA NA EML6 86481 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 55248216 55248544 55248355 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 89213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 55249584 55250267 55249993 Y NA NA NA NA NA NA RTN4 87490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 55338983 55339153 55339057 Y CCDC88A,RTN4,RTN4 RTN4 C2orf63,RTN4,EML6 IMR90 Hi-C 24141950 RTN4 1226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 55360803 55361407 55361172 Y SMEK2,CCDC88A,RTN4 RTN4 RTN4,C2orf63,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 23046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 55364745 55365096 55365046 Y NA RTN4 RTN4,EML6 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RTN4 26988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 55450545 55450658 55450592 Y CCDC88A,EML6,RTN4 RPS27A,MTIF2 NA NA NA NA RPS27A 6381 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr2 55558772 55559057 55558882 Y NA NA NA NA NA NA MTIF2 64289 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 60962204 60962802 60962781 Y NA PAPOLG NA NA NA NA PAPOLG 18563 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 61133049 61133418 61133217 Y NA REL,RNU4-51P NA NA NA NA RNU4-51P 3020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 61580039 61580318 61580309 Y NA NA NA NA NA NA USP34 115586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 61586795 61586939 61586907 Y AHSA2,USP34 NA NA NA NA NA USP34 108965 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 61921641 61922071 61921953 Y NA NA NA NA NA NA FAM161A 157207 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 61990946 61991094 61991044 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 88184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 61991278 61991660 61991557 Y NA NA XPO1,FAM161A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FAM161A 87618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr2 63842322 63842740 63842368 Y UGP2 MDH1 NA NA NA NA MDH1 28579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 64352533 64352773 64352693 Y NA AC074289.1,PELI1 NA NA NA NA AC074289.1 15600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 64540204 64540217 64540210 Y NA NA LINC00309,PELI1,AFTPH IMR90 Hi-C 24141950 LGALSL 138886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 64756167 64756526 64756224 Y NA AFTPH NA NA NA NA AFTPH 6702 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 64978173 64978610 64978385 Y CEP68 SERTAD2 SERTAD2,LOC339807,AFTPH IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 2034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 64994926 64995226 64995021 Y SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2 SERTAD2 SERTAD2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SERTAD2 18787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 65214378 65214996 65214823 Y NA SLC1A4 NA NA NA NA SLC1A4 767 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 65303160 65303240 65303200 Y SERTAD2,SLC1A4,ACTR2,RAB1A CEP68 NA NA NA NA CEP68 21660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 65326595 65326952 65326834 Y NA CEP68,RAB1A NA NA NA NA RAB1A 28288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 65657861 65658229 65658008 Y SLC1A4,SPRED2,SPRED2 SPRED2 NA NA NA NA SPRED2 90 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 65804222 65804385 65804306 Y RAB1A NA ACTR2,SPRED2 IMR90 Hi-C 24141950 SPRED2 146451 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 67625110 67625487 67625291 Y ETAA1 ETAA1 NA NA NA NA ETAA1 2659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 67744212 67744599 67744410 Y NA NA MEIS1 IMR90 Hi-C 24141950 ETAA1 121761 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 68472906 68473226 68473141 Y PPP3R1 PPP3R1 NA NA NA NA PPP3R1 8143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 68964895 68965352 68965007 Y PLEK,FBXO48,APLF NA NA NA NA NA APLF 272202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 68966770 68967047 68966940 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 271263 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 69309666 69309994 69309927 Y NA NA NA NA NA NA ANTXR1 71356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 69390293 69390547 69390355 Y ARHGAP25,ARHGAP25 NA NA NA NA NA ANTXR1 151983 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 69851897 69852398 69852223 Y NA ANXA4,AAK1 NA NA NA NA ANXA4 17159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 70335985 70336314 70336204 Y AAK1,C2orf42,PCBP1 PCBP1,PCBP1-AS1,AC016700.4 NA NA NA NA AC016700.4 8302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 71129017 71129173 71129049 Y NA VAX2 NA NA NA NA VAX2 3297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 71681748 71682153 71682029 Y NA DYSF NA NA NA NA DYSF 2896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 72426245 72426403 72426323 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 624767 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 72541323 72541406 72541365 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 509764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 72980109 72980387 72980306 Y NA NA NA NA NA NA EXOC6B 70783 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 73338552 73338952 73338867 Y RAB11FIP5 SFXN5,RAB11FIP5 NA NA NA NA SFXN5 37805 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 73613683 73613856 73613817 Y DUSP11,ALMS1 ALMS1 NA NA NA NA ALMS1 2797 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 74152201 74152400 74152268 Y NA ACTG2,DGUOK NA NA NA NA DGUOK 248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 74446656 74447054 74446868 Y NA MOB1A,MTHFD2 NA NA NA NA MTHFD2 22967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 75427361 75427621 75427415 Y TACR1 TACR1 NA NA NA NA TACR1 2535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 75498571 75498680 75498627 Y NA NA TACR1 IMR90 Hi-C 24141950 TACR1 73745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 85116002 85116322 85116077 Y C2orf89,TMSB10 TMSB10 TMSB10 MCF7 ChIA-PET 22265404 TMSB10 14427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 85147093 85147556 85147171 Y TMSB10 TMSB10,KCMF1 NA NA NA NA TMSB10 16344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 85185071 85185576 85185382 Y NA KCMF1 TMSB10,KCMF1 IMR90 Hi-C 24141950 KCMF1 10640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 85664544 85665596 85664830 Y KCMF1,TGOLN2,CAPG,SH2D6 NA NA NA NA NA RETSAT 84801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 85764802 85765239 85764815 Y SH2D6,USP39 MAT2A,GGCX,VAMP8,VAMP5 NA NA NA NA MAT2A 514 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 85814700 85815022 85814855 Y VAMP5 GGCX,VAMP8,VAMP5,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68 NA NA NA NA VAMP5 5169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 85993562 85993638 85993601 Y NA RNU1-38P,ATOH8 NA NA NA NA ATOH8 17095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 86030361 86030633 86030487 Y SH2D6 NA LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ATOH8 53894 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 86113603 86114063 86113862 Y CAPG,GNLY,ST3GAL5 ST3GAL5,AC105053.4 LOC284950 IMR90 Hi-C 24141950 ST3GAL5 74 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 86452715 86452898 86452804 Y RNF103,RMND5A IMMT,MRPL35 NA NA NA NA MRPL35 28237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 86722014 86722392 86722297 Y RMND5A NA NA NA NA NA KDM3A 56244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 91815672 91815808 91815787 Y NA NA NA NA NA NA AC096579.7 2652019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 97151625 97152085 97151839 Y ASTL,DUSP2,TMEM127,KIAA1310,CNNM4,ARID5A ARID5A NA NA NA NA ARID5A 48395 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr2 97204407 97205263 97204568 Y NA ARID5A NA NA NA NA ARID5A 3927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 99125275 99125485 99125370 Y INPP4A NA NA NA NA NA INPP4A 65958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 100082054 100082282 100082201 Y NA REV1 NA NA NA NA REV1 22215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 100484034 100484497 100484368 Y NA NA NA NA NA NA REV1 379537 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 100654601 100654935 100654768 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 377183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 100908504 100908788 100908727 Y NA NA NA NA NA NA CHST10 123330 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 101010496 101010959 101010820 Y AFF3 CHST10 NA NA NA NA CHST10 21159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 102063368 102063658 102063441 Y RNF149,MAP4K4,MAP4K4 NA CREG2 IMR90 Hi-C 24141950 CREG2 61311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 102382879 102383094 102382925 Y NA NA NA NA NA NA MAP4K4 71567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 102649919 102650192 102650054 Y IL1RL2,IL1R1,IL18RAP,IL18R1,MAP4K4,MAP4K4,IL1R2 IL1R1 NA NA NA NA IL1R1 28812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 102856746 102856850 102856799 Y IL1R2,IL18RAP,IL1R1 NA NA NA NA NA IL18R1 69139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 105655685 105655967 105655739 Y NA MRPS9 NA NA NA NA MRPS9 3244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 106009982 106010344 106010250 Y FHL2,FHL2 FHL2 NA NA NA NA FHL2 42626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 106370571 106370808 106370750 Y TGFBRAP1,C2orf49,NCK2 NCK2 NA NA NA NA NCK2 11217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 108883612 108883815 108883711 Y NA NA NA NA NA NA SULT1C4 108552 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 109789769 109790041 109789880 Y NA NA NA NA NA NA CCDC138 388556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 109790230 109790424 109790331 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 389017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 109859358 109859584 109859496 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 458145 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 109864376 109864774 109864388 Y SH3RF3 NA NA NA NA NA CCDC138 463163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 110859077 110859497 110859213 Y NA MALL NA NA NA NA MALL 12646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 111879046 111879315 111879118 Y NA BCL2L11 NA NA NA NA BCL2L11 4091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 112428952 112429342 112429151 Y MERTK NA BCL2L11,ACOXL IMR90 Hi-C 24141950 ANAPC1 210925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 112456456 112456792 112456629 Y NA NA BCL2L11,ACOXL IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ANAPC1 183475 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 113388786 113388926 113388836 Y NA CHCHD5,AC079922.2,SLC20A1 NA NA NA NA AC079922.2 11042 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 113581693 113582026 113582010 Y NA IL1B NA NA NA NA IL1B 10454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 113657771 113658101 113657937 Y NA NA CKAP2L,IL1A,IL37,IL1B IMR90 Hi-C 24141950 IL1B 65291 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 114082449 114082815 114082523 Y NA NA PAX8,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 115350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr2 114132430 114132930 114132660 Y IL36G,IL36B,IL36RN,IL1RN,CBWD2 NA PAX8,IL1RN,LOC654433 IMR90 Hi-C 24141950 PAX8-AS1 165331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 119067655 119067950 119067737 Y NA NA NA NA NA NA AC093901.1 125693 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 121334562 121334634 121334591 Y NA NA LOC84931 IMR90 Hi-C 24141950 GLI2 156565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 121575399 121575754 121575577 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 84200 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 121624920 121625080 121625001 Y NA NA NA NA NA NA GLI2 133721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 4.60455209502222 chr2 122405703 122406017 122405860 Y NA CLASP1,NIFK-AS1 NA NA NA NA NIFK-AS1 477 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 127862933 127863341 127863123 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 2 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 127863441 127863795 127863513 Y NA BIN1 NA NA NA NA BIN1 510 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 128143711 128144108 128144023 Y SFT2D3,MAP3K2 NA CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 128147350 128147625 128147497 Y WDR33,SFT2D3,AMMECR1L,MAP3K2 MAP3K2 CYP27C1,IWS1 IMR90 Hi-C 24141950 MAP3K2 3309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 128469057 128469300 128469179 Y NA LIMS2,SFT2D3 NA NA NA NA SFT2D3 12460 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 128598749 128599093 128599053 Y IWS1,SFT2D3,AMMECR1L WDR33,POLR2D NA NA NA NA POLR2D 14638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 129381655 129381863 129381711 Y NA NA UGGT1,HS6ST1 IMR90 Hi-C 24141950 HS6ST1 307504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 130201021 130201117 130201085 Y NA NA NA NA NA NA MZT2B 736193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr2 131058181 131058640 131058440 Y NA AC068137.13,IMP4,CCDC115 NA NA NA NA AC068137.13 8786 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 131828545 131828813 131828794 Y NA FAM168B,PLEKHB2 NA NA NA NA FAM168B 20220 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 132511121 132511398 132511143 Y TUBA3D NA NA NA NA NA AC093838.4 262735 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 133025188 133025675 133025588 Y NA NA GPR39,ANKRD30BL,CEP68,STAMBP,NRXN1,KCNIP3,ADCY3,EML4,DDX1,MIR4778,STARD7,TGOLN2,MAP3K2,RNU4ATAC,GCC2,CNNM3,LHCGR,LOC100189589,CLASP1,GMCL1,SULT6B1,ANKRD20A8P,MRPS9,NMS,RHOQ,CAPG,DGUOK,SMYD5,MPHOSPH10,ARID5A,HAAO,RMND5A,LOC440905,LIMS2,FOXN2,GPAT2,CIB4,LOC100216479,FEZ2,LOC729121,TTC7A,RTKN,CDKL4,POLR2D,LOC339803,EMILIN1,LYG1,MYCNOS,STEAP3,FAM49A,CKAP2L,EFR3B,OTOF,HK2,CNGA3,GEMIN6,ALK,SPR,LOC440895,IL18RAP,LOC375190,PTRHD1,C2orf81,MATN3,PEX13,FABP1,NPHP1,FAM161A,DDX18,ADRA2B,KRCC1,BIRC6,CCDC74B,C2orf49,THNSL2,ST3GAL5,NAT8B,ERCC3,CCDC88A,QPCT,LOC100506123,TLX2,REG1A,LOC284950,CHCHD5,SMC6,LOC254128,PNPT1,DBI,LOC100505716,LOC285103,TMSB10,RAD51AP2,MGAT4A,PLEKHH2,ELMOD3,PKDCC,GALM,GLI2,LIMS3-LOC440895,RPL31,ASXL2,LOC100132215,SMEK2,FBLN7,EPT1,SRSF7,DUSP2,CYP4F30P,LOC100131320,LOC388948,ATOH8,GCFC2,ACTR2,C2orf27B,IWS1,GPR17,MTIF2,LBX2,POU3F3,SUPT7L,SPDYA,TEKT4,ANKRD39,WDR54,RAB1A,IL36A,FAM123C,LOC285000,REV1,GPR148,MRPL33,EPB41L5,RPS27A,CEBPZ,EHBP1,RALB,APOB,DUSP11,LOC400958,CRIPT,CYP1B1-AS1,CHAC2,GFPT1,NPAS2,PTCD3,LOC389023,TRIM54,SFXN5,MALL,NT5C1B-RDH14,LOC100507334,POLE4,C2orf18,IL1A,C2orf73,CD8A,ATL2,LOC654342,UNC50,ITPRIPL1,HADHB,IL1R1,ZFP36L2,MAP4K3,FIGLA,LOC440900,ZNF512,POTEE,PDCL3,ABCG8,CCDC142,MYADML,MIR4783,PCBP1-AS1,PFN4,LOC150568,SEMA4F,TMEM177,LOC401010,MRPL19,GCKR,TTC32,GGCX,LOC151009,THUMPD2,LOC728537,IL36B,PCDP1,VAMP5,LRRTM4,SF3B14,SULT1C2,RGPD4,MCEE,AAK1,SFTPB,SLC5A7,SCTR,ACTR1B,CIAO1,DNAJC5G,SIX3,SERTAD2,PIGF,CD8B,GGT8P,SLC9A2,NFU1,SNAR-H,POTEKP,VWA3B,SH3RF3,FAHD2B,UBXN2A,LOC284998,MEIS1,FAM98A,LOC90784,LAPTM4A,CCDC104,LOC100499194,MAPRE3,PPP1R21,ANXA4,LOC440910,LOC100506421,FAM84A,GKN2,TMEM185B,RASGRP3,ABHD1,AFF3,CRIM1,MOGS,BOLA3,DNAJC27,MZT2B,MAL,NRBP1,UXS1,PRKD3,SOCS5,FLJ30838,TTC31,RNF103-CHMP3,HADHA,MIR4435-1,NOTO,RPL23AP7,C1QL2,CHMP3,RNF149,AUP1,TBC1D8,AGBL5,GYPC,MSH6,LOC728730,VPS54,EIF5B,GALNT14,PLEK,GEN1,LOC100505876,MIR4432,VAMP8,ST6GAL2,C2orf91,KIAA1841,MORN2,LOC100128590,IL1RL2,BMP10,EIF2B4,ARHGEF4,REG3A,SULT1C3,ADD2,TSN,IFT172,TSGA10,HNRPLL,DPY30,LGALSL,ZNF2,ZNF638,IMP4,CCDC138,INSIG2,ACOXL,FBXO41,DYSF,C2orf51,TMEM214,TMEM127,ALMS1P,CDC42EP3,MZT2A,TMEM150A,EGR4,FOXI3,C2orf16,FOSL2,OR7E91P,UGGT1,TMEM87B,TXNDC9,NBAS,CREG2,RGPD6,ABCG5,PUM2,RNF181,LINC00116,LOC646743,MIR4757,C2orf78,MRPL35,LOC541471,INHBB,RHOB,LOC388942,STON1-GTF2A1L,DCTN1,CCDC115,LOC100129726,KCNS3,UNQ6975,ZAP70,NAGK,C2orf53,MIR4436A,C2orf76,THADA,VRK2,SLC5A6,RABL2A,CCDC75,PLEKHB2,MXD1,ANKRD36BP2,REG1P,MIR217,C2orf63,ASTL,WDR33,NLRC4,XPO1,RETSAT,TUBA3E,TRIM43B,CAMKMT,BCL2L11,PUS10,PAIP2B,RPIA,SH2D6,PCBP1,USP39,REG3G,FSHR,MYCN,SEMA4C,ANKRD23,C1D,IL1R2,MKI67IP,MOB1A,LOC389043,ACTR3BP2,EPCAM,MAT2A,PCGF1,RGPD2,BIN1,KANSL3,LOC100287010,LOXL3,CD207,DPYSL5,VAX2,PPP1CB,POLR1A,LOC644838,BCL11A,SULT1C4,ANKRD36,DBIL5P2,B3GNT2,LINC00309,ARHGEF33,TFCP2L1,C2orf89,IL1F10,OTX1,PPM1B,GKN1,ANTXR1,FKBP1B,ATP6V1B1,CCT7,CCDC74A,TEX261,MTA3,MFSD9,COX5B,RGPD1,FOXD4L1,FLJ42351,EFEMP1,SLC30A6,FAM168B,GDF7,NEURL3,TUBA3D,POLR1B,USP34,MSH2,MFSD2B,EXOC6B,RANBP2,LRRTM1,LOC100286979,C2orf84,KCNK12,MIR4267,CAD,FAM138B,SPRED2,HTRA2,ACTG2,AHSA2,SLC30A3,RBKS,NCK2,MIR548AD,FLJ16341,TRMT61B,SLC1A4,PROKR1,ATAD2B,LOC100630918,LCLAT1,CAPN14,LMAN2L,C2orf65,CTNNA2,SRD5A2,MIR4265,CCT4,INPP4A,SLC20A1,COX7A2L,SNRNP27,TMEM178,MIR4266,SULT1C2P1,MIR4436B1,MRPS5,IMMT,ALMS1,CYP27C1,HS6ST1,LOC728819,WTH3DI,CHST10,LOC375196,SMPD4,OSR1,PAPOLG,KRTCAP3,EPAS1,MDH1,C2orf74,IL18R1,LOC1720,CCDC164,LOC285074,VIT,PLGLB2,C2orf61,LONRF2,CCDC85A,UCN,C2orf28,DQX1,FAM178B,CENPA,MRPL30,MERTK,TCF23,DNAJC27-AS1,FAM176A,IL36G,IL1B,LIPT1,ZNF513,COA5,CLEC4F,PPP3R1,BRE,C2orf15,RAB6C,DOK1,PLGLA,GPR45,MIR4780,TMEM131,CBWD2,TSPYL6,LOC388946,CLIP4,C2orf42,SNRPG,LOC654433,LOC100505624,PTPN18,C2orf71,POMC,EML6,KIF3C,WASH2P,LOC150776,GTF3C2,WDR43,MEMO1,ETAA1,TRIM43,MRPL53,CAPN13,MIR4264,TIA1,SPTBN1,CENPO,C2orf55,FLJ12334,HS1BP3,COMMD1,IL1RN,LOC285033,ANKRD36B,LOC440894,PRADC1,C2orf68,TCF7L1,TMEM37,ATP6V1E2,SIX2,REG1B,CYP26B1,PREPL,WDR35,PAX8,OST4,CGREF1,PELI1,REL,POTEF,ZC3H8,KLHL29,DHX57,C2orf40,CNTNAP5,C2orf44,TGFBRAP1,PRKCE,LRPPRC,SLC35F5,FBXO48,GPR113,SUCLG1,LOC100288911,NCAPH,WDR92,TACR1,MARCO,MIR216A,CALM2,BUB1,ANKRD53,SLC4A1AP,DDX11L2,LOC100134259,FANCL,ACYP2,ITSN2,DNMT3A,PROM2,LYG2,LOC100287216,GPR75-ASB3,PCYOX1,MAP4K4,PNO1,LOC151534,YIPF4,PREB,ANAPC1,EMX1,REEP1,GPN1,PRORSD1P,ZNF514,WDPCP,KDM3A,NAT8,KCMF1,YPEL5,C2orf27A,LIMS1,EDAR,DYNC2LI1,LOC339807,SEPT10,FUNDC2P2,EHD3,SLC9A4,RAB10,FAM179A,HEATR5B,IL37,OXER1,SOWAHC,AFTPH,LOC389033,LOC729234,DNAH6,TET3,SMYD1,RGPD8,UGP2,LOC442028,STRN,CFC1B,LTBP1,FNDC4,MIR3682,MYO7B,ZC3H6,SNX17,TGFA,C2orf56,TPRKB,TMEM17,SAP130,FBXO11,AMMECR1L,RFX8,EIF2AK3,GNLY,PLB1,MSGN1,SLC3A1,TMEM182,C2orf29,LINC00486,FAM59B,PTPN4,CNNM4,RTN4,ACTR3,MITD1,LOC645949,IL1RL1,PPM1G,ASB3,INO80B-WBP1,CNRIP1,XDH,LBH,IL36RN,SLC8A1,PROC,LINC00152,KHK,EN1,NCOA1,FAM82A1,KCNK3,FAM136A,FER1L5,PSD4,SNORD89,SLC4A5,MPV17,SDC1,SPAST,VSNL1,ERLEC1,MIR216B,SRBD1,APLF,CCDC93,LOC84931,CCDC121,C2orf43,SFT2D3,DTNB,RGPD3,TTL,FHL2,LOC100133985,SOS1,TP53I3,RAB11FIP5,ARHGAP25,MTHFD2,BOLA3-AS1,KCNG3,EIF2AK2,DPP10,CYP1B1,C2orf70,TTC27,SNRNP200,PSME4,FAHD2A,MCFD2 IMR90 Hi-C 24141950 GPR39 146472 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 133914495 133914622 133914567 Y NCKAP5 NA NA NA NA NA LYPD1 487343 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 135437323 135437554 135437491 Y TMEM163 NA NA NA NA NA CCNT2 236251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 136268329 136268541 136268430 Y NA ZRANB3,R3HDM1 NA NA NA NA ZRANB3 18265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 137003597 137004126 137003957 Y CXCR4,CXCR4 NA NA NA NA NA DARS 261927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 139289140 139289372 139289256 Y NA AC097721.2,SPOPL NA NA NA NA SPOPL 31769 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 143688672 143689047 143688712 Y NA NA NA NA NA NA KYNU 55605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 144769205 144769351 144769311 Y GTDC1,GTDC1 NA NA NA NA NA GTDC1 318784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 145583333 145583749 145583430 Y ZEB2 NA NA NA NA NA TEX41 159799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 148318690 148318914 148318854 Y ACVR2A NA NA NA NA NA ACVR2A 281172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 150278954 150279172 150279087 Y NA NA NA NA NA NA LYPD6 94455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 150440132 150440521 150440417 Y NA AC144449.1,MMADHC NA NA NA NA AC144449.1 1189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 150999106 150999378 150999253 Y RND3 NA RND3,MMADHC,RBM43 IMR90 Hi-C 24141950 RND3 394147 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 151022837 151023057 151022971 Y NA NA RND3 MCF7 ChIA-PET 22265404 RND3 370468 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr2 151323622 151323873 151323744 Y NA NA NA NA NA NA RND3 69652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 151383394 151383753 151383509 Y RND3 RND3 RND3,RBM43 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RND3 9772 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 152971717 152971973 152971845 Y NA NA NA NA NA NA STAM2 58533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 154379200 154379581 154379374 Y NA NA NA NA NA NA AC012501.2 68220 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 154442869 154442990 154442930 Y NA AC012501.2 NA NA NA NA AC012501.2 4811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 157191997 157192231 157192220 Y GPD2,NR4A2 NR4A2 GPD2 IMR90 Hi-C 24141950 NR4A2 4629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 158067838 158068005 158067865 Y NA NA NA NA NA NA ACVR1C 415512 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 159251786 159251944 159251889 Y NA NA NA NA NA NA PKP4 59532 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 159855059 159855514 159855150 Y NA TANC1 NA NA NA NA TANC1 31913 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 159996824 159997456 159997123 Y NA NA NA NA NA NA WDSUB1 143854 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 160097747 160098072 160097910 Y TANC1 WDSUB1 NA NA NA NA WDSUB1 43238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 161064664 161064880 161064794 Y NA NA ITGB6,RBMS1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PLA2R1 147543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 161098241 161098623 161098428 Y ITGB6 NA TANK,ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR4785 163770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 161208357 161208687 161208675 Y NA NA NA NA NA NA MIR4785 53706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 161232354 161232597 161232498 Y NA MIR4785 NA NA NA NA MIR4785 29796 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 161522878 161523352 161523066 Y TANK,TANK NA ITGB6,RBMS1 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS1 174573 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 162197345 162197490 162197464 Y NA PSMD14,AC009299.5 NA NA NA NA AC009299.5 1508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 164204698 164204962 164204800 Y NA NA FIGN IMR90 Hi-C 24141950 FIGN 385560 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 166779898 166780276 166780103 Y NA TTC21B NA NA NA NA TTC21B 28077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 167269953 167270071 167269980 Y NA SCN9A NA NA NA NA SCN9A 39450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 170441657 170442069 170441908 Y NA FASTKD1,PPIG NA NA NA NA PPIG 2807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 170684911 170685465 170685124 Y PPIG,C2orf77,PHOSPHO2,UBR3 SSB,METTL5,UBR3 NA NA NA NA UBR3 2943 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 171786835 171787228 171786978 Y TLK1 GORASP2 NA NA NA NA GORASP2 3861 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 172628972 172629294 172629196 Y NA NA NA NA NA NA DYNC1I2 87053 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 172693152 172693396 172693274 Y NA NA NA NA NA NA HAT1 83562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 172958586 172958929 172958756 Y DYNC1I2,DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 6699 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 172960097 172960530 172960322 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 5098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 172961367 172961608 172961457 Y DLX1,DLX2 DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 4020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr2 172961678 172962145 172962061 Y NA DLX1,DLX2 NA NA NA NA DLX2 3483 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 173117910 173118399 173118084 Y NA NA ITGA6 IMR90 Hi-C 24141950 DLX2 152282 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 173647954 173648254 173648105 Y NA NA NA NA NA NA AC093818.1 228630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 173826948 173827225 173827025 Y ZAK NA NA NA NA NA CDCA7 390323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 174963658 174963852 174963755 Y NA NA NA NA NA NA SP3 135228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 175643140 175643660 175643376 Y CIR1 CHRNA1 NA NA NA NA CHRNA1 15940 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 175708423 175708587 175708507 Y NA NA NA NA NA NA CHRNA1 81223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 176866139 176866392 176866261 Y KIAA1715 KIAA1715 NA NA NA NA KIAA1715 572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 178104644 178105169 178104872 Y NFE2L2,NFE2L2,HNRNPA3 HNRNPA3,AC079305.8,MIR3128 NA NA NA NA MIR3128 13569 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr2 182675600 182675877 182675735 Y SSFA2 NA SSFA2 IMR90 Hi-C 24141950 SSFA2 78683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 183839050 183839414 183839395 Y NA NA NA NA NA NA NCKAP1 62172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 187015061 187015446 187015349 Y NA NA NA NA NA NA ZC3H15 333437 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 188414787 188415077 188415012 Y NA TFPI NA NA NA NA TFPI 13410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 189168145 189168606 189168510 Y NA GULP1 NA NA NA NA GULP1 13749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 191217459 191217900 191217739 Y NA INPP1,HIBCH NA NA NA NA HIBCH 10540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 191984586 191984681 191984634 Y NA NA NA NA NA NA STAT1 100900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 192069255 192069475 192069372 Y STAT4 MYO1B MYO1B,STAT4 IMR90 Hi-C 24141950 MYO1B 38436 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 192544982 192545232 192545125 Y OBFC2A NA NA NA NA NA MYO1B 437071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 194428592 194428916 194428605 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 2009785 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 196425923 196426330 196426251 Y NA SLC39A10 SLC39A10 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SLC39A10 12371 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 196617949 196618273 196617953 Y NA NA NA NA NA NA SLC39A10 179248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 197529863 197529926 197529879 Y NA CCDC150 NA NA NA NA CCDC150 27585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 197936511 197936873 197936784 Y NA NA NA NA NA NA PGAP1 145991 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 197962665 197962866 197962743 Y NA NA NA NA NA NA ATP5G2P3 162969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 200328214 200328741 200328463 Y SATB2,SATB2,SATB2 SATB2-AS1,SATB2 NA NA NA NA SATB2 5248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 201238754 201239056 201238905 Y NA NA NA NA NA NA SPATS2L 70150 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 201403171 201403461 201403317 Y NA SGOL2,KCTD18 NA NA NA NA KCTD18 20664 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 201830040 201830326 201830203 Y KCTD18,FAM126B,CASP8,CLK1,CLK1 AC005037.3,ORC2 NA NA NA NA ORC2 3637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 202104378 202104489 202104432 Y BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,FAM126B,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10 CASP8 NA NA NA NA CASP8 8212 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 202898182 202898685 202898353 Y TMEM237,FZD7 FZD7 NA NA NA NA FZD7 872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.08301166203386 chr2 203231501 203231745 203231624 Y NA BMPR2 BMPR2,NOP58 IMR90 Hi-C 24141950 BMPR2 7914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 204311629 204311925 204311741 Y NBEAL1,CYP20A1,ABI2 NA NA NA NA NA RAPH1 86208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 204668913 204669218 204669026 Y NA NA RAPH1,CD28,ABI2 IMR90 Hi-C 24141950 RAPH1 270780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 206935678 206936046 206935862 Y NA AC007383.3,INO80D NA NA NA NA AC007383.3 11283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 207669258 207669658 207669463 Y NA FASTKD2,MDH1B NA NA NA NA MDH1B 40987 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 207981292 207981447 207981370 Y NA KLF7 NA NA NA NA KLF7 48544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 208016492 208017045 208016857 Y CREB1 KLF7 NA NA NA NA KLF7 12946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 208027980 208028625 208028335 Y CREB1,KLF7 KLF7 NA NA NA NA KLF7 1366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 208395422 208395980 208395659 Y PLEKHM3,METTL21A,METTL21A,CREB1 CREB1,AC007879.5 NA NA NA NA AC007879.5 2903 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 210872654 210873081 210872784 Y C2orf67 RPE NA NA NA NA RPE 7365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 216222811 216223009 216222866 Y NA ATIC NA NA NA NA ATIC 48271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 216558345 216558652 216558547 Y NA NA NA NA NA NA AC012462.1 259369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 217180784 217180970 217180877 Y NA NA NA NA NA NA MARCH4 53780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 217500633 217500954 217500700 Y NA PSMB3P2,IGFBP2 NA NA NA NA IGFBP2 5082 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 217556283 217557311 217557110 Y NA IGFBP5 NA NA NA NA IGFBP5 937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 217639400 217639563 217639456 Y NA NA DIRC3,TNS1,IGFBP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IGFBP5 81152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 218088198 218088590 218088283 Y NA NA DIRC3,IGFBP5,IGFBP2 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBP5 529950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr2 218714903 218715515 218715204 Y PNKD,ARPC2,ARPC2 NA NA NA NA NA TNS1 150203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 219270976 219271406 219271230 Y CXCR2,CXCR2,CXCR1,ZNF142,USP37,TTLL4,SLC11A1 CTDSP1 NA NA NA NA CTDSP1 9997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 219434664 219435146 219434778 Y USP37 USP37,RQCD1,PLCD4 NA NA NA NA RQCD1 3361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 219596297 219596622 219596516 Y TMBIM1,PNKD,SLC11A1,USP37,TTLL4,CYP27A1 TTLL4,CYP27A1 NA NA NA NA TTLL4 22729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 219761045 219761550 219761369 Y USP37,ZNF142,ZFAND2B,TUBA4A,CNPPD1,ANKZF1,ANKZF1,WNT10A WNT6 NA NA NA NA WNT6 38501 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 219773515 219774011 219773826 Y USP37,RQCD1,ZNF142,STK36,TTLL4,NHEJ1,GLB1L,CCDC108,ANKZF1,ANKZF1,ABCB6,WNT6,WNT10A CDK5R2 NA NA NA NA CDK5R2 48366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr2 219827943 219828258 219828078 Y USP37,STK36,PTPRN,PTPRN,CDK5R2,FEV CDK5R2,CRYBA2 NA NA NA NA CDK5R2 5566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 220400310 220400471 220400469 Y NA GMPPA,TMEM198,CHPF,OBSL1 NA NA NA NA TMEM198 5914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 221093432 221093609 221093525 Y NA NA EPHA4 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 AC009502.1 545915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 221802042 221802413 221802264 Y NA NA NA NA NA NA EPHA4 634509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 222826690 222827411 222827014 Y NA NA EPHA4 IMR90 Hi-C 24141950 PAX3 334304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr2 223824867 223825201 223825044 Y NA NA NA NA NA NA KCNE4 89331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 223957413 223957625 223957519 Y NA KCNE4 AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 KCNE4 42881 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 224325508 224325708 224325596 Y WDFY1 NA SCG2,AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 139513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 224413942 224414282 224414142 Y NA NA NA NA NA NA SCG2 50939 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 224569350 224569680 224569515 Y NA NA AP1S3 IMR90 Hi-C 24141950 SCG2 104129 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 224761528 224761781 224761678 Y WDFY1 WDFY1 NA NA NA NA WDFY1 46323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 227526564 227526855 227526789 Y IRS1 NA IRS1,LOC646736 IMR90 Hi-C 24141950 IRS1 135620 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 227656309 227656561 227656437 Y NA IRS1,RHBDD1 NA NA NA NA IRS1 5914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 230215591 230215819 230215699 Y PID1 NA NA NA NA NA PID1 81590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 230309727 230309993 230309861 Y TRIP12,PID1 NA NA NA NA NA PID1 175726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 230470740 230471103 230470968 Y NA NA NA NA NA NA DNER 106171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 230736228 230736612 230736477 Y SP110 FBXO36,TRIP12 NA NA NA NA FBXO36 48406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 231276384 231276790 231276706 Y NA SP100 NA NA NA NA SP100 1867 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 231649547 231649844 231649697 Y NA NA NA NA NA NA BANF1P3 61429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 231922388 231922877 231922602 Y NA C2orf72,PSMD1 NA NA NA NA PSMD1 2810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 232095962 232096104 232096033 Y NA ARMC9,AC018738.2 NA NA NA NA AC018738.2 22706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 232229850 232230117 232229960 Y NA NA NA NA NA NA SNORD82 93034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 232276597 232276762 232276665 Y B3GNT7 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 46389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 232277113 232277443 232277206 Y C2orf72 SNORD82 NA NA NA NA SNORD82 45708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 232468888 232470128 232469532 Y DIS3L2,PTMA,NMUR1 NA NA NA NA NA NMUR1 75682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr2 232478879 232479328 232479053 Y NA NA NA NA NA NA NMUR1 85673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 232507409 232507767 232507481 Y NA NA PDE6D IMR90 Hi-C 24141950 PTMA 61838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 232526700 232527324 232527119 Y DIS3L2 PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 42281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 232530920 232531416 232531295 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 38189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 232531704 232531853 232531745 Y NA PTMA COPS7B,PTMA IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTMA 37752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 232545684 232546083 232545868 Y COPS7B PTMA PTMA K562 ChIA-PET 22265404 PTMA 23522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 234342075 234342448 234342262 Y NA NA NA NA NA NA DGKD 80922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 234465976 234466363 234466311 Y HJURP USP40 NA NA NA NA USP40 7065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 234614877 234615153 234615015 Y NA UGT1A9,UGT1A7 NA NA NA NA UGT1A7 26293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 236842338 236842740 236842449 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 231350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 236910231 236910384 236910319 Y NA NA NA NA NA NA AC079135.1 163706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 237482983 237483115 237483021 Y NA NA NA NA NA NA IQCA1 68798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 238018538 238018666 238018550 Y NA COPS8,AC105760.2 NA NA NA NA AC105760.2 26078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238122137 238122516 238122344 Y COL6A3 NA MLPH,COL6A3 IMR90 Hi-C 24141950 AC105760.2 129677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238382776 238383011 238382901 Y LRRFIP1 AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 9060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238383141 238383356 238383272 Y NA AC112721.2,MLPH LRRFIP1,MLPH,COL6A3,RAB17,COPS8,PRLH IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MLPH 8715 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 238421741 238422134 238421894 Y MLPH MLPH NA NA NA NA MLPH 29670 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238508822 238509122 238509050 Y RAB17,LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 NA NA NA NA RAB17 565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.97337946929524 chr2 238512238 238512938 238512467 Y LRRFIP1 RAB17,LRRFIP1 LRRFIP1,MLPH,PRLH,RAB17 IMR90 Hi-C 24141950 RAB17 3981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238582267 238582825 238582560 Y LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 48048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238583352 238583931 238583637 Y UBE2F,LRRFIP1 LRRFIP1 NA NA NA NA LRRFIP1 49133 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 238968617 238969014 238968782 Y NA SCLY NA NA NA NA SCLY 1087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 239194414 239194788 239194667 Y NA HES6,PER2,TRAF3IP1 LOC643387,LOC151174,HES6 IMR90 Hi-C 24141950 PER2 1955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 240196255 240196671 240196554 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 124459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 240196933 240197336 240197049 Y HDAC4 NA NA NA NA NA AC062017.1 123794 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr2 240201720 240202445 240202126 Y NA NA NA NA NA NA AC062017.1 118685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 240386953 240387173 240387118 Y NA NA NDUFA10,HDAC4,LOC150935 IMR90 Hi-C 24141950 HDAC4 65605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 241585712 241586190 241585819 Y DUSP28,CAPN10,GPR35,MTERFD2 NA NA NA NA NA CAPN10 61579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 241845496 241845803 241845554 Y NA AGXT LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 AGXT 39600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 241860652 241861096 241860920 Y GPC1,SNED1 NA LOC200772,SNED1,MTERFD2 IMR90 Hi-C 24141950 AGXT 54756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 242030281 242030580 242030300 Y SNED1,PASK MTERFD2 NA NA NA NA MTERFD2 9167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 242267084 242267405 242267274 Y MTERFD2 SEPT2,HDLBP,FARP2 NA NA NA NA HDLBP 12608 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 242304310 242304654 242304483 Y FARP2 HDLBP,FARP2 NA NA NA NA FARP2 10652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr2 242480531 242480899 242480752 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 15237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr2 242484648 242485001 242484705 Y NA STK25,BOK NA NA NA NA BOK 11135 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr2 242500447 242500594 242500505 Y NEU4,BOK BOK NA NA NA NA BOK 4311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 247683 247718 247701 Y NA C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1 NA NA NA NA C20orf96 21672 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 290672 290826 290757 Y SOX12,NRSN2 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 13381 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr20 290991 291448 291293 Y C20orf54 C20orf96,ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4 NA NA NA NA SOX12 12759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 623135 623319 623297 Y NA TCF15,SRXN1 NA NA NA NA SRXN1 8695 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1119535 1119804 1119673 Y NA PSMF1,TMEM74B NA NA NA NA PSMF1 27629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1154843 1155127 1154985 Y FAM110A,SIRPB2,SIRPB1 TMEM74B,RAD21L1 NA NA NA NA TMEM74B 8932 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1258531 1258969 1258603 Y NA SNPH FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 13571 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 1267390 1267580 1267486 Y SIRPG SNPH LOC100507495,FKBP1A-SDCBP2 IMR90 Hi-C 24141950 SNPH 22430 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1332285 1332772 1332374 Y C20orf46,SDCBP2 FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 39034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 1338546 1338920 1338732 Y NA FKBP1A NA NA NA NA FKBP1A 32886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1398801 1399138 1399021 Y FKBP1A FKBP1A SNPH,RAD21L1,FKBP1A-SDCBP2,LOC100507495 IMR90 Hi-C 24141950 FKBP1A 26995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1790289 1790734 1790591 Y NA NA SIRPA,STK35 IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 82420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 1801326 1801756 1801551 Y SDCBP2,NSFL1C,SIRPB2,SIRPB1,SIRPA,SIRPA,SIRPA NA SIRPA IMR90 Hi-C 24141950 SIRPA 71398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 2671963 2672026 2672004 Y NA NOP56,SNORD86,SNORD57,IDH3B,RP4-686C3.7,EBF4 NA NA NA NA EBF4 439 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 2855066 2855678 2855300 Y NA VPS16,PTPRA NA NA NA NA PTPRA 12236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 3286864 3286977 3286928 Y NA NA NA NA NA NA SLC4A11 69028 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 3348660 3349006 3348744 Y FASTKD5,UBOX5,GFRA4 C20orf194 NA NA NA NA C20orf194 37266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 3788108 3788452 3788409 Y NA C20orf27,SPEF1,CENPB,CDC25B,MAVS NA NA NA NA CDC25B 22530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 3909447 3909819 3909642 Y RNF24,RNF24,PANK2 PANK2 NA NA NA NA PANK2 41961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 3932717 3933076 3932937 Y NA NA MIR103B2,PANK2 IMR90 Hi-C 24141950 RNF24 61153 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 3960925 3961306 3961172 Y PANK2,PANK2,RNF24,RNF24 RNF24,FTLP3 NA NA NA NA RNF24 32923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4045309 4045541 4045432 Y C20orf27,CENPB,C20orf29 FTLP3 RNF24,PANK2,MAVS IMR90 Hi-C 24141950 FTLP3 42757 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4065883 4066158 4066005 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 33469 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4070898 4071147 4070999 Y PANK2,RNF24,RNF24 SMOX RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 SMOX 28480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4116351 4116485 4116423 Y PANK2,PANK2,SMOX SMOX ADRA1D,SMOX IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SMOX 16724 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4203123 4203484 4203336 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 24237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 4206645 4206924 4206784 Y NA ADRA1D NA NA NA NA ADRA1D 20797 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4493607 4493844 4493709 Y NA NA ADRA1D IMR90 Hi-C 24141950 PRNP 171038 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 4794672 4795153 4795057 Y SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2 RASSF2 NA NA NA NA RASSF2 7138 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 4954142 4954446 4954407 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2,CDS2 SLC23A2 NA NA NA NA SLC23A2 34493 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 5046140 5046913 5046758 Y PRNP,PRNP,RASSF2,RASSF2,SLC23A2 NA SLC23A2,C20orf30,RASSF2,PCNA,PCNA-AS1,PRND,PRNT,CDS2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC23A2 57201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 5072801 5072926 5072885 Y NA PCNA,CDS2 NA NA NA NA PCNA 32346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 5553446 5553705 5553635 Y NA GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 35967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr20 5589880 5590681 5590650 Y CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1 GPCPD1 NA NA NA NA GPCPD1 208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr20 5637936 5638327 5638312 Y NA GPCPD1 C20orf196,GPCPD1,TRMT6 IMR90 Hi-C 24141950 GPCPD1 48264 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 5739573 5739619 5739595 Y PROKR2 C20orf196 NA NA NA NA C20orf196 10534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 7967671 7967684 7967678 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 30792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 7978054 7978163 7978110 Y NA TMX4 NA NA NA NA TMX4 20313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 8057856 8057913 8057886 Y NA NA PLCB1,TMX4 IMR90 Hi-C 24141950 PLCB1 52911 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 8412863 8413194 8412910 Y TMX4,PLCB1 NA NA NA NA NA PLCB1 302039 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 9378451 9378962 9378838 Y NA NA NA NA NA NA LAMP5 114043 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 9384292 9384675 9384295 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA LAMP5 108330 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 9390788 9390859 9390825 Y PLCB4,PLCB4,PLCB4 NA NA NA NA NA LAMP5 102146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 11242212 11242292 11242265 Y NA NA NA NA NA NA JAG1 617198 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 13705752 13706023 13705888 Y NA NA NA NA NA NA ESF1 57509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 15888913 15889317 15889175 Y NA NA NA NA NA NA KIF16B 662761 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 16373141 16373392 16373267 Y OTOR NA NA NA NA NA KIF16B 178686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 17485095 17485774 17485421 Y PCSK2 NA NA NA NA NA BFSP1 62091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 17538189 17538505 17538334 Y NA BFSP1,DSTN NA NA NA NA BFSP1 9360 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 17637776 17637930 17637851 Y BANF2 RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 23010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 17644857 17645185 17645058 Y NA RRBP1 NA NA NA NA RRBP1 15755 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 18700394 18700719 18700556 Y NA NA NA NA NA NA DTD1 133857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 19241410 19241666 19241515 Y NA NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 494686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 19638978 19639033 19639006 Y C20orf26 NA NA NA NA NA RP1-122P22.2 97319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 19737104 19737460 19737269 Y NA RP1-122P22.2 SLC24A3,RIN2,C20orf26,CRNKL1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP1-122P22.2 752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 19889354 19889507 19889429 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 24189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 19890524 19890778 19890583 Y NA RIN2 NA NA NA NA RIN2 25359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 19917960 19918777 19918135 Y NA NA NA NA NA NA RIN2 52795 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 20009163 20009558 20009361 Y NA NAA20,CRNKL1 NA NA NA NA NAA20 13403 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 20432950 20433312 20432989 Y C20orf26,INSM1 NA NA NA NA NA RALGAPA2 257819 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 20590950 20591282 20591151 Y RALGAPA2 NA NA NA NA NA RALGAPA2 99849 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 20652620 20652826 20652771 Y NA RALGAPA2 NA NA NA NA RALGAPA2 38305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 20724152 20724406 20724200 Y RALGAPA2 RALGAPA2 RALGAPA2 IMR90 Hi-C 24141950 RALGAPA2 33021 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 22744166 22744500 22744407 Y THBD NA THBD,NXT1,NAPB IMR90 Hi-C 24141950 NXT1 584873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 22904759 22904912 22904836 Y NA NA NA NA NA NA NXT1 424461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 22905662 22905881 22905772 Y NA NA NA NA NA NA NXT1 423492 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 25299092 25299564 25299289 Y NA NA NA NA NA NA ABHD12 70055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 25671297 25671837 25671511 Y NA ZNF337 NA NA NA NA ZNF337 3640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 25842208 25842444 25842317 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 112354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr20 25846181 25846562 25846485 Y ZNF337 NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 116327 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 26116339 26116766 26116505 Y NA NA NA NA NA NA RP13-401N8.1 386485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 29518777 29518943 29518821 Y NA NA NA NA NA NA FRG1B 90914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 29636705 29636738 29636722 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 26848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 29647996 29648434 29648295 Y DEFB121,DEFB116 FRG1B NA NA NA NA FRG1B 38139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 29649919 29650288 29650100 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40062 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 29650599 29650997 29650932 Y NA FRG1B NA NA NA NA FRG1B 40742 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 29833463 29833838 29833651 Y DEFB121,DEFB116 RP5-854E16.2 NA NA NA NA RP5-854E16.2 38800 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 30183712 30184220 30184085 Y ID1 ID1 HM13 MCF7 ChIA-PET 22265404 ID1 6866 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 30190743 30190994 30190797 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 92 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 30191850 30192346 30192159 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.08301166203386 chr20 30196293 30196740 30196417 Y ID1 ID1 NA NA NA NA ID1 5207 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 30200712 30201016 30200864 Y TTLL9,DUSP15,DEFB116,DEFB121 ID1 NA NA NA NA ID1 9626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 30262675 30263005 30262853 Y HCK,BCL2L1 BCL2L1 NA NA NA NA BCL2L1 46787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 30300504 30300973 30300648 Y NA BCL2L1,TPX2 NA NA NA NA BCL2L1 8819 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 30705137 30705472 30705281 Y HCK,PLAGL2 TM9SF4 NA NA NA NA TM9SF4 9828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 31063072 31063625 31063366 Y NA NA ASXL1 IMR90 Hi-C 24141950 C20orf112 107251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 31373290 31373636 31373312 Y C20orf185,DNMT3B,DNMT3B COMMD7,DNMT3B,MAPRE1 MAPRE1 IMR90 Hi-C 24141950 DNMT3B 25099 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 31687729 31687935 31687834 Y NA NA NA NA NA NA MAPRE1 282030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 32142835 32143155 32142948 Y C20orf186,CDK5RAP1,CHMP4B NA NA NA NA NA CBFA2T2 66954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 32803456 32803920 32803688 Y NA NA ITCH,DYNLRB1,ASIP IMR90 Hi-C 24141950 AHCY 93688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 33064297 33064587 33064427 Y ACSS2 DYNLRB1 NA NA NA NA DYNLRB1 37627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 33294754 33295084 33294783 Y NA PIGU,TP53INP2 NA NA NA NA TP53INP2 4660 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 33803083 33803443 33803260 Y NA PROCR,MT1P3,MMP24 TRPC4AP,PROCR,GGT7,CEP250,ACSS2,EDEM2,MMP24,UQCC,FAM83C,EIF6 IMR90 Hi-C 24141950 MT1P3 369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 34357066 34357356 34357208 Y NA RBM39,PHF20 NA NA NA NA PHF20 540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 34652590 34653055 34652672 Y NA EPB41L1 LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EPB41L1 24371 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 35464098 35464342 35464182 Y RBL1,DSN1,DSN1 NA NA NA NA NA DSN1 63877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 35490387 35490628 35490526 Y MANBAL,KIAA0889 NA KIAA0889 MCF7 ChIA-PET 22265404 SAMHD1 87618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 35572677 35573004 35572914 Y RBL1,TGIF2,TGIF2,SLA2,SAMHD1 SAMHD1 NA NA NA NA SAMHD1 5242 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36034782 36035452 36035129 Y C20orf132,VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 36484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36040005 36040428 36040132 Y VSTM2L,NNAT RPL7AP14 NA NA NA NA RPL7AP14 31508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36154671 36154957 36154793 Y BLCAP,BLCAP,BLCAP BLCAP NA NA NA NA BLCAP 338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36618785 36619379 36619133 Y RALGAPB,RPRD1B TTI1,RPRD1B NA NA NA NA TTI1 40491 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36763112 36763416 36763201 Y NA TGM2 NA NA NA NA TGM2 29564 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 36986320 36986515 36986447 Y BPI NA NA NA NA NA SNORA71C 69931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 37302978 37303466 37303191 Y ACTR5,SLC32A1 NA ARHGAP40,ACTR5,SLC32A1,PPP1R16B IMR90 Hi-C 24141950 ACTR5 71619 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 37678805 37678873 37678867 Y SLC32A1,PPP1R16B NA NA NA NA NA DHX35 89863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 39339297 39339534 39339402 Y NA MAFB MAFB IMR90 Hi-C 24141950 MAFB 23417 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 39785946 39786458 39785968 Y CHD6,PLCG1 PLCG1 NA NA NA NA PLCG1 22346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 39826598 39826945 39826630 Y CHD6 NA NA NA NA NA PLCG1 62998 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 39939044 39939335 39939233 Y NA ZHX3,LPIN3 ZHX3,PLCG1 IMR90 Hi-C 24141950 ZHX3 4977 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 40188226 40188487 40188477 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 56646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 40193452 40193754 40193691 Y NA NA NA NA NA NA CHD6 51379 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 42286061 42286420 42286177 Y SRSF6,L3MBTL1,MYBL2 MYBL2 MYBL2 IMR90 Hi-C 24141950 MYBL2 7334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr20 42545648 42546044 42545953 Y NA TOX2 NA NA NA NA TOX2 4144 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 42554497 42554746 42554685 Y IFT52,TOX2 TOX2 NA NA NA NA TOX2 12993 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 42780306 42780638 42780459 Y NA JPH2 NA NA NA NA JPH2 33580 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 42955373 42955435 42955404 Y NA FITM2 NA NA NA NA FITM2 17564 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 43238683 43239068 43238831 Y NA ADA NA NA NA NA ADA 39806 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 44604057 44604097 44604095 Y NA PCIF1,ZNF335,MMP9,SLC12A5 NA NA NA NA ZNF335 5224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 44855330 44855616 44855473 Y ZNF334,SLC12A5,CDH22 NA NA NA NA NA CD40 110419 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 45399106 45399311 45399226 Y NA NA NCOA3,EYA2,ZMYND8,C1orf201 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,19890323 SLC2A10 62980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 45870109 45870518 45870490 Y ZMYND8,NCOA3 NA NA NA NA NA RP4-569M23.2 108787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 45962816 45963214 45963054 Y NA RP4-569M23.2,ZMYND8 NA NA NA NA RP4-569M23.2 16091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 45989347 45989834 45989660 Y SULF2 RP4-569M23.2,ZMYND8 ZMYND8,LOC100131496,NCOA3 IMR90 Hi-C 24141950 ZMYND8 5780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 46396946 46397288 46397164 Y SULF2,SULF2 SULF2 NA NA NA NA SULF2 16072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 46420724 46421103 46420967 Y NA SULF2 SULF2,PREX1,ARFGEF2 IMR90 Hi-C 24141950 SULF2 7364 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 46523491 46523897 46523893 Y NA NA NA NA NA NA SULF2 110131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 46601191 46601469 46601377 Y SULF2,SULF2 NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 187831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 46653872 46653986 46653882 Y NA NA SULF2 MCF7 ChIA-PET 22265404 SULF2 240512 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.74080481846561 chr20 47337131 47337315 47337224 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 105105 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 47344986 47345424 47345132 Y NA NA NA NA NA NA PREX1 96996 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 47393475 47393771 47393686 Y NA PREX1 NA NA NA NA PREX1 48649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 47544338 47544681 47544534 Y DDX27 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 7911 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 47547466 47547777 47547635 Y ZNFX1,ARFGEF2 ARFGEF2 NA NA NA NA ARFGEF2 11039 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 47893075 47893400 47893157 Y B4GALT5,ZNFX1 ZNFX1,SNORD12 NA NA NA NA ZNFX1 112 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48040275 48040654 48040626 Y NA NA NA NA NA NA PTGIS 142029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48291121 48291501 48291391 Y ZNFX1,SNAI1,SLC9A8,B4GALT5 B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 36914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48293445 48293839 48293746 Y NA B4GALT5 NA NA NA NA B4GALT5 34576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48313235 48313496 48313350 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 14919 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48317219 48317517 48317348 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 10898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 48327368 48328064 48327696 Y ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5 B4GALT5,SNRPFP1 NA NA NA NA B4GALT5 351 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48391675 48392320 48391995 Y ZNFX1,B4GALT5,TMEM189,SNAI1,CEBPB,SLC9A8 SNRPFP1,SLC9A8 B4GALT5,SLC9A8,KCNB1,SPATA2 IMR90 Hi-C 24141950 SLC9A8 34930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 48646361 48646933 48646559 Y NA SNAI1 TMEM189-UBE2V1,UBE2V1,SNAI1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNAI1 48825 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 48663510 48663968 48663673 Y NA NA SNAI1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 SNAI1 65974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48903106 48903611 48903352 Y NA RP11-290F20.3 LOC284751,PARD6B,PTPN1,FAM65C,MIR645,CEBPB IMR90 Hi-C 24141950 RP11-290F20.3 21083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 48924890 48925591 48925260 Y SLC9A8,RNF114,SNAI1,TMEM189,CEBPB,PTPN1 RP11-290F20.3 NA NA NA NA RP11-290F20.3 42867 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 48995783 48996016 48995938 Y NA NA LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-290F20.3 113760 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49032230 49032497 49032297 Y NA NA LOC284751,CEBPB,TMEM189-UBE2V1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 92394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49100027 49100544 49100221 Y TMEM189,CEBPB,PTPN1 PTPN1 LOC284751,TMEM189-UBE2V1,MIR645,FAM65C,PTPN1,PARD6B,UBE2V1,SNAI1,CEBPB IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PTPN1 24347 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 49133154 49133451 49133362 Y CEBPB,PTPN1 PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 8263 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49170357 49170595 49170426 Y NA PTPN1 NA NA NA NA PTPN1 45466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49407275 49407470 49407371 Y MOCS3 BCAS4 ZMYND8,BCAS4,ADNP,LOC100131496,FAM65C,NCOA3 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCAS4 1961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49516325 49516426 49516399 Y ADNP RP5-914P20.5,ADNP NA NA NA NA RP5-914P20.5 29095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49574418 49574471 49574465 Y PTPN1,ADNP RP5-914P20.5,ADNP,DPM1,MOCS3 NA NA NA NA MOCS3 1055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49598879 49599145 49599015 Y PTPN1 DPM1,MOCS3,KCNG1 NA NA NA NA MOCS3 25516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49976918 49977375 49977162 Y NFATC2 NA NA NA NA NA KCNG1 339252 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 49982609 49983533 49983215 Y KCNG1 NA NA NA NA NA KCNG1 344943 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 50100584 50100753 50100686 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 248319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 50134591 50134950 50134771 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 214122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 50141744 50142683 50142582 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 206389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 50178083 50178314 50178273 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 170758 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr20 50180369 50180507 50180463 Y NFATC2 NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 168565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr20 50247670 50248383 50248096 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 100689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr20 50252715 50253081 50252915 Y NA NA NA NA NA NA RP5-827A12.2 95991 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 50383575 50384083 50383723 Y ATP9A RP5-827A12.2,ATP9A NA NA NA NA ATP9A 402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr20 50416703 50416783 50416765 Y ZFP64,SALL4 ATP9A NA NA NA NA ATP9A 33530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 51026712 51027212 51026874 Y NA NA NA NA NA NA ZFP64 207865 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 52201463 52201802 52201714 Y ZNF217 ZNF217 NA NA NA NA ZNF217 22644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 52351984 52352361 52352104 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 127538 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 52353948 52354213 52354172 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 129502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 52355086 52355238 52355182 Y NA NA ZNF217,BCAS1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 130640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr20 52391089 52391563 52391364 Y NA NA ZNF217,BCAS1,SUMO1P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF217 166643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 52445816 52446339 52446069 Y ZNF217 NA ZNF217,BCAS1,BMP7,SUMO1P1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF217 221370 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 52565886 52566139 52565988 Y ZNF217 NA NA NA NA NA CYP24A1 222373 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 52570477 52570680 52570623 Y NA NA NA NA NA NA CYP24A1 217832 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 52749873 52750284 52750109 Y NA CYP24A1 NA NA NA NA CYP24A1 38228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 56293544 56293843 56293665 Y NA PMEPA1 NA NA NA NA PMEPA1 8952 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 56592321 56592469 56592395 Y PMEPA1,PMEPA1 NA ZBP1 IMR90 Hi-C 24141950 PPP4R1L 290026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 56592800 56593208 56592856 Y NA NA ZBP1,PMEPA1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP4R1L 289287 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 56881560 56881733 56881657 Y STX16,RAB22A PPP4R1L,RAB22A NA NA NA NA PPP4R1L 762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 56881907 56882420 56882011 Y STX16,RAB22A PPP4R1L,RAB22A NA NA NA NA PPP4R1L 75 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 56983736 56983744 56983737 Y NA VAPB NA NA NA NA VAPB 21558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 57198784 57199334 57199089 Y NA STX16,STX16-NPEPL1 NA NA NA NA STX16 24994 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr20 57228113 57228577 57228221 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA STX16-NPEPL1 3623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 57270107 57270808 57270490 Y NA STX16,STX16-NPEPL1,NPEPL1 NA NA NA NA NPEPL1 7920 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 57586300 57586427 57586364 Y NA CTSZ,ATP5E,SLMO2 NA NA NA NA CTSZ 5998 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr20 59325352 59325574 59325428 Y NA NA NA NA NA NA CDH4 499908 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 59828827 59829192 59829064 Y CDH4 CDH4 NA NA NA NA CDH4 3345 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 60256764 60257074 60256889 Y CDH4 NA NA NA NA NA TAF4 381792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 60500389 60500694 60500636 Y NA NA NA NA NA NA TAF4 138172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 60719468 60719634 60719593 Y SS18L1,GTPBP5 LSM14B,PSMA7,SS18L1 NA NA NA NA SS18L1 2646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr20 60875997 60876347 60876165 Y GATA5,CABLES2 ADRM1,MIR4758 NA NA NA NA ADRM1 848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 60924549 60924827 60924688 Y TAF4,SS18L1,SLCO4A1,C20orf151,LAMA5 ADRM1,MIR4758,LAMA5,RPS21 NA NA NA NA LAMA5 15541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 60972798 60973035 60972874 Y NA LAMA5,RPS21,CABLES2 NA NA NA NA CABLES2 7306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61192605 61193059 61192901 Y NA NA NA NA NA NA SLCO4A1 78738 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr20 61200879 61201219 61201079 Y NA NA RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20 IMR90 Hi-C 24141950 SLCO4A1 70578 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 61282674 61283033 61282738 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 10877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61283206 61283870 61283565 Y OSBPL2,DPH3P1,OGFR,DIDO1 SLCO4A1 NA NA NA NA SLCO4A1 11409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61423534 61423709 61423679 Y NA OGFR,OGFR-AS1,COL9A3 LAMA5,SLCO4A1,LOC100127888 MCF7 ChIA-PET 22265404 OGFR 10478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61553883 61554120 61553955 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 13184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61554875 61554902 61554887 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 12402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 61555881 61556606 61556058 Y DIDO1 DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 10698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 61560348 61560848 61560731 Y NA DIDO1 NA NA NA NA DIDO1 6456 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr20 61639302 61639436 61639344 Y TCFL5,DIDO1,BHLHE23 NA NA NA NA NA DIDO1 71998 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61646020 61646413 61646169 Y C20orf11,YTHDF1 NA NA NA NA NA DIDO1 78716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 61687989 61688195 61688101 Y NA HAR1B NA NA NA NA HAR1B 43476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 62285983 62286092 62286038 Y NA GMEB2,CTD-3184A7.4,STMN3,RTEL1,TNFRSF6B NA NA NA NA RTEL1 1071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 62313782 62314225 62314041 Y NA STMN3,RTEL1,TNFRSF6B,ZGPAT,ARFRP1 NA NA NA NA TNFRSF6B 11796 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 62494990 62495823 62495679 Y NA ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5,RNU1-134P NA NA NA NA TPD52L2 394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr20 62676233 62676312 62676273 Y SLC2A4RG,TCEA2,SOX18 ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA ZNF512B 1801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 62685313 62685625 62685427 Y UCKL1,SOX18,TCEA2 ZNF512B,SOX18,TCEA2,RGS19 NA NA NA NA TCEA2 6124 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 62820558 62820833 62820696 Y NA NA NA NA NA NA PCMTD2 64261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr20 62887659 62888425 62887862 Y SAMD10,PCMTD2 PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 2565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr20 62908248 62908643 62908435 Y NA PCMTD2 NA NA NA NA PCMTD2 23154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 9881917 9882087 9882000 Y NA NA NA NA NA NA MIR3648 58085 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 11128400 11128724 11128645 Y NA BAGE2 BAGE5 IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 31420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 11174514 11174910 11174556 Y NA NA BAGE5,TPTE IMR90 Hi-C 24141950 BAGE2 77534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 15450488 15450803 15450511 Y NA NA NA NA NA NA AP001347.6 52746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 16129964 16130277 16130229 Y NA NA NA NA NA NA AF127936.7 122019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 16431175 16431558 16431528 Y NA NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 3763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 16435480 16435873 16435862 Y NRIP1 NRIP1 NA NA NA NA NRIP1 159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 17125389 17125620 17125425 Y USP25 USP25 NA NA NA NA USP25 25045 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 18984370 18984546 18984496 Y NA BTG3 NA NA NA NA BTG3 1105 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr21 26724396 26724439 26724418 Y NA NA NA NA NA NA MIR155HG 207782 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 26762963 26763092 26762975 Y NA NA NA NA NA NA MIR155HG 169129 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 26952057 26952278 26952105 Y JAM2 MIR155HG,MRPL39 NA NA NA NA MIR155HG 19836 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 26962945 26963646 26963455 Y NA MIR155HG,MRPL39,JAM2 NA NA NA NA MRPL39 14183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 27353741 27354048 27353953 Y APP NA NA NA NA NA APP 187398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 27370700 27370785 27370725 Y NA NA NA NA NA NA APP 170661 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 27809790 27810078 27809885 Y NA NA NA NA NA NA APP 268344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 29580186 29580338 29580262 Y NA NA ADAMTS1 IMR90 Hi-C 24141950 N6AMT1 675355 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 30374865 30375265 30375125 Y C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16 LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16 LTN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPL23P2 6511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.19264385477249 chr21 30567933 30569654 30568878 Y USP16,BACH1,BACH1 U3,LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 3541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 30607939 30608477 30608249 Y USP16,BACH1,BACH1 LINC00189,BACH1 NA NA NA NA BACH1 43547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 30617454 30617803 30617527 Y USP16,BACH1,BACH1 NA NA NA NA NA BACH1 53062 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 30684361 30684712 30684409 Y NA NA NA NA NA NA BACH1 119969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 32553780 32554124 32553993 Y NA NA NA NA NA NA TIAM1 376166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 33042550 33042842 33042696 Y NA SOD1 NA NA NA NA SOD1 12615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 33105563 33105881 33105775 Y SCAF4 SCAF4 NA NA NA NA SCAF4 3175 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 33303378 33303399 33303389 Y NA NA NA NA NA NA HUNK 59750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 33893754 33894020 33893930 Y C21orf63 NA NA NA NA NA C21orf59 89156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 34733678 34734189 34733958 Y OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,IFNGR2,GART,GART IFNAR1,IFNGR2 NA NA NA NA IFNAR1 38944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 34755296 34756154 34755534 Y IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 IFNGR2 MCF7 ChIA-PET 22265404 IFNGR2 17048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 34773380 34773606 34773471 Y OLIG2,OLIG1,IFNAR2,IL10RB,IFNAR1,SON,GART,GART,IFNGR2 IFNGR2 NA NA NA NA IFNGR2 178 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 35310348 35310699 35310436 Y GART,GART,SON ATP5O NA NA NA NA ATP5O 24064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr21 35319562 35320491 35320153 Y NA ATP5O NA NA NA NA ATP5O 33278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 35574029 35574459 35574413 Y NA NA NA NA NA NA SLC5A3 130159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 35750965 35751183 35751074 Y KCNE1 NA NA NA NA NA RCAN1 234258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 35863434 35863747 35863591 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 121694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 35959381 35959645 35959576 Y NA RCAN1 NA NA NA NA RCAN1 25796 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 36143971 36144119 36144107 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 158530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 36208387 36209191 36208566 Y KCNE1,RUNX1,RUNX1 NA NA NA NA NA RCAN1 222946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 36214787 36216208 36215152 Y NA NA NA NA NA NA RCAN1 229346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 37486095 37486219 37486157 Y NA CBR1,SETD4,CBR3,DOPEY2 NA NA NA NA CBR3 18991 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 37695369 37695803 37695437 Y MORC3 MORC3 NA NA NA NA MORC3 4882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 37712607 37712952 37712729 Y NA MORC3,CHAF1B NA NA NA NA MORC3 22120 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 38282263 38282520 38282368 Y CLDN14 NA NA NA NA NA AP000704.5 54292 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 38801876 38802213 38802018 Y DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A,DYRK1A NA NA NA NA NA DYRK1A 65784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 38935728 38936411 38936235 Y TTC3,DYRK1A,DYRK1A NA DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DYRK1A 199636 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr21 40386657 40387043 40386856 Y NA NA ETS2,LINC00114 IMR90 Hi-C 24141950 PSMG1 166734 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 40673787 40673929 40673891 Y NA BRWD1,HMGN1 NA NA NA NA BRWD1 17556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 41146916 41147071 41146994 Y LCA5L NA NA NA NA NA C21orf88 164168 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 42743414 42743752 42743584 Y NA MX2,MX1 NA NA NA NA MX2 11544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 43181534 43181711 43181623 Y MX2,MX1,MX1,MX1,ZNF295,ABCG1 RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 3555 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 43214290 43214658 43214474 Y NA RIPK4 NA NA NA NA RIPK4 29024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 43653155 43654253 43653819 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 35356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 43654635 43655282 43654967 Y NA ABCG1 TFF3 IMR90 Hi-C 24141950 ABCG1 36836 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 44104688 44105340 44105026 Y ABCG1,ABCG1,UBASH3A PDE9A NA NA NA NA PDE9A 32942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 44278308 44278654 44278481 Y NA WDR4,NDUFV3 NA NA NA NA WDR4 19024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 44425410 44425661 44425536 Y NA PKNOX1 NA NA NA NA PKNOX1 32790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 45015260 45015643 45015451 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 61731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 45020604 45020960 45020754 Y NA NA NA NA NA NA HSF2BP 56414 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 45080522 45080871 45080626 Y TRAPPC10,PWP2,SIK1,RRP1B HSF2BP,RRP1B NA NA NA NA RRP1B 3093 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 45187861 45188442 45188176 Y ICOSLG,PDXK,CSTB CSTB,RRP1 NA NA NA NA CSTB 5884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 45573584 45574271 45573954 Y PDXK,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG PWP2,C21orf33 NA NA NA NA C21orf33 22097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 45587301 45587635 45587415 Y PDXK,AGPAT3,TRAPPC10,TRPM2,ICOSLG C21orf33 C21orf33 K562 ChIA-PET 22265404 C21orf33 35814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46097395 46097576 46097539 Y KRTAP10-7,KRTAP10-12 NA NA NA NA NA UBE2G2 122358 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46349799 46350126 46349963 Y KRTAP10-12 FAM207A NA NA NA NA FAM207A 7799 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46461202 46461645 46461341 Y ITGB2,ADARB1 LINC00162,ADARB1 ADARB1,SSR4P1 K562 ChIA-PET 22265404 ADARB1 30123 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46496242 46496452 46496442 Y NA ADARB1 NA NA NA NA ADARB1 4474 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46726845 46727332 46727050 Y NA POFUT2 NA NA NA NA POFUT2 21032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46737459 46737695 46737585 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 31646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr21 46738832 46739011 46738964 Y COL18A1 POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46739517 46739788 46739671 Y NA POFUT2 COL18A1 MCF7 ChIA-PET 22265404 POFUT2 33704 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr21 46769779 46770045 46769871 Y NA NA ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 53007 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46783934 46784395 46784118 Y NA COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 COL18A1 38657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr21 46786853 46787266 46786994 Y COL18A1,POFUT2 COL18A1 ADARB1,LOC642852,LINC00315,POFUT2,COL18A1-AS1,COL18A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 35786 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46823895 46824295 46824014 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 46824359 46824541 46824457 Y COL18A1 COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 1307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46859041 46859207 46859093 Y NA COL18A1 NA NA NA NA COL18A1 35989 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr21 46891281 46891413 46891347 Y NA NA SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL18A1 68229 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 46982041 46982418 46982230 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,LINC00315,LOC642852 IMR90 Hi-C 24141950 SLC19A1 19716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47010467 47010705 47010586 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr21 47010868 47011351 47011033 Y NA SLC19A1,AL133493.2 PCBP3,LOC100129027,SLC19A1,COL18A1,POFUT2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AL133493.2 217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47035179 47035682 47035497 Y NA AL133493.2,PCBP3 PCBP3,POFUT2,SLC19A1,COL18A1,LOC100129027,ADARB1 IMR90 Hi-C 24141950 AL133493.2 23611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47038276 47038513 47038446 Y NA AL133493.2,PCBP3 PCBP3,ADARB1,LOC100129027,LOC642852,LINC00315,POFUT2,SLC19A1 IMR90 Hi-C 24141950 PCBP3 23095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47295042 47295436 47295304 Y NA NA NA NA NA NA COL6A1 104215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr21 47394030 47394545 47394409 Y LSS,COL6A2,C21orf56,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 5106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47395087 47395227 47395108 Y COL6A2,COL6A1 COL6A1 COL6A1 K562 ChIA-PET 22265404 COL6A1 4424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr21 47469357 47469652 47469491 Y COL6A1,COL6A2 COL6A2 COL6A2,FTCD,PCBP3,COL6A1,LSS,MCM3AP-AS1,C21orf56 IMR90 Hi-C 24141950 COL6A2 46359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr21 48042238 48042469 48042310 Y DIP2A,PRMT2 S100B,PRMT2 DIP2A,PCNT,S100B,PRMT2 IMR90 Hi-C 24141950 PRMT2 10610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 17652206 17652871 17652785 Y NA CECR5-AS1,CECR5,AC005300.5 NA NA NA NA CECR5 8029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 18404666 18404945 18404902 Y NA NA NA NA NA NA MICAL3 100380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 18506386 18506784 18506419 Y MICAL3 MICAL3 NA NA NA NA MICAL3 1061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 19159081 19159242 19159165 Y NA DGCR14,SLC25A1 NA NA NA NA SLC25A1 5101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr22 19410653 19410889 19410838 Y HIRA MRPL40,HIRA,AC000068.5,C22orf39 NA NA NA NA MRPL40 6536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 20142939 20143182 20143142 Y NA RANBP1,TRMT2A,ZDHHC8 NA NA NA NA ZDHHC8 27960 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 20207380 20207531 20207452 Y NA NA NA NA NA NA RTN4R 61238 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 22011632 22012115 22011859 Y NA YDJC,SDF2L1,PPIL2 NA NA NA NA PPIL2 7073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr22 22170870 22171333 22171102 Y HIC2,PPM1F,MAPK1 MAPK1 NA NA NA NA MAPK1 48637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 23863943 23864332 23864232 Y GNAZ,RTDR1,BCR NA ZDHHC8P1 IMR90 Hi-C 24141950 ZDHHC8P1 121030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 24255997 24256450 24256302 Y C22orf43,CABIN1,CABIN1 MIF NA NA NA NA MIF 21806 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr22 24756229 24756614 24756466 Y NA NA NA NA NA NA ADORA2A 55233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 25348731 25349104 25348989 Y NA NA SGSM1,KIAA1671,TMEM211 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SNORD56 53550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 27041081 27041748 27041447 Y SEZ6L,ASPHD2 CTA-211A9.5 MIAT IMR90 Hi-C 24141950 CTA-211A9.5 24982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 27043800 27044733 27044318 Y SEZ6L CTA-211A9.5 NA NA NA NA CTA-211A9.5 21997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 27872779 27873029 27872871 Y NA NA PITPNB,TTC28,TTC28-AS1,MN1,MIAT IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1172A22.1 254091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 28261904 28262359 28262203 Y PITPNB,MN1 NA NA NA NA NA TTC28-AS1 51005 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 28304832 28305219 28305193 Y NA TTC28-AS1,PITPNB NA NA NA NA TTC28-AS1 8145 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 29319930 29320200 29320120 Y NA ZNRF3 NA NA NA NA ZNRF3 42350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 29505815 29505935 29505933 Y NA KREMEN1 NA NA NA NA KREMEN1 38749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 29548778 29549084 29549009 Y XBP1,KREMEN1 NA NA NA NA NA EMID1 50756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 29877762 29878123 29877961 Y NA NEFH NA NA NA NA NEFH 3543 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 30018031 30018407 30018261 Y NF2 NIPSNAP1,NF2 NA NA NA NA NF2 20486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 30390990 30391309 30391217 Y NA NA NA NA NA NA MTMR3 113846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 30601535 30602099 30601994 Y MTMR3,SLC35E4,SF3A1,DUSP18,CCDC157,OSM,LIF LIF HORMAD2,LIF,GATSL3 IMR90 Hi-C 24141950 LIF 38741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 30612739 30612994 30612810 Y TBC1D10A,LIF LIF NA NA NA NA LIF 27846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 30620211 30620567 30620379 Y NA LIF NA NA NA NA LIF 20273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 30647782 30648063 30647863 Y SEC14L2,RNF215,GAL3ST1,LIF LIF,GATSL3 NA NA NA NA LIF 6942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 31298089 31298190 31298144 Y NA NA MORC2,MORC2-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 TUG1 66473 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 31629034 31629491 31629163 Y SMTN,RNF185,LIMK2 LIMK2 NA NA NA NA LIMK2 22809 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 31854917 31854933 31854925 Y NA SFI1,EIF4ENIF1 NA NA NA NA SFI1 27741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 32928366 32928835 32928615 Y NA NA NA NA NA NA FBXO7 59703 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 33199078 33199894 33199157 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 3391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 33202022 33202333 33202121 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 6335 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 33202971 33203258 33203149 Y NA TIMP3 NA NA NA NA TIMP3 7284 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 33243745 33243918 33243862 Y NA TIMP3,Z98256.1 NA NA NA NA Z98256.1 10502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 34249918 34249944 34249938 Y NA NA NA NA NA NA SNORA76 151012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr22 35709404 35709640 35709485 Y APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1 TOM1 NA NA NA NA TOM1 16136 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 36299462 36299943 36299718 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 122530 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 36325608 36325959 36325784 Y NA NA NA NA NA NA RBFOX2 96514 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 36727482 36728450 36727733 Y APOL3 NA NA NA NA NA MYH9 53613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 36750973 36751374 36751265 Y APOL3 MYH9,RP4-633O19__A.1 NA NA NA NA MYH9 30689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 37518077 37518635 37518386 Y MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB NA NA NA NA NA IL2RB 50459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 37544341 37544573 37544511 Y SH3BP1,MFNG,MFNG,RAC2,IL2RB IL2RB,C1QTNF6 NA NA NA NA IL2RB 24521 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 37582993 37583226 37583109 Y NA IL2RB,C1QTNF6,Z82188.1 NA NA NA NA C1QTNF6 10199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 37638328 37638951 37638750 Y SH3BP1,NOL12,MFNG,MFNG,LGALS2,GGA1,GGA1,NCF4,CSF2RB,RAC2,CYTH4 C1QTNF6,Z82188.1,CYTH4 NA NA NA NA RAC2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr22 37663226 37663580 37663275 Y MFNG,MFNG,NCF4,RAC2 Z82188.1,RAC2,CYTH4 CARD10,C1QTNF6,SSTR3,RAC2,CYTH4,ELFN2,MFNG,CDC42EP1,LGALS2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTH4 12488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 37813025 37813137 37813082 Y TRIOBP,PDXP,ELFN2 RP1-63G5.5,ELFN2 NA NA NA NA RP1-63G5.5 8343 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 37942064 37942352 37942192 Y KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1 CARD10,CDC42EP1 ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDC42EP1 12102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 38012270 38012654 38012462 Y NA GGA1,SH3BP1,PDXP NA NA NA NA GGA1 9789 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 38847286 38847612 38847528 Y NA KDELR3 NA NA NA NA KDELR3 14455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 38857668 38857748 38857703 Y NA KDELR3,DDX17 KCNJ4 K562 ChIA-PET 22265404 KDELR3 4319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 39091291 39091422 39091336 Y NA CBY1,RP3-508I15.9,TOMM22,JOSD1,GTPBP1 NA NA NA NA JOSD1 4139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 39154682 39154985 39154835 Y APOBEC3G,APOBEC3D,JOSD1,SUN2,SUN2 SUN2,DNAL4 NA NA NA NA SUN2 33163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 39541576 39542088 39541730 Y JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7 CBX7 NA NA NA NA CBX7 4591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 39608827 39609203 39608881 Y NA PDGFB NA NA NA NA PDGFB 29553 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 39698105 39698354 39698234 Y NA RPL3,SYNGR1 NA NA NA NA RPL3 16040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 40573139 40573276 40573210 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P52 72069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 40781478 40781596 40781515 Y NA ADSL,SGSM3 NA NA NA NA SGSM3 16883 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 40908486 40908830 40908701 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 121876 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 40958851 40958976 40958969 Y NA NA NA NA NA NA MKL1 71730 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr22 40982487 40982801 40982645 Y NA MKL1 NA NA NA NA MKL1 47905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 41048065 41048352 41048232 Y EP300,MKL1 MKL1,GAPDHP37 ST13,MKL1,MCHR1,ADSL IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MKL1 17359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr22 41417973 41418366 41418067 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39690 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 41418482 41418837 41418726 Y MKL1,EP300 RP11-12M9.3 ST13,RBX1,MIR1281,EP300 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-12M9.3 39219 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 41460471 41460696 41460583 Y NA RP11-12M9.3,EP300 RBX1,EP300,XPNPEP3,MIR1281,RANGAP1,CHADL,L3MBTL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-12M9.3 2415 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 41684313 41684541 41684479 Y PPPDE2,RANGAP1 RANGAP1,ZC3H7B NA NA NA NA RANGAP1 4058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 41776948 41777130 41776981 Y NA TEF NA NA NA NA TEF 15611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 41809427 41810696 41809981 Y CCDC134,EP300,CHADL,TOB2,ACO2,TEF,TEF TEF,TOB2 NA NA NA NA TOB2 30331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 41840300 41840792 41840564 Y NA TOB2,PHF5A,ACO2 NA NA NA NA TOB2 235 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr22 42063539 42063782 42063553 Y NA XRCC6,C22orf46,NHP2L1,MEI1 NA NA NA NA C22orf46 19161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 42327988 42328313 42328152 Y NA TNFRSF13C,CENPM,SEPT3 TNFRSF13C MCF7 ChIA-PET 22265404 TNFRSF13C 7166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 43165805 43166293 43166166 Y NFAM1,ARFGAP3 NA ARFGAP3,PACSIN2,CYB5R3 IMR90 Hi-C 24141950 A4GALT 50501 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 43283489 43283802 43283626 Y NFAM1,POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 31377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 43288479 43288908 43288801 Y NFAM1,PACSIN2,PACSIN2 ARFGAP3 NA NA NA NA ARFGAP3 36367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 43333511 43333722 43333661 Y POLDIP3,ARFGAP3,PACSIN2,PACSIN2 NA NA NA NA NA PACSIN2 75429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 43409761 43409918 43409853 Y PACSIN2,PACSIN2 PACSIN2 NA NA NA NA PACSIN2 610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr22 43659776 43660445 43660004 Y NA Z99756.1 NA NA NA NA Z99756.1 9516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 43795472 43795645 43795562 Y NA NA SCUBE1,EFCAB6,SULT4A1,MPPED1 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE1 58078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 44759236 44759683 44759589 Y NA NA KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 132495 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr22 44947082 44947372 44947286 Y PARVG,PARVG NA PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229 IMR90 Hi-C 24141950 LDOC1L 54904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 45402294 45403188 45402906 Y NA PHF21B NA NA NA NA PHF21B 692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 45642150 45642482 45642292 Y NA KIAA0930,UPK3A LOC100506714,NUP50,KIAA0930,UPK3A,FBLN1,SMC1B IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0930 7500 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 45664918 45665214 45665118 Y NA KIAA0930,UPK3A,FAM118A LOC100506714,SMC1B,PHF21B,FBLN1,KIAA0930,FAM118A,RIBC2,UPK3A,ATXN10 IMR90 Hi-C 24141950 UPK3A 13649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 46028588 46028889 46028879 Y WNT7B ATXN10 NA NA NA NA ATXN10 36789 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46330758 46331082 46331012 Y NA WNT7B NA NA NA NA WNT7B 39927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46393370 46393721 46393470 Y C22orf26 WNT7B C22orf40,PKDREJ,ATXN10,GTSE1,CN5H6.4,TRMU,C22orf26,LOC150381 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WNT7B 22361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46441533 46441708 46441621 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4 NA NA NA NA RP6-109B7.3 5877 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46464940 46465203 46464976 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 1169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46467914 46468476 46468052 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 4143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr22 46470082 46470656 46470309 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 6311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46472616 46472825 46472697 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 8845 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 46474643 46475112 46474791 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 10872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46480881 46481264 46481017 Y NA RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 17110 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr22 46483894 46484294 46483949 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B NA NA NA NA RP6-109B7.4 20123 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr22 46495432 46495673 46495573 Y C22orf26 RP6-109B7.3,C22orf26,RP6-109B7.4,MIR4763,MIRLET7B,PPARA NA NA NA NA MIR4763 11773 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46934347 46934575 46934459 Y CELSR1 CELSR1,GRAMD4 NA NA NA NA CELSR1 3280 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46957537 46957704 46957620 Y NA CELSR1,GRAMD4 TRMU,CELSR1,GRAMD4 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 12205 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 46989093 46989561 46989508 Y TBC1D22A,CERK,GRAMD4 GRAMD4 GRAMD4,CELSR1 IMR90 Hi-C 24141950 GRAMD4 19184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 47126357 47126654 47126612 Y NA CERK,TBC1D22A NA NA NA NA CERK 5504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 47848340 47848433 47848387 Y NA NA NA NA NA NA RP11-191L9.4 176990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 48035641 48035928 48035744 Y NA RP11-191L9.4 TBC1D22A IMR90 Hi-C 24141950 RP11-191L9.4 10218 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 49157619 49157940 49157765 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 891250 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 49765184 49765573 49765231 Y NA NA NA NA NA NA C22orf34 283617 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr22 50329443 50330313 50330025 Y TUBGCP6,TRABD,PIM3,PANX2,HDAC10,BRD1 CRELD2,ALG12,PIM3 NA NA NA NA ALG12 19337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 50608010 50608409 50608105 Y MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA PANX2 850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 50625511 50626004 50625814 Y BRD1,ZBED4,PIM3,SCO2,SBF1,PPP6R2,ODF3B,NCAPH2,CHKB,ARSA,PANX2,TUBGCP6,SELO,HDAC10 PANX2,TRABD,SELO NA NA NA NA TRABD 3167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 50743986 50744741 50744427 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr22 50744748 50744986 50744827 Y PIM3,TRABD,TYMP,TYMP,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 50747003 50747284 50747232 Y PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2 MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2 NA NA NA NA PLXNB2 2947 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr22 50912071 50912698 50912340 Y NA SBF1,ADM2,LMF2,NCAPH2 NA NA NA NA SBF1 617 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr22 50977955 50978429 50978214 Y PANX2,TRABD,HDAC10,CHKB,SCO2,SCO2,TYMP,TYMP,ODF3B LMF2,NCAPH2,SCO2,TYMP,ODF3B,SYCE3,CHKB-CPT1B NA NA NA NA ODF3B 8946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 3177157 3177268 3177188 Y CRBN TRNT1,CRBN NA NA NA NA TRNT1 10557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 4468384 4468713 4468579 Y NA SUMF1 NA NA NA NA SUMF1 38252 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 4909917 4910799 4910503 Y ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B AC018816.3 NA NA NA NA AC018816.3 16178 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 5028534 5029013 5028702 Y ITPR1,EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 8888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 5043972 5044716 5044216 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 NA NA NA NA BHLHE40-AS1 24326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 5067974 5068590 5068209 Y EDEM1,ARL8B,BHLHE40 BHLHE40,BHLHE40-AS1 BHLHE40,ITPR1,EGOT MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 BHLHE40-AS1 48328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 9197454 9197478 9197466 Y NA NA NA NA NA NA RAD18 193997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 9422978 9423353 9423146 Y SETD5,RAD18,THUMPD3 THUMPD3,SRGAP3,RP11-380O24.1,SETD5,SETD5-AS1 NA NA NA NA SETD5 13946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 9904404 9904624 9904511 Y OGG1,LOC401052,ARPC4,ARPC4,TADA3,RPUSD3,CIDEC,JAGN1,IL17RE,IL17RE,IL17RC,IL17RC,CIDEC,CIDEC RPUSD3,JAGN1,IL17RE NA NA NA NA RPUSD3 20118 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 10215234 10216150 10215734 Y NA VHL,IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 10685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 10233695 10234220 10233931 Y VHL,IRAK2,TATDN2 IRAK2 NA NA NA NA IRAK2 29146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 11138272 11138477 11138338 Y NA HRH1 HRH1,ATG7 IMR90 Hi-C 24141950 HRH1 38302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 11237617 11237805 11237677 Y NA NA NA NA NA NA HRH1 60838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 11261398 11261658 11261529 Y HRH1 NA NA NA NA NA ATG7 50337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 12211698 12212069 12211921 Y PPARG,PPARG NA NA NA NA NA PPARG 114798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 12350153 12350305 12350183 Y NA PPARG NA NA NA NA PPARG 23286 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 13035460 13035932 13035883 Y CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1 NA NA NA NA NA IQSEC1 76685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 13493281 13493606 13493395 Y NA NUP210,HDAC11 IQSEC1,NUP210 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HDAC11 25618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 13936849 13937176 13936976 Y NA NA C3orf19,TMEM43,CHCHD4,XPC,LSM3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CHCHD4 227194 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 14167210 14167731 14167391 Y TMEM43,XPC CHCHD4,TMEM43 NA NA NA NA TMEM43 2770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr3 14444961 14445761 14445267 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 2885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 14451404 14452012 14451691 Y C3orf19,SLC6A6 SLC6A6 NA NA NA NA SLC6A6 9328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 14715115 14715196 14715168 Y NR2C2,C3orf20 C3orf20 NA NA NA NA C3orf20 509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15060728 15061023 15060876 Y NR2C2 MRPS25 NA NA NA NA MRPS25 43819 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15109564 15109704 15109605 Y ZFYVE20 MRPS25,ZFYVE20 NA NA NA NA MRPS25 4722 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15286616 15286745 15286681 Y NR2C2,ZFYVE20,SH3BP5,EAF1,COLQ,CAPN7 CAPN7 NA NA NA NA CAPN7 40957 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15712856 15713111 15712984 Y NA NA NA NA NA NA HACL1 71518 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15813744 15814005 15813933 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,ANKRD28 NA BTD IMR90 Hi-C 24141950 ANKRD28 85273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 15835826 15836097 15835987 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 63181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 15847096 15847637 15847448 Y SH3BP5,SH3BP5,EAF1,COLQ,DPH3,ANKRD28 NA NA NA NA NA ANKRD28 51641 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 16101834 16102183 16102049 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 202296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 16102393 16102705 16102619 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 201774 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 16108554 16108934 16108707 Y NA NA GALNTL2,BTD,OXNAD1,DPH3,ANKRD28 IMR90 Hi-C 24141950 DPH3 195545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 16324333 16324353 16324342 Y NA DPH3,OXNAD1 NA NA NA NA OXNAD1 19627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 17543312 17543623 17543461 Y NA NA NA NA NA NA TBC1D5 940686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 18580242 18580387 18580280 Y NA RAD23BP1 NA NA NA NA RAD23BP1 2077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 19188369 19188866 19188531 Y NA NA NA NA NA NA RAD23BP1 610204 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 20205868 20206079 20206039 Y SGOL1,SGOL1 SGOL1 NA NA NA NA SGOL1 19705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 23709947 23710120 23710034 Y UBE2E1 NA UBE2E2,UBE2E1,NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 135274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 23898490 23898770 23898565 Y NA NA NKIRAS1,RPL15 IMR90 Hi-C 24141950 UBE2E1 53096 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 23991964 23992189 23991965 Y NA RPL15,NR1D2,NKIRAS1 NA NA NA NA NKIRAS1 5882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 24506233 24506581 24506477 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28192 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 24563741 24564038 24564033 Y NA THRB NA NA NA NA THRB 28968 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 25515408 25515797 25515715 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 188601 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 25623618 25623990 25623898 Y NA NA NA NA NA NA TOP2B 80408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 25790563 25790933 25790768 Y NA OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 31475 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 25796078 25796406 25796226 Y NGLY1 OXSM,NGLY1 NA NA NA NA OXSM 26002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 27448460 27448581 27448568 Y NA NEK10 NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 NEK10 39509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 27524458 27524952 27524717 Y NA SLC4A7 NA NA NA NA SLC4A7 547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 27674607 27674970 27674793 Y NA AC098614.2 SLC4A7,NEK10 IMR90 Hi-C 24141950 AC098614.2 2140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr3 29106794 29107135 29106965 Y NA NA RBMS3 IMR90 Hi-C 24141950 RBMS3 213338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 29660032 29660218 29660060 Y NA NA NA NA NA NA RBMS3 339559 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 29983920 29984245 29984164 Y NA NA NA NA NA NA TGFBR2 661749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 30700179 30700500 30700249 Y TGFBR2 NA NA NA NA NA TGFBR2 54185 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 32526070 32526309 32526138 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 16591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 32535422 32535827 32535806 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 7073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 32549205 32549429 32549313 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 6305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 32557705 32558097 32557882 Y NA CMTM6 NA NA NA NA CMTM6 14805 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 33554713 33555077 33554895 Y NA NA NA NA NA NA UBP1 73850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 37901883 37902306 37902042 Y CTDSPL AC093415.2,CTDSPL NA NA NA NA CTDSPL 432 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 38497232 38497482 38497354 Y NA ACVR2B,EXOG NA NA NA NA ACVR2B 3890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 38568637 38569221 38568871 Y SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG EXOG NA NA NA NA EXOG 33019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 39193999 39194528 39194467 Y NA TTC21A,GORASP1,XIRP1 NA NA NA NA CSRNP1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 39222162 39222653 39222434 Y NA CSRNP1,XIRP1 NA NA NA NA XIRP1 9434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 42085178 42085330 42085254 Y NA TRAK1 TRAK1,ULK4 IMR90 Hi-C 24141950 TRAK1 31884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 42237448 42237989 42237678 Y NA NA NA NA NA NA CCK 67710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 42514954 42515471 42515310 Y NA RP11-219I21.1,VIPR1 TRAK1,VIPR1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-219I21.1 5822 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr3 43913925 43914045 43914001 Y ANO10 NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 182839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 44040259 44040834 44040651 Y NA NA ANO10 IMR90 Hi-C 24141950 ANO10 309173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 4.60455209502222 chr3 44621262 44622718 44622436 Y NA ZNF660,ZNF197 NA NA NA NA ZNF197 1662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 44654573 44654874 44654724 Y ZNF445,ZNF501,ZNF167,ZNF660,ZNF197 ZNF660,ZNF197,ZNF35 NA NA NA NA ZNF197 30193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 45035735 45035877 45035806 Y ZNF660,ZNF35 EXOSC7,ZDHHC3,CLEC3B NA NA NA NA CLEC3B 5163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 45103596 45103920 45103694 Y NA NA NA NA NA NA CLEC3B 62556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 45106273 45106458 45106405 Y NA NA NA NA NA NA CLEC3B 65233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 45185924 45186005 45185965 Y NA CDCP1,RPS24P8 NA NA NA NA CDCP1 10 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 45209101 45209416 45209191 Y LIMD1 CDCP1,RPS24P8 LARS2,CDCP1,CLEC3B,TMEM158 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RPS24P8 9434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr3 45240276 45240388 45240335 Y NA RPS24P8,AC010170.1,TMEM158 NA NA NA NA AC010170.1 25131 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 46600040 46600219 46600077 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 19370 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr3 46616855 46617260 46617039 Y NA LRRC2 NA NA NA NA LRRC2 2329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 46670526 46670816 46670674 Y NA NA NA NA NA NA LRRC2 50937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 47002825 47003246 47003204 Y NA NBEAL2,CCDC12 NA NA NA NA NBEAL2 15927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 47421570 47421869 47421711 Y NA PTPN23 NA NA NA NA PTPN23 1069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 47704557 47705253 47705047 Y SETD2 NA NA NA NA NA CSPG5 84275 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 47879431 47879730 47879653 Y SPINK8 DHX30 NA NA NA NA DHX30 37032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 47898226 47898293 47898260 Y NA NA NA NA NA NA DHX30 55827 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 49171125 49171202 49171164 Y NA QRICH1,QARS,USP19,LAMB2,CCDC71,KLHDC8B NA NA NA NA LAMB2 2574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 49242505 49242600 49242553 Y NA CCDC71,KLHDC8B,CCDC36 NA NA NA NA CCDC36 8644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 49389809 49389972 49389904 Y ARIH2,DALRD3,RHOA,USP4 USP4,GPX1 NA NA NA NA GPX1 4061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 49503154 49503264 49503210 Y NA NICN1,DAG1 NA NA NA NA DAG1 882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 50201601 50201845 50201760 Y TUSC2,HYAL2,C3orf54,MST1R,MON1A,SEMA3F,IFRD2 SEMA3F,SLC38A3 NA NA NA NA SEMA3F 11123 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 50208155 50208394 50208279 Y MAPKAPK3,RBM5,GNAI2 SEMA3F,SLC38A3 GNAT1,SLC38A3,GNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 SEMA3F 17677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 50274525 50274666 50274593 Y RASSF1,IP6K1,RBM5,GNAI2,GNAI2 SLC38A3,GNAI2,SEMA3B NA NA NA NA GNAI2 12801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 50657930 50658131 50658036 Y GNAI2,GNAI2,RASSF1,RASSF1,CYB561D2,MAPKAPK3 MAPKAPK3,CISH NA NA NA NA CISH 10668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 52073968 52074235 52074157 Y GPR62 RPL29,DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 14331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 52080287 52080923 52080751 Y NT5DC2,TWF2,DUSP7 DUSP7 NA NA NA NA DUSP7 7643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 52143667 52143964 52143845 Y NA POC1A NA NA NA NA POC1A 42742 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 52287340 52287625 52287477 Y PBRM1,NISCH,WDR82,GLYCTK,PPM1M,PPM1M RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA PPM1M 9499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 52299133 52299501 52299437 Y NA RP5-1157M23.2,TWF2,PPM1M,GLYCTK,WDR82 NA NA NA NA GLYCTK 19604 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 53106812 53106929 53106871 Y TMEM110,SFMBT1 SFMBT1 NA NA NA NA SFMBT1 28046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 53270281 53270430 53270371 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 17638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 53272912 53273168 53273085 Y TMEM110,PRKCD,DCP1A TKT NA NA NA NA TKT 14900 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 53288705 53289353 53289077 Y NA TKT NA NA NA NA TKT 637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 53304049 53304491 53304265 Y PRKCD,DCP1A,TKT TKT NA NA NA NA TKT 15981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 55103844 55104087 55103966 Y NA NA NA NA NA NA WNT5A 417886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 55194265 55194440 55194343 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 327533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 55224453 55224624 55224517 Y WNT5A NA WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 297349 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 55364571 55364745 55364625 Y NA NA CACNA2D3,WNT5A,ERC2,C3orf51 IMR90 Hi-C 24141950 WNT5A 157228 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 55518078 55518594 55518516 Y WNT5A WNT5A,RP11-875H7.5 NA NA NA NA WNT5A 3379 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 56443112 56443203 56443174 Y NA NA NA NA NA NA CCDC66 145986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr3 56769464 56769764 56769614 Y CCDC66 NA NA NA NA NA FAM208A 54199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57197470 57197866 57197668 Y NA RP11-157F20.1,IL17RD NA NA NA NA IL17RD 4468 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57555554 57555589 57555572 Y FAM116A,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA PDE12 15551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57562103 57562255 57562188 Y SLMAP,FAM116A,APPL1,PDE12 PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 19692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57572232 57572342 57572306 Y NA PDE12,ARF4 NA NA NA NA ARF4 9605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57960548 57960842 57960815 Y FLNB FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 31285 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 57969350 57969849 57969627 Y PDE12,PXK FLNB ARF4,FLNB IMR90 Hi-C 24141950 FLNB 22278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 58390134 58390421 58390274 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 27163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 58412465 58412623 58412544 Y NA PDHB NA NA NA NA PDHB 4961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 59488457 59488969 59488744 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 454647 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 59526553 59526908 59526731 Y NA NA NA NA NA NA C3orf67 492743 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 61548977 61549431 61549203 Y NA PTPRG NA NA NA NA PTPRG 3734 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 62572991 62573174 62573036 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 219986 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 62573493 62573782 62573553 Y NA NA NA NA NA NA PTPRG-AS1 220488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 63848274 63848561 63848418 Y NA THOC7,ATXN7 NA NA NA NA ATXN7 41 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 63946118 63946531 63946303 Y NA NA LOC100507062 IMR90 Hi-C 24141950 PSMD6 61127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 64563963 64564300 64564067 Y ADAMTS9 NA NA NA NA NA ADAMTS9-AS2 104285 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 65013149 65013388 65013334 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS9 341473 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 67512199 67512308 67512254 Y NA NA NA NA NA NA SUCLG2 190730 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 69337600 69337654 69337627 Y NA NA NA NA NA NA ARL6IP5 205505 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 69338000 69338210 69338108 Y MITF NA NA NA NA NA ARL6IP5 205905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 69790676 69790712 69790690 Y MITF MITF NA NA NA NA MITF 4090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 71136796 71137147 71137136 Y FOXP1 NA NA NA NA NA FOXP1 493993 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 71771089 71771328 71771261 Y FOXP1,PROK2,GPR27,EIF4E3,EIF4E3,EIF4E3 GPR27,EIF4E3 NA NA NA NA GPR27 29873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 71863099 71863325 71863212 Y NA NA NA NA NA NA EIF4E3 61175 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 73159773 73160145 73159855 Y EBLN2 NA PDZRN3,CACNA1D IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC75P1 70297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 73697614 73697785 73697708 Y NA PDZRN3 NA NA NA NA PDZRN3 25523 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 75472638 75472968 75472803 Y NA FAM86DP NA NA NA NA FAM86DP 9293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 75765975 75766371 75766287 Y NA NA NA NA NA NA ZNF717 66363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 80100853 80101105 80100983 Y NA NA NA NA NA NA ROBO1 285888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr3 80819406 80819881 80819642 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 989431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 5.04308086597672 chr3 80820355 80820528 80820440 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 988784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr3 83266585 83266839 83266721 Y NA NA NA NA NA NA GBE1 1457273 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 86999128 86999300 86999212 Y CHMP2B VGLL3 NA NA NA NA VGLL3 38969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 88208920 88209337 88209164 Y CGGBP1,C3orf38 C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 11885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 88211290 88211624 88211397 Y NA C3orf38,CGGBP1 NA NA NA NA CGGBP1 14255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 96336052 96336669 96336607 Y NA NA NA NA NA NA HNRNPKP4 269654 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr3 97508761 97509065 97508913 Y NA ARL6 NA NA NA NA ARL6 27396 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 98504725 98505044 98504856 Y OR5K4,ST3GAL6 NA NA NA NA NA DCBLD2 113489 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 98625177 98625421 98625283 Y DCBLD2 DCBLD2,CTD-2021J15.1 DCBLD2 K562 ChIA-PET 22265404 CTD-2021J15.1 5909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 99620045 99620512 99620235 Y NA NA NA NA NA NA COL8A1 264726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 99768992 99769102 99769071 Y C3orf26 NA NA NA NA NA TBC1D23 208742 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 99944403 99944723 99944568 Y NA TBC1D23 C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L IMR90 Hi-C 24141950 TBC1D23 33121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 100077983 100078198 100078091 Y FILIP1L NIT2,LNP1,TOMM70A NA NA NA NA NIT2 26438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 101146332 101146443 101146386 Y NA NA NA NA NA NA SENP7 83642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 101403455 101403770 101403678 Y SENP7,RG9MTD1,PCNP,NFKBIZ,ZBTB11,RPL24 ZBTB11,CEP97 NA NA NA NA RPL24 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 101875301 101875563 101875428 Y NA NA FAM55C,LOC152225,NFKBIZ IMR90 Hi-C 24141950 NFKBIZ 330466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 106782352 106782425 106782408 Y NA NA CBLB IMR90 Hi-C 24141950 MTND5P16 166616 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 107318808 107318949 107318879 Y NA NA NA NA NA NA BBX 79025 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 107706134 107706639 107706380 Y NA NA MYH15,IFT57,CD47,LOC285205 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD47 101233 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 107780870 107781332 107781111 Y MYH15,CD47 CD47 NA NA NA NA CD47 26540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 111623667 111623869 111623803 Y NA NA NA NA NA NA ABHD10 71988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 112274528 112274888 112274746 Y SLC35A5,ATG3 SLC35A5,ATG3 NA NA NA NA SLC35A5 3668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 112994855 112995215 112995035 Y NA NA NA NA NA NA BOC 67005 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 113638745 113638778 113638762 Y NA NA NA NA NA NA QTRTD1 83902 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 114103176 114103363 114103329 Y NA NA NA NA NA NA KIAA1407 329716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 114784892 114785127 114785010 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 78991 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 114998646 114998840 114998743 Y NA NA GAP43 IMR90 Hi-C 24141950 ZBTB20 134528 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 115503263 115503751 115503546 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 639145 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 115790074 115790198 115790193 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB20 925956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 117441288 117441601 117441524 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384F7.2 272838 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 119144576 119144994 119144966 Y ARHGAP31,COX17,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 40683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 119146429 119146829 119146680 Y ARHGAP31,CD80,ADPRH TMEM39A,POGLUT1 NA NA NA NA TMEM39A 38848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 119357693 119358081 119357897 Y GSK3B,ARHGAP31,ADPRH RP11-190C22.1,COX17 NA NA NA NA RP11-190C22.1 4696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 120492875 120493095 120492951 Y NA GTF2E1,RABL3 NA NA NA NA RABL3 33035 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 121257379 121257441 121257436 Y NA POLQ NA NA NA NA POLQ 5412 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 121374377 121374548 121374517 Y EAF2,HCLS1,GOLGB1 HCLS1 NA NA NA NA HCLS1 3226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 121713958 121714176 121714068 Y HCLS1,EAF2,CD86 NA NA NA NA NA EAF2 161928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 122151096 122151154 122151125 Y KPNA1 WDR5B NA NA NA NA WDR5B 18214 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 122463361 122463618 122463490 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 47053 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 122467278 122467457 122467368 Y NA HSPBAP1,DIRC2 NA NA NA NA HSPBAP1 43214 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 122988091 122988383 122988237 Y NA NA NA NA NA NA SEC22A 69317 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 123351425 123351671 123351446 Y ADCY5 PTPLB,MYLK-AS1 NA NA NA NA MYLK-AS1 49036 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 123379811 123380137 123379976 Y NA NA NA NA NA NA MYLK-AS1 77422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 123662416 123662605 123662519 Y NA CCDC14 NA NA NA NA CCDC14 15959 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 124553626 124554125 124554004 Y KALRN NA NA NA NA NA ITGB5 64140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 124708345 124708776 124708566 Y NA MUC13 NA NA NA NA MUC13 37682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 124714923 124714954 124714939 Y NA MUC13 NA NA NA NA MUC13 44260 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 124779995 124780351 124780112 Y ITGB5,HEG1 HEG1 NA NA NA NA HEG1 7193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 125986265 125986571 125986320 Y NA NA KLF15,ZXDC,ALDH1L1,CCDC37 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1L1 71428 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126391611 126391660 126391640 Y NA TXNRD3,CHCHD6 NA NA NA NA TXNRD3 19613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126630341 126630598 126630469 Y ZXDC NA NA NA NA NA PLXNA1 74839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126701397 126702091 126701497 Y PLXNA1 PLXNA1 CHCHD6,PLXNA1 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PLXNA1 3346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126721076 126721245 126721142 Y PLXNA1 PLXNA1 NA NA NA NA PLXNA1 15639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126945431 126945830 126945484 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 239994 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 126945882 126946306 126946211 Y MCM2 NA NUP210P1 IMR90 Hi-C 24141950 PLXNA1 240445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr3 128216520 128216923 128216625 Y EEFSEC,DNAJB8,GATA2,GATA2,GATA2 RP11-475N22.4 GATA2,C3orf27,RUVBL1,EEFSEC,DNAJB8,DNAJB8-AS1 MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-475N22.4 10465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 128267469 128267837 128267725 Y NA NA GATA2 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-475N22.4 61414 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 128336521 128336831 128336572 Y DNAJB8 NA NA NA NA NA RPN1 61087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 128475272 128475670 128475352 Y RAB7A,ISY1,CNBP RAB7A,FTH1P4 NA NA NA NA FTH1P4 6191 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 128564550 128565114 128564776 Y DNAJB8,KIAA1257 ACAD9 NA NA NA NA ACAD9 31325 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 128745839 128746109 128746044 Y NA NA NA NA NA NA RAB43 93535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr3 129315678 129315871 129315798 Y PLXND1 PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 7790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 129344975 129345039 129344984 Y NA PLXND1 NA NA NA NA PLXND1 21314 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 131197540 131197572 131197556 Y NA MRPL3 NA NA NA NA MRPL3 22255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 131854898 131855187 131855050 Y NA NA CPNE4 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7P16 105922 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 132164768 132165015 132164817 Y DNAJC13 DNAJC13 NA NA NA NA DNAJC13 30398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 132979220 132979385 132979303 Y NA NA NA NA NA NA TMEM108 223985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 134068231 134068586 134068519 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 4817 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 134069780 134070244 134070081 Y NA RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2 NA NA NA NA RPL39P5 3159 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 134182898 134183261 134183039 Y AMOTL2 CEP63,ANAPC13 NA NA NA NA CEP63 19324 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 138364761 138365360 138365102 Y PIK3CB,ARMC8 FAIM NA NA NA NA FAIM 39313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 138594717 138594956 138594896 Y NA PIK3CB NA NA NA NA PIK3CB 42937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 138634319 138634690 138634472 Y NA NA ESYT3,PIK3CB,MRPS22,MRAS,CEP70,FAIM IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CB 82539 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 139018358 139018692 139018412 Y FOXL2,C3orf72 NA BPESC1 IMR90 Hi-C 24141950 COPB2 87882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 139253953 139254145 139254018 Y NA RBP1 NA NA NA NA RBP1 2526 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 139344390 139344678 139344552 Y NA NA NA NA NA NA NMNAT3 50181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141050524 141051086 141050761 Y NA ZBTB38 NA NA NA NA ZBTB38 9469 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141118771 141119120 141118811 Y NA NA NA NA NA NA ZBTB38 77716 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141130337 141130617 141130393 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 73272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141319185 141319480 141319327 Y RASA2 NA NA NA NA NA RASA2 115296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141458120 141458481 141458300 Y RASA2 RNF7 NA NA NA NA RNF7 3074 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141572106 141572412 141572258 Y ATP1B3 ATP1B3 RASA2,GRK7,ATP1B3 IMR90 Hi-C 24141950 ATP1B3 20554 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141610914 141611173 141610928 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 17948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 141611491 141611772 141611584 Y NA ATP1B3 NA NA NA NA ATP1B3 18525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 145785304 145785639 145785521 Y NA NA NA NA NA NA PLOD2 93801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 146257874 146258309 146258204 Y NA PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 2342 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 146259909 146260381 146260206 Y PLSCR1 PLSCR1 NA NA NA NA PLSCR1 270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 146955604 146955955 146955778 Y NA NA NA NA NA NA ZIC4 166692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 149284462 149284628 149284613 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 74015 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 149297469 149297617 149297606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-278L15.6 87022 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 149333585 149333911 149333859 Y TM4SF18,TM4SF18,TM4SF1,WWTR1,WWTR1 NA NA NA NA NA WWTR1 118590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 149339543 149339560 149339552 Y NA NA NA NA NA NA WWTR1 112941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 149657313 149657850 149657694 Y TSC22D2,RNF13 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 26322 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 149676286 149676648 149676501 Y TM4SF4 ANKUB1 NA NA NA NA ANKUB1 7524 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 150987276 150987626 150987385 Y P2RY12,MED12L NA NA NA NA NA MED12L 185792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 152121454 152121974 152121660 Y MBNL1 NA NA NA NA NA MBNL1-AS1 136110 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 152878171 152878732 152878352 Y P2RY1,RAP2B RAP2B NA NA NA NA RAP2B 142 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 156268270 156268550 156268410 Y NA SSR3 NA NA NA NA SSR3 2423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 156443600 156443618 156443611 Y LEKR1,LEKR1,CCNL1,TIPARP,TIPARP,TIPARP NA NA NA NA NA TIPARP-AS1 53433 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 156502026 156502257 156502105 Y SSR3 LINC00886 NA NA NA NA LINC00886 30594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 156530301 156530778 156530576 Y TIPARP,TIPARP,TIPARP,CCNL1,LEKR1,LEKR1 LINC00886 NA NA NA NA LINC00886 2073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 158431050 158431280 158431158 Y NA MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 16707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 158440805 158440990 158440882 Y MFSD1 MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA MFSD1 6997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 158466226 158466540 158466401 Y MFSD1 MFSD1,RARRES1 NA NA NA NA RARRES1 17741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 160014353 160014630 160014494 Y NA NA NA NA NA NA C3orf80 72930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 160627332 160627671 160627502 Y NA NA NA NA NA NA PPM1L 155942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 163200280 163200389 163200295 Y NA NA NA NA NA NA BCHE 2352871 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 169379831 169380308 169379976 Y NA NA NA NA NA NA TERC 100540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 169872442 169872609 169872497 Y NA PHC3 NA NA NA NA PHC3 24928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 170073991 170074311 170074218 Y SKIL,SKIL SKIL NA NA NA NA SKIL 525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 170442364 170442688 170442585 Y CLDN11 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 14466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 170444418 170445820 170444586 Y CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2 RP11-373E16.4 CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI IMR90 Hi-C 24141950 RP11-373E16.4 11334 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr3 171002565 171002750 171002646 Y NA NA NA NA NA NA TNIK 173447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 171825348 171825521 171825406 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 69930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 171847438 171848726 171847798 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 92020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 171855430 171855856 171855550 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 100012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 171858231 171859026 171858504 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 102813 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 171870963 171871593 171871291 Y PLD1,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 115545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 171878014 171878468 171878150 Y PLD1,FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 122596 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 171954526 171954782 171954635 Y FNDC3B,FNDC3B NA NA NA NA NA FNDC3B 199108 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 172229975 172230511 172230380 Y FNDC3B,TNFSF10,TNFSF10 TNFSF10 NA NA NA NA TNFSF10 8786 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr3 172510084 172510259 172510171 Y NA ECT2,RNU4-4P NA NA NA NA RNU4-4P 2089 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 178787910 178788066 178787991 Y ZMAT3 ZMAT3 NA NA NA NA ZMAT3 1 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 178978348 178978737 178978528 Y PIK3CA,MFN1,GNB4 LRRFIP1P1 NA NA NA NA LRRFIP1P1 1287 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 179161841 179162229 179161903 Y NA GNB4 NA NA NA NA GNB4 5149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 179244857 179244994 179244926 Y NA ACTL6A GNB4 IMR90 Hi-C 24141950 ACTL6A 33674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 181959526 181959782 181959653 Y NA NA NA NA NA NA ATP11B 549506 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 182645862 182646115 182645990 Y MCF2L2,MCCC1 NA NA NA NA NA DCUN1D1 55626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 182930008 182930187 182930076 Y ATP11B,KLHL6,KLHL24,B3GNT5 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 38845 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 183003579 183004143 183003750 Y ATP11B,B3GNT5,KLHL6,KLHL24 B3GNT5 NA NA NA NA B3GNT5 34547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr3 183231092 183231442 183231267 Y B3GNT5,KLHL6,KLHL24 NA NA NA NA NA MCF2L2 86526 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 184503800 184503841 184503824 Y NA VPS8 VPS8,EPHB3,EIF4G1,POLR2H,THPO,CHRD IMR90 Hi-C 24141950 VPS8 24090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 186490704 186490868 186490793 Y ST6GAL1,TBCCD1,TBCCD1,EIF4A2 EIF4A2,RFC4 NA NA NA NA EIF4A2 8126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 186892076 186892095 186892086 Y NA RPL39L LOC100131635 IMR90 Hi-C 24141950 RPL39L 4601 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 187457681 187458370 187457991 Y RTP4,BCL6,BCL6,BCL6 BCL6 NA NA NA NA BCL6 3145 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 187607399 187607588 187607479 Y BCL6 NA BCL6,LPP IMR90 Hi-C 24141950 BCL6 145884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 187883507 187883633 187883573 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 13662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 187891343 187891657 187891500 Y NA LPP,LPP-AS2 NA NA NA NA LPP-AS2 21498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 188296495 188296603 188296541 Y NA NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 366825 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 189240469 189240487 189240479 Y TP63 NA NA NA NA NA TPRG1-AS1 577041 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 190284228 190284576 190284349 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAP 54388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 191721344 191721353 191721349 Y NA NA NA NA NA NA CCDC50 676478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 191840902 191841040 191840996 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 792910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 191899426 191899438 191899432 Y NA NA NA NA NA NA MB21D2 734512 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 192608372 192608637 192608617 Y NA MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 25313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 192634153 192634990 192634777 Y MB21D2 MB21D2 NA NA NA NA MB21D2 203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr3 192873675 192873788 192873739 Y NA NA NA NA NA NA HRASLS 83126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 193587539 193587846 193587782 Y NA NA LOC100131551,LOC647323,HES1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-135A1.3 219504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 193597420 193597611 193597456 Y NA NA HES1,OPA1,LOC647323 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 RP11-135A1.3 209739 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 193851636 193853009 193852912 Y ATP13A3,HES1 RP11-135A1.3 NA NA NA NA HES1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr3 193857372 193857551 193857481 Y HES1 HES1 NA NA NA NA HES1 5438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 193859199 193859624 193859359 Y TMEM44 HES1 NA NA NA NA HES1 7265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr3 193876735 193877026 193876899 Y NA HES1 NA NA NA NA HES1 24801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 194153543 194153935 194153911 Y ATP13A3 NA NA NA NA NA ATP13A3 63158 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 194247870 194248550 194248205 Y HES1,ATP13A3 ATP13A3 ATP13A3,GP5,TMEM44,FLJ34208 IMR90 Hi-C 24141950 ATP13A3 30777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 194277383 194277706 194277514 Y NA TMEM44-AS1 ATP13A3,TMEM44,LRRC15,CPN2,FLJ34208,GP5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TMEM44-AS1 25034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 194461690 194461887 194461800 Y FAM43A NA NA NA NA NA FAM43A 57068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 194561866 194562021 194561957 Y FAM43A NA LOC100507391,XXYLT1,ACAP2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM43A 157244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr3 195542423 195542578 195542499 Y MUC20,MUC4 MUC4 NA NA NA NA MUC4 5275 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr3 196047617 196047878 196047747 Y NA PCYT1A,TCTEX1D2 NA NA NA NA TCTEX1D2 4447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 196255741 196255873 196255820 Y NA RNF168,FBXO45,WDR53 UBXN7,MUC20,RNF168,C3orf43,PCYT1A,TM4SF19-TCTEX1D2,WDR53,FBXO45,CEP19 IMR90 Hi-C 24141950 RNF168 27102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 196696811 196697020 196696957 Y LRRC33,PIGZ NCBP2,PIGZ,AC011322.1,MFI2-AS1 NA NA NA NA PIGZ 2880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 197007663 197007913 197007866 Y NA DLG1 NA NA NA NA DLG1 16258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr3 197301708 197302062 197301885 Y NA BDH1 NA NA NA NA BDH1 3514 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 693278 693552 693364 Y GAK,MFSD7,PCGF3 MYL5,ATP5I,PCGF3 NA NA NA NA PCGF3 3985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 742666 742733 742699 Y NA PCGF3,RP11-440L14.1 NA NA NA NA RP11-440L14.1 30904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 1027686 1027967 1027729 Y FGFRL1,FGFRL1,FGFRL1 DGKQ,IDUA,FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 25962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 1037465 1037841 1037534 Y MAEA,KIAA1530,MFSD7,PCGF3,GAK,IDUA FGFRL1 NA NA NA NA FGFRL1 35741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 1184509 1184886 1184846 Y RNF212,CRIPAK NA NA NA NA NA CTBP1 56855 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 1712467 1712893 1712787 Y WHSC1 SLBP,TMEM129,TACC3 NA NA NA NA SLBP 185 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 2414575 2415364 2414914 Y HAUS3,TNIP2,TNIP2,SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,ZFYVE28,RNF4,RNF4,LOC402160 ZFYVE28,RNF4 NA NA NA NA ZFYVE28 3026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 2537711 2538436 2538089 Y NA NA NA NA NA NA RNF4 75764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 2574508 2574529 2574516 Y NA NA POLN,MXD4,LOC402160,RNF4,FAM193A,TNIP2,ADD1 IMR90 Hi-C 24141950 RNF4 112561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 3085381 3085754 3085447 Y NA HTT NA NA NA NA HTT 10973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 3203733 3204143 3203890 Y SH3BP2,SH3BP2,SH3BP2,HTT NA NA NA NA NA RGS12 88612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 3293872 3294174 3294028 Y NA RGS12 RGS12 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RGS12 1117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 4542716 4543043 4542880 Y ZBTB49,STX18 STX18-AS1,STX18 NA NA NA NA STX18 643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 5034935 5035238 5035206 Y NA CYTL1,STK32B STK32B,EVC2 IMR90 Hi-C 24141950 CYTL1 15736 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 6179706 6179940 6179759 Y JAKMIP1 NA NA NA NA NA WFS1 89636 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 6223621 6224023 6223692 Y PPP2R2C,PPP2R2C,MRFAP1L1,CRMP1,CRMP1,JAKMIP1 WFS1 NA NA NA NA WFS1 45553 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 6311062 6311148 6311105 Y NA WFS1 NA NA NA NA WFS1 41486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 6592942 6593078 6593012 Y NA MAN2B2,MRFAP1 NA NA NA NA MAN2B2 18040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 6734442 6734743 6734533 Y KIAA0232 MRFAP1L1,KIAA0232 NA NA NA NA MRFAP1L1 24835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 7191564 7191944 7191754 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 7209017 7209262 7209117 Y NA SORCS2 NA NA NA NA SORCS2 16752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 7649791 7650390 7650086 Y NA NA NA NA NA NA AFAP1 289263 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 7833117 7833393 7833178 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 106260 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 7834057 7834311 7834184 Y AFAP1 NA NA NA NA NA AFAP1 105342 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 7905982 7906260 7906100 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 33393 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 7974971 7975417 7975298 Y AFAP1 AFAP1 NA NA NA NA AFAP1 35318 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 10184786 10184981 10184889 Y NA NA WDR1,CLNK,ZNF518B K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 WDR1 68213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 10976046 10976392 10976234 Y NA NA NA NA NA NA MIR572 392059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 13613048 13613249 13613164 Y NA AC006445.7 NA NA NA NA AC006445.7 18974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 13922430 13922925 13922628 Y NA NA LOC441009,CPEB2,C1QTNF7 IMR90 Hi-C 24141950 LINC01085 188667 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 14311175 14311415 14311293 Y NA NA NA NA NA NA LINC01085 199583 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 15590411 15590648 15590624 Y FBXL5 NA NA NA NA NA FAM200B 90637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 15655935 15656313 15656300 Y FBXL5,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1 NA NA NA NA FAM200B 24972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 15684115 15684561 15684231 Y FBXL5,FAM200B,BST1 FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1 NA NA NA NA FBXL5 2813 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 15757957 15758240 15758119 Y FBXL5,TAPT1,CD38 RP11-115L11.1,CD38 C1QTNF7,CD38,FGFBP2,PROM1,CC2D2A IMR90 Hi-C 24141950 CD38 19658 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 16226860 16227020 16226938 Y FGFBP2,TAPT1 TAPT1,RPS21P4 NA NA NA NA TAPT1 13 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 16544160 16544423 16544292 Y NA NA NA NA NA NA RPS21P4 287982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 16629750 16630155 16629855 Y NA NA NA NA NA NA LDB2 268277 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 17030410 17030670 17030540 Y NA NA LDB2 IMR90 Hi-C 24141950 LDB2 131978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 19572039 19572379 19572208 Y NA NA NA NA NA NA RP11-3J1.1 115422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 19875292 19875467 19875380 Y NA NA NA NA NA NA SLIT2 377416 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 22636233 22636363 22636286 Y NA RP11-10G12.1 NA NA NA NA RP11-10G12.1 42414 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 22636795 22637032 22636911 Y GBA3 RP11-10G12.1 NA NA NA NA RP11-10G12.1 42976 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 23890124 23890507 23890316 Y PPARGC1A PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 13205 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 23890635 23890864 23890849 Y NA PPARGC1A NA NA NA NA PPARGC1A 12848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 24840398 24840758 24840578 Y NA NA SOD3 IMR90 Hi-C 24141950 SOD3 50864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 25536997 25537326 25537166 Y NA NA NA NA NA NA RP11-302F12.1 141146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 25815962 25816321 25816294 Y SEL1L3 SEL1L3 NA NA NA NA SEL1L3 47061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 36183139 36183486 36183313 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 60645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 36191564 36191723 36191675 Y NA NA NA NA NA NA ARAP2 52408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 37074925 37075290 37075112 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 610708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 37581972 37582372 37582240 Y NA NA NA NA NA NA RELL1 103626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 38665008 38665204 38665059 Y TLR6,TLR1,KLHL5,KLF3 KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 38697805 38697826 38697816 Y NA KLF3,RP11-617D20.1 NA NA NA NA RP11-617D20.1 33301 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 38857753 38857899 38857797 Y KLF3,TLR1,TLR6 TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1 1315 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 38859134 38859762 38859410 Y KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6 TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA TLR1 2696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 38871281 38871430 38871296 Y NA TLR1,FAM114A1 NA NA NA NA FAM114A1 3983 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 39908966 39909133 39909103 Y NA NA NA NA NA NA PDS5A 68443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 40623743 40623952 40623867 Y RBM47 NA NA NA NA NA NSUN7 125962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 40791893 40792102 40791997 Y NSUN7 NSUN7 NA NA NA NA NSUN7 41979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 41413971 41414162 41414067 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 54347 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 41574178 41574364 41574271 Y NA NA NA NA NA NA LIMCH1 214554 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 47645618 47645920 47645780 Y NA NA NA NA NA NA RP11-100N21.1 60469 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 48851417 48851730 48851443 Y ZAR1,FRYL OCIAD1 NA NA NA NA OCIAD1 46188 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 52873079 52873103 52873091 Y NA SGCB NA NA NA NA SGCB 29545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 54055240 54055561 54055400 Y NA NA NA NA NA NA SCFD2 174681 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 54890749 54890967 54890889 Y GSX2 CHIC2 NA NA NA NA CHIC2 37890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 54958023 54958135 54958077 Y NA CHIC2 SCFD2,CHIC2 IMR90 Hi-C 24141950 CHIC2 29166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr4 55093767 55093987 55093860 Y NA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 55100480 55100923 55100634 Y PDGFRA PDGFRA NA NA NA NA PDGFRA 7216 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 55405838 55406147 55405887 Y KIT NA NA NA NA NA PDGFRA 312574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 55574456 55574839 55574648 Y NA NA NA NA NA NA PDGFRA 481192 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 57278248 57278433 57278373 Y NA AASDH,PPAT,PAICS NA NA NA NA PPAT 21348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 67430351 67431255 67431078 Y NA NA NA NA NA NA RP11-396M11.1 472507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 71695000 71695080 71695041 Y NA GRSF1 NA NA NA NA GRSF1 8582 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 77468225 77468282 77468244 Y NA NA NA NA NA NA FAM47E 335032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 77869090 77869312 77869177 Y NA SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 77869398 77869850 77869619 Y SEPT11 SEPT11 NA NA NA NA SEPT11 542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 78397361 78397583 78397472 Y NA NA CXCL13 IMR90 Hi-C 24141950 CCNG2 321057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 84398625 84398990 84398638 Y NA HELQ,MRPS18C,FAM175A NA NA NA NA MRPS18C 23540 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 85420434 85420908 85420714 Y NA NA NA NA NA NA CDS1 81224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 86180599 86180971 86180785 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP24 213296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 86410493 86410688 86410582 Y NA ARHGAP24 NA NA NA NA ARHGAP24 16226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 87835479 87835856 87835675 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA AFF1 18298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 87881950 87882282 87882116 Y NA AFF1,C4orf36,TECRP1 NA NA NA NA TECRP1 12674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 88024894 88025201 88025055 Y NA NA NA NA NA NA KLHL8 134265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 88408034 88408084 88408060 Y SPARCL1 NA NA NA NA NA NUDT9 66300 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 88765103 88765413 88765203 Y HSD17B11 NA NA NA NA NA SPP1 129406 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 90174156 90174307 90174302 Y NA NA NA NA NA NA GPRIN3 52854 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 90211830 90212216 90212109 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 14945 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 90226723 90227111 90227016 Y GPRIN3 GPRIN3 NA NA NA NA GPRIN3 50 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 92985275 92985297 92985287 Y NA NA NA NA NA NA SMARCAD1 2141465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 95437375 95437547 95437461 Y PDLIM5 NA NA NA NA NA PDLIM5 66338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 99469455 99469759 99469656 Y NA NA NA NA NA NA TSPAN5 108021 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 99580316 99580421 99580372 Y NA TSPAN5 NA NA NA NA TSPAN5 2536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 99984592 99984944 99984751 Y NA ADH5 NA NA NA NA ADH5 23008 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 101977991 101978172 101977999 Y NA NA NA NA NA NA AP001816.1 288765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 106324406 106324791 106324687 Y NA NA NA NA NA NA PPA2 68447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 106391866 106392288 106392204 Y TET2,TET2 PPA2 NA NA NA NA PPA2 950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 106628155 106628490 106628322 Y NA GSTCD NA NA NA NA GSTCD 220 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 108783895 108784172 108784033 Y SGMS2 SGMS2 NA NA NA NA SGMS2 40176 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 111117471 111117868 111117585 Y NA ELOVL6 NA NA NA NA ELOVL6 487 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 112732930 112733119 112733025 Y NA NA NA NA NA NA C4orf32 331434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 114382932 114383313 114383209 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 297770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 114390310 114390498 114390393 Y NA NA NA NA NA NA CAMK2D 290585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 114820974 114821152 114821063 Y NA NA NA NA NA NA ARSJ 77731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 117519495 117520605 117520296 Y NA ACTN4P1 NA NA NA NA ACTN4P1 2178 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr4 119756174 119756657 119756269 Y NA SEC24D NA NA NA NA SEC24D 1181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr4 119890642 119890944 119890758 Y NA NA NA NA NA NA SEC24D 132804 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 120437308 120437708 120437606 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 63362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr4 120444503 120444790 120444647 Y NA NA NA NA NA NA RP11-33B1.1 70557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 120476359 120476426 120476393 Y PDE5A NA NA NA NA NA PDE5A 71720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 120511055 120511277 120511169 Y NA PDE5A NA NA NA NA PDE5A 36869 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 122077221 122077584 122077249 Y TNIP3 NA NA NA NA NA NDNF 85045 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 122610538 122611647 122611314 Y ANXA5 ANXA5 NA NA NA NA ANXA5 4621 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 123705556 123705703 123705648 Y NA FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 40160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 123719302 123719557 123719375 Y FGF2 FGF2 FGF2,NUDT6,BBS12 IMR90 Hi-C 24141950 FGF2 26306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 124364843 124364989 124364898 Y SPRY1 NA SPATA5 IMR90 Hi-C 24141950 SPATA5 522614 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 124764674 124764868 124764687 Y NA NA NA NA NA NA TECRP2 618077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 125634465 125634726 125634691 Y NA ANKRD50 NA NA NA NA ANKRD50 2578 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 129244135 129244496 129244419 Y NA PGRMC2 PGRMC2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PGRMC2 36151 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 129389693 129389923 129389761 Y NA NA PHF17,PGRMC2 IMR90 Hi-C 24141950 PGRMC2 181709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 138585739 138585945 138585825 Y PCDH18 NA PCDH18 IMR90 Hi-C 24141950 PCDH18 134091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 138975341 138975477 138975408 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 186026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 139300997 139301320 139301159 Y NA NA NA NA NA NA SLC7A11 139494 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 139814320 139814623 139814472 Y NA NA SLC7A11,LOC641365 IMR90 Hi-C 24141950 CCRN4L 120320 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 139960222 139960706 139960403 Y CCRN4L CCRN4L NA NA NA NA CCRN4L 25279 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 140003738 140004448 140004114 Y CCRN4L,RAB33B,ELF2,ELF2 NA CCRN4L K562 ChIA-PET 22265404 CCRN4L 68795 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 140321405 140321719 140321434 Y ELF2,NAA15,RAB33B NA NA NA NA NA RAB33B 50667 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 140737173 140737338 140737263 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 152251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 140748220 140748477 140748349 Y NA NA NA NA NA NA MGST2 163298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 141012548 141012827 141012747 Y MAML3 NA NA NA NA NA MAML3 60511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 141015706 141016341 141016156 Y NA NA NA NA NA NA MAML3 56997 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 141071687 141072625 141072041 Y MAML3 MAML3 NA NA NA NA MAML3 713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr4 141174275 141174653 141174618 Y NA SCOC MGST2,MAML3,SCOC,LOC100129858 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SCOC 1787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr4 141287573 141287758 141287638 Y NA RP11-425I13.1 NA NA NA NA RP11-425I13.1 1558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 143608710 143609035 143608873 Y NA NA NA NA NA NA INPP4B 157550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 145956046 145956369 145956259 Y NA NA NA NA NA NA ABCE1 60715 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 146024258 146024314 146024286 Y NA ABCE1,ANAPC10 NA NA NA NA ANAPC10 6565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 146656396 146656737 146656614 Y NA NA NA NA NA NA MMAA 118981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 148654111 148654384 148654270 Y PRMT10 ARHGAP10 NA NA NA NA ARHGAP10 2897 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 148768906 148769305 148769088 Y NA NA NA NA NA NA ARHGAP10 117692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 152047125 152047385 152047255 Y NA RPS3A NA NA NA NA RPS3A 28400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 152246032 152246165 152246086 Y FAM160A1 NA FAM160A1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-610P16.1 81822 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 153313306 153313343 153313324 Y NA NA NA NA NA NA TMEM154 285974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 154580466 154580842 154580627 Y TLR2 TLR2 NA NA NA NA TLR2 39810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 158219771 158220072 158219781 Y NA NA NA NA NA NA GLRB 224562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 159643443 159643599 159643521 Y FNIP2,PPID PPID,FNIP2 NA NA NA NA PPID 895 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 165728924 165729125 165729024 Y NA NA NA NA NA NA NACA3P 133317 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 169479701 169480223 169479961 Y NA DDX60L NA NA NA NA DDX60L 22764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 169490335 169490520 169490463 Y PALLD DDX60L NA NA NA NA DDX60L 33398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 169661125 169661437 169661279 Y DDX60,DDX60L NA NA NA NA NA DDX60L 204188 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 169802596 169802736 169802661 Y PALLD NA NA NA NA NA CBR4 126690 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 169839395 169839702 169839549 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 89724 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 170023521 170023783 170023621 Y NA NA NA NA NA NA CBR4 94095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 174285204 174285286 174285258 Y NA HMGB2,SAP30 SAP30 K562 ChIA-PET 22265404 SAP30 3834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 180979740 180980372 180979835 Y NA NA NA NA NA NA AC108142.1 2084030 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 184042355 184042696 184042526 Y NA WWC2 NA NA NA NA WWC2 23909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 184256615 184256836 184256706 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 106908 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 184270201 184270461 184270317 Y NA NA CLDN24,CLDN22 IMR90 Hi-C 24141950 CDKN2AIP 93283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 184319940 184320161 184319981 Y NA CDKN2AIP WWC2,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 43583 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 184328356 184328744 184328447 Y CDKN2AIP CDKN2AIP WWC2,ODZ3,C4orf38,CLDN24,CLDN22,CDKN2AIP IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CDKN2AIP 35000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 185189191 185189340 185189323 Y IRF2,CASP3 NA IRF2,CASP3,LOC728175,CCDC111,MLF1IP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IRF2 204394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 185298493 185298859 185298858 Y NA NA NA NA NA NA IRF2 94875 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr4 186306025 186306048 186306047 Y NA ANKRD37,UFSP2,C4orf47 NA NA NA NA ANKRD37 9127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 187762182 187762435 187762391 Y NA NA FAT1,LOC339975 IMR90 Hi-C 24141950 FAT1 116306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr4 188400076 188400296 188400188 Y NA NA NA NA NA NA RP11-565A3.2 191499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 190197516 190197817 190197669 Y NA NA NA NA NA NA HSP90AA4P 194302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 190534349 190534813 190534562 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-51P 94055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 190936592 190936699 190936668 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 76649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr4 190942271 190942591 190942322 Y NA NA NA NA NA NA FRG1 82328 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr5 53990 54174 54063 Y PLEKHG4B,C5orf55 CTD-2231H16.1 LRRC14B,CCDC127,PLEKHG4B,SDHA IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2231H16.1 36092 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 373392 373627 373429 Y EXOC3,C5orf55,PDCD6 NA NA NA NA NA C5orf55 67631 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 373695 374160 373984 Y EXOC3 NA NA NA NA NA C5orf55 67098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.75411508381799 chr5 379590 379862 379712 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 61396 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 389983 390379 390026 Y NA NA NA NA NA NA C5orf55 50879 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 395451 395827 395512 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 45431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 399875 400445 400189 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3 NA NA NA NA C5orf55 40813 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.74080481846561 chr5 448605 448866 448667 Y EXOC3 C5orf55,EXOC3,CTD-2228K2.5 NA NA NA NA EXOC3 7332 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 584616 584947 584782 Y NA CEP72 SLC9A3,CEP72,TRIP13,TPPP IMR90 Hi-C 24141950 CEP72 25440 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 656184 656577 656381 Y SLC9A3,ZDHHC11,TPPP CEP72,TPPP NA NA NA NA TPPP 34933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 672861 673336 673024 Y NA TPPP NA NA NA NA TPPP 18174 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 5.04308086597672 chr5 759096 759567 759320 Y TPPP NA SLC9A3,ZDHHC11,CEP72,BRD9,TRIP13 IMR90 Hi-C 24141950 TPPP 67586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 784651 785023 784908 Y ZDHHC11,TPPP NA NA NA NA NA TPPP 93141 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr5 1746722 1746833 1746762 Y NA NA NA NA NA NA MRPL36 52647 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 1782613 1782742 1782678 Y TERT MRPL36,NDUFS6 NA NA NA NA MRPL36 16738 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 1876782 1877128 1876955 Y NA NA NA NA NA NA NDUFS6 77268 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 3304230 3304631 3304430 Y NA NA NA NA NA NA C5orf38 553985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 5340490 5340721 5340596 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0947 78056 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 6712873 6713977 6713364 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 81417 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 4.16602332406772 chr5 6927514 6927543 6927527 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 296058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 6961316 6961478 6961397 Y NA NA NA NA NA NA SRD5A1 329860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 8843874 8844185 8844159 Y NA NA SEMA5A IMR90 Hi-C 24141950 SEMA5A 700002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 10422961 10423316 10423021 Y NA ROPN1L NA NA NA NA ROPN1L 16320 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 11283783 11284165 11283974 Y NA NA NA NA NA NA DAP 524399 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 12060867 12061015 12060936 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1301483 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 12099131 12099529 12099330 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1339747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 12246135 12246533 12246334 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1486751 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 12314219 12314247 12314235 Y NA NA NA NA NA NA DAP 1554835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 12670425 12670804 12670615 Y NA NA NA NA NA NA DNAH5 1271848 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14034644 14034850 14034764 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 91992 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14035955 14036534 14036234 Y TRIO NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 93303 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14037561 14037744 14037653 Y NA NA TRIO IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAH5 94909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14174472 14174896 14174531 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 32661 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14178655 14179133 14178814 Y TRIO TRIO NA NA NA NA TRIO 36844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 14264855 14265210 14264930 Y TRIO NA NA NA NA NA TRIO 123044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14268390 14268821 14268476 Y NA NA NA NA NA NA TRIO 126579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 14404233 14404452 14404428 Y TRIO NA NA NA NA NA FAM105A 175432 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 14673178 14673249 14673214 Y NA EEF1A1P13,FAM105B NA NA NA NA FAM105B 10405 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 14926139 14926359 14926282 Y NA NA FAM105B,ANKH,FAM105A,LOC100130744 IMR90 Hi-C 24141950 ANKH 56252 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16492574 16492683 16492630 Y FAM134B ZNF622 NA NA NA NA ZNF622 28673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16698370 16698703 16698671 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 83203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16715199 16715528 16715435 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 100032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16723637 16724009 16723823 Y BASP1 NA NA NA NA NA FAM134B 108470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16727981 16728387 16728161 Y FAM134B NA NA NA NA NA FAM134B 112814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 16735791 16735955 16735874 Y NA NA NA NA NA NA FAM134B 120624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 16894604 16895174 16894829 Y NA CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 5576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 16898106 16898497 16898302 Y MYO10 CTB-55B8.1,MYO10 NA NA NA NA CTB-55B8.1 2253 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 17118695 17119132 17119047 Y BASP1 NA NA NA NA NA BASP1 54988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 17282496 17282827 17282587 Y BASP1 NA NA NA NA NA RN7SKP133 60898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 17359663 17360122 17359876 Y BASP1 RN7SKP133,FTH1P10 NA NA NA NA FTH1P10 6930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 23303766 23303789 23303778 Y NA NA NA NA NA NA HSPD1P1 1423072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 25910581 25911176 25910785 Y NA NA NA NA NA NA RP11-549K20.1 721816 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr5 27309667 27310060 27309866 Y NA NA NA NA NA NA CDH9 190410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 29796154 29796219 29796166 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2134P3.1 988798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 31894536 31894834 31894609 Y NA NA NA NA NA NA PDZD2 257019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 32274798 32274903 32274861 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 36212 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 32349231 32349269 32349250 Y NA MTMR12 NA NA NA NA MTMR12 38116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 32391012 32391652 32391274 Y SUB1 NA NA NA NA NA ZFR 51215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 33676049 33676427 33676252 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTS12 213870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 34585438 34585952 34585758 Y RAI14,RAI14 NA RAI14 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RAI14 68390 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 34655418 34655812 34655539 Y NA RAI14 TTC23L IMR90 Hi-C 24141950 RAI14 1076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 35319810 35320103 35319994 Y PRLR NA PRLR,UGT3A1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRLR 91016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 36109062 36109362 36109328 Y NA UGT3A2,LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA UGT3A2 39602 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 36119586 36119746 36119728 Y SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA LMBRD2 30317 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 36151218 36151404 36151252 Y C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2 LMBRD2,SKP2 NA NA NA NA SKP2 1127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 36425659 36425959 36425758 Y NA NA NA NA NA NA RANBP3L 125443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 37615302 37615631 37615482 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 237988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 37718043 37718447 37718273 Y NA NA NA NA NA NA WDR70 340729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 38514652 38514707 38514680 Y NA CTD-2263F21.1,MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 40956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 38538245 38538619 38538432 Y LIFR MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 17044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 38546436 38546759 38546707 Y NA MIR3650 NA NA NA NA MIR3650 8904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 38650799 38651230 38651069 Y NA LIFR EGFLAM,LIFR,OSMR IMR90 Hi-C 24141950 LIFR 44343 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 38660472 38660667 38660594 Y LIFR NA EGFLAM,LIFR IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LIFR 54016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr5 38846956 38846992 38846979 Y OSMR,OSMR CTD-2127H9.1,OSMR NA NA NA NA OSMR 2996 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 39069838 39069965 39069908 Y NA RICTOR NA NA NA NA RICTOR 2545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 39072904 39073873 39073587 Y FYB,RICTOR RICTOR NA NA NA NA RICTOR 394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 39760848 39761179 39761033 Y NA NA PTGER4,PRKAA1,TTC33 IMR90 Hi-C 24141950 DAB2 300446 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 40796420 40796758 40796693 Y NA TTC33,RPL37,CARD6 NA NA NA NA PRKAA1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 40941168 40941181 40941175 Y NA NA NA NA NA NA CARD6 101882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 41845041 41845055 41845050 Y OXCT1,FBXO4 OXCT1 NA NA NA NA OXCT1 23566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 42465969 42466319 42466144 Y GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR,GHR GHR NA NA NA NA GHR 44090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 42994649 42995346 42995172 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 21185 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr5 43007637 43008177 43007831 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1 NA NA NA NA CTD-2035E11.3 8354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 43038627 43038828 43038720 Y ZNF131,C5orf39 CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA AC025171.1 849 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 43051482 43051716 43051600 Y NA CTD-2035E11.3,AC025171.1,ZNF131,CTD-2201E18.3 NA NA NA NA ZNF131 11562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 43099724 43100011 43099805 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 ZNF131,LOC648987 IMR90 Hi-C 24141950 CTD-2201E18.3 34203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 43105884 43106284 43106088 Y NA ZNF131,CTD-2201E18.3 LOC153684,LOC100132356,ZNF131 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2201E18.3 40363 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 44091721 44091926 44091824 Y NA NA NA NA NA NA NNT-AS1 490389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 44821100 44821499 44821234 Y NA RP11-53O19.1,MRPS30 NA NA NA NA MRPS30 14073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 45492621 45492641 45492631 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 685594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 45793437 45793825 45793631 Y NA NA NA NA NA NA MRPS30 986410 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 52023689 52023809 52023721 Y NA NA NA NA NA NA ITGA1 57921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 52155124 52155267 52155195 Y NA NA NA NA NA NA PELO 73350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 52327592 52327905 52327807 Y ITGA2 ITGA2,CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 43484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 52333334 52333832 52333660 Y NA CTD-2175A23.1 NA NA NA NA CTD-2175A23.1 49226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 53298305 53298413 53298402 Y NA NA NA NA NA NA ARL15 305999 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 54722913 54723133 54723024 Y SKIV2L2 NA NA NA NA NA RNF138P1 101396 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 54751142 54751459 54751301 Y NA NA NA NA NA NA RNF138P1 73070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 54897039 54897427 54897238 Y IL6ST,PPAP2A NA NA NA NA NA PPAP2A 68161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 55289605 55289989 55289924 Y IL6ST IL6ST,CTD-2031P19.3 NA NA NA NA CTD-2031P19.3 610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 55575946 55576115 55576004 Y NA NA MAP3K1,MIER3 IMR90 Hi-C 24141950 AC022431.1 222784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 56784239 56784594 56784302 Y GPBP1,ACTBL2 ACTBL2 PLK2 IMR90 Hi-C 24141950 ACTBL2 7603 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 57758033 57758252 57758173 Y NA PLK2 NA NA NA NA PLK2 3946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 58359884 58360252 58360059 Y RAB3C,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 483836 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 58423022 58423147 58423096 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 546974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 58746343 58746348 58746346 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 870295 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 58798066 58798450 58798258 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA RAB3C 922018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 58816932 58817290 58817225 Y NA NA NA NA NA NA RAB3C 940884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 58866470 58866828 58866806 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 949119 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 58874550 58874813 58874554 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 941134 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 58951498 58952014 58951831 Y PDE4D,PDE4D,PDE4D,PDE4D NA NA NA NA NA PDE4D 863933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 58952543 58952885 58952791 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 863062 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 59056590 59056824 59056644 Y NA NA NA NA NA NA PDE4D 759123 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 59917855 59917860 59917858 Y NA NA NA NA NA NA DEPDC1B 76157 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 60239574 60239836 60239702 Y ELOVL7,ZSWIM6,ERCC8 ERCC8,NDUFAF2 NA NA NA NA NDUFAF2 618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 60597691 60598057 60597813 Y NA ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 28043 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 60600910 60601202 60601013 Y ZSWIM6 ZSWIM6 ZSWIM6,C5orf43,NDUFAF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZSWIM6 24898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 60626321 60626538 60626370 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 221 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 60629089 60629454 60629159 Y NA ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 2989 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 60629701 60630027 60629731 Y ZSWIM6 ZSWIM6 NA NA NA NA ZSWIM6 3601 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 60704594 60705129 60704691 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 18896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 60710257 60710608 60710433 Y NA RPL3P6 NA NA NA NA RPL3P6 24559 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 64331292 64332267 64331637 Y NA NA NA NA NA NA CWC27 268535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 64398874 64399506 64398924 Y NA NA ADAMTS6,CWC27,PPWD1,CENPK IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CWC27 336117 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 65015496 65015671 65015598 Y CENPK,PPWD1,TRIM23,C5orf44,SREK1,SGTB NLN,SGTB NA NA NA NA NLN 352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 65228217 65228394 65228309 Y NA ERBB2IP NA NA NA NA ERBB2IP 7914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 65447669 65447962 65447814 Y SREK1,SREK1 SREK1 NA NA NA NA SREK1 13870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 66531527 66531959 66531721 Y NA NA PIK3R1,MAST4,CD180 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MAST4-AS1 233746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 67069285 67069755 67069460 Y PIK3R1 NA NA NA NA NA PIK3R1 439793 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 67242397 67242498 67242448 Y NA NA NA NA NA NA PIK3R1 267050 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 68338463 68338878 68338699 Y NA CTC-498J12.1,SLC30A5 NA NA NA NA CTC-498J12.1 815 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 71218510 71218673 71218589 Y NA NA NA NA NA NA MAP1B 182388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 71648982 71649164 71649085 Y NA PTCD2,MRPS27 NA NA NA NA MRPS27 34509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 71748206 71748633 71748536 Y NA NA NA NA NA NA MRPS27 133733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 71852331 71852540 71852377 Y NA NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 237858 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 71852712 71853181 71852905 Y TNPO1 NA TNPO1,ZNF366,PTCD2 IMR90 Hi-C 24141950 MRPS27 238239 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 72118223 72118546 72118402 Y TNPO1 TNPO1 NA NA NA NA TNPO1 8084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 72512311 72512636 72512493 Y FOXD1 RP11-60A8.1 FOXD1,FCHO2,TMEM171,BTF3 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-60A8.1 4537 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 72995047 72995144 72995131 Y NA NA NA NA NA NA ANKRA2 135536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 73611863 73612159 73611974 Y NA NA RGNEF,ENC1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HEXB 321689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 74163639 74163858 74163748 Y NA FAM169A GFM2 IMR90 Hi-C 24141950 FAM169A 2863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 74863696 74863807 74863784 Y ANKRD31,COL4A3BP,COL4A3BP,POC5 NA NA NA NA NA COL4A3BP 57733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 76034658 76035100 76034908 Y IQGAP2 F2R NA NA NA NA F2R 24790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 76102045 76102389 76102284 Y F2RL1 F2RL1 F2RL1,IQGAP2,NCRUPAR,F2R IMR90 Hi-C 24141950 F2RL1 10369 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 76958449 76958840 76958645 Y NA WDR41 NA NA NA NA WDR41 44013 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77289736 77289928 77289813 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 127132 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77374282 77374304 77374295 Y NA NA NA NA NA NA TBCA 211678 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77765293 77765351 77765322 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 110954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77803150 77803526 77803443 Y AP3B1,LHFPL2,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 148811 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 77810178 77810481 77810268 Y AP3B1 NA NA NA NA NA SCAMP1 155839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77814404 77814787 77814528 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 160065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77822722 77823939 77823093 Y AP3B1,ARSB NA NA NA NA NA SCAMP1 168383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 77837141 77837359 77837248 Y NA NA NA NA NA NA SCAMP1 182802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77843471 77844086 77843723 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA SCAMP1 189132 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 77888034 77888302 77888035 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 175542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 77890894 77891278 77891114 Y LHFPL2 NA NA NA NA NA LHFPL2 172566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 78585055 78585206 78585119 Y NA NA NA NA NA NA JMY 55043 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 79421543 79422183 79421865 Y ZFYVE16,FAM151B NA NA NA NA NA SERINC5 127715 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 79543086 79543324 79543242 Y ZFYVE16,SERINC5 SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 6574 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 79553045 79553765 79553579 Y NA SERINC5 NA NA NA NA SERINC5 3147 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 79902559 79902570 79902565 Y NA MTRNR2L2,MSH3,DHFR NA NA NA NA MTRNR2L2 42285 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 80579237 80579431 80579394 Y NA CKMT2-AS1,ZCCHC9 NA NA NA NA CKMT2-AS1 15948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 80895638 80895717 80895678 Y NA NA NA NA NA NA SSBP2 149899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 81074673 81075064 81074862 Y NA SSBP2 SSBP2,ZCCHC9,ATG10 IMR90 Hi-C 24141950 SSBP2 29057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 81147637 81148063 81147790 Y NA CTD-2249K22.1 ATG10,SSBP2,ACOT12 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CTD-2249K22.1 2217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr5 82770174 82770695 82770300 Y NA VCAN NA NA NA NA VCAN 4890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 86629389 86629577 86629451 Y NA NA NA NA NA NA RASA1 67684 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 86649300 86650123 86649885 Y NA NA NA NA NA NA CCNH 56713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 86663167 86663443 86663248 Y NA CCNH NA NA NA NA CCNH 43393 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 87851521 87851656 87851586 Y MEF2C NA NA NA NA NA CTC-467M3.1 118380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 87956632 87957169 87956907 Y MEF2C,MEF2C CTC-467M3.1,LINC00461 NA NA NA NA CTC-467M3.1 12867 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 88030090 88030417 88030349 Y MEF2C,MEF2C LINC00461 NA NA NA NA LINC00461 45232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 88159446 88159658 88159552 Y NA MEF2C NA NA NA NA MEF2C 38264 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 88171082 88171456 88171409 Y MEF2C MEF2C NA NA NA NA MEF2C 26466 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 88219671 88220042 88220001 Y NA MEF2C NA NA NA NA MEF2C 21749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 90485915 90486074 90486029 Y ARRDC3 NA GPR98,ARRDC3,LOC100129716 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-90P 78470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 90662566 90662573 90662570 Y NA ARRDC3 NA NA NA NA ARRDC3 14603 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 90772639 90772960 90772848 Y NA NA NA NA NA NA ARRDC3 95463 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 92760867 92761238 92761060 Y NA NA NA NA NA NA NR2F1 155805 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 92958001 92958327 92958133 Y NA NR2F1 NA NA NA NA NR2F1 40958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 94038768 94039036 94038830 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0825 86459 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 94049532 94049756 94049644 Y KIAA0825 NA NA NA NA NA KIAA0825 97223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95048086 95048445 95048385 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,ARSK,SPATA9,RFESD IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RHOBTB3 860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95053997 95054284 95054091 Y ELL2,RHOBTB3 RHOBTB3,CTD-2154I11.2 RHOBTB3,SPATA9 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB3 6771 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95063779 95063897 95063838 Y NA RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 2102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95064673 95064837 95064747 Y ELL2 RHOBTB3,CTD-2154I11.2 NA NA NA NA CTD-2154I11.2 1162 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 95113820 95114121 95113969 Y NA CTD-2154I11.2,GLRX NA NA NA NA GLRX 42588 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr5 95157129 95157323 95157255 Y NA GLRX,C5orf27,AC008592.5 NA NA NA NA GLRX 420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95170754 95171173 95170855 Y GLRX,ELL2 GLRX,C5orf27,AC008592.5 RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLRX 14045 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 95227563 95227763 95227704 Y NA C5orf27,AC008592.5 NA NA NA NA AC008592.5 32073 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95295681 95296335 95296056 Y ELL2 NA NA NA NA NA CTD-2337A12.1,ELL2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95482384 95482735 95482679 Y NA NA ELL2 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-254I22.1 98565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 95873123 95873359 95873236 Y LNPEP,CAST,CAST CAST ELL2,PCSK1,CAST IMR90 Hi-C 24141950 CAST 14152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 96152147 96152486 96152312 Y LNPEP,ERAP1 ERAP1 ERAP1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 ERAP1 10344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 98175322 98175662 98175493 Y NA NA NA NA NA NA RGMB-AS1 68149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 99382569 99383254 99382906 Y NA NA NA NA NA NA CTD-2001C12.1 485712 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 101404486 101404751 101404619 Y NA NA NA NA NA NA PAM 682934 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 102091646 102092087 102091846 Y NA PAM NA NA NA NA PAM 3961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 102121468 102121525 102121497 Y PPIP5K2 PAM NA NA NA NA PAM 33783 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 102304978 102305194 102305031 Y NA NA NA NA NA NA PPIP5K2 148659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 105752390 105752961 105752697 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 1251635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 106637772 106638015 106637896 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 366581 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 106803068 106803432 106803267 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 201164 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 106803890 106804202 106804046 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 200394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 106805205 106805528 106805416 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 199068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 106900103 106900354 106900202 Y NA NA NA NA NA NA EFNA5 104242 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 108137615 108137706 108137661 Y NA NA NA NA NA NA FER 56092 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 108735031 108735161 108735096 Y NA PJA2 NA NA NA NA PJA2 8534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 109125780 109125881 109125831 Y NA NA NA NA NA NA MAN2A1 102713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 111054290 111054596 111054444 Y C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13 NA NA NA NA NA STARD4 208002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 112020535 112020963 112020695 Y NA APC APC IMR90 Hi-C 24141950 APC 20232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 112383528 112383665 112383560 Y DCP2,YTHDC2 NA NA NA NA NA DCP2 73129 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 112425460 112425614 112425558 Y NA NA NA NA NA NA DCP2 115061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 112585948 112586168 112586156 Y MCC NA NA NA NA NA MCC 236359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 112857514 112857856 112857617 Y NA MCC,YTHDC2 NA NA NA NA YTHDC2 10134 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 114726097 114726311 114726134 Y NA NA NA NA NA NA CCDC112 95569 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 114847596 114847935 114847760 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 30656 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 114848957 114849251 114849109 Y NA FEM1C NA NA NA NA FEM1C 29340 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 114959651 114959879 114959766 Y COMMD10 AC010226.4,TMED7 NA NA NA NA TMED7-TICAM2,TICAM2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 114970299 114970641 114970577 Y NA AC010226.4,TMED7-TICAM2,TICAM2,TMED7 NA NA NA NA TMED7 3610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 115205022 115205387 115205036 Y FEM1C AP3S1,ATG12 NA NA NA NA ATG12 29467 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 115236990 115237113 115237051 Y NA NA NA NA NA NA ATG12 61435 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 115420076 115420175 115420113 Y LOC644100 CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 1388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 115421672 115422041 115421857 Y NA CTD-2287O16.1,COMMD10 NA NA NA NA COMMD10 2984 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 118259114 118259147 118259131 Y NA PTMAP2 NA NA NA NA PTMAP2 48344 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 118453384 118453586 118453485 Y NA RP11-950K24.2 NA NA NA NA RP11-950K24.2 8553 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 118605337 118605637 118605457 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 2950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 118610393 118610883 118610628 Y DMXL1,TNFAIP8,TNFAIP8 TNFAIP8 NA NA NA NA TNFAIP8 8006 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 118659966 118660476 118660173 Y NA NA NA NA NA NA TNFAIP8 57579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 122885327 122885717 122885442 Y CEP120,CSNK1G3 CSNK1G3 NA NA NA NA CSNK1G3 39534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 123738017 123738276 123738143 Y NA NA NA NA NA NA ZNF608 344224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 123987356 123987539 123987440 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 94961 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 123997171 123997561 123997207 Y ZNF608 NA NA NA NA NA ZNF608 84939 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 125690030 125690185 125690123 Y GRAMD3,GRAMD3 GRAMD3 GRAMD3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GRAMD3 3639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 125773418 125773804 125773609 Y GRAMD3 NA NA NA NA NA GRAMD3 79594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 125779791 125780174 125779834 Y NA NA NA NA NA NA GRAMD3 85967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 126478879 126479210 126479043 Y NA NA NA NA NA NA C5orf63 71695 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 130715394 130715800 130715520 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 136208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 130730635 130730890 130730763 Y FNIP1,CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 151449 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 130739357 130739526 130739407 Y NA NA NA NA NA NA CDC42SE2 160171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 130750368 130750574 130750471 Y CDC42SE2,RAPGEF6 NA NA NA NA NA CDC42SE2 171182 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131074214 131074509 131074363 Y NA NA NA NA NA NA FNIP1 56201 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131108111 131108375 131108174 Y NA FNIP1 NA NA NA NA FNIP1 22335 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 131422074 131422446 131422224 Y NA CSF2 NA NA NA NA CSF2 14591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131446640 131446942 131446887 Y RAPGEF6,IL5,RAD50,IL3,CSF2 CSF2 IL3,P4HA2 IMR90 Hi-C 24141950 CSF2 39157 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131595834 131595951 131595900 Y KIF3A,PDLIM4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 4470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131601385 131601782 131601639 Y P4HA2 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA PDLIM4 10021 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131629178 131629624 131629352 Y FNIP1,IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr5 131633963 131634368 131634191 Y IRF1,SLC22A4 PDLIM4,SLC22A4,P4HA2 NA NA NA NA P4HA2 4955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131774835 131775712 131775188 Y SLC22A4,IRF1 C5orf56,AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA C5orf56 30507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 131802496 131802987 131802660 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 NA NA NA NA AC116366.6 3748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 131832561 131832909 131832704 Y AFF4,SLC22A4,IRF1 AC116366.6,IRF1 IRF1 IMR90 Hi-C 24141950 IRF1 8071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 131981394 131981469 131981432 Y NA NA NA NA NA NA KIF3A 89861 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 132323487 132323535 132323508 Y NA AFF4,AC010240.3,ZCCHC10 NA NA NA NA AC010240.3 1685 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 132576270 132576709 132576388 Y AFF4,ZCCHC10 NA NA NA NA NA HSPA4 190616 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 133313011 133313350 133313119 Y UBE2B,PPP2CA C5orf15,VDAC1 NA NA NA NA C5orf15 10533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 133540709 133541017 133540863 Y NA SKP1,MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA MIR3661 18431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 133562679 133563046 133562870 Y NA MIR3661,PPP2CA NA NA NA NA PPP2CA 2846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 133801466 133801754 133801589 Y NA AC005355.1,AC005355.2 PHF15,SKP1,CDKN2AIPNL,UBE2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AC005355.1 31064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 133863130 133863560 133863438 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 22887 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 133864116 133864195 133864168 Y NA AC005355.2 NA NA NA NA AC005355.2 23873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 134259128 134259903 134259220 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11,MTND4P12,MIR4461 NA NA NA NA MTND5P11 246 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr5 134261311 134262635 134261858 Y NA PCBD2,CTB-36O1.7,MTND6P4,MTND5P11 NA NA NA NA MTND4P12,MIR4461 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 134733668 134734080 134733976 Y H2AFY H2AFY NA NA NA NA H2AFY 64 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 134812502 134812741 134812563 Y NA NA CXCL14 IMR90 Hi-C 24141950 H2AFY 78898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 135329682 135329872 135329792 Y TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 32712 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 135330774 135331163 135330964 Y NA TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 31421 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 135341804 135342193 135341990 Y FBXL21,TGFBI TGFBI TGFBI,VTRNA2-1,FBXL21 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 20391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 135357182 135357477 135357330 Y NA TGFBI VTRNA2-1,TGFBI,FBXL21,LECT2,SMAD5 IMR90 Hi-C 24141950 TGFBI 5107 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 136450174 136450503 136450334 Y NA NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 258857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 136482104 136482426 136482383 Y SPOCK1 NA NA NA NA NA CTB-1I21.2 290787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 136715478 136715738 136715608 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 216330 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 136786191 136786446 136786319 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 145622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 136795919 136796307 136796181 Y NA NA NA NA NA NA SPOCK1 135761 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 136833088 136833480 136833319 Y KLHL3,SPOCK1 NA NA NA NA NA SPOCK1 98588 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 136900041 136900222 136900186 Y NA SPOCK1 TRPC7 IMR90 Hi-C 24141950 SPOCK1 31846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 137799770 137800154 137799916 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 591 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr5 137800317 137800564 137800421 Y FAM13B,FAM53C,KDM3B,ETF1,EGR1 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 1138 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr5 137815410 137815785 137815600 Y BRD8,HSPA9 REEP2,EGR1 NA NA NA NA EGR1 16231 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 137827710 137828119 137827817 Y EGR1 EGR1,ETF1 NA NA NA NA EGR1 28531 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 137870529 137870619 137870574 Y FAM53C,KDM3B,ETF1 ETF1,HSPA9 NA NA NA NA ETF1 6370 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 138127302 138127500 138127374 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 81557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 138258617 138258897 138258757 Y NA LRRTM2 NA NA NA NA LRRTM2 49560 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 138262166 138262549 138262196 Y NA NA NA NA NA NA LRRTM2 53109 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 138620359 138620541 138620439 Y UBE2D2,MATR3 MATR3,SIL1 NA NA NA NA SIL1 6705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 138897527 138897822 138897662 Y MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2 TMEM173,UBE2D2 DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBE2D2 6194 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 138965572 138965797 138965632 Y NA NA NA NA NA NA CXXC5 59087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 139040519 139041115 139040855 Y PAIP2 CXXC5 NA NA NA NA CXXC5 15635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 139077054 139077268 139077188 Y CXXC5 NA NA NA NA NA CXXC5 52170 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 139078128 139078514 139078502 Y C5orf53,DNAJC18,CXXC5,NRG2,PSD2 NA NA NA NA NA CXXC5 53244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 139088295 139089196 139088669 Y NA NA CXXC5 K562 ChIA-PET 22265404 CXXC5 63411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 139488718 139489038 139488945 Y NA PURA NRG2,CYSTM1,IGIP IMR90 Hi-C 24141950 PURA 3356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 139636160 139636260 139636251 Y SRA1 PFDN1 NA NA NA NA PFDN1 44446 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 140090601 140091006 140090806 Y NA WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1,VTRNA1-3 NA NA NA NA VTRNA1-1 1741 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 140420005 140420137 140420073 Y NA NA PCDHA1 MCF7 ChIA-PET 22265404 PCDHB2 52090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 141054975 141055298 141055138 Y PCDHB12,PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGB7,PCDHGB7,PCDHGC3,PCDHGC4 HDAC3,RELL2,FCHSD1,ARAP3 NA NA NA NA ARAP3 4490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 141256552 141256862 141256814 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 141262176 141262446 141262287 Y PCDHGA9,PCDHGB6,PCDHGC4,PCDHGC5,RELL2,NDFIP1,PCDH1 PCDH1,KIAA0141 NA NA NA NA PCDH1 5365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 141375136 141375383 141375261 Y NA RNF14,PCDH12,GNPDA1 NA NA NA NA GNPDA1 15223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 142182965 142183820 142183151 Y ARHGAP26 ARHGAP26 NA NA NA NA ARHGAP26 35016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 142356404 142356953 142356617 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 208455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 142361615 142361922 142361810 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA ARHGAP26 213666 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 142562980 142563339 142563259 Y NR3C1 NA NA NA NA NA RPL7P21 146831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 142600445 142600900 142600783 Y NR3C1,NR3C1,ARHGAP26 NA NA NA NA NA RPL7P21 109270 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 143300463 143300651 143300509 Y NA NA ARHGAP26,NR3C1 IMR90 Hi-C 24141950 YIPF5 247627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 147364399 147364757 147364579 Y NA NA NA NA NA NA C5orf46 80298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 147463828 147464105 147463998 Y NA NA NA NA NA NA C5orf46 179727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 147616301 147616769 147616552 Y FBXO38 NA NA NA NA NA RP11-373N22.3 144577 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 148172345 148172765 148172447 Y FBXO38,ADRB2 ADRB2 SH3TC2,ADRB2,ABLIM3 IMR90 Hi-C 24141950 ADRB2 31391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 148514080 148514173 148514127 Y NA ABLIM3 ABLIM3,AFAP1L1,ADRB2,SH3TC2 IMR90 Hi-C 24141950 ABLIM3 4873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 148591795 148592037 148591918 Y ABLIM3 NA NA NA NA NA AFAP1L1 57397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr5 148668144 148668260 148668168 Y AFAP1L1 AFAP1L1 NA NA NA NA AFAP1L1 18710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 149110531 149110757 149110649 Y PPARGC1B PPARGC1B NA NA NA NA PPARGC1B 2670 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 149339062 149339484 149339111 Y CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3 SLC26A2,HMGXB3,TIGD6 NA NA NA NA SLC26A2 762 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 149518246 149518623 149518550 Y NA PDGFRB NA NA NA NA PDGFRB 14812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr5 149696810 149697163 149696894 Y SYNPO,PDGFRB ARSI,TCOF1 SLC6A7,TCOF1,HMGXB3,CSF1R,CD74,PPARGC1B,PDGFRB,CDX1,ARSI,CAMK2A,RPS14,NDST1,TIGD6 IMR90 Hi-C 24141950 ARSI 19707 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 149789263 149789759 149789627 Y RBM22,DCTN4,DCTN4,CD74,CD74 CD74,RPS14 NA NA NA NA CD74 733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 151108065 151108456 151108379 Y NA SPARC,RP11-54C4.1,G3BP1,ATOX1 NA NA NA NA RP11-54C4.1 35483 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 151200780 151201112 151200835 Y GLRA1 NA NA NA NA NA ATOX1 50687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 153128376 153128507 153128442 Y GRIA1 NA NA NA NA NA MFAP3 287959 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 154205315 154205569 154205444 Y KIF4B,GEMIN5 CNOT8 NA NA NA NA CNOT8 29544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 154274946 154275114 154275030 Y NA CNOT8,GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA CNOT8 39833 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 154313326 154313392 154313358 Y NA GEMIN5,MRPL22 NA NA NA NA GEMIN5 2377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 154871450 154872048 154871744 Y KIF4B NA NA NA NA NA MRPL22 552820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr5 156476668 156477024 156476779 Y HAVCR1,HAVCR1 NA NA NA NA NA HAVCR2 90856 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 156540141 156540423 156540353 Y NIPAL4,ADAM19,HAVCR2 HAVCR2,MED7 NA NA NA NA HAVCR2 27457 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 158491555 158491917 158491726 Y EBF1 EBF1,RP11-175K6.1 NA NA NA NA EBF1 32852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 158611896 158612266 158612182 Y IL12B,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145 CTB-11I22.1,RNF145 NA NA NA NA CTB-11I22.1 22663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 158876999 158877252 158877089 Y NA NA NA NA NA NA UBLCP1 188910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159451021 159451194 159451125 Y NA TTC1 NA NA NA NA TTC1 16901 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159533500 159533764 159533742 Y NA PWWP2A NA NA NA NA PWWP2A 10666 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159592107 159592427 159592336 Y NA PWWP2A TTC1,CCNJL,PWWP2A,FABP6,C1QTNF2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PWWP2A 47677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 159732256 159732561 159732409 Y NA RP11-34P1.2,CCNJL FABP6 IMR90 Hi-C 24141950 CCNJL 37842 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159815159 159815328 159815245 Y NA CCNJL,C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA C5orf54 9776 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159837617 159837836 159837727 Y NA C1QTNF2,C5orf54,SLU7,PTTG1 NA NA NA NA SLU7 8882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 159933720 159933957 159933888 Y PWWP2A,SLU7 MIR146A NA NA NA NA MIR146A 40445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 162811410 162811429 162811421 Y NA NA NA NA NA NA RP11-541P9.3 50903 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 163343940 163344177 163344063 Y NA NA NA NA NA NA MAT2B 415820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 164595581 164595748 164595665 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P20 858568 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 167909535 167909826 167909541 Y NA RARS,FBLL1 RARS IMR90 Hi-C 24141950 RARS 1624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 169404223 169404546 169404350 Y FAM196B FAM196B NA NA NA NA FAM196B 1198 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 170060615 170060931 170060764 Y RANBP17 NA NA NA NA NA RANBP17 225943 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171326428 171326478 171326475 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 105399 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171432610 171432692 171432660 Y NA FBXW11 NA NA NA NA FBXW11 733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171498342 171498743 171498483 Y NA NA NA NA NA NA FBXW11 66465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171529769 171530204 171529991 Y NA NA NA NA NA NA STK10 83186 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 171540284 171540310 171540295 Y STK10 NA NA NA NA NA STK10 73080 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171556459 171556821 171556736 Y STK10 NA NA NA NA NA STK10 56569 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171602273 171602685 171602548 Y STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 10705 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr5 171606484 171606964 171606720 Y UBTD2,STK10 STK10 NA NA NA NA STK10 6426 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171834226 171834319 171834273 Y NA SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 45208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 171882832 171882998 171882915 Y SH3PXD2B SH3PXD2B NA NA NA NA SH3PXD2B 3305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 172167900 172168183 172168030 Y UBTD2,DUSP1 DUSP1 ERGIC1,DUSP1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP1 28015 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 172234136 172234644 172234380 Y NA DUSP1,ERGIC1 DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ERGIC1 24634 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 172350033 172350394 172350214 Y NA RPL26L1 NA NA NA NA RPL26L1 33338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 173205115 173205307 173205218 Y CPEB4 NA CPEB4 IMR90 Hi-C 24141950 CPEB4 107976 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 173369010 173369228 173369031 Y NA NA NA NA NA NA CPEB4 55727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 173846628 173846975 173846845 Y NA NA MSX2,MIR4634 IMR90 Hi-C 24141950 MSX2 302561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 173957114 173957459 173957290 Y NA NA MSX2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MSX2 192077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 174906234 174906555 174906308 Y NA SFXN1 NA NA NA NA SFXN1 4169 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 176543923 176544044 176544003 Y TSPAN17,PRR7,DBN1 FGFR4,NSD1 NA NA NA NA NSD1 13982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 176790168 176790403 176790363 Y DOK3,RGS14 LMAN2,RGS14,GRK6 NA NA NA NA RGS14 7330 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 176856256 176856655 176856453 Y UIMC1,UIMC1,UIMC1,NSD1,NSD1,RAB24,RGS14,FAM193B,GRK6,PRR7,DOK3,DOK3 GRK6,PRR7,PRR7-AS1,DBN1 NA NA NA NA PRR7 14791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 177042588 177043196 177042926 Y NSD1,FAM193B TMED9,B4GALT7 NA NA NA NA B4GALT7 17487 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 178259703 178260206 178260005 Y ZNF879 ZNF354B,RNU1-39P ZNF879,AGXT2L2,GRM6,COL23A1 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF354B 24748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr5 178729378 178729778 178729559 Y NA ADAMTS2 NA NA NA NA ADAMTS2 40653 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr5 179513863 179514025 179513944 Y NA RNF130 NA NA NA NA RNF130 16745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 179517331 179517686 179517646 Y HNRNPH1,MAML1,RNF130 RNF130 NA NA NA NA RNF130 20213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 180285670 180285966 180285744 Y NA MGAT1,LINC00847,ZFP62 NA NA NA NA ZFP62 320 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 180541875 180541994 180541989 Y OR2Y1 NA BTNL8,MGAT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTC-338M12.5 74930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 180600516 180600767 180600667 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 16157 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 180611137 180611357 180611292 Y MGAT1 CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41 NA NA NA NA CTC-338M12.5 5567 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr5 180633694 180634117 180633980 Y NA CTC-338M12.5,TRIM7,TRIM41,CTC-338M12.4,GNB2L1 NA NA NA NA TRIM7 3401 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 710742 711015 710979 Y HUS1B EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 19625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 711154 711526 711478 Y DUSP22,EXOC2 EXOC2 NA NA NA NA EXOC2 20037 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr6 1609094 1609758 1609395 Y FOXC1 FOXC1 NA NA NA NA FOXC1 413 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 1953013 1953362 1953197 Y NA NA NA NA NA NA GMDS 290564 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 2330490 2330806 2330587 Y NA NA NA NA NA NA GMDS-AS1 86508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 2872094 2872570 2872534 Y NA SERPINB1,SERPINB9 NA NA NA NA SERPINB9 28944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 3163246 3163428 3163368 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 7486 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 3166310 3166878 3166542 Y NA BPHL,TUBB2A NA NA NA NA TUBB2A 10550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 3248062 3248427 3248198 Y SLC22A23,TUBB2A,TUBB2B PSMG4,TUBB2B TUBB2A,BPHL,RIPK1,LOC100507194,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 TUBB2B 18098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr6 3254273 3254642 3254472 Y SLC22A23 PSMG4,TUBB2B NA NA NA NA TUBB2B 24309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 3356099 3356749 3356628 Y NA NA NA NA NA NA TUBB2B 126135 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 3797931 3798162 3798051 Y NA PXDC1,FAM50B SLC22A23,FAM50B,TUBB2B,RIPK1,BPHL IMR90 Hi-C 24141950 PXDC1 47671 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 3826272 3826513 3826435 Y C6orf145 FAM50B SLC22A23,TUBB2B IMR90 Hi-C 24141950 FAM50B 21107 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 4317088 4317563 4317434 Y CDYL NA RPP40,CDYL,LYRM4 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 183257 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 4358823 4359231 4358978 Y CDYL NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 ECI2 224992 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 4582137 4582541 4582469 Y NA NA CDYL,RPP40 IMR90 Hi-C 24141950 CDYL 121852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5179288 5179492 5179391 Y NA NA NA NA NA NA LYRM4 79680 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5296297 5296648 5296345 Y NA LYRM4,FARS2 NA NA NA NA FARS2 37020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5660943 5661332 5661178 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 343868 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5724236 5724398 5724319 Y NA NA NA NA NA NA NRN1 280802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5966118 5966226 5966172 Y NA NRN1 NA NA NA NA NRN1 38974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 5997075 5997523 5997169 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 7677 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 6001980 6002334 6002157 Y NRN1 NRN1 NA NA NA NA NRN1 2866 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 6657678 6658009 6657847 Y NA NA NA NA NA NA RREB1 447821 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 6687140 6687567 6687361 Y NA NA RREB1,SSR1,SNRNP48 IMR90 Hi-C 24141950 RREB1 418263 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 7130548 7130794 7130662 Y RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 24718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 7137966 7138068 7138020 Y RIOK1,RIOK1,CAGE1,RREB1,RREB1 RREB1 NA NA NA NA RREB1 32136 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 7261407 7261720 7261663 Y NA NA NA NA NA NA RP11-69L16.5 76081 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 7618671 7618993 7618833 Y NA SNRNP48 NA NA NA NA SNRNP48 30239 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 9037386 9037741 9037564 Y NA NA NA NA NA NA SLC35B3 603592 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 10316491 10316897 10316818 Y TFAP2A,TFAP2A NA LOC100506207,TFAP2A,LOC100130275 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TFAP2A 100995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 10383571 10383981 10383824 Y TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 33911 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 10403752 10404250 10404030 Y TMEM14C,TMEM14B,PAK1IP1,C6orf52,TFAP2A,TFAP2A,TFAP2A TFAP2A NA NA NA NA TFAP2A 13642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 11197003 11197299 11197017 Y ERVFRD-1,NEDD9 NA NA NA NA NA ELOVL2 154456 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 11210069 11210603 11210460 Y NA NA NA NA NA NA ELOVL2 167522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 11212824 11213214 11213068 Y TMEM170B,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 167367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 11229489 11229708 11229675 Y TMEM170B,MAK,ELOVL2,NEDD9,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 150873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 11243333 11243432 11243383 Y MAK,NEDD9 NA NA NA NA NA NEDD9 137149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 11730766 11731308 11730965 Y TMEM170B,HIVEP1 NA NA NA NA NA TMEM170B 194828 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 13302642 13303798 13303216 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 23017 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 13303878 13304185 13304075 Y GFOD1,GFOD1,TBC1D7 TBC1D7 NA NA NA NA TBC1D7 22630 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 13602068 13602103 13602086 Y NA SIRT5,NOL7 NA NA NA NA NOL7 11456 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 13649579 13649948 13649702 Y NA NOL7 NA NA NA NA NOL7 36020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 13671877 13672171 13672102 Y TBC1D7,GFOD1,GFOD1,CD83 RANBP9 NOL7,SIRT5 K562 ChIA-PET 22265404 RANBP9 37625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 14211061 14211714 14211398 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 95189 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 14211875 14212265 14212161 Y CD83 NA JARID2,DTNBP1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD83 96003 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 15541251 15541598 15541282 Y NA NA NA NA NA NA DTNBP1 119691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 15569583 15569742 15569685 Y DTNBP1 NA NA NA NA NA DTNBP1 91547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16474193 16474630 16474472 Y MYLIP,ATXN1 NA NA NA NA NA GMPR 237382 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16673403 16673483 16673443 Y NA NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 85886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16684658 16685097 16684682 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 74272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16690098 16690263 16690180 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 69106 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16690265 16690543 16690477 Y ATXN1 NA NA NA NA NA RP1-151F17.1 68826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16713666 16713734 16713668 Y ATXN1 RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 45635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16729304 16729629 16729584 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 29740 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 16741302 16741617 16741570 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 NA NA NA NA RP1-151F17.1 17752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 16771345 16771373 16771363 Y NA RP1-151F17.1,ATXN1 ATXN1 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ATXN1 11623 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 17280388 17280785 17280395 Y CAP2,RBM24,RBM24,RBM24 NA NA NA NA NA CAP2 110662 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 17473157 17473283 17473220 Y NA NA NA NA NA NA RPL7P26 56600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 17703484 17703614 17703560 Y KDM1B,FAM8A1,NUP153 NUP153 NA NA NA NA NUP153 1042 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 17715315 17715544 17715493 Y NUP153 NUP153 NUP153,KIF13A IMR90 Hi-C 24141950 NUP153 10659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 18153083 18153444 18153238 Y RNF144B,NHLRC1,KDM1B NHLRC1,KDM1B NA NA NA NA TPMT 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 18402733 18403120 18402803 Y KDM1B,RNF144B RNF144B NA NA NA NA RNF144B 35954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 18833535 18833568 18833552 Y NA NA NA NA NA NA RNF144B 466756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 19805542 19805809 19805569 Y NA RP4-625H18.2,ID4 ID4 MCF7 ChIA-PET 22265404 RP4-625H18.2 2559 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 20174199 20174610 20174442 Y MBOAT1 MBOAT1 NA NA NA NA MBOAT1 36060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 20575670 20575691 20575681 Y NA CDKAL1 NA NA NA NA CDKAL1 42982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 21587723 21589288 21589205 Y SOX4 SOX4 LINC00340,CDKAL1 MCF7 ChIA-PET 22265404 SOX4 2684 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 21947021 21947287 21947156 Y NA NA NA NA NA NA SOX4 355049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 25094713 25094741 25094729 Y NA NA NA NA NA NA LRRC16A 182565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 25992254 25993073 25992840 Y NA TRIM38,HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2 NA NA NA NA HIST1H1A 22967 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.50823016763598 chr6 26016753 26016987 26016816 Y HIST1H1A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H1A 713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 26026306 26026795 26026679 Y HIST1H1D,BTN3A3,BTN3A2,BTN3A2,BTN3A1,HIST1H2BD,HIST1H1E,TRIM38,HIST1H3A HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,U91328.2,HIST1H3C,HIST1H1C NA NA NA NA HIST1H4B 826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 26126352 26126787 26126533 Y HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E HFE,HIST1H4C,HIST1H1T,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD NA NA NA NA HIST1H2AC 3979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.75411508381799 chr6 26304989 26305345 26305268 Y NA HIST1H3G,HIST1H2BI,HIST1H4H HCG11,HIST1H1D,HIST1H4F,HIST1H2AE,HIST1H2BF,HIST1H2BG,HIST1H3D,HIST1H4E,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H4G,HIST1H2BI,HIST1H3G,HIST1H4H,BTN3A2,BTN2A2,BTN1A1,HMGN4,BTN3A3,HIST1H2AH,HIST1H2BK,MIR3143,ABT1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 HIST1H4H 21227 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 26397110 26397374 26397265 Y NA BTN3A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN2A3P,BTN3A3 NA NA NA NA BTN3A1 3091 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 26474010 26474599 26474187 Y NA BTN3A3,BTN2A1,HCG11 NA NA NA NA BTN2A1 17860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 26521003 26521206 26521108 Y HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD,HIST1H1D,BTN3A2,BTN3A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN2A2,BTN3A1,BTN3A3,BTN2A1,BTN2A1,ABT1 HCG11,HMGN4 NA NA NA NA HCG11 927 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27145585 27145720 27145705 Y FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1 HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-209A2.1 31303 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27205361 27205470 27205416 Y NA RP11-209A2.1 OR2B2,LOC100131289,ZNF184 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-209A2.1 28338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27446506 27447382 27447356 Y NA ZNF184 ZNF184,HIST1H2AG,MIR3143,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,HIST1H2AH,PRSS16,LOC100131289,HIST1H2BN,HIST1H2AK,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,OR2B2,HIST1H3J,HIST1H2BO,HIST1H2AM K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF184 7609 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27655687 27656083 27655918 Y NA NA LOC100507173 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 HIST1H2BL 117626 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 27706104 27706357 27706299 Y NA NA NA NA NA NA HIST1H2BL 67352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr6 27740489 27740807 27740621 Y NA HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J NA NA NA NA HIST1H2BL 32902 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27759985 27760333 27760032 Y ZNF391,ZNF184,ZNF193,ZNF192,PGBD1,HIST1H2BN,HIST1H2AM,HIST1H3H HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN NA NA NA NA HIST1H2BL 13376 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 27862895 27863061 27863012 Y ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZKSCAN4,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 3692 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 27863298 27863662 27863535 Y ZKSCAN3,ZNF184,HIST1H2BL,HIST1H2AI,HIST1H3H,HIST1H2AJ,HIST1H2BM,ZNF323,ZNF193,ZNF192,ZKSCAN4,PGBD1,HIST1H4J,HIST1H4K,HIST1H2AK,HIST1H2BN,HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO HIST1H2AL,HIST1H1B,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H3J,HIST1H2AM,HIST1H2BO NA NA NA NA HIST1H2BO 4095 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 28072476 28072872 28072543 Y HIST1H4K,HIST1H2AK,ZNF165,ZSCAN16,ZNF192 ZNF165,ZSCAN12P1,ZSCAN16 NA NA NA NA ZSCAN12P1 15544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 28280351 28280639 28280495 Y NA PGBD1,ZKSCAN3 NA NA NA NA PGBD1 33037 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 28414953 28415259 28415025 Y NA ZSCAN12,ZSCAN23 NA NA NA NA ZSCAN23 5674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 28710805 28711035 28710922 Y NA NA NA NA NA NA SCAND3 128816 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 28805076 28805418 28805247 Y NA NA NA NA NA NA HCG14 56889 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 28956602 28956848 28956725 Y NA HCG15,ZNF311 NA NA NA NA HCG15 4622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 29932777 29932958 29932802 Y HLA-F,TRIM10,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,HLA-A HLA-K,HLA-A,HLA-J NA NA NA NA HLA-A 25740 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr6 30068638 30068845 30068662 Y NA ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 36152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr6 30069810 30070038 30069951 Y HLA-E,ABCF1,HLA-F,LOC554223,HLA-G,TRIM39-RPP21,TRIM39,TRIM39,TRIM26,PPP1R11,RNF39,RNF39 ZNRD1,ZNRD1-AS1,PPP1R11 NA NA NA NA PPP1R11 37324 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30177609 30178061 30177863 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 1143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30182160 30182533 30182417 Y NA TRIM26,HLA-L NA NA NA NA TRIM26 2956 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30247447 30247451 30247450 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 22086 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30254050 30254472 30254356 Y NA HLA-L,TRIM39,HCG18 NA NA NA NA HLA-L 28689 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30276337 30276699 30276532 Y ATAT1,ATAT1 TRIM39,HCG18,RPP21 NA NA NA NA TRIM39 15557 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30716597 30717062 30716912 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 PPP1R18,NRM,IER3,FLOT1,GTF2H4,VARS2,DDR1,DPCR1 IMR90 Hi-C 24141950 IER3 6266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30719576 30719814 30719695 Y IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30720004 30720713 30720325 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,NRM,PPP1R18,MDC1,FLOT1,IER3,C6orf136,DHX16,DDR1,VARS2,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 9673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 30731781 30732171 30732168 Y NA MDC1,TUBB,FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90 Hi-C 24141950 IER3 21450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30736850 30737361 30737156 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,ABCF1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,FLOT1,IER3 FLOT1,IER3 DPCR1,PPP1R18,SFTA2,CCHCR1,PSORS1C1,PSORS1C2,FLOT1,TUBB,IER3,MDC1,GTF2H4,DDR1,VARS2,C6orf15,PRRC2A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 26519 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30761567 30761766 30761739 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PRR3,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,PBMUCL1,HLA-C,FLOT1,IER3 NA FLOT1,C6orf15,PSORS1C1,DHX16,PPP1R18,TUBB,NRM,MDC1,DDR1,IER3,DPCR1,SFTA2,VARS2,C6orf136,GTF2H4,MUC22,PSORS1C3,TCF19,POU5F1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 IER3 51236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30787859 30788252 30788206 Y TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949,HLA-C,IER3 NA FLOT1,TUBB,VARS2,DHX16,IER3,DDR1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDR1 53946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 30923441 30923743 30923649 Y GNL1,CCHCR1,CCHCR1,DDR1 GTF2H4,VARS2 NA NA NA NA VARS2 49422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr6 31240851 31241006 31240942 Y NCR3,LY6G5B,LTB,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,ABHD16A,ABHD16A,HLA-C,HLA-B HLA-C,RPL3P2 NA NA NA NA HLA-C 2944 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 31276281 31276390 31276356 Y NA HLA-C,RPL3P2,HLA-B MUC22,PSORS1C1,C6orf15,PSORS1C2,CCHCR1,HCG26 IMR90 Hi-C 24141950 RPL3P2 30187 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 31705604 31706142 31705906 Y HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1B,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1 ABHD16A,DDAH2,CLIC1,VWA7 NA NA NA NA MSH5 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 31789672 31790268 31789876 Y NA VWA7,VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,NEU1 NA NA NA NA HSPA1B 3244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr6 32050642 32051035 32051003 Y LY6G6C,TNXB,PPT2,PPT2,TNXB TNXB,ATF6B,FKBPL NA NA NA NA TNXB 30076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 32081652 32082042 32081917 Y NA TNXB,ATF6B,FKBPL,PPT2,EGFL8 NA NA NA NA TNXB 541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 32427743 32428120 32427936 Y PRRT1 HLA-DRA NA NA NA NA HLA-DRA 22124 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 32577297 32577935 32577770 Y GPSM3,HLA-DRA,HLA-DRB5,TAP2,TAP1,PSMB9,PSMB8,PSMB8,HLA-DQB2,HLA-DQA2,HLA-DPB1,HLA-DPA1,HLA-DOB,HLA-DOA,HLA-DMB,HLA-DMA,BRD2,BRD2,BRD2,HLA-DRB1,HLA-DQB1,HLA-DQA1 HLA-DRB1 NA NA NA NA HLA-DRB1 21672 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 32783377 32783532 32783485 Y HLA-DQB1,HLA-DQA2,HLA-DQB2,TAPBP,RGL2,BRD2,BRD2,B3GALT4,TAP2,HLA-DOB TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP2 21025 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 32834766 32835076 32834920 Y BRD2,TAP2,PSMB8,PSMB8,TAP1,PSMB9 TAP2,TAPSAR1,PSMB9,PSMB8,TAP1 NA NA NA NA TAP1 15011 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 33538911 33539356 33539169 Y LEMD2,LEMD2,HLA-DPB1,RXRB,RPS18,B3GALT4,TAPBP,PHF1 BAK1,ITPR3 NA NA NA NA BAK1 6663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 33950913 33951144 33951041 Y NA NA NA NA NA NA LEMD2 196000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 34112239 34112588 34112446 Y PACSIN1,GRM4 NA MIR1275 IMR90 Hi-C 24141950 CYCSP55 72628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 34150537 34150894 34150814 Y HMGA1 CYCSP55 C6orf106,NUDT3,RPS10-NUDT3,PACSIN1,MNF1,ANKS1A,SPDEF,HMGA1,IP6K3,MLN,LEMD2,GRM4,UHRF1BP1,TAF11,SNRPC,C6orf1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CYCSP55 34322 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 34625381 34625487 34625387 Y HMGA1 C6orf106 NA NA NA NA C6orf106 37149 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 34992488 34992843 34992549 Y NA NA NA NA NA NA ANKS1A 137446 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 35152934 35153484 35153156 Y NA SCUBE3 UHRF1BP1,ANKS1A,SCUBE3,ZNF76,TCP11 IMR90 Hi-C 24141950 SCUBE3 26706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 35569141 35569999 35569809 Y FKBP5,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,FKBP5,FKBP5,ZNF76,DEF6 NA NA NA NA NA TEAD3 106288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 35875551 35875739 35875654 Y SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,MAPK13,BRPF3,SRPK1 SRPK1 NA NA NA NA SRPK1 11380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 36086314 36086741 36086595 Y SRPK1,SLC26A8,SLC26A8,SLC26A8,MAPK14,STK38,SRSF3,PXT1,KCTD20,BRPF3 NA NA NA NA NA BRPF3 75780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 36404249 36404468 36404378 Y MAPK14,PNPLA1,STK38 KCTD20 ETV7 IMR90 Hi-C 24141950 KCTD20 4076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 36737758 36737957 36737899 Y ETV7,ETV7,PXT1,PIM1 NA NA NA NA NA CPNE5 67821 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 36786044 36786391 36786334 Y NA CPNE5 NA NA NA NA CPNE5 19387 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37070053 37070857 37070460 Y CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2 NA PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 65122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr6 37104908 37105418 37105405 Y NA PIM1 PIM1,CPNE5,TMEM217,PPIL1,C6orf89,FGD2,TBC1D22B IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIM1 30561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37210643 37210874 37210721 Y TMEM217,TMEM217 TBC1D22B,TMEM217 NA NA NA NA TBC1D22B 12674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37269905 37270172 37270040 Y C6orf89,TBC1D22B TBC1D22B,TMEM217,RNF8 NA NA NA NA TMEM217 45974 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37484293 37484960 37484497 Y NA CCDC167 CCDC167,MDGA1,RNF8,FTSJD2,TBC1D22B,MIR4462,ZFAND3 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCDC167 18595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37522898 37523251 37523222 Y NA NA NA NA NA NA CCDC167 57200 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 37745135 37745338 37745265 Y NA ZFAND3 BTBD9,ZFAND3,FTSJD2,MDGA1 IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND3 39937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 38229881 38230014 38229948 Y NA NA NA NA NA NA BTBD9 375910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 39195802 39196179 39195967 Y KCNK5 KCNK5 NA NA NA NA KCNK5 576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 39280684 39281091 39280762 Y GLP1R,C6orf64,KCNK16,KCNK17,KCNK17 KCNK17 NA NA NA NA KCNK17 355 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 39393880 39394120 39394000 Y NA NA NA NA NA NA KCNK17 113551 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 39850347 39850811 39850571 Y NA MOCS1 NA NA NA NA MOCS1 49479 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 40215028 40215342 40215185 Y NA NA KIF6 IMR90 Hi-C 24141950 TDRG1 85351 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 40904550 40904902 40904649 Y UNC5CL NA APOBEC2,C6orf130,TSPO2,UNC5CL IMR90 Hi-C 24141950 NFYA 133782 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 41341728 41341773 41341752 Y FRS3 NA NA NA NA NA TREM1 89271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 41400166 41400378 41400291 Y FOXP4 NA FOXP4 IMR90,H1ESC Hi-C,5C 24141950,22955621 FOXP4 111786 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 41471691 41471833 41471786 Y NA FOXP4,RP11-328M4.2 FOXP4 IMR90 Hi-C 24141950 FOXP4 40331 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 41929474 41929675 41929644 Y NA MED20,BYSL NA NA NA NA BYSL 42548 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42013318 42013860 42013560 Y TFEB,TRERF1,CCND3 CCND3,TAF8 NA NA NA NA CCND3 2235 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42306418 42306926 42306742 Y UBR2,TRERF1 NA NA NA NA NA TRERF1 110863 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42409399 42409623 42409499 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 8166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42420719 42421067 42420926 Y NA TRERF1 NA NA NA NA TRERF1 2930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42515407 42515543 42515467 Y NA UBR2 TRERF1,GUCA1A,TAF8,GUCA1B,CCND3,C6orf132,MRPS10,UBR2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 UBR2 14257 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42694331 42694739 42694439 Y KLC4,KLC4,CUL9,TRERF1,C6orf226,PRPH2,TBCC ATP6V0CP3,TBCC NA NA NA NA ATP6V0CP3 1359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42735698 42735757 42735728 Y NA ATP6V0CP3,TBCC TBCC,KIAA0240,GUCA1A,PRPH2,UBR2,ATP6V0CP3,RPL7L1,C6orf226,CNPY3 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TBCC 23140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 42944777 42944970 42944923 Y NA CNPY3,RPL24P4,GNMT,PPP2R5D,MEA1,KLHDC3,RRP36 NA NA NA NA PEX6 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 43878497 43878687 43878563 Y GTPBP2,MRPS18A NA NA NA NA NA VEGFA 142576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 43978439 43978901 43978686 Y NFKBIE NA NA NA NA NA RP5-1120P11.1 61488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 43979820 43980209 43980006 Y NFKBIE,MAD2L1BP NA NA NA NA NA RP5-1120P11.1 60180 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 44002049 44002379 44002368 Y NFKBIE,GTPBP2 RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 38010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44009201 44009753 44009484 Y SLC35B2,MRPL14 RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 30636 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44011469 44011879 44011690 Y NA RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 28510 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44011946 44012485 44012109 Y NA RP5-1120P11.1 RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA IMR90 Hi-C 24141950 RP5-1120P11.1 27904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 44630454 44631299 44630653 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 277192 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44632359 44632804 44632603 Y NA NA CLIC5,RUNX2,SUPT3H,CDC5L IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 279097 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44634916 44635472 44635214 Y NA NA CLIC5,SUPT3H,RUNX2 IMR90 Hi-C 24141950 CDC5L 281654 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44783475 44783845 44783660 Y NA NA NA NA NA NA CDC5L 430213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44823725 44823846 44823786 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 470048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 44953084 44953474 44953278 Y NA NA NA NA NA NA RUNX2 340420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45301191 45301441 45301316 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA RUNX2 7297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45322429 45322774 45322605 Y NA RUNX2,SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 20916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45390987 45391259 45391097 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 47297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45392235 45392572 45392528 Y RUNX2 SUPT3H NA NA NA NA SUPT3H 48545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45503403 45503548 45503462 Y RUNX2 NA NA NA NA NA SUPT3H 159713 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 45503698 45503963 45503769 Y NA NA NA NA NA NA SUPT3H 160008 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 45618234 45618676 45618425 Y RUNX2 NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90 Hi-C 24141950 SUPT3H 274544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 45623562 45623937 45623654 Y NA NA RUNX2,SUPT3H,CLIC5 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 SUPT3H 279872 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 46291119 46291322 46291276 Y CLIC5,ENPP4,ENPP5,SLC25A27,RCAN2 NA NA NA NA NA ENPP5 154411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 47220408 47220656 47220576 Y NA NA NA NA NA NA TNFRSF21 54985 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 47382599 47382792 47382666 Y NA NA CD2AP IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CD2AP 60733 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 48967422 48967791 48967607 Y MUT NA NA NA NA NA MUT 461113 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 52217307 52217701 52217502 Y NA PAQR8 PAQR8,MCM3,EFHC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PAQR8 6518 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 52261634 52261809 52261784 Y EFHC1 PAQR8,EFHC1 NA NA NA NA EFHC1 21297 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 52376478 52376751 52376615 Y NA NA NA NA NA NA TRAM2 62962 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 52377018 52377269 52377212 Y GSTA5,TRAM2 NA NA NA NA NA TRAM2 62444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 52463140 52463494 52463299 Y NA TRAM2 EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TRAM2 23427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 53167531 53167800 53167691 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 44147 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 53195071 53195341 53195324 Y NA ELOVL5 NA NA NA NA ELOVL5 16606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 53224045 53224723 53224315 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 12098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 53225493 53225821 53225675 Y NA ELOVL5 ELOVL5 K562 ChIA-PET 22265404 ELOVL5 13546 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 53376137 53376766 53376496 Y NA NA NA NA NA NA GCLC 103002 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 53412768 53413364 53413026 Y GCLC NA NA NA NA NA GCLC 66404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 56296413 56296568 56296543 Y NA NA NA NA NA NA BEND6 521205 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 57478986 57479248 57479117 Y NA NA NA NA NA NA PRIM2 301383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 58778631 58779245 58778717 Y NA NA NA NA NA NA GUSBP4 524062 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 64151294 64151779 64151706 Y NA NA NA NA NA NA PTP4A1 77887 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr6 67322312 67322659 67322486 Y NA NA NA NA NA NA PHF3 2978587 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 70489653 70490034 70489967 Y NA LMBRD1 NA NA NA NA LMBRD1 14969 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 72114373 72114910 72114587 Y NA LINC00472 NA NA NA NA LINC00472 13562 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 72188537 72188902 72188719 Y NA NA OGFRL1 IMR90 Hi-C 24141950 LINC00472 60065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 73329727 73330142 73329822 Y NA KCNQ5 NA NA NA NA KCNQ5 207 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 73867627 73867898 73867877 Y NA NA NA NA NA NA RP11-398K22.12 103040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 73987583 73987923 73987651 Y NA RP11-398K22.12,KHDC1 KHDC1L IMR90 Hi-C 24141950 RP11-398K22.12 16645 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 74289769 74290568 74290415 Y MB21D1,SLC17A5,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 58249 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 74295249 74295764 74295450 Y MB21D1,CD109,CD109,EEF1A1 NA NA NA NA NA EEF1A1 63729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 76467215 76467333 76467230 Y NA MYO6 NA NA NA NA MYO6 10306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 79718228 79718616 79718429 Y PHIP NA NA NA NA NA PHIP 67337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 79753259 79753564 79753411 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 32389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 79779425 79779709 79779568 Y NA PHIP NA NA NA NA PHIP 6244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 81197510 81197656 81197595 Y NA NA NA NA NA NA BCKDHB 383146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 82956000 82956181 82956090 Y NA IBTK NA NA NA NA IBTK 529 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 83546132 83546541 83546207 Y NA NA UBE3D,IBTK IMR90 Hi-C 24141950 DOPEY1 228844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 83893224 83893469 83893362 Y RWDD2A,PGM3,PGM3 RWDD2A,PGM3 NA NA NA NA RWDD2A 7629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 86113432 86113601 86113525 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 44208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 86114496 86114829 86114663 Y NT5E NT5E NT5E,SNX14 IMR90 Hi-C 24141950 NT5E 42980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr6 87897430 87897787 87897609 Y NA ZNF292 NA NA NA NA ZNF292 36879 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 88441576 88441861 88441705 Y AKIRIN2 AKIRIN2 AKIRIN2,AKIRIN2-AS1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AKIRIN2 31649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 89440448 89440768 89440686 Y NA NA NA NA NA NA RNGTT 230580 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 89744998 89746016 89745827 Y UBE2J1,PNRC1 PNRC1 PNRC1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PNRC1 42454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 89796215 89796534 89796231 Y NA PNRC1,SRSF12 NA NA NA NA PNRC1 7745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 90878882 90879095 90878991 Y NA NA NA NA NA NA BACH2 125532 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 93802046 93802077 93802062 Y NA NA NA NA NA NA MANEA 2221342 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 99777728 99778013 99777871 Y POU3F2,C6orf168 NA NA NA NA NA COQ3 62067 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 99901572 99901766 99901669 Y NA RP11-98I9.4,PNISR NA NA NA NA PNISR 30365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 100012296 100012415 100012356 Y NA USP45,CCNC,PRDM13 NA NA NA NA CCNC 2434 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 101149750 101149957 101149936 Y NA NA NA NA NA NA RP1-121G13.3 173598 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 105388915 105389637 105389155 Y HACE1 NA NA NA NA NA HACE1 83121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 106049296 106049799 106049571 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 200337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 106057484 106057635 106057546 Y PRDM1 NA PRDM1,ATG5 IMR90 Hi-C 24141950 PREP 208525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 106612334 106612792 106612510 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 80139 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 106645133 106645598 106645505 Y PRDM1 NA NA NA NA NA PRDM1 112938 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 108169525 108169909 108169631 Y NA NA NA NA NA NA SEC63 107484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 109011028 109011405 109011217 Y NA NA NA NA NA NA FOXO3 131990 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 109288163 109288636 109288487 Y FOXO3,SMPD2,MICAL1 NA NA NA NA NA RP11-249L21.4 61087 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 112544295 112544605 112544462 Y NA LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 29536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 112552727 112553228 112552920 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 20913 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 112570641 112571001 112570894 Y LAMA4 LAMA4 NA NA NA NA LAMA4 3140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 115163170 115163515 115163320 Y NA NA NA NA NA NA HDAC2 832698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 117804575 117804878 117804739 Y NA DCBLD1 NA NA NA NA DCBLD1 31595 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 119029991 119030657 119030634 Y C6orf204,MCM9,C6orf204 CEP85L NA NA NA NA CEP85L 753 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 119635586 119635800 119635693 Y MCM9 MAN1A1 NA NA NA NA MAN1A1 33126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 119896932 119897123 119897095 Y NA NA NA NA NA NA MAN1A1 228006 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 121398601 121398951 121398918 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-35P 374316 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 121399720 121399938 121399829 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-35P 373329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 122172452 122172679 122172567 Y NA NA GJA1 IMR90 Hi-C 24141950 RNU4-35P 399185 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 122769670 122769957 122769896 Y HSF2,PKIB SERINC1,PKIB NA NA NA NA SERINC1 21010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 125420883 125421200 125421024 Y NA TPD52L1 NA NA NA NA TPD52L1 16995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 126267356 126267782 126267584 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 8145 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 126279126 126279509 126279187 Y NCOA7 HINT3,TRMT11 NA NA NA NA HINT3 3199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 127981338 127981402 127981371 Y NA NA NA NA NA NA SOGA3 143192 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 128793943 128794334 128794205 Y NA PTPRK NA NA NA NA PTPRK 45536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 130004742 130004922 130004817 Y NA ARHGAP18 NA NA NA NA ARHGAP18 24448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 133020075 133020153 133020114 Y NA NA NA NA NA NA RPS12 113427 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 133843297 133843543 133843427 Y NA NA NA NA NA NA EYA4 283561 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 134761528 134761869 134761739 Y SGK1,SGK1 NA NA NA NA NA SGK1 124278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 135344059 135344242 135344151 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 77952 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 135352829 135352991 135352910 Y NA NA NA NA NA NA HBS1L 69203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 136729350 136729610 136729525 Y MAP7,MAP7,MAP7,MAP7,MAP7 NA NA NA NA NA BCLAF1 120361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 137082760 137083090 137082822 Y MAP3K5 MAP3K5 NA NA NA NA MAP3K5 28566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 139350632 139351255 139350885 Y NA REPS1 NA NA NA NA REPS1 43234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 142644630 142644955 142644766 Y NA GPR126 NA NA NA NA GPR126 23639 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 143247398 143248213 143248022 Y HIVEP2 HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 16125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 143248323 143248614 143248469 Y NA HIVEP2 NA NA NA NA HIVEP2 15724 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 144066654 144067070 144066822 Y NA NA NA NA NA NA LTV1 95411 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 144537313 144537754 144537668 Y NA TPT1P4 STX11,SF3B5 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 TPT1P4 17211 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 145131744 145132215 145131879 Y NA NA NA NA NA NA TPT1P4 611642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 146866760 146867250 146866919 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 3931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 146867560 146867942 146867733 Y RAB32 RAB32 NA NA NA NA RAB32 4731 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 147643373 147644201 147643793 Y NA NA NA NA NA NA YAP1P1 81824 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 149551907 149552171 149551992 Y NA RP1-111D6.3,TAB2 UST,TAB2 IMR90 Hi-C 24141950 TAB2 14130 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 149802955 149803363 149803024 Y LATS1,KATNA1,TAB2,PPIL4,ZC3H12D ZC3H12D NA NA NA NA ZC3H12D 834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 150183311 150183513 150183478 Y NA LRP11 NA NA NA NA LRP11 686 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 151178746 151179109 151178841 Y NA MTHFD1L NA NA NA NA MTHFD1L 5576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 155306251 155306499 155306375 Y TIAM2 NA TIAM2,TFB1M,CLDN20 IMR90 Hi-C 24141950 TIAM2 154420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 155492232 155492854 155492387 Y SCAF8 NA NA NA NA NA RP11-477D19.2 83004 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 155590165 155590417 155590245 Y NA RP11-477D19.2,TFB1M NA NA NA NA RP11-477D19.2 14307 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 157007979 157008724 157008580 Y ARID1B NA MIR4466,ARID1B,NOX3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 88339 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 157041058 157041538 157041248 Y ARID1B NA ARID1B,MIR4466 K562,IMR90,MCF7 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ARID1B 55525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 157158909 157159282 157158999 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 61846 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 157342507 157343524 157343342 Y ARID1B,ZDHHC14 NA NA NA NA NA ARID1B 245444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 157411919 157412211 157412008 Y NA NA NA NA NA NA ARID1B 314856 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 157542479 157542718 157542566 Y NA NA NA NA NA NA TMEM242 199915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr6 157738321 157738749 157738506 Y NA TMEM242 NA NA NA NA TMEM242 3884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 158254729 158255396 158255020 Y NA SNX9 NA NA NA NA SNX9 12433 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 158424430 158424803 158424679 Y SYNJ2 SYNJ2 NA NA NA NA SYNJ2 23542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 158478416 158478907 158478642 Y NA NA NA NA NA NA SYNJ2 77528 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 158481547 158481708 158481650 Y SNX9 NA NA NA NA NA SYNJ2 80659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 159270971 159271326 159271104 Y TAGAP,SYTL3,EZR,EZR EZR NA NA NA NA EZR 32527 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 159284894 159285253 159285074 Y NA EZR OSTCP1 K562 ChIA-PET 22265404 EZR 46450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 159360638 159360649 159360643 Y TAGAP NA EZR IMR90 Hi-C 24141950 RSPH3 58570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 160135538 160135989 160135680 Y IGF2R,SOD2,WTAP,WTAP WTAP,ACAT2,SOD2 LOC100129518,ACAT2,WTAP,SOD2 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 WTAP 8628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 161855973 161856365 161856002 Y NA NA NA NA NA NA AGPAT4 162880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 163833938 163834442 163834340 Y NA QKI NA NA NA NA QKI 906 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 163976539 163976874 163976679 Y NA NA NA NA NA NA QKI 143507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 166422302 166422862 166422743 Y NA NA NA NA NA NA SFT2D1 331217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 166711154 166711571 166711225 Y PRR18 SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 42508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 166795008 166795404 166795174 Y NA SFT2D1 NA NA NA NA SFT2D1 40929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr6 167115544 167115618 167115576 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA2 202321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 169308928 169309266 169309084 Y THBS2 NA WDR27,LINC00574,PHF10,C6orf70,PSMB1,SMOC2,LINC00242 IMR90 Hi-C 24141950 THBS2 342873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr6 169827902 169828288 169828095 Y NA NA NA NA NA NA THBS2 175763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 170491997 170492052 170492021 Y NA NA NA NA NA NA DLL1 105509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 170600439 170600921 170600644 Y NA DLL1,FAM120B NA NA NA NA FAM120B 2648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr6 170692180 170692479 170692329 Y NA NA NA NA NA NA FAM120B 94389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 89354 89662 89513 Y NA NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57935 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 90161 90450 90245 Y FAM20C NA FAM20C,HEATR2 IMR90 Hi-C 24141950 AC093627.10 57147 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 373094 373351 373247 Y PRKAR1B NA FLJ44511,PDGFA MCF7 ChIA-PET 22265404 AC093627.12 180914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 652642 652893 652768 Y PRKAR1B,ADAP1 AC147651.4 NA NA NA NA AC147651.4 11820 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 964406 964697 964471 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 28346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 965289 965600 965408 Y ZFAND2A,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 27443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 968255 968622 968448 Y ZFAND2A,COX19,ADAP1 ADAP1,COX19 NA NA NA NA ADAP1 24421 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 1329910 1330257 1330187 Y NA NA UNCX IMR90 Hi-C 24141950 ZFAND2A 131515 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 1416814 1417157 1416984 Y NA NA NA NA NA NA MICALL2 79981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 1560213 1560697 1560426 Y C7orf50,TMEM184A,PSMG3,PSMG3,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 7653 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 1571273 1571500 1571366 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 2923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 1572262 1572844 1572636 Y ZFAND2A,MAFK INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3 NA NA NA NA MAFK 3912 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 1945683 1945719 1945693 Y NA NA NA NA NA NA AC074389.9 165756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 2077835 2078163 2078150 Y NA NA NA NA NA NA MAD1L1 192715 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 2143904 2144149 2144041 Y LFNG NA NA NA NA NA MAD1L1 126729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 2681143 2681305 2681209 Y SNX8,LFNG,LFNG,TTYH3 TTYH3,AMZ1 NA NA NA NA TTYH3 11558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 2860040 2860490 2860319 Y LFNG,LFNG,GNA12 AC006028.11,GNA12 NA NA NA NA AC006028.11 12765 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 2903227 2903785 2903462 Y LFNG,LFNG,TTYH3,GNA12 AC006028.11,GNA12 GNA12 MCF7 ChIA-PET 22265404 GNA12 21269 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 3283908 3284312 3284215 Y SDK1 NA SDK1 IMR90 Hi-C 24141950 SDK1 54768 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 4660172 4660397 4660258 Y NA FOXK1 SDK1,FOXK1 IMR90 Hi-C 24141950 FOXK1 20991 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 4681329 4681565 4681443 Y MMD2 NA SDK1,FOXK1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 FOXK1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 4764796 4765177 4765030 Y KIAA0415 NA NA NA NA NA FOXK1 83408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr7 4784652 4785031 4784763 Y NA NA NA NA NA NA FOXK1 103264 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 5594554 5594977 5594837 Y WIPI2 FBXL18,ACTB,FSCN1 RNF216,FBXL18,TNRC18 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 6438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 5609541 5610012 5609880 Y SLC29A4,TNRC18,FBXL18,FSCN1 ACTB,FSCN1 RNF216,FSCN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ACTB 8126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 5635420 5636238 5635862 Y NA ACTB,FSCN1 NA NA NA NA FSCN1 4981 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 5724329 5724708 5724518 Y NA NA NA NA NA NA FSCN1 93890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 5787686 5787972 5787829 Y NA RNF216 NA NA NA NA RNF216 31398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 7996944 7997264 7997104 Y NA GLCCI1 LOC729852,GLCCI1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 GLCCI1 9161 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 8300852 8301132 8300960 Y ICA1,ICA1,ICA1 AC007009.1,ICA1 NA NA NA NA ICA1 535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 8550473 8550803 8550530 Y NA NA NA NA NA NA ICA1 250156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 12297328 12297575 12297487 Y ARL4A TMEM106B NA NA NA NA TMEM106B 48461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 12758831 12759023 12758905 Y ARL4A ARL4A ARL4A K562 ChIA-PET 22265404 ARL4A 34350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 14702275 14702543 14702458 Y NA NA NA NA NA NA ETV1 673225 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 17029591 17029925 17029620 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 TSPAN13 238431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr7 17360383 17360757 17360401 Y NA AHR,AC003075.4 NA NA NA NA AC003075.4 23402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 17564000 17564574 17564249 Y NA NA AHR IMR90 Hi-C 24141950 AC003075.4 227019 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 18563504 18563902 18563528 Y HDAC9,HDAC9,HDAC9 NA NA NA NA NA SNX13 585380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 20346814 20347223 20346902 Y NA ITGB8 TMEM196,MACC1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ITGB8 21102 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 20513866 20514196 20514029 Y ITGB8 NA TMEM196 IMR90 Hi-C 24141950 ITGB8 145541 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 20837430 20837819 20837731 Y SP8 SP8,RPL23P8 SP8 K562 ChIA-PET 22265404 SP8 12925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 21928607 21928632 21928620 Y NA NA NA NA NA NA CDCA7L 55070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 22626962 22627257 22627168 Y NA STEAP1B NA NA NA NA STEAP1B 43287 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 23229571 23229876 23229614 Y NA NUPL2,GPNMB NA NA NA NA NUPL2 10125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 23510676 23511223 23510889 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 NA NA NA NA IGF2BP3 2590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 23513815 23514383 23514045 Y NUPL2,C7orf30,IGF2BP3 IGF2BP3 MALSU1 K562 ChIA-PET 22265404 IGF2BP3 5729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr7 24860577 24860798 24860662 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53333 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 24861129 24861331 24861204 Y C7orf31,DFNA5 NA NA NA NA NA DFNA5 53885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 24924727 24925102 24925076 Y NA NA NA NA NA NA OSBPL3 94151 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 25009429 25009748 25009721 Y NA OSBPL3 NA NA NA NA OSBPL3 9505 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 25064852 25065012 25064919 Y NA OSBPL3 OSBPL3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 OSBPL3 45599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 25896245 25896461 25896419 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 293399 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 25896515 25897081 25896801 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292779 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 25897167 25897316 25897282 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 292544 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 25901745 25902114 25902023 Y NA NA HOXA9,HOXA10-HOXA9,SKAP2,NFE2L3,HNRNPA2B1,CBX3,HOTAIRM1,HOXA3,HOXA2,HOXA1,HOXA5,HOXA6,HOXA7,HOXA4,HOXA-AS3,EVX1,HOXA11,HOXA-AS5,SNX10 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NFE2L3 287746 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 25990725 25991211 25991018 Y NA NA NA NA NA NA NFE2L3 198649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 26317891 26318244 26318068 Y NA AC010677.5,SNX10 HNRNPA2B1,CBX3 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 AC010677.5 4076 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 26589150 26589521 26589235 Y SNX10 NA LOC441204,KIAA0087 IMR90 Hi-C 24141950 AC004540.5 152937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 26815721 26816027 26815980 Y SNX10,SNX10,SKAP2 NA NA NA NA NA SKAP2 216831 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27143635 27143783 27143725 Y NA HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3 NA NA NA NA HOXA-AS2 1613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27176174 27176251 27176224 Y HOXA3,HOXA3,HOXA4,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA11 NA NA NA NA HOXA5 5036 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27176942 27177056 27176971 Y HOXA3,HOXA5 HOTAIRM1,HOXA1,HOXA-AS2,HOXA-AS3,HOXA4,HOXA5,HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA11 NA NA NA NA HOXA5 4231 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27231816 27231998 27231907 Y HOXA10,HOXA11,HOXA13 HOXA6,HOXA3,HOXA7,HOXA11,HOTTIP NA NA NA NA HOTTIP 4196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27531639 27532015 27531830 Y NA EIF4HP1 NA NA NA NA EIF4HP1 35171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 27573880 27573985 27573933 Y NA NA NA NA NA NA EIF4HP1 77412 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 28076890 28077172 28076964 Y CREB5 NA NA NA NA NA JAZF1-AS1 140769 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 28190212 28190323 28190268 Y NA JAZF1-AS1,JAZF1 NA NA NA NA JAZF1-AS1 27618 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 30204020 30204306 30204163 Y ZNRF2 NA NA NA NA NA ZNRF2 117617 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 32026855 32027150 32027002 Y NA NA NA NA NA NA PDE1C 309791 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 32944853 32945232 32945065 Y KBTBD2 KBTBD2,RP9P,FKBP9 NA NA NA NA KBTBD2 13110 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 33316298 33316594 33316442 Y NA NA NA NA NA NA BBS9 149442 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 33708733 33708947 33708840 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 233576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 34173056 34173436 34173156 Y BMPER NA NA NA NA NA BMPER 230533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 34429750 34429913 34429832 Y NA NA NA NA NA NA BMPER 487227 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 35075861 35076697 35076367 Y NA NA NA NA NA NA DPY19L2P1 147237 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr7 36480174 36480717 36480189 Y NA NA NA NA NA NA KIAA0895 52440 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 36555269 36555573 36555424 Y ELMO1,AOAH,EEPD1 NA NA NA NA NA KIAA0895 127535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 37105106 37105894 37105654 Y AOAH,ELMO1,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA AOAH 342952 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 37221797 37222057 37221923 Y NA NA NA NA NA NA ELMO1 264795 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 37370501 37370793 37370647 Y GPR141,ELMO1,ELMO1 NA NA NA NA NA ELMO1 116059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 37447702 37448057 37447969 Y NA ELMO1 NA NA NA NA ELMO1 38795 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 38750267 38750277 38750273 Y NA NA NA NA NA NA VPS41 219717 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 39454182 39454306 39454268 Y POU6F2 NA NA NA NA NA YAE1D1 149669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 40088776 40089159 40088837 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 101140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 40591236 40591497 40591392 Y NA NA NA NA NA NA CDK13 603600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 41926602 41926763 41926636 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 185896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 41927130 41927355 41927263 Y NA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 186424 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 41951393 41951863 41951630 Y INHBA NA LOC285954,C7orf10,INHBA IMR90 Hi-C 24141950 INHBA 210687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 42533163 42533415 42533331 Y NA NA GLI3 IMR90 Hi-C 24141950 GLI3 257694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 43625293 43625372 43625313 Y URGCP,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 4936 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43644873 43645023 43645002 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 24516 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43652779 43653072 43652905 Y POLM,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 32422 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43654812 43655175 43654945 Y POLM,DBNL,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 34455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43657815 43658085 43657951 Y POLM,STK17A,URGCP STK17A NA NA NA NA STK17A 37458 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 43659947 43660692 43660336 Y DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 39590 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43670120 43670185 43670135 Y POLM,DBNL,STK17A STK17A NA NA NA NA STK17A 49763 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43796405 43796790 43796474 Y BLVRA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43801940 43802267 43802061 Y NA BLVRA NA NA NA NA BLVRA 5661 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43912365 43912715 43912516 Y NA MRPS24 NA NA NA NA MRPS24 4873 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 43959007 43959429 43959215 Y NA URGCP,UBE2D4 NA NA NA NA URGCP 4581 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 44855333 44855416 44855373 Y TBRG4,H2AFV PPIA,H2AFV NA NA NA NA PPIA 21054 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 44934410 44934613 44934565 Y OGDH,ZMIZ2,PURB H2AFV,PURB TBRG4,OGDH,PURB IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PURB 11450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 46072625 46072971 46072717 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 113152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 46184955 46185274 46185142 Y NA NA NA NA NA NA IGFBP3 225482 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 46803788 46804144 46803966 Y NA NA IGFBP1,IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 203156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 46920965 46921354 46921105 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 85946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47092629 47092731 47092679 Y NA NA IGFBP3 IMR90 Hi-C 24141950 AC004870.4 85329 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47293209 47293414 47293276 Y NA NA NA NA NA NA AC004870.4 285909 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 47390589 47390737 47390670 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 229419 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47391456 47391672 47391564 Y C7orf65 NA NA NA NA NA TNS3 228484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47514732 47515208 47514929 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 104948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 47517591 47517776 47517700 Y NA NA NA NA NA NA TNS3 102380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47521562 47522093 47521877 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 98063 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 47533820 47533921 47533853 Y HUS1 NA NA NA NA NA TNS3 86235 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47610205 47610436 47610283 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 9720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47611156 47611689 47611507 Y C7orf69,TNS3 TNS3 NA NA NA NA TNS3 8467 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr7 47612587 47612873 47612749 Y NA TNS3 NA NA NA NA TNS3 7283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 47620098 47620164 47620135 Y TNS3 NA NA NA NA NA TNS3 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 47631233 47631542 47631345 Y C7orf69,TNS3 TNS3 TNS3,LINC00525,C7orf69,PKD1L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 TNS3 11077 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47691174 47691510 47691360 Y C7orf69,TNS3,C7orf65 NA TNS3,PKD1L1,LINC00525,C7orf69 IMR90 Hi-C 24141950 TNS3 71018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 47823605 47823820 47823740 Y TNS3 C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 9069 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 47826128 47826596 47826342 Y NA C7orf69 NA NA NA NA C7orf69 6293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 48031393 48031616 48031481 Y HUS1 HUS1,C7orf57 HUS1 K562 ChIA-PET 22265404 HUS1 14215 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 48126389 48126700 48126545 Y NA UPP1 NA NA NA NA UPP1 164 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 48294708 48294972 48294840 Y HUS1,UPP1,UPP1 NA NA NA NA NA ABCA13 85653 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 53130490 53130791 53130640 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-14P 300960 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55063666 55063958 55063856 Y EGFR EGFR EGFR IMR90 Hi-C 24141950 EGFR 20756 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55132578 55133258 55132929 Y SEC61G,EGFR EGFR NA NA NA NA EGFR 47864 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 55155188 55155533 55155358 Y EGFR NA NA NA NA NA EGFR 70474 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55200352 55201043 55200686 Y SEC61G,EGFR NA NA NA NA NA EGFR 115638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 55201472 55201858 55201601 Y SEC61G NA NA NA NA NA EGFR 116758 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 55235458 55235690 55235573 Y NA NA NA NA NA NA EGFR 150744 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55322570 55322956 55322611 Y EGFR NA EGFR,SEC61G IMR90 Hi-C 24141950 LANCL2 108185 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr7 55436942 55437154 55437048 Y NA LANCL2 NA NA NA NA LANCL2 5801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55529793 55530311 55530129 Y ZNF713,VOPP1 NA NA NA NA NA LANCL2 98652 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 55543241 55543436 55543358 Y VOPP1 NA NA NA NA NA VOPP1 95245 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 55615946 55616205 55616135 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 22476 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 55638699 55638887 55638779 Y VOPP1 VOPP1 NA NA NA NA VOPP1 18 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 56013517 56013601 56013542 Y ZNF713 GBAS,MRPS17 NA NA NA NA GBAS 3885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 56243524 56243790 56243559 Y LOC389493 NA NA NA NA NA NUPR1L 61431 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 57471842 57471971 57471867 Y NA NA NA NA NA NA NUPR1L 1289749 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 57639323 57639702 57639567 Y ZNF479,ZNF716 NA NA NA NA NA NUPR1L 1457230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 57706434 57706786 57706770 Y ZNF716 NA NA NA NA NA NUPR1L 1524341 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 61968807 61969730 61969008 Y NA NA NA NA NA NA RP11-340I6.8 1389471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 63767130 63767234 63767166 Y NA ZNF736 NA NA NA NA ZNF736 1293 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 63924105 63924304 63924148 Y NA HNRNPCP7 NA NA NA NA HNRNPCP7 34899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 65762762 65763060 65762890 Y RABGEF1,KCTD7 NA NA NA NA NA TPST1 94576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 65878387 65878723 65878560 Y RABGEF1,KCTD7 NA ASL,CRCP,TPST1,LINC00174 IMR90 Hi-C 24141950 GS1-124K5.3 77830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 66056218 66056609 66056384 Y NA KCTD7 KCTD7 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 KCTD7 35259 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 66120269 66120628 66120390 Y RABGEF1,KCTD7 KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1 NA NA NA NA RP4-756H11.3 2744 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 66206459 66206659 66206557 Y KCTD7,C7orf42,RABGEF1 NA NA NA NA NA RABGEF1 61308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 66343310 66343680 66343495 Y NA NA C7orf42 IMR90 Hi-C 24141950 TYW1 114480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 67219684 67219936 67219811 Y NA NA NA NA NA NA RP4-736H5.3 59668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr7 72929530 72929887 72929777 Y NA BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 4721 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 72939749 72940060 72940006 Y BAZ1B BAZ1B,BCL7B NA NA NA NA BAZ1B 5141 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73015142 73015298 73015257 Y NA BCL7B,TBL2,MLXIPL NA NA NA NA MLXIPL 21575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73062013 73062614 73062579 Y BAZ1B,ABHD11,MLXIPL,STX1A MLXIPL,WBSCR22,DNAJC30 MLXIPL,MIR4284,WBSCR22,STX1A IMR90 Hi-C 24141950 MLXIPL 25140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 73180066 73180446 73180256 Y NA STX1A,ABHD11,CLDN3,CLDN4 NA NA NA NA CLDN3 2154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73641053 73641366 73641100 Y LIMK1,LAT2 RFC2 NA NA NA NA RFC2 25408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73686776 73686884 73686792 Y LAT2 RFC2,CLIP2 RFC2,LAT2,CLIP2 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CLIP2 14921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73694024 73694283 73694118 Y LAT2 RFC2,CLIP2 CLIP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLIP2 7522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 73704690 73704803 73704747 Y CLIP2 RFC2,CLIP2 NA NA NA NA CLIP2 2885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 74020929 74021149 74021053 Y NA GTF2I NA NA NA NA GTF2I 48845 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 74064444 74064957 74064539 Y GTF2IRD2B,LAT2 GTF2I NA NA NA NA GTF2I 5037 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 74138320 74138615 74138328 Y NA NA NA NA NA NA GTF2I 68326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 75199057 75199167 75199108 Y POR PMS2P3 NA NA NA NA PMS2P3 43579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 75253450 75253956 75253637 Y POR NA NA NA NA NA PMS2P3 97972 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 75268782 75269322 75269061 Y NA NA NA NA NA NA HIP1 96958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 75354773 75355120 75354947 Y NA HIP1 NA NA NA NA HIP1 11160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 75465283 75465439 75465360 Y MDH2 CCL26,RHBDD2 STYXL1,MDH2,HIP1,CCL26,TMEM120A,POR IMR90 Hi-C 24141950 RHBDD2 4481 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 75567331 75567651 75567437 Y POR POR NA NA NA NA POR 40813 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 75795833 75796053 75795969 Y RHBDD2,POR NA SRRM3,HSPB1,MDH2,STYXL1 IMR90 Hi-C 24141950 MDH2 120464 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 75923846 75924306 75924205 Y HSPB1 HSPB1 NA NA NA NA HSPB1 5555 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 75947305 75947626 75947472 Y RHBDD2,SRRM3 HSPB1,YWHAG NA NA NA NA HSPB1 17444 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 76009173 76009680 76009431 Y POR YWHAG,ZP3 NA NA NA NA ZP3 15155 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 77039475 77039927 77039691 Y PTPN12,PTPN12,PION NA NA NA NA NA PTPN12 124665 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 77177634 77177834 77177685 Y FGL2,PION,PTPN12,PTPN12 PTPN12 NA NA NA NA PTPN12 13042 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 85711087 85711321 85711204 Y NA NA NA NA NA NA SEMA3D 896916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 86948267 86948659 86948457 Y CROT TP53TG1,CROT NA NA NA NA TP53TG1 24172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 90600966 90601241 90601095 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 290542 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 90861359 90861732 90861539 Y NA FZD1 NA NA NA NA FZD1 30051 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 91195125 91195302 91195221 Y NA NA NA NA NA NA FZD1 303342 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 91206328 91206484 91206406 Y NA NA NA NA NA NA MTERF 301550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92233387 92233691 92233548 Y NA FAM133B FAM133B MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 FAM133B 15679 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92271044 92271426 92271360 Y SAMD9 NA NA NA NA NA FAM133B 53336 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92324544 92325563 92325510 Y NA NA FAM133B IMR90 Hi-C 24141950 FAM133B 106836 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92373404 92373742 92373580 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 90055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92382003 92382200 92382102 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 81597 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92383173 92383232 92383216 Y NA NA NA NA NA NA AC002454.1 80565 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92384322 92384817 92384698 Y CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1 78980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92439060 92439368 92439205 Y PEX1,C7orf64,FAM133B,SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 24429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92459714 92460134 92460069 Y SAMD9 AC002454.1,CDK6 NA NA NA NA AC002454.1 3663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 92463754 92464079 92463922 Y CDK6,CDK6 NA NA NA NA NA AC002454.1,CDK6 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 94021237 94021945 94021560 Y NA NA NA NA NA NA COL1A2 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 94284072 94284624 94284343 Y NA SGCE,PEG10 NA NA NA NA PEG10 435 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 95030354 95030375 95030365 Y NA PON1,PON3,PON2 NA NA NA NA PON3 6674 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 95070230 95070589 95070236 Y PON1,PON3,PDK4 PON1,PON3,PON2 PON2 MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 PON2 7720 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 95861904 95862185 95862172 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 87274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 95877265 95877280 95877275 Y NA NA NA NA NA NA SLC25A13 72179 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 98973055 98973209 98973129 Y ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B ARPC1B,BUD31,PDAP1 NA NA NA NA ARPC1B 3183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 99094567 99094648 99094634 Y NA PTCD1,ATP5J2-PTCD1,ATP5J2,ZNF789,ZNF394,ZKSCAN5 NA NA NA NA ZNF394 1299 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 99678619 99678725 99678657 Y NA ZSCAN21,ZNF3,COPS6,AP4M1,MCM7,CNPY4,TAF6,MBLAC1,RP11-506M12.1 NA NA NA NA ZNF3 448 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 99957855 99958254 99957887 Y NA PILRB,PMS2P1 NA NA NA NA PMS2P1 20324 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 99961767 99962035 99961969 Y NA PILRB,PMS2P1 PILRA IMR90 Hi-C 24141950 PMS2P1 24236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 100142246 100142436 100142312 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 7412 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 100143295 100143664 100143516 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4 NA NA NA NA AGFG2 8461 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 100167857 100168189 100168134 Y NA AGFG2,RP11-44M6.3,LRCH4,PCOLCE,PCOLCE-AS1,MOSPD3 NA NA NA NA RP11-44M6.3 2103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 100342957 100343164 100343095 Y NA POP7 NA NA NA NA POP7 41281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 100760673 100761017 100760905 Y GNB2,EPHB4,ZNHIT1,PLOD3,AP1S1,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF AP1S1,VGF MCF7 ChIA-PET 22265404 SERPINE1 7353 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 100765253 100766084 100765924 Y TRIM56,SERPINE1 TRIM56,SERPINE1,AP1S1,VGF NA NA NA NA SERPINE1 2286 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 101017578 101017665 101017619 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 54474 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 101045498 101045795 101045583 Y NA NA NA NA NA NA RABL5 82394 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 101499743 101500539 101499888 Y SH2B2,CUX1,CUX1,CUX1 CUX1 NA NA NA NA CUX1 42784 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 101569375 101569771 101569405 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 112416 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 101609189 101609564 101609377 Y NA NA NA NA NA NA CUX1 152230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 101929501 101929660 101929574 Y CUX1,CUX1,CUX1,POLR2J3,ORAI2,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 101929978 101930313 101930074 Y CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2 NA NA NA NA NA PRKRIP1 72006 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.63117262572698 chr7 101967480 101967865 101967673 Y NA PRKRIP1 NA NA NA NA PRKRIP1 34454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 104585458 104586124 104585640 Y MLL5 NA LHFPL3,MLL5,SRPK2,LOC723809,LOC100216545,LOC100216546 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC01004 65367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 104607797 104607862 104607830 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 43629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 104614051 104614727 104614598 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 36764 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 104618643 104618978 104618693 Y NA LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 32513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 104626890 104627731 104627241 Y MLL5 LINC01004 NA NA NA NA LINC01004 23760 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 105123568 105123582 105123575 Y NA PUS7,RINT1 NA NA NA NA PUS7 37132 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 105459888 105460220 105459903 Y NA NA NA NA NA NA ATXN7L1 54830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 105489836 105490303 105490021 Y NA ATXN7L1,CDHR3 NA NA NA NA ATXN7L1 24747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 106408522 106408807 106408715 Y NAMPT,PIK3CG,HBP1 NA CCDC71L,PIK3CG,HBP1,NAMPT,PRKAR2B,CBLL1 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PIK3CG 94916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 106808132 106808705 106808532 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 726 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 106838325 106838672 106838499 Y NA HBP1 NA NA NA NA HBP1 30919 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 107026511 107026865 107026723 Y NA NA NA NA NA NA DUS4L 175064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 107562078 107562130 107562088 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 32663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 107567511 107567568 107567540 Y NA DLD NA NA NA NA DLD 38096 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 107573965 107574445 107574339 Y LAMB1 DLD NA NA NA NA DLD 44550 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 107644827 107645024 107644950 Y LAMB1 LAMB1 NA NA NA NA LAMB1 3127 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 108095684 108095814 108095727 Y NRCAM,NRCAM NRCAM NA NA NA NA NRCAM 523 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 108118010 108118358 108118206 Y NA NRCAM,RPL7P32 NA NA NA NA NRCAM 22849 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 110326552 110326706 110326634 Y NA NA NA NA NA NA LRRN3 402356 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 110723657 110723799 110723727 Y LRRN3 LRRN3 NA NA NA NA LRRN3 5263 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 111641194 111641556 111641398 Y ZNF277,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 202910 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 111671285 111671420 111671354 Y IFRD1,IFRD1,DOCK4 NA NA NA NA NA DOCK4 173046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 111762700 111763025 111763010 Y NA NA NA NA NA NA DOCK4 81441 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 112404343 112404501 112404446 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 24146 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 112414156 112414445 112414299 Y NA TMEM168 NA NA NA NA TMEM168 14202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 112599414 112599621 112599541 Y C7orf60 C7orf60 NA NA NA NA C7orf60 21443 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 114018736 114018896 114018817 Y FOXP2 NA NA NA NA NA MDFIC 541313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 115957232 115957778 115957588 Y NA CAV2 CAV1,CAV2,TES,CAPZA2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 31798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 115995232 115995555 115995330 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 NA CAV2,CAV1,TES,MET IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CAV2 69798 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr7 116168216 116168790 116168273 Y CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1 CAV1 NA NA NA NA CAV1 5377 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 116314942 116315351 116315128 Y ST7,TES,CAV2,CAV2,MET MET NA NA NA NA MET 4498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 120938122 120938485 120938307 Y FAM3C NA NA NA NA NA FAM3C 95933 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 122311337 122311706 122311522 Y NA RPS26P31 NA NA NA NA RPS26P31 7638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 122466235 122466438 122466337 Y NA NA NA NA NA NA CADPS2 58375 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 127455662 127455822 127455742 Y NA NA NA NA NA NA SND1 165428 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 128047079 128047125 128047082 Y LRRC4,IMPDH1 IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6 NA NA NA NA IMPDH1 1181 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 128094514 128094949 128094639 Y LEP,C7orf68 IMPDH1,HILPDA,RP11-155G14.6,METTL2B NA NA NA NA RP11-155G14.6 523 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 128170830 128171695 128171212 Y NA RP11-212P7.1 IMPDH1,HILPDA,METTL2B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-212P7.1 37047 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 6.46829937157883 chr7 128249599 128249637 128249625 Y NA RP11-212P7.1 FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-212P7.1 40857 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 128468302 128468509 128468385 Y FLNC CCDC136,ATP6V1F NA NA NA NA FLNC 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 128995385 128995592 128995489 Y NA NA FAM40B IMR90 Hi-C 24141950 RP11-305M3.2 52619 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 129246747 129246901 129246817 Y NA NRF1 NRF1 MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 2654 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 129419876 129420343 129420085 Y NA NA NRF1,UBE2H MCF7 ChIA-PET 22265404 NRF1 170321 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr7 129464915 129465297 129464948 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 125492 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 129465628 129465864 129465722 Y NA NA NA NA NA NA UBE2H 124925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130151792 130152099 130151899 Y NA NA NA NA NA NA CEP41 71518 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130552122 130552429 130552276 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 43640 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130586004 130586434 130586371 Y NA MIR29A NA NA NA NA MIR29A 9635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 130589567 130590049 130589961 Y NA MIR29A MIR29A,MIR29B1 IMR90 Hi-C 24141950 MIR29A 6020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130614674 130615489 130615212 Y MKLN1,MKLN1 MIR29A NA NA NA NA MIR29A 18605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130696655 130697004 130696978 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95851 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130697034 130697567 130697379 Y NA NA NA NA NA NA MKLN1 95288 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130720133 130720826 130720768 Y MKLN1,MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 72029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 130735932 130736596 130736429 Y MKLN1 NA NA NA NA NA MKLN1 56259 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130875085 130875581 130875276 Y NA AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 49768 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 130920397 130920794 130920689 Y MKLN1,MKLN1 AC009362.2 NA NA NA NA AC009362.2 4555 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 133390444 133390812 133390625 Y NA NA NA NA NA NA LRGUK 419240 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 134117156 134117311 134117298 Y NA AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 24725 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.28896578215873 chr7 134144888 134145050 134144951 Y AKR1B1 AKR1B1 NA NA NA NA AKR1B1 2852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 134354676 134354988 134354798 Y NA BPGM NA NA NA NA BPGM 25116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 134397020 134397253 134397193 Y NA CALD1 CALD1,BPGM IMR90 Hi-C 24141950 CALD1 29750 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 134469498 134469802 134469635 Y CALD1 CALD1 NA NA NA NA CALD1 42495 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 134521262 134521714 134521389 Y NA NA NA NA NA NA CALD1 94259 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 134540961 134541304 134541061 Y CALD1 NA NA NA NA NA CALD1 113958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 134550071 134550586 134550435 Y NA NA NA NA NA NA AGBL3 118673 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr7 134836328 134836759 134836549 Y WDR91,CNOT4,TMEM140 TMEM140,C7orf49 NA NA NA NA TMEM140 5504 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 135459124 135459310 135459189 Y NA NA C7orf73,SLC13A4,FAM180A IMR90 Hi-C 24141950 C7orf73 113880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 135665513 135665767 135665568 Y NA MTPN NA NA NA NA MTPN 5412 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 137352437 137352725 137352566 Y NA NA NA NA NA NA PTN 325826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 137942214 137942717 137942409 Y TRIM24 AC008155.2 NA NA NA NA AC008155.2 38512 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 138123858 138124244 138124036 Y CREB3L2,SVOPL,TRIM24 AC008155.1,TRIM24 NA NA NA NA TRIM24 18835 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 138858843 138859133 138858995 Y SVOPL TTC26 NA NA NA NA TTC26 42353 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 138917056 138917428 138917261 Y ZC3HAV1,UBN2 UBN2 NA NA NA NA UBN2 3954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 139899867 139900246 139899982 Y TBXAS1,JHDM1D NA NA NA NA NA PARP12 138346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 139930411 139930852 139930521 Y TBXAS1,JHDM1D NA LOC100134229,JHDM1D MCF7 ChIA-PET 22265404 PARP12 168890 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 140267387 140267618 140267517 Y DENND2A NA NA NA NA NA MKRN1 90018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 141285767 141286195 141285861 Y TAS2R38,AGK AGK NA NA NA NA AGK 36778 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 141374630 141374958 141374810 Y NA KIAA1147 NA NA NA NA KIAA1147 24995 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 142936809 142937123 142937021 Y NA GSTK1,CASP2 NA NA NA NA GSTK1 2063 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 143048257 143048354 143048306 Y TRPV5,OR9A2,OR6V1,TAS2R40,TAS2R41,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX NA NA NA NA FAM131B 9509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 143083267 143084129 143083354 Y TAS2R40,FAM131B,FAM131B FAM131B,AC093673.5,ZYX,EPHA1 NA NA NA NA ZYX 7094 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 146573041 146573429 146573238 Y NA NA NA NA NA NA AC005229.5 1702064 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 148638273 148638633 148638462 Y NA NA EZH2,ZNF786,ZNF398,ZNF425,CUL1 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 EZH2 58860 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.20595412012487 chr7 148684338 148684706 148684475 Y NA PDIA4 NA NA NA NA PDIA4 39027 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr7 149468740 149469267 149468803 Y NA ZNF467 NA NA NA NA ZNF467 172 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 150054539 150054733 150054638 Y NA RARRES2,REPIN1,ZNF775 RARRES2 IMR90 Hi-C 24141950 REPIN1 8545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 151157060 151157432 151157203 Y NA NA CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 WDR86 51247 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 151184518 151184840 151184768 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 30366 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 151192969 151193321 151193145 Y NA RHEB NA NA NA NA RHEB 21885 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 151199311 151199621 151199557 Y NA RHEB CRYGN IMR90 Hi-C 24141950 RHEB 15585 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 152105895 152106094 152106005 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 265156 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 152160343 152160554 152160402 Y ACTR3B NA NA NA NA NA XRCC2 210696 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 152160715 152161193 152160959 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 210057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr7 152161348 152162014 152161594 Y NA NA NA NA NA NA XRCC2 209236 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.31558631286349 chr7 154742897 154743129 154742996 Y NA PAXIP1 NA NA NA NA PAXIP1 49665 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr7 155006028 155006426 155006187 Y NA AC099552.4,AC099552.3 NA NA NA NA AC099552.3 12171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 155276719 155276807 155276762 Y PAXIP1,CNPY1 NA NA NA NA NA RBM33 158338 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 155383034 155383540 155383287 Y RBM33 NA LMBR1,CNPY1,RBM33,LOC100132707 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RBM33 51605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 155580383 155580450 155580415 Y NA NA NA NA NA NA AC009403.2 144484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 155754558 155754796 155754722 Y NA NA LOC285889 IMR90 Hi-C 24141950 AC009403.2 318659 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 156111013 156111412 156111192 Y RNF32,RNF32,RNF32 NA NA NA NA NA RNF32 319563 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.64448289107936 chr7 157069496 157069783 157069568 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 56292 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 157071910 157072285 157071928 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 53790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr7 157112606 157112849 157112710 Y NA DNAJB6 UBE3C,DNAJB6 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DNAJB6 13226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 157405982 157406183 157406105 Y NA NA NA NA NA NA DNAJB6 279907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 158167398 158167566 158167494 Y NA NA NA NA NA NA AC078942.1 160621 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 158224670 158224991 158224878 Y NA NA NA NA NA NA AC078942.1 103196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr7 158225517 158225999 158225657 Y NA NA NA NA NA NA AC078942.1 102188 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr7 158613624 158614053 158613981 Y ESYT2 ESYT2,WDR60 NA NA NA NA ESYT2 6891 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 638062 638589 638348 Y ZNF596,ZNF596,ERICH1 ERICH1 NA NA NA NA ERICH1 47517 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 786605 786748 786705 Y FBXO25 NA NA NA NA NA ERICH1 100499 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 1321281 1321540 1321454 Y NA NA DLGAP2 IMR90 Hi-C 24141950 CLN8 380404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 1908202 1908376 1908284 Y NA KBTBD11 NA NA NA NA KBTBD11 11668 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 2079243 2079548 2079396 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 159199 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 2591169 2591450 2591225 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 671125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 3252665 3252838 3252782 Y NA NA NA NA NA NA KBTBD11 1332621 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 4848301 4848393 4848346 Y CSMD1 NA NA NA NA NA PAICSP4 205447 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 6415254 6415472 6415345 Y NA ANGPT2 NA NA NA NA ANGPT2 3458 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 6518047 6518428 6518274 Y NA CTD-2541M15.1,AGPAT5 NA NA NA NA CTD-2541M15.1 45302 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 10267879 10268236 10267884 Y NA NA NA NA NA NA MSRA 358101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 10573649 10573859 10573801 Y SOX7 NA NA NA NA NA SOX7 121498 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 10676875 10677241 10677058 Y NA SOX7,PINX1 NA NA NA NA SOX7 18116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 11312887 11313950 11313920 Y NA FAM167A,BLK NA NA NA NA FAM167A 16274 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr8 11373324 11373814 11373559 Y FAM167A FAM167A,BLK NA NA NA NA BLK 23814 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr8 11558749 11558994 11558836 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 26281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 11560575 11560973 11560829 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 28107 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 11562739 11563084 11562994 Y GATA4 GATA4 NA NA NA NA GATA4 30271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 11690057 11690160 11690110 Y NA SUB1P1,FDFT1,RP11-297N6.4,CTSB NA NA NA NA RP11-297N6.4 31980 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 11754568 11755261 11754938 Y CTSB CTSB CTSB,FAM167A,BLK,NEIL2,GATA4,FDFT1 IMR90 Hi-C 24141950 CTSB 29611 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 12988209 12988727 12988474 Y DLC1 NA NA NA NA NA KIAA1456 187058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 17463292 17463534 17463469 Y MTMR7,MTUS1 PDGFRL NA NA NA NA PDGFRL 31350 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 18424432 18424631 18424532 Y NA NA NA NA NA NA NAT1 398446 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 18836263 18836433 18836318 Y NA NA NA NA NA NA PSD3 103807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 19266409 19266742 19266623 Y CSGALNACT1 NA NA NA NA NA SH2D4A 97281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 20125746 20125979 20125927 Y NA LZTS1 DOK2,XPO7,ATP6V1B2,LZTS1 IMR90 Hi-C 24141950 LZTS1 33495 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 21624397 21624558 21624547 Y NPM2,GFRA2 NA NA NA NA NA XPO7 150622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 21775759 21776194 21775973 Y PHYHIP,DOK2,NPM2 XPO7 NA NA NA NA XPO7 579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 21804083 21804253 21804128 Y NA XPO7 NA NA NA NA XPO7 28903 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 21867707 21867918 21867811 Y PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2 NPM2 NA NA NA NA NPM2 11718 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 21999982 22000221 22000101 Y POLR3D NUDT18,HR,REEP4,LGI3,BMP1 NA NA NA NA REEP4 2518 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 22068132 22068339 22068246 Y NA BMP1,MIR320A,POLR3D NA NA NA NA MIR320A 32217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 22240884 22241560 22241218 Y C8orf58 SLC39A14 NA NA NA NA SLC39A14 18122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 22513437 22513754 22513670 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 10907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 22516346 22516607 22516450 Y NA BIN3,EGR3 NA NA NA NA BIN3 8054 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 22808149 22808394 22808223 Y NA RHOBTB2 PEBP4,TNFRSF10B,BIN3,EGR3,RHOBTB2 IMR90 Hi-C 24141950 RHOBTB2 34536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 23020215 23020436 23020325 Y NA TNFRSF10D NA NA NA NA TNFRSF10D 672 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 23034603 23034952 23034670 Y TNFRSF10B,TNFRSF10D TNFRSF10D,TNFRSF10A NA NA NA NA TNFRSF10D 15060 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 23138717 23138953 23138815 Y LOXL2 CHMP7,R3HCC1 NA NA NA NA R3HCC1 13084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 23202733 23203217 23203148 Y LOXL2 NA NA NA NA NA R3HCC1 77100 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 23390028 23390384 23390041 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 5710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 23396383 23397127 23396699 Y TNFRSF10B,TNFRSF10C,ENTPD4,ENTPD4,SLC25A37 SLC25A37 NA NA NA NA SLC25A37 12065 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 24799462 24799718 24799592 Y NEFL NEFM NA NA NA NA NEFM 30937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 24858208 24858485 24858356 Y NA NA NA NA NA NA NEFM 89683 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 26306627 26307336 26307213 Y NA NA BNIP3L,KCTD9,CDCA2,PPP2R2A,DPYSL2 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PNMA2 62272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 26466209 26466513 26466418 Y PPP2R2A,BNIP3L NA NA NA NA NA DPYSL2 96418 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 26466894 26467238 26467101 Y NA NA NA NA NA NA DPYSL2 97103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.41190824024973 chr8 26498541 26498935 26498595 Y NA NA NA NA NA NA RP11-384C12.1 128372 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 27209291 27209793 27209526 Y PTK2B,PTK2B TRIM35 NA NA NA NA TRIM35 42455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 27387404 27387600 27387502 Y PTK2B,PTK2B,EPHX2 EPHX2 NA NA NA NA EPHX2 41108 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 28258528 28258941 28258737 Y HMBOX1,HMBOX1 ZNF395 ZNF395,FBXO16 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF395 310 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 28269273 28269920 28269515 Y ZNF395 ZNF395 NA NA NA NA ZNF395 11055 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 28886327 28886717 28886347 Y HMBOX1,HMBOX1,DUSP4 CTD-2647L4.4 NA NA NA NA CTD-2647L4.4 24735 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 29230784 29230978 29230896 Y KIF13B,DUSP4 DUSP4 C8orf75,LOC286135,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,LEPROTL1,DUSP4 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DUSP4 24599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 29316675 29316889 29316765 Y KIF13B,DUSP4 NA C8orf75 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 110490 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 29356550 29356734 29356564 Y KIF13B,DUSP4,DUSP4 NA LOC286135,C8orf75,MIR3148,MIR548O2,TMEM66,DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 150365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 29495067 29495424 29495202 Y KIF13B NA DUSP4,LOC286135,C8orf75,MIR3148 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 288882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 29533274 29533303 29533292 Y NA NA DUSP4 IMR90 Hi-C 24141950 DUSP4 327089 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 29576846 29577118 29576977 Y KIF13B NA NA NA NA NA TMEM66 361605 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 30273402 30273800 30273435 Y NA RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 32485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 30280646 30281238 30280961 Y MBOAT4 RBPMS,RBPMS-AS1 NA NA NA NA RBPMS-AS1 39729 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 30769723 30770025 30769859 Y NA NA TEX15,WRN,PPP2CB,PURG IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PPP2CB 99893 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 30892240 30892587 30892393 Y UBXN8 WRN NA NA NA NA WRN 2923 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 33579772 33580017 33579844 Y NA NA NA NA NA NA RP1-273G13.1 135724 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 9.64763296099894 chr8 33718252 33718557 33718395 Y NA RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 2511 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 33743518 33743769 33743644 Y MAK16 RP1-273G13.1 NA NA NA NA RP1-273G13.1 27777 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 35382808 35383133 35382968 Y NA LSM12P1 NA NA NA NA LSM12P1 1527 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.53485069834074 chr8 37000181 37000618 37000483 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.6 371921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 37002327 37002551 37002443 Y NA NA KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-150O12.6 369988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 38242599 38242872 38242674 Y TACC1,WHSC1L1,LETM2,LETM2 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 874 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 38262735 38263237 38262894 Y TACC1,PLEKHA2,C8orf86 WHSC1L1,LETM2 NA NA NA NA LETM2 21010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 38523213 38523472 38523342 Y C8orf86 NA C8orf86,FGFR1,WHSC1L1,RNF5P1,PPAPDC1B IMR90 Hi-C 24141950 TACC1 60232 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 38867572 38867594 38867583 Y C8orf86 TM2D2,ADAM9 NA NA NA NA ADAM9 15184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 39797063 39797940 39797610 Y NA IDO1 NA NA NA NA IDO1 39269 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 39800131 39800493 39800357 Y NA IDO1 NA NA NA NA IDO1 42337 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 39801503 39801850 39801608 Y NA IDO1 NA NA NA NA IDO1 43709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 39865066 39865447 39865202 Y NA NA NA NA NA NA IDO1 107272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 40032102 40032537 40032342 Y IDO1 C8orf4 NA NA NA NA C8orf4 23113 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 40049035 40049230 40049136 Y NA C8orf4 GOLGA7,C8orf4,ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 40046 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 40056491 40056661 40056575 Y C8orf4 C8orf4 GOLGA7,ZMAT4,IDO2 IMR90 Hi-C 24141950 C8orf4 47502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 40207660 40208018 40207838 Y NA CTA-392C11.1 ZMAT4 IMR90 Hi-C 24141950 CTA-392C11.1 8739 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 41146046 41146081 41146065 Y SFRP1 SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 18935 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 41160567 41160649 41160637 Y NA SFRP1 NA NA NA NA SFRP1 4367 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr8 41775383 41775559 41775471 Y NA NA ANK1 IMR90 Hi-C 24141950 KAT6A 131949 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 41997279 41998522 41997937 Y NA AP3M2 KAT6A,ANK1,POLB,AP3M2,VDAC3 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AP3M2 9942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 42053833 42054135 42053951 Y NA AP3M2,PLAT NA NA NA NA PLAT 9107 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 43092918 43093442 43093017 Y HOOK3 NA NA NA NA NA HGSNAT 99362 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.42521850560212 chr8 43093596 43094096 43093640 Y NA NA NA NA NA NA HGSNAT 100040 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 48265617 48265884 48265750 Y CEBPD NA NA NA NA NA NDUFA5P12 191124 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 48434780 48435210 48435108 Y CEBPD NA NA NA NA NA CEBPD 214438 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 49320367 49320668 49320511 Y NA RPL29P19 SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 25217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 49426952 49427328 49427172 Y SNAI2 NA SNAI2 IMR90 Hi-C 24141950 RPL29P19 131802 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 49815340 49815765 49815552 Y SNAI2 SNAI2 NA NA NA NA SNAI2 16534 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 52809491 52809887 52809877 Y PCMTD1 NA NA NA NA NA PCMTD1,RP11-110G21.1 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 53379796 53380092 53379874 Y RB1CC1 NA NA NA NA NA RB1CC1 276311 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 53625473 53626379 53625848 Y RB1CC1 RB1CC1 NA NA NA NA RB1CC1 30024 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 54932125 54932445 54932251 Y NA TCEA1 NA NA NA NA TCEA1 644 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 55071691 55071823 55071748 Y ATP6V1H,ATP6V1H MRPL15 NA NA NA NA MRPL15 25921 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 55366813 55366957 55366864 Y NA NA SOX17 K562 ChIA-PET 22265404 RP11-53M11.3 97964 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 56362318 56362387 56362358 Y NA NA NA NA NA NA TGS1 321314 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 56684291 56684685 56684461 Y NA TGS1,TMEM68 NA NA NA NA TMEM68 325 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 56906988 56907115 56907052 Y NA NA NA NA NA NA RPS20 77954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 56916302 56916441 56916350 Y LYN NA NA NA NA NA RPS20 68628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 59476129 59476409 59476167 Y NA SDCBP NA NA NA NA SDCBP 12646 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 61564243 61564650 61564285 Y CA8,CHD7 CHD7 CHD7,RAB2A MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 CHD7 24687 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 61850490 61850754 61850677 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261153 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 61850776 61851191 61851141 Y NA NA CHD7 IMR90 Hi-C 24141950 CHD7 261439 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 62146139 62146518 62146329 Y NA NA NA NA NA NA ASPH 478637 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 62445230 62445580 62445420 Y CLVS1,ASPH NA NA NA NA NA ASPH 179575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 62624516 62625412 62625017 Y ASPH NA NA NA NA NA ASPH,MIR4470 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 62634431 62634735 62634612 Y ASPH ASPH,MIR4470 NA NA NA NA MIR4470 9084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 63776641 63776831 63776733 Y NA NA NA NA NA NA GGH 172899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 63934936 63935021 63934979 Y NA GGH NA NA NA NA GGH 14709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 64082499 64082747 64082682 Y YTHDF3 YTHDF3 NA NA NA NA YTHDF3 3387 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 64133013 64133210 64133061 Y NA NA NA NA NA NA YTHDF3 53901 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 66615323 66615688 66615531 Y NA NA NA NA NA NA MTFR1 60354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 66641187 66641625 66641410 Y PDE7A NA NA NA NA NA MTFR1 86218 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 67032130 67032353 67032272 Y NA NA NA NA NA NA PDE7A 279573 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 68097028 68097398 68097213 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 103010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 68098646 68098899 68098873 Y NA NA NA NA NA NA COPS5 104628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 68499569 68499804 68499684 Y NA NA NA NA NA NA ARFGEF1 245657 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 71124105 71124438 71124275 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152C15.1 109691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 71188678 71189062 71188836 Y NA NA NA NA NA NA NCOA2 124978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 71303418 71303670 71303544 Y NA NCOA2,RP11-333A23.1 NA NA NA NA NCOA2 10370 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 71503238 71503393 71503365 Y NA TRAM1 NA NA NA NA TRAM1 15229 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 72743502 72744020 72743667 Y NA RP11-383H13.1,MSC NA NA NA NA RP11-383H13.1 5100 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 74282734 74282969 74282907 Y NA NA STAU2,LOC100128126,RDH10 IMR90 Hi-C 24141950 RPL7 76710 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 74371877 74372089 74371987 Y RDH10 NA NA NA NA NA RPL7 165853 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 74637544 74637721 74637705 Y NA STAU2 NA NA NA NA STAU2 20222 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 77128503 77128819 77128661 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 462635 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 77515612 77515766 77515691 Y NA NA NA NA NA NA ZFHX4 75688 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 77590079 77590470 77590424 Y ZFHX4 ZFHX4 NA NA NA NA ZFHX4 984 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 79674578 79674862 79674701 Y NA IL7 NA NA NA NA IL7 40896 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 80680806 80681178 80681064 Y HEY1 HEY1 NA NA NA NA HEY1 2708 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 80705910 80706255 80706054 Y HEY1 HEY1 HEY1,MRPS28 IMR90 Hi-C 24141950 HEY1 27812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 81034251 81034528 81034390 Y ZBTB10,TPD52 NA NA NA NA NA MRPS28 93727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 83490846 83490929 83490888 Y NA NA NA NA NA NA SNX16 737745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 86090980 86091058 86091024 Y E2F5,E2F5 E2F5,C8orf59,CA13 NA NA NA NA E2F5 3520 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 87358801 87359051 87358932 Y NA WWP1 NA NA NA NA WWP1 5834 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 87444767 87445117 87444942 Y WWP1 CPNE3 NA NA NA NA CPNE3 49942 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 87484005 87484360 87484214 Y NA CPNE3,SLC2A3P4 NA NA NA NA CPNE3 10699 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 87673960 87674305 87674138 Y CNGB3 NA NA NA NA NA SLC2A3P4 160140 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 90627835 90627903 90627892 Y NA NA MMP16 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-37B2.1 140052 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 92112003 92112264 92112167 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 31579 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 92128196 92128480 92128215 Y NA GS1-251I9.4,OTUD6B NA NA NA NA OTUD6B 47772 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 92337525 92337634 92337580 Y NA NA NA NA NA NA OTUD6B 257101 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 95003706 95004122 95004001 Y NA NA LINC00535,RBM12B,RAD54B,CDH17,GEM IMR90 Hi-C 24141950 PDP1 135671 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 96805008 96805462 96805317 Y NA NA NA NA NA NA UQCRB 440400 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 97272793 97273157 97272974 Y NA UQCRB,MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 850 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 97319675 97319761 97319753 Y NA MTERFD1,PTDSS1 NA NA NA NA PTDSS1 47732 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 97571754 97571902 97571855 Y NA NA NA NA NA NA SDC2 68175 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 99021655 99021985 99021673 Y NA RPL30 NA NA NA NA RPL30 34712 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 99526737 99526942 99526761 Y NA NA NA NA NA NA NIPAL2 222116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 99953302 99954000 99953407 Y STK3,OSR2 STK3,OSR2 NA NA NA NA STK3 247 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 100808377 100808591 100808586 Y NA NA NA NA NA NA COX6C 95699 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 101222720 101222891 101222806 Y NA NA NA NA NA NA SPAG1 54586 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 101731045 101731633 101731441 Y NA PABPC1 NA NA NA NA PABPC1 1404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 101801288 101801504 101801352 Y NA NA PABPC1,SNX31 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 PABPC1 68251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 101881903 101882335 101882088 Y ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ NA YWHAZ,ZNF706,FLJ42969 IMR90 Hi-C 24141950 YWHAZ 81281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 101920209 101920392 101920320 Y PABPC1,ZNF706,ZNF706,YWHAZ,YWHAZ YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 43224 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 101920723 101921107 101920870 Y NA YWHAZ NA NA NA NA YWHAZ 42509 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 102015928 102016078 102016021 Y NA NA FLJ42969,YWHAZ,ZNF706 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 52312 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102038562 102039020 102038731 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 74946 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102039589 102039925 102039833 Y GRHL2 NA ZNF706,YWHAZ,SNX31,FLJ42969 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 YWHAZ 75973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102092753 102093116 102092848 Y GRHL2 NA NA NA NA NA ZNF706 123305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102120764 102121998 102120921 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706 MCF7,IMR90,K562 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 ZNF706 94423 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 102140192 102140420 102140327 Y YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 NA YWHAZ,FLJ42969,ZNF706,PABPC1 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 76001 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102167683 102167913 102167765 Y NA ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 48508 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 102171133 102171473 102171263 Y PABPC1,YWHAZ,YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 102171817 102172037 102171960 Y YWHAZ,ZNF706,ZNF706 ZNF706 ZNF706,YWHAZ,FLJ42969 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZNF706 44384 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 103669513 103669869 103669680 Y AZIN1,ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3383 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 103669922 103670289 103670129 Y ATP6V1C1,KLF10,KLF10 KLF10 NA NA NA NA KLF10 3792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 103801151 103801773 103801337 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 72755 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 103806867 103807011 103806958 Y NA NA KLF10,UBR5,ODF1 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KB-1507C5.2 67517 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 103910563 103910945 103910847 Y NA KB-1507C5.2,AZIN1 ATP6V1C1,AZIN1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AZIN1 6471 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 104059632 104059708 104059689 Y NA ATP6V1C1 NA NA NA NA ATP6V1C1 28341 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 105409050 105409327 105409190 Y NA NA NA NA NA NA DPYS 67954 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 106582164 106582354 106582260 Y NA NA NA NA NA NA RP11-152P17.2 488398 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 107665296 107665542 107665419 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 42699 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 107740443 107740789 107740616 Y NA TAGLN2P1 NA NA NA NA TAGLN2P1 32202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 109230729 109230920 109230833 Y NA NA NA NA NA NA EIF3E 214642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 110248064 110248088 110248074 Y NA NA NA NA NA NA ENY2 96465 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 115322659 115322858 115322759 Y NA NA NA NA NA NA RP11-709P2.1 935761 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 116660380 116660747 116660648 Y TRPS1 NA NA NA NA NA TRPS1 159152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 117456775 117457003 117456919 Y NA NA TRPS1,LINC00536 IMR90 Hi-C 24141950 UTP23 319739 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 117529764 117530094 117529930 Y C8orf85 NA NA NA NA NA UTP23 246648 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 118072404 118072549 118072412 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 187299 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 118128259 118128494 118128265 Y NA NA NA NA NA NA RAD21 243154 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 118778404 118778792 118778598 Y NA NA EXT1 IMR90 Hi-C 24141950 MED30 247452 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119023512 119024035 119023740 Y EXT1 NA NA NA NA NA EXT1 98057 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119068312 119068746 119068717 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 53346 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119264701 119264795 119264748 Y SAMD12 NA NA NA NA NA EXT1 142609 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119317381 119317491 119317437 Y NA NA NA NA NA NA EXT1 195289 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119485123 119485454 119485409 Y NA NA NA NA NA NA SAMD12 146780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119808728 119809168 119808881 Y TNFRSF11B NA TNFRSF11B IMR90 Hi-C 24141950 TNFRSF11B 153271 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 119960672 119960883 119960778 Y NA TNFRSF11B,COLEC10 NA NA NA NA TNFRSF11B 1556 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 120232000 120232286 120232044 Y NA NA NA NA NA NA MAL2 56727 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 122157265 122157468 122157378 Y NA NA NA NA NA NA SNTB1 333752 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 123795111 123795992 123795667 Y C8orf76,ZHX2 ZHX2 NA NA NA NA ZHX2 3478 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 123908169 123908483 123908299 Y NA NA NA NA NA NA ZHX2 116536 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 124248679 124249062 124248866 Y NA C8orf76,ZHX1 NA NA NA NA C8orf76 2576 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 124301303 124301534 124301414 Y NA C8orf76,ZHX1 ATAD2,ZHX1-C8ORF76 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ZHX1 15522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 124337288 124337362 124337325 Y NA NA NA NA NA NA ZHX1 51507 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 124549741 124550229 124550044 Y FBXO32,FBXO32 FBXO32 NA NA NA NA FBXO32 1217 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 124665857 124666229 124666132 Y NA NA NA NA NA NA FAM91A1 112467 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 125210059 125210285 125210207 Y FAM91A1,TMEM65,RNF139 ARF1P3 TMEM65,FAM91A1,FER1L6,FER1L6-AS1 IMR90 Hi-C 24141950 ARF1P3 47895 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 125302460 125302812 125302637 Y TMEM65,RNF139 NA NA NA NA NA TMEM65 80121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 125984707 125984742 125984718 Y ZNF572 ZNF572,SQLE NA NA NA NA ZNF572 1167 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 126195292 126195668 126195512 Y TRIB1,KIAA0196,NSMCE2 NA TRIB1 IMR90 Hi-C 24141950 KIAA0196 93210 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 126231490 126231859 126231657 Y MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 129408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 126238973 126239274 126239019 Y NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA KIAA0196 136891 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 126285545 126285900 126285649 Y KIAA0196,NSMCE2,TRIB1 NA NA NA NA NA TRIB1 154663 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 126290719 126290948 126290836 Y NA NA NA NA NA NA TRIB1 149615 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr8 127927068 127927434 127927240 Y NA NA NA NA NA NA CCAT1 301899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 128227982 128228299 128228180 Y NA CCAT1 LOC727677,MYC IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 CCAT1 1034 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 128276351 128276739 128276546 Y NA CCAT1 LOC727677 IMR90 Hi-C 24141950 CCAT1 47018 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 128825013 128825274 128825028 Y MYC PVT1 NA NA NA NA PVT1 20234 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 128926432 128926732 128926619 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 94125 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 129036981 129037022 129036995 Y NA RNU4-25P NA NA NA NA RNU4-25P 16124 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 129076309 129076777 129076518 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 55452 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 129121216 129121486 129121350 Y NA NA NA NA NA NA RNU4-25P 100359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 130373600 130373989 130373795 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 653386 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 130651209 130651494 130651319 Y FAM49B NA NA NA NA NA FAM49B 375881 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 131054431 131054834 131054758 Y NA FAM49B NA NA NA NA FAM49B 27056 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 131201084 131201473 131201279 Y NA NA NA NA NA NA FAM49B 173709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 131276645 131276741 131276715 Y NA NA NA NA NA NA ASAP1 177165 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 133562041 133562364 133562205 Y HHLA1,KCNQ3,KCNQ3 NA NA NA NA NA LRRC6 123474 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 134104989 134105333 134105063 Y ST3GAL1,TG NA NA NA NA NA WISP1 95949 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 134156406 134156683 134156433 Y ST3GAL1,TMEM71,PHF20L1 WISP1 NA NA NA NA WISP1 44599 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 134387761 134388081 134387916 Y NA ST13P6 TG,WISP1,NDRG1,PHF20L1 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ST13P6 30168 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 134453521 134453599 134453592 Y SLA ST13P6 NA NA NA NA ST13P6 35272 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 134940088 134940285 134940173 Y ST3GAL1 RP11-157E21.1 ST3GAL1,ZFAT IMR90 Hi-C 24141950 RP11-157E21.1 43349 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 135843585 135843751 135843688 Y ZFAT MIR30D ZFAT,MIR30D,MIR30B IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 MIR30D 28397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 136476552 136476867 136476709 Y NA KHDRBS3 NA NA NA NA KHDRBS3 8852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 138127767 138128050 138127889 Y NA NA NA NA NA NA RNU1-35P 1375029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 140830815 140831120 140830968 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 635558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 141108529 141108796 141108710 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 357882 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 141108929 141109987 141109387 Y KCNK9,TRAPPC9 NA NA NA NA NA TRAPPC9 356691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 141110302 141110773 141110688 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 355905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 141358966 141359028 141358983 Y NA NA NA NA NA NA TRAPPC9 107650 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr8 141474376 141475403 141474918 Y NA TRAPPC9,CHRAC1 TRAPPC9,EIF2C2,CHRAC1 K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 TRAPPC9 7698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 141598802 141599709 141599120 Y TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2 NA NA NA NA NA CHRAC1 79405 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr8 141655804 141656158 141655981 Y NA NA NA NA NA NA CHRAC1 136407 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 141886994 141887102 141887066 Y PTK2 NA NA NA NA NA PTK2 123213 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 142215999 142216277 142216212 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 90622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr8 142216641 142216829 142216751 Y DENND3,SLC45A4 NA NA NA NA NA DENND3 91264 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 143533998 143534621 143534303 Y LYNX1,LYNX1,TSNARE1,BAI1 NA BAI1,TSNARE1 MCF7 ChIA-PET 22265404 TSNARE1 51397 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 143837804 143838151 143837954 Y NA LYNX1 NA NA NA NA LYNX1 19489 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 144094701 144094997 144094860 Y LY6K,C8orf55 LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA LY6E 2402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 144106773 144106936 144106849 Y NA LY6E,RP11-273G15.2,C8orf31 NA NA NA NA RP11-273G15.2 8919 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 144300737 144301128 144300944 Y GPIHBP1 ZFP41,GLI4 NA NA NA NA ZFP41 26152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 144328155 144328364 144328211 Y NA ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA ZFP41 875 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr8 144360422 144361034 144360946 Y ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696 NA NA NA NA RP13-582O9.5 826 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr8 144959402 144959607 144959478 Y C8orf73,MAPK15,EPPK1 PUF60,NRBP2 PLEC,NRBP2,PUF60 IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 NRBP2 37202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 145015768 145015971 145015849 Y FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 32931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 145025737 145026802 145026365 Y ZC3H3,GSDMD,NAPRT1,EEF1D,SPATC1,PLEC,PARP10 PLEC,GRINA NA NA NA NA PLEC 22100 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr8 145071465 145071788 145071627 Y NA PLEC,GRINA,PARP10 NA NA NA NA GRINA 9239 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 145911932 145912089 145912059 Y SCRT1,KIFC2,LRRC24,ZNF34 ARHGAP39 ARHGAP39,ZNF251,ZNF34 IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ARHGAP39 2738 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 146010487 146010786 146010731 Y NA ZNF251,RPL8,ZNF7 NA NA NA NA ZNF34 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr8 146125688 146125902 146125777 Y ZNF250 COMMD5,ZNF250,ZNF16 NA NA NA NA ZNF250 135 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 2875811 2876206 2875956 Y NA KIAA0020 NA NA NA NA KIAA0020 33570 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 3450123 3450354 3450276 Y NA NA NA NA NA NA RFX3 73650 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 3507863 3508210 3507917 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15794 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 3508264 3508975 3508586 Y RFX3 RFX3,RP11-509J21.1 NA NA NA NA RFX3 15029 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 3971837 3971870 3971849 Y NA NA NA NA NA NA RP11-509J21.1 447114 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 4340074 4340431 4340362 Y NA NA GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020 IMR90 Hi-C 24141950 SLC1A1 148013 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 4530559 4530733 4530650 Y NA SLC1A1 NA NA NA NA SLC1A1 42115 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 4544914 4545090 4545003 Y NA NA NA NA NA NA SLC1A1 56470 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 4835219 4835506 4835309 Y CDC37L1,RCL1 RCL1,MIR101-2 NA NA NA NA MIR101-2 12785 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 5844710 5844756 5844733 Y RANBP6 ERMP1 ERMP1 IMR90 Hi-C 24141950 ERMP1 13593 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 6488249 6488567 6488283 Y NA NA NA NA NA NA UHRF2 77098 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 6680895 6681975 6681336 Y UHRF2,KDM4C RP11-106A1.2,RP11-390F4.6,KDM4C KDM4C,UHRF2,GLDC K562,MCF7 ChIA-PET 22265404 KDM4C 36888 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 12487595 12487982 12487864 Y NA NA NA NA NA NA TYRP1 195457 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 14233168 14233395 14233282 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 163587 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 14322295 14322910 14322674 Y ZDHHC21,NFIB NA NA NA NA NA NFIB 74072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 14437606 14437932 14437918 Y NA NFIB FLJ41200,NFIB IMR90 Hi-C 24141950 NFIB 40624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 14536495 14536792 14536644 Y NFIB NA NA NA NA NA NFIB 139513 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 15999707 15999922 15999846 Y NA NA BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 474026 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 16100753 16101130 16100880 Y NA NA C9orf93,BNC2 IMR90 Hi-C 24141950 FTH1P12 575072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 16506213 16506544 16506471 Y NA NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 218268 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 16526132 16526493 16526417 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 198319 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 16666623 16666991 16666807 Y BNC2 NA NA NA NA NA RP11-62F24.2 57821 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 18099109 18099372 18099241 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 372520 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 18718417 18718817 18718751 Y NA NA NA NA NA NA ADAMTSL1 246525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 19184256 19184894 19184463 Y PLIN2 PLIN2 HAUS6,ACER2,DENND4C,PLIN2 IMR90 Hi-C 24141950 PLIN2 36968 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 20532398 20532530 20532463 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 88012 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 20552301 20552464 20552406 Y MLLT3 NA NA NA NA NA MLLT3 68078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 21096394 21096639 21096525 Y KIAA1797 NA MLLT3,KIAA1797 IMR90 Hi-C 24141950 PTPLAD2 66759 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 21695810 21696232 21696052 Y NA NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 104310 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 21696521 21696698 21696606 Y IFNA6,IFNA1 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103844 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 21696721 21697113 21696912 Y IFNA8 NA MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 MTAP 103429 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 21836477 21836868 21836612 Y NA MTAP NA NA NA NA MTAP 35935 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 21996110 21996456 21996153 Y NA CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 2810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 21996542 21996712 21996656 Y MTAP,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2A,CDKN2B CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6 NA NA NA NA CDKN2A 3242 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 22083926 22084220 22084073 Y NA NA NA NA NA NA UBA52P6 73772 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 22216803 22217265 22216812 Y NA NA CDKN2B,CDKN2B-AS1,MTAP,MIR31HG IMR90 Hi-C 24141950 UBA52P6 206649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 22482961 22483350 22483156 Y NA DMRTA1 NA NA NA NA DMRTA1 38121 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 26975716 26975874 26975793 Y NA IFT74,PLAA NA NA NA NA PLAA 30255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 27155069 27155179 27155099 Y TEK TEK NA NA NA NA TEK 47930 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 29826427 29826586 29826507 Y NA NA NA NA NA NA RBMXP2 860517 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 32461734 32461764 32461747 Y DDX58 NA NA NA NA NA DDX58 62558 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 32535412 32535514 32535462 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11090 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 32535541 32535857 32535751 Y NA DDX58,TOPORS,NDUFB6 NA NA NA NA DDX58 11219 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 33023891 33023961 33023926 Y NA APTX,DNAJA1 NA NA NA NA DNAJA1 682 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 33165457 33166051 33165900 Y DNAJA1,SMU1,NFX1,CHMP5,B4GALT1 B4GALT1 NA NA NA NA B4GALT1 103 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 33942829 33943199 33943013 Y NA NA NA NA NA NA UBAP2 103748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 34681857 34682174 34682025 Y ARID3C,IL11RA,IL11RA SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5 NA NA NA NA RP11-195F19.5 17748 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 35114116 35114547 35114222 Y DNAJB5,KIAA1539 VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B NA NA NA NA FAM214B 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 35516545 35516820 35516591 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 28421 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 35520478 35520852 35520494 Y NA RUSC2 NA NA NA NA RUSC2 32354 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 35603992 35604628 35604112 Y TMEM8B,TMEM8B,TMEM8B,SPAG8,GBA2,C9orf128,RUSC2 TESK1 NA NA NA NA TESK1 625 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.09632192738624 chr9 35907858 35908401 35908282 Y OR2S2,OR13J1,HRCT1 NDUFA5P4,HRCT1 NA NA NA NA HRCT1 3669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 35924004 35924206 35924105 Y NA HRCT1,YBX1P10 NA NA NA NA HRCT1 19815 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 36040345 36040403 36040371 Y NA RECK NA NA NA NA RECK 5915 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 36231547 36231666 36231607 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA CLTA 42694 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 36232002 36232125 36232063 Y GNE CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 42928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 36232965 36233105 36233040 Y NA CLTA,GNE NA NA NA NA GNE 41948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 36471008 36471193 36471156 Y NA RNF38 RNF38,MELK IMR90 Hi-C 24141950 RNF38 14352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr9 37009861 37010203 37010032 Y PAX5 NA NA NA NA NA ZCCHC7 108333 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 37198449 37198887 37198604 Y ZBTB5,ZCCHC7 NA NA NA NA NA ZCCHC7 79913 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 37773119 37773290 37773253 Y FRMPD1 DCAF10,EXOSC3 NA NA NA NA DCAF10 25209 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 37938183 37938323 37938277 Y SHB NA NA NA NA NA RP11-613M10.9 128361 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 38066980 38067628 38067261 Y SHB RP11-613M10.9 NA NA NA NA SHB 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 38437570 38437747 38437611 Y NA ALDH1B1,IGFBPL1 TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1 IMR90 Hi-C 24141950 IGFBPL1 15126 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.75411508381799 chr9 66455332 66455763 66455668 Y NA NA NA NA NA NA RP11-764K9.4 1997612 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 68436364 68436652 68436508 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 16723 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 68455261 68455556 68455421 Y NA RP11-764K9.4 NA NA NA NA RP11-764K9.4 1886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 5.26234525145397 chr9 71728196 71728449 71728285 Y NA TJP2 NA NA NA NA TJP2 5760 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 72717148 72717358 72717253 Y NA NA NA NA NA NA MAMDC2 60651 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 72837972 72838313 72838181 Y NA SMC5 NA NA NA NA SMC5 33624 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 72923580 72923722 72923651 Y SMC5 NA NA NA NA NA SMC5 51643 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 73025885 73026723 73026293 Y KLF9 KLF9 NA NA NA NA KLF9 817 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 73033763 73035382 73035076 Y SMC5,KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 6223 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.6178623603746 chr9 73035561 73035945 73035863 Y KLF9 KLF9 TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8021 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr9 73036465 73036957 73036835 Y KLF9 KLF9 TRPM3,KLF9 MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 KLF9 8925 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 73168765 73169157 73169115 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 141225 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 73196795 73197009 73196903 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 169255 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 73198481 73198826 73198654 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 170941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 73215942 73217043 73216172 Y KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 188402 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr9 73219456 73219798 73219627 Y TRPM3,KLF9 NA NA NA NA NA KLF9 191916 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 73224625 73224828 73224734 Y NA NA NA NA NA NA KLF9 197085 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 74292775 74292963 74292884 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90258 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 74293239 74293379 74293310 Y TMEM2 NA NA NA NA NA RPL35AP21 90722 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 74511654 74511799 74511765 Y NA C9orf85 NA NA NA NA C9orf85 12627 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 75612445 75612548 75612497 Y NA NA ALDH1A1 IMR90 Hi-C 24141950 ALDH1A1 80810 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 75747117 75747734 75747349 Y ANXA1 ANXA1 ANXA1 IMR90 Hi-C 24141950 ANXA1 16939 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr9 79303501 79303668 79303622 Y GCNT1 NA NA NA NA NA AL161626.1 118770 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 80354506 80354684 80354595 Y NA NA NA NA NA NA GNA14 93283 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 81637955 81638246 81638090 Y NA NA NA NA NA NA CHCHD2P9 365973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 82185317 82185693 82185378 Y NA TLE4 NA NA NA NA TLE4 629 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 84236979 84237179 84237078 Y NA NA NA NA NA NA TLE1 65041 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 88935508 88935794 88935577 Y NA ISCA1,ZCCHC6 NA NA NA NA ZCCHC6 31575 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 89626902 89626982 89626949 Y NA CDC20P1 NA NA NA NA CDC20P1 2335 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr9 89699545 89699882 89699714 Y NA NA NA NA NA NA CDC20P1 74978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 90117444 90117744 90117580 Y DAPK1 DAPK1,RP11-40C6.2 NA NA NA NA DAPK1 7301 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 90328172 90328868 90328486 Y DAPK1,CTSL1 NA CTSL1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-40C6.2 189955 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 91022048 91022386 91022218 Y NA SPIN1 NA NA NA NA SPIN1 20714 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 91147328 91147523 91147436 Y NXNL2 NXNL2 NA NA NA NA NXNL2 493 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 91654177 91654400 91654289 Y NA S1PR3 NA NA NA NA S1PR3 49815 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 91795136 91795669 91795494 Y C9orf47,SHC3 SHC3 NA NA NA NA SHC3 3454 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 7.45498910622645 chr9 92762358 92762553 92762476 Y NA NA NA NA NA NA GADD45G 544430 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 93954665 93954922 93954788 Y NA RP11-305L7.3 NA NA NA NA RP11-305L7.3 31296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 93955991 93956732 93956142 Y NA RP11-305L7.3 NA NA NA NA RP11-305L7.3 32622 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 93975322 93975401 93975365 Y NA NA NA NA NA NA RP11-305L7.3 51953 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 94834730 94835154 94834963 Y OGN SPTLC1 NA NA NA NA SPTLC1 40512 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 95860928 95861146 95861059 Y IPPK,PHF2,C9orf89,NINJ1 SUSD3,C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA C9orf89 4428 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 95880555 95880921 95880640 Y NA C9orf89,NINJ1 NA NA NA NA NINJ1 13649 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 96928143 96928630 96928259 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90963 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 96928795 96929410 96929111 Y NA NA NA NA NA NA ZNF169 90183 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr9 97629577 97629759 97629671 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 142594 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 97679079 97679413 97679326 Y NA NA NA NA NA NA C9orf3 192096 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 97684288 97685133 97684708 Y NA NA FANCC IMR90 Hi-C 24141950 C9orf3 197305 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 98262009 98262267 98262138 Y PTCH1,PTCH1,PTCH1 PTCH1 NA NA NA NA PTCH1 15072 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 99106686 99107122 99106995 Y NA SLC35D2 NA NA NA NA SLC35D2 36870 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 99171138 99171308 99171256 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA RP11-172F4.2 3572 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 99181547 99181719 99181643 Y NA SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4 NA NA NA NA ZNF367 2936 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr9 99334926 99335181 99335054 Y NA CDC14B HABP4 IMR90 Hi-C 24141950 CDC14B 44931 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 100455337 100455352 100455343 Y NA XPA NA NA NA NA XPA 2287 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 100772550 100772875 100772560 Y NA ANP32B,NANS NANS,TRIM14 IMR90 Hi-C 24141950 ANP32B 28907 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 100788386 100788828 100788550 Y NA ANP32B,NANS NA NA NA NA NANS 28193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 101557390 101557800 101557457 Y NA ANKS6,GALNT12 NA NA NA NA ANKS6 143 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 101868249 101868435 101868378 Y NA TGFBR1 NA NA NA NA TGFBR1 3929 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 102195698 102196356 102196027 Y TGFBR1,NR4A3 NA NA NA NA NA SEC61B 213352 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 102646895 102646933 102646914 Y NA STX17 NA NA NA NA STX17 19982 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 107635337 107635884 107635542 Y ABCA1 NA NA NA NA NA ABCA1 52634 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 107730510 107730878 107730708 Y SLC44A1,FSD1L,FSD1L,ABCA1 ABCA1,RP11-217B7.3 ABCA1 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-217B7.3 21184 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 108005367 108005618 108005429 Y NA SLC44A1 NA NA NA NA SLC44A1 464 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 109626456 109627144 109627032 Y NA ZNF462 NA NA NA NA ZNF462 3078 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 111774521 111775173 111774726 Y NA CTNNAL1 NA NA NA NA CTNNAL1 712 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 112578065 112578653 112578312 Y PALM2 PALM2-AKAP2,AKAP2 NA NA NA NA AKAP2 37296 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 112811971 112812606 112812251 Y AKAP2 NA NA NA NA NA TXN 204314 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 112905689 112906067 112905829 Y NA NA NA NA NA NA TXN 110853 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 114678571 114678728 114678577 Y NA UGCG NA NA NA NA UGCG 21525 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 114707434 114708001 114707643 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 50388 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 114792518 114792641 114792625 Y NA NA NA NA NA NA UGCG 135472 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 115258728 115258879 115258816 Y SNX30,SUSD1,ROD1 KIAA1958,C9orf147 NA NA NA NA C9orf147 11244 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 115757286 115757809 115757590 Y NA ZNF883 NA NA NA NA ZNF883 14698 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 115982258 115982474 115982402 Y SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15 FKBP15,SLC31A1 NA NA NA NA SLC31A1 450 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 116036635 116036980 116036798 Y SLC31A2,FKBP15,RGS3 PRPF4,CDC26 NA NA NA NA CDC26 766 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 116341254 116341479 116341362 Y RGS3 NA NA NA NA NA RGS3 136243 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 116937744 116937911 116937764 Y ORM1,COL27A1 COL27A1 NA NA NA NA COL27A1 21904 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 117785314 117785612 117785505 Y NA NA NA NA NA NA TNC 92924 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 117883580 117883602 117883591 Y TNFSF15,TNC,DEC1 TNC TNC,DEC1 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 5044 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118024698 118025071 118024956 Y NA NA NA NA NA NA TNC 146162 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118028504 118028557 118028531 Y NA NA NA NA NA NA TNC 149968 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 118350454 118350525 118350489 Y DEC1 NA ASTN2,PAPPA,TNC,DEC1,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 471918 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 118358577 118359027 118358666 Y NA NA ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 TNC 480041 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118403305 118403595 118403372 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 510488 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118412488 118412760 118412588 Y NA NA PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474 IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 501323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.75411508381799 chr9 118496415 118496674 118496563 Y NA NA NA NA NA NA PAPPA 417409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 118701397 118701694 118701515 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 212389 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118706424 118707025 118706637 Y NA NA ASTN2,LINC00474,PAPPA IMR90 Hi-C 24141950 PAPPA 207058 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118917854 118918405 118917899 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 3771 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 118953256 118953446 118953306 Y PAPPA PAPPA NA NA NA NA PAPPA 39173 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 119404408 119404429 119404420 Y NA TRIM32 NA NA NA NA TRIM32 43152 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 122127885 122128245 122128065 Y DBC1 NA NA NA NA NA CDK5RAP2 1212203 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 123546044 123546305 123546215 Y TRAF1,TRAF1,MEGF9,FBXW2 FBXW2,PSMD5-AS1 NA NA NA NA FBXW2 7385 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 123635278 123635355 123635317 Y NA PSMD5,PHF19 NA NA NA NA PHF19 2251 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 124031340 124031517 124031432 Y GSN RAB14 NA NA NA NA RAB14 48048 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 124361597 124361984 124361689 Y NA DAB2IP NA NA NA NA DAB2IP 34261 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 125869246 125869355 125869301 Y OR1L3,OR1K1,GPR21 NA NA NA NA NA STRBP 159500 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 126028834 126029635 126029406 Y NA NA NA NA NA NA STRBP 0 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 126102323 126102736 126102675 Y NA NA RC3H2,RABGAP1,MIR600HG,STRBP,CRB2,DENND1A IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 STRBP 73468 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 127029560 127030143 127029899 Y DENND1A NEK6 NA NA NA NA NEK6 11675 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 127045133 127045416 127045344 Y NEK6,NEK6 NEK6 NA NA NA NA NEK6 27248 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 127155102 127155374 127155331 Y DENND1A PSMB7 NA NA NA NA PSMB7 20349 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 127384209 127384538 127384362 Y ARPC5L MIR181A2HG NA NA NA NA MIR181A2HG 34208 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 127519728 127520109 127519909 Y NA NR6A1,OLFML2A NA NA NA NA NR6A1 11480 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 127944437 127944756 127944696 Y NR6A1,GOLGA1,PPP6C,GAPVD1 SCAI,PPP6C,RABEPK NA NA NA NA PPP6C 5462 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 127980597 127980978 127980790 Y NA PPP6C,RABEPK,HSPA5,RP11-65N13.8,GAPVD1 NA NA NA NA RABEPK 19776 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 128170862 128170906 128170878 Y NA NA PBX3 MCF7 ChIA-PET 22265404 GAPVD1 148789 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 129624910 129625209 129625060 Y RALGPS1 ZBTB34,RALGPS1 NA NA NA NA ZBTB34 3966 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 129889359 129889542 129889416 Y NA ANGPTL2 NA NA NA NA ANGPTL2 6197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 130461605 130461892 130461787 Y GARNL3,STXBP1,ST6GALNAC6,SLC25A25,PIP5KL1,TTC16 MIR3911,C9orf117,PTRH1,TOR2A NA NA NA NA C9orf117 5376 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 130600573 130601245 130600861 Y FAM129B,TOR2A,CDK9,FPGS,FPGS FPGS,ENG,AK1 NA NA NA NA ENG 13790 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chr9 130992546 130992666 130992589 Y SPTAN1,SH2D3C,SH2D3C,ST6GALNAC6,SLC25A25,DNM1,CIZ1 DNM1,CIZ1,SWI5,GOLGA2 NA NA NA NA CIZ1 27884 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 131637939 131638335 131638137 Y NA C9orf114,LRRC8A,CCBL1 C9orf114,ENDOG IMR90 Hi-C 24141950 LRRC8A 4056 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 131937094 131937487 131937262 Y PRRX2,METTL11A,ASB6,ZDHHC12,TBC1D13,ENDOG,PHYHD1,DOLK,CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L IER5L NA NA NA NA IER5L 1053 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 132145857 132146151 132146146 Y FAM73B,C9orf106,USP20,USP20,TOR1B,C9orf78,ASB6 NA C9orf106,LOC100506190,IER5L,C9orf50,PPP2R4,CRAT IMR90,MCF7,K562,HELA Hi-C,ChIA-PET,5C 24141950,22265404,22955621 RP11-65J3.1 53278 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 132175926 132176326 132176076 Y NA NA C9orf106,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,IER5L IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 67404 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.986689734647618 chr9 132223086 132223659 132223410 Y C9orf106,TOR1B LINC00963 PPP2R4,CRAT,LOC100506190,IER5L,C9orf106,C9orf50,METTL11A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 LINC00963 20071 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 132247452 132247693 132247545 Y C9orf106 LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 3722 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132249735 132250094 132249903 Y NA LINC00963 NA NA NA NA LINC00963 6005 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132330921 132331424 132331168 Y IER5L,C9orf50 NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 71020 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 132331590 132331738 132331651 Y CRAT,PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,IER5L NA FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A IMR90,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 ASB6 70706 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132359774 132359922 132359814 Y PPP2R4,PPP2R4,PPP2R4,METTL11A ASB6 NA NA NA NA ASB6 42522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132369856 132370376 132370136 Y CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107 ASB6 NA NA NA NA ASB6 32068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132372165 132372686 132372524 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 29758 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132373475 132373922 132373518 Y NA ASB6 NA NA NA NA ASB6 28522 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132431533 132431827 132431685 Y NA ASB6,PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 5613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132459422 132459648 132459595 Y NA PRRX2 NA NA NA NA PRRX2 33502 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 132464908 132465166 132465090 Y C9orf50,PRRX2 PRRX2,PTGES NA NA NA NA PRRX2 38988 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132505331 132505539 132505390 Y PTGES PTGES NA NA NA NA PTGES 7787 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 132718798 132719167 132719105 Y NA NA NA NA NA NA FNBP1 84306 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 133565449 133565699 133565571 Y NA RP11-57C19.2,EXOSC2,ABL1 NA NA NA NA EXOSC2 1409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 134113096 134113636 134113575 Y PRRC2B,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 49445 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 134131602 134132161 134131829 Y RAPGEF1,PRRC2B,QRFP,NUP214,FAM78A PPAPDC3 NA NA NA NA PPAPDC3 30920 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr9 134248752 134249121 134248943 Y AIF1L,POMT1,PRRC2B PRRC2B PRRC2B,NUP214,FAM78A IMR90 Hi-C 24141950 PRRC2B 18359 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 1.86374727655661 chr9 134770006 134770262 134770128 Y NA NA NA NA NA NA RAPGEF1 156545 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 136001357 136002105 136001796 Y SLC2A6,RALGDS,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 35196 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 136009131 136009458 136009277 Y GTF3C4,DDX31,TSC1,RALGDS RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 27843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chr9 136019465 136020353 136020023 Y NA RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA RALGDS 16948 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 136075454 136075720 136075558 Y NA RALGDS,GBGT1 NA NA NA NA GBGT1 38122 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 136576519 136576779 136576603 Y SURF4 SARDH NA NA NA NA SARDH 26298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chr9 136579870 136580130 136580087 Y NA SARDH NA NA NA NA SARDH 22947 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 136690997 136691266 136691141 Y RPL7A,SLC2A6 NA NA NA NA NA SARDH 87920 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 136856624 136856782 136856656 Y VAV2 VAV2,LINC00094 NA NA NA NA VAV2 898 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 137040428 137040559 137040494 Y SARDH,SARDH,RXRA WDR5 NA NA NA NA WDR5 41941 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137215635 137215833 137215709 Y RXRA RXRA NA NA NA NA RXRA 8691 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 137252796 137253042 137252967 Y NA RXRA NA NA NA NA RXRA 45852 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137257724 137257990 137257923 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 50780 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137305745 137306050 137305907 Y RXRA NA NA NA NA NA RXRA 98801 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137348030 137348540 137348200 Y NA NA NA NA NA NA RXRA 141086 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137483960 137484781 137484422 Y NA COL5A1 RXRA,COL5A1 IMR90 Hi-C 24141950 COL5A1 46839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137535299 137535511 137535433 Y COL5A1 COL5A1 NA NA NA NA COL5A1 3679 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 137718262 137718824 137718799 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 186642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 137739401 137739789 137739783 Y NA NA NA NA NA NA COL5A1 207781 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 138021937 138022314 138022177 Y NA NA NA NA NA NA OLFM1 56669 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 138348639 138348707 138348673 Y NA PPP1R26,MRPS2,C9orf116 NA NA NA NA PPP1R26 20218 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 138780125 138780291 138780208 Y CAMSAP1 CAMSAP1,RP11-432J22.2 NA NA NA NA CAMSAP1 16783 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 138884665 138885093 138884961 Y NA UBAC1 NA NA NA NA UBAC1 33439 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 139123667 139124081 139124003 Y SEC16A,NOTCH1,CARD9 QSOX2 NA NA NA NA QSOX2 11606 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 139462526 139462651 139462613 Y C9orf69 NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 RP11-611D20.2 23862 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chr9 139466507 139466851 139466737 Y NA NOTCH1,RP11-611D20.2 MIR4674,NOTCH1,SEC16A,C9orf163 IMR90 Hi-C 24141950 RP11-611D20.2 27843 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 139514178 139514562 139514471 Y CARD9,SEC16A,NOTCH1,UAP1L1,FUT7 NA MIR4674,NOTCH1,INPP5E,SEC16A,C9orf163,EGFL7 IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 AGPAT2 65313 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 139608810 139609132 139608936 Y SNAPC4,INPP5E,EGFL7,EGFL7,FAM69B AGPAT2,FAM69B,SNHG7 NA NA NA NA FAM69B 3788 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 139826661 139826850 139826762 Y NOTCH1,NDOR1,LCNL1,TRAF2 FBXW5,C8G,PTGDS NA NA NA NA FBXW5 10298 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chr9 140023271 140023604 140023504 Y EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2 MAN1B1,DPP7,MIR3621 NA NA NA NA DPP7 15642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chr9 140023869 140024391 140024239 Y NA MAN1B1,DPP7,MIR3621 GRIN1 K562 ChIA-PET 22265404 DPP7 16240 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 6.90682814253333 chr9 140117588 140118357 140118103 Y C9orf37,C9orf86,FBXW5,ABCA2,NPDC1,GRIN1,SSNA1,ANAPC2,TPRN,TMEM203,RNF208,WDR85,NELF,MRPL41,COBRA1 ANAPC2,SSNA1,TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 15308 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chr9 140134697 140134985 140134927 Y C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3 TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B NA NA NA NA TUBB4B 1032 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chr9 140163781 140164247 140164025 Y NA TUBB4B,NRARP NA NA NA NA TUBB4B 30116 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 3102520 3102927 3102578 Y NA NA CXorf28 IMR90 Hi-C 24141950 CXorf28 84934 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chrX 3732525 3732707 3732561 Y NA NA NA NA NA NA PRKX 102876 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 3732842 3733263 3733002 Y PRKX NA NA NA NA NA PRKX 103193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 9433838 9434425 9434365 Y TBL1X TBL1X NA NA NA NA TBL1X 4503 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 10586151 10586408 10586285 Y NA NA NA NA NA NA MID1 263365 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 11360130 11360328 11360210 Y MSL3 NA NA NA NA NA HCCS 232709 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 12228582 12228906 12228588 Y NA NA NA NA NA NA MSL3 454304 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 12974184 12974672 12974538 Y TMSB4X,TLR7,TLR8 TMSB4X NA NA NA NA TMSB4X 16555 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 13170049 13170410 13170120 Y NA NA NA NA NA NA TMSB4X 178822 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 15695028 15695432 15695331 Y ZRSR2,AP1S2,PIGA CA5BP1,CA5B NA NA NA NA CA5BP1 3973 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 15769418 15769925 15769650 Y PIGA,CA5B,ZRSR2 ZRSR2 NA NA NA NA ZRSR2 36670 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 16805192 16805460 16805250 Y TXLNG TXLNG NA NA NA NA TXLNG 2642 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 19701008 19701387 19701257 Y SH3KBP1 NA NA NA NA NA SH3KBP1 202332 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 19893071 19893438 19893374 Y NA SH3KBP1 NA NA NA NA SH3KBP1 10281 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 20079434 20079826 20079560 Y NA NA NA NA NA NA MAP7D2 53209 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 20154251 20154286 20154269 Y NA MAP7D2,EIF1AX NA NA NA NA EIF1AX 3676 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 20628422 20628647 20628433 Y NA NA NA NA NA NA RPS6KA3 344899 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 22013670 22013825 22013692 Y NA NA NA NA NA NA SMS 56979 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 24044003 24044417 24044292 Y ZFX,ZFX,ZFX,ZFX,PDK3,ACOT9,SAT1 EIF2S3 NA NA NA NA EIF2S3 26416 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 29678122 29678339 29678241 Y NA NA NA NA NA NA NR0B1 647376 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 33686045 33686057 33686052 Y NA NA NA NA NA NA TBCAP1 628533 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39018621 39018929 39018842 Y MID1IP1 NA NA NA NA NA MID1IP1 359936 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39680161 39680842 39680511 Y NA GAPDHP1 NA NA NA NA GAPDHP1 34771 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39767458 39767957 39767519 Y NA NA BCOR IMR90 Hi-C 24141950 GAPDHP1 122068 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39873339 39874259 39873676 Y NA NA BCOR MCF7,K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 160323 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39965558 39965902 39965820 Y BCOR,BCOR NA NA NA NA NA BCOR 68680 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39968308 39968728 39968376 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65854 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 39968932 39969265 39969200 Y BCOR NA NA NA NA NA BCOR 65317 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 40032962 40033837 40033453 Y BCOR,CXorf38,BCOR BCOR NA NA NA NA BCOR 745 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 40038666 40038844 40038781 Y CXorf38,ATP6AP2 BCOR NA NA NA NA BCOR 4084 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 40132742 40132979 40132844 Y ATP6AP2 NA BCOR K562 ChIA-PET 22265404 BCOR 98160 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 40691770 40692090 40691930 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 73147 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 40692126 40692324 40692241 Y NA NA NA NA NA NA RP11-77G22.2 72913 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 40869399 40869667 40869505 Y USP9X,ATP6AP2,CXorf38,MED14 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 73221 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 40869896 40870061 40869955 Y ATP6AP2 NA MED14,USP9X IMR90,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 USP9X 72827 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 40943673 40944218 40943773 Y CXorf38,MED14,DDX3X,USP9X USP9X NA NA NA NA USP9X 785 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 41182589 41182765 41182693 Y NA DDX3X DDX3X IMR90,MCF7,K562 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 DDX3X 7886 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 41192009 41192079 41192030 Y NA DDX3X NA NA NA NA DDX3X 1358 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 41242516 41242827 41242698 Y DDX3X NA DDX3X,USP9X MCF7,K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 DDX3X 51865 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 41413588 41413590 41413589 Y NA NA NA NA NA NA DDX3X 222937 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 41538171 41538545 41538500 Y CASK NA NA NA NA NA CASK 242171 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 43888590 43889088 43888779 Y EFHC2 NA NA NA NA NA NDP 57840 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 44168721 44168911 44168853 Y NA EFHC2 NA NA NA NA EFHC2 32007 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 45666059 45666529 45666404 Y NA RP5-1158E12.3 NA NA NA NA RP5-1158E12.3 42391 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 46989082 46989431 46989227 Y NA RBM10,NDUFB11 NA NA NA NA RBM10 12837 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chrX 47016809 47017199 47017004 Y NA RBM10,NDUFB11,UBA1 NA NA NA NA NDUFB11 13906 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 47374044 47374207 47374095 Y CFP,CFP,ARAF ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41 IMR90 Hi-C 24141950 ZNF41 33699 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 47382833 47383145 47382966 Y SYN1,SPACA5,CFP,CFP ZNF41,ARAF UBA1,ZNF41,USP11,CDK16 IMR90 Hi-C 24141950 ARAF 35371 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 47423323 47423681 47423373 Y CDK16,CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1 NA NA NA NA ARAF 4807 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 47438054 47438403 47438273 Y CFP,CFP,ARAF ARAF,TIMP1,SYN1,CFP NA NA NA NA TIMP1 1309 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 47880817 47881226 47880903 Y SYN1 ZNF182,ZNF630 NA NA NA NA ZNF182 19440 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 48350817 48351213 48350906 Y WAS,RBM3,PORCN,OTUD5 FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25 NA NA NA NA PORCN 14137 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 49012442 49012818 49012676 Y NA GPKOW,PLP2,PRICKLE3,SYP MAGIX,PLP2 IMR90 Hi-C 24141950 PLP2 13455 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 49108550 49108714 49108667 Y PIM2,PPP1R3F,FOXP3 HSPB1P2,CCDC22,PPP1R3F NA NA NA NA PPP1R3F 15592 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 52964244 52964539 52964367 Y TSPYL2,KDM5C,IQSEC2,FAM156A FAM156B NA NA NA NA FAM156B 45908 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chrX 53155305 53155690 53155322 Y XAGE5,FAM156A,FAM156B,FAM156A,GPR173,IQSEC2,TSPYL2 TSPYL2,LINC01155 KDM5C IMR90 Hi-C 24141950 LINC01155 33978 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 53428419 53428681 53428625 Y NA RIBC1,SMC1A,HSD17B10 NA NA NA NA RIBC1 18958 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 58292059 58292236 58292148 Y NA NA NA NA NA NA RP3-323P24.3 1145964 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 64255385 64255512 64255449 Y ZC4H2 ZC4H2 NA NA NA NA ZC4H2 2792 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 67291116 67291490 67291298 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 360265 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chrX 67352579 67352916 67352601 Y NA NA NA NA NA NA OPHN1 298839 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 67905949 67906235 67906128 Y NA STARD8 NA NA NA NA STARD8 40441 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 68004355 68004677 68004478 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 42163 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 68058070 68058239 68058155 Y NA EFNB1 NA NA NA NA EFNB1 11230 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 68215899 68216039 68215946 Y NA NA NA NA NA NA PJA1 167597 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 69653784 69653948 69653832 Y NA NA NA NA NA NA PDZD11 145420 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 69654278 69654566 69654417 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 145914 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 69655002 69655313 69655257 Y DLG3 NA NA NA NA NA PDZD11 146638 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 70640504 70640913 70640718 Y NA NA NA NA NA NA TAF1 56390 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 71761722 71762003 71761864 Y NA HDAC8 NA NA NA NA HDAC8 28950 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 73250242 73250558 73250399 Y NA NA NA NA NA NA JPX 88083 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 73350281 73350820 73350789 Y RLIM USMG5P1 JPX IMR90 Hi-C 24141950 USMG5P1 40905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 73507125 73507445 73507287 Y NA FTX NA NA NA NA FTX 3964 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 74960822 74961039 74960972 Y NA NA NA NA NA NA ZDHHC15 219485 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 77226253 77226302 77226278 Y NA NA NA NA NA NA ATP7A 62059 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 77908831 77908963 77908901 Y CYSLTR1 NA NA NA NA NA TAF9B 515628 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 85280770 85281145 85280958 Y CHM CHM NA NA NA NA CHM 19421 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 85339971 85340972 85340615 Y NA CHM NA NA NA NA CHM 39405 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.877057541908994 chrX 92479084 92479478 92479382 Y NA RP13-88F20.1 NA NA NA NA RP13-88F20.1 1070 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 95228939 95229189 95229110 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 708473 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 96701855 96702106 96701982 Y NA NA NA NA NA NA DIAPH2 764193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 99903962 99904188 99904076 Y SRPX2 TSPAN6,SRPX2 NA NA NA NA SRPX2 6747 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 100792680 100793554 100793013 Y NA ARMCX1 NA NA NA NA ARMCX1 9960 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 103382264 103382489 103382378 Y NA ZCCHC18,FAM199X NA NA NA NA FAM199X 26812 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 104559193 104559437 104559342 Y NA NA NA NA NA NA IL1RAPL2 750197 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 106595212 106595632 106595477 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235155 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 106595667 106595822 106595802 Y NA NA NA NA NA NA RBM41 235610 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 106920003 106920801 106920325 Y TSC22D3,TSC22D3 NA TSC22D3 K562,MCF7,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 PRPS1 50266 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 106944916 106945406 106945227 Y TSC22D3,TSC22D3 NA NA NA NA NA TSC22D3 73166 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 106954265 106954667 106954451 Y TSC22D3,TSC22D3,ATG4A NA NA NA NA NA TSC22D3 63905 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 107070299 107070693 107070500 Y MID2 MID2 NA NA NA NA MID2 3314 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 108883543 108883897 108883721 Y NA NA NA NA NA NA ACSL4 90735 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 109429267 109429621 109429491 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA TMEM164 185408 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 109487499 109487581 109487556 Y AMMECR1 NA NA NA NA NA AMMECR1 193880 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 112084647 112084962 112084847 Y AMOT,AMOT AMOT NA NA NA NA AMOT 2604 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 115238483 115238690 115238635 Y NA NA NA NA NA NA RP11-761E20.1 155061 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 116006387 116006717 116006592 Y NA NA NA NA NA NA RP11-232D9.3 180231 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 120331489 120331718 120331553 Y NA NA NA NA NA NA C1GALT1C1 569484 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 3.50823016763598 chrX 122898767 122899176 122898998 Y NA THOC2 NA NA NA NA THOC2 33861 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 123128662 123128935 123128809 Y XIAP,XIAP,STAG2 STAG2 NA NA NA NA STAG2 36600 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 123606177 123606254 123606218 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 514115 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 123735078 123735231 123735154 Y NA NA NA NA NA NA STAG2 643016 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 125606277 125607115 125606755 Y NA MTND4P24 NA NA NA NA MTND4P24 1409 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chrX 129066097 129066492 129066260 Y NA UTP14A,BCORL1 NA NA NA NA UTP14A 28000 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 129118011 129118370 129118054 Y NA BCORL1 BCORL1,UTP14A IMR90,K562,MCF7 Hi-C,ChIA-PET 24141950,22265404 BCORL1 4928 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.657793156431746 chrX 129400519 129400680 129400638 Y NA ZNF280C NA NA NA NA ZNF280C 193 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chrX 133305762 133306165 133305903 Y PHF6,CCDC160 NA NA NA NA NA CCDC160 62912 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.76742534917037 chrX 133952675 133952993 133952834 Y NA FAM122C,FAM122B NA NA NA NA FAM122B 23413 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 134048475 134048529 134048502 Y MOSPD1 MOSPD1 NA NA NA NA MOSPD1 1178 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.219264385477249 chrX 134138094 134138444 134138243 Y NA FAM127C,FAM127A,FAM127B NA NA NA NA FAM127C 16115 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 135275239 135275595 135275317 Y CT45A6,MMGT1,FHL1,FHL1 FHL1 NA NA NA NA FHL1 47680 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 135940631 135940874 135940833 Y HTATSF1 RBMX,RP11-308D16.4 NA NA NA NA RBMX 20049 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 138215503 138215737 138215513 Y NA NA NA NA NA NA FGF13 87202 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 138929859 138929869 138929864 Y CXorf66 NA NA NA NA NA ATP11C 95566 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 139858514 139858763 139858620 Y NA NA NA NA NA NA LDOC1 410547 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 149862815 149863170 149863006 Y MTMR1 MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3380 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 149863384 149863571 149863479 Y NA MTMR1 NA NA NA NA MTMR1 3949 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 149996146 149996459 149996317 Y NA NA NA NA NA NA CD99L2 68830 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 150047001 150047063 150047035 Y NA CD99L2 NA NA NA NA CD99L2 18226 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 150152595 150153067 150152778 Y NA HMGB3,RPL19P21 NA NA NA NA HMGB3 5613 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 2.08301166203386 chrX 152127371 152127756 152127434 Y NA NA NA NA NA NA PNMA3 95010 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chrX 152742295 152742894 152742640 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 HAUS7,ATP2B3 K562,IMR90 ChIA-PET,Hi-C 22265404,24141950 TREX2 8250 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 152753051 152753292 152753194 Y NA TREX2,BGN,HAUS7 BGN MCF7 ChIA-PET 22265404 BGN 5105 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.328896578215873 chrX 153166203 153166850 153166548 Y ABCD1,PLXNB3,MECP2,ATP6AP1,RENBP L1CAM,ARHGAP4,NAA10,RENBP NA NA NA NA L1CAM 5827 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 153311757 153312308 153312067 Y NA IRAK1,MECP2 NA NA NA NA IRAK1 28326 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrX 153596671 153598676 153598064 Y NA FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1 NA NA NA NA FLNA 2330 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.548160963693121 chrX 153956289 153956510 153956418 Y TKTL1,IKBKG,IKBKG,F8A2,F8A1,GAB3 GAB3,DKC1 NA NA NA NA GAB3 21348 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624 chrY 15207344 15207441 15207401 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 1541535 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.438528770954497 chrY 28555183 28555400 28555298 Y NA NA NA NA NA NA AGKP1 11806207 CAGE SW 872 hg19 FANTOM5 0.109632192738624